隨著分子檢測的不斷發(fā)展，甲基化qPCR檢測以及甲基化NGS檢測已成為非常普及的檢測技術，這兩種技術的必經之路就是甲基化轉化，甲基化轉化從方法學上可分為亞硫酸氫鹽轉化和酶法轉化，近幾年，基于DNA甲基化位點的檢測試劑盒陸續(xù)獲批面世。NMPA批準的甲基化檢測試劑盒大部分為熒光PCR法，主要原因在于熒光PCR法操作簡便，無需在PCR后電泳，且具有靈敏度高、特異性強、重復性好等特點。這些甲基化檢測試劑采用的轉化方法為亞硫酸氫鹽轉化法，亞硫酸氫鹽轉化成為DNA甲基化檢測的“金標準”。但是傳統的亞硫酸氫鹽轉化有很多局限性，例如過長的轉化時間、嚴重的DNA損傷、被高估的5mC水平、C-U轉化不完全等。
圖1.亞硫酸氫鹽催化C轉化為U的化學反應概要
甲基化檢測技術在疾病早篩領域持續(xù)火爆，2024-2025 年獲國家藥監(jiān)局最新批準的甲基化檢測試劑盒如下：
思博士 ? MT-1A、Epo 及 Septin9 基因甲基化檢測試劑盒（PCR 熒光探針法）2：2024 年 8 月 7 日獲批（國械注準 20243401386），由博爾誠（北京）科技有限公司自主研發(fā)，是 NMPA 批準上市的首款食管癌血液基因甲基化檢測產品，可通過測定外周血中腫瘤 DNA 特定位點（MT-1A、Epo 及 Septin9 基因）的甲基化程度，僅需 5ml 外周血即可實現食管癌的高效精準檢出。
人 CDO1 和 CELF4 基因甲基化檢測試劑盒（PCR - 熒光探針法）10：2024 年 12 月 17 日獲批（國械注準 20243402610），由北京起源聚禾生物科技有限公司研發(fā)，用于體外定性檢測人宮頸脫落細胞 DNA 中 CDO1 和 CELF4 基因的甲基化水平。
艾思寧 ——KCNA3 和 OTOP2 基因甲基化聯合檢測試劑盒（熒光 PCR 法）：2025 年 1 月 21 日獲批（國械注準 20253400207），由武漢艾米森自主研發(fā)，基于實時熒光 PCR 技術，通過檢測血液 ctDNA 中的 OTOP2 和 KCNA3 基因甲基化程度實現對食管癌的早期檢測。
人 Twist1/Vimentin 基因甲基化檢測試劑盒（熒光 PCR 法）：2025 年 1 月獲批（國械注準 20253400083），由江蘇為真生物醫(yī)藥技術股份有限公司研發(fā)，針對癌種為尿路上皮癌。
GNB4 和 Riplet 基因甲基化聯合檢測試劑盒（熒光 PCR 法）：2025 年 1 月獲批（國械注準 20253400101），由武漢艾米森生命科技有限公司研發(fā)，針對癌種為肝癌。
人類 Septin9、SDC2 和 NDRG4 基因甲基化檢測試劑盒（熒光 PCR 法）6：2025 年 3 月 6 日獲批（國械注準 20253400481），由江蘇健為診斷科技有限公司研發(fā)，用于體外定性檢測人糞便樣本 DNA 中 Septin9、SDC2 和 NDRG4 基因的甲基化狀態(tài)，對判斷患者結直腸癌的發(fā)生風險進行輔助診斷。
人 CDO1/AJAP1/GALR1 基因甲基化檢測試劑盒（熒光 PCR 法）1：2025 年獲批，由武漢凱德維斯生物技術有限公司研發(fā)，對人宮腔脫落細胞樣本中基因甲基化狀態(tài)進行定性檢測，用于疑似子宮內膜癌患者的輔助診斷。
2024年1月2日，芝加哥大學何川教授團隊在Nature Biotechnology上在線發(fā)表了題為Ultrafast bisulfite sequencing detection of 5?methylcytosine in DNA and RNA的研究論文，該研究提出并開發(fā)了對DNA和RNA上的5-甲基胞嘧啶修飾進行快速，準確檢測的測序方法，簡稱為UBS-seq。該技術比現有的轉化反應過程加速20-30倍，同時明顯的降低了DNA損傷，以及C-U轉化不徹底導致的背景干擾。
圖2.UBS-seq法在微量樣本中應用，傳統BS轉化相比有更低的背景噪音
傳統BS轉化的不足之處和Superfast BS-seq的優(yōu)勢有哪些呢？
傳統BS-seq:
轉化液濃度低，反應時間長，約3 h；
在高 GC DNA 區(qū)域轉化不充分；
DNA降解嚴重；
非甲基化區(qū)域優(yōu)先降解。
Superfast BS-seq
轉化液濃度高，轉化時間短，約5min；
DNA降解程度低，轉化后樣本完整度好；
GC區(qū)域轉化率高，假陽性率低。
翌圣生物的Hieff Superfast DNA Methylation Bisulfite Kit（柱式：12225ES）和Hieff Mag Superfast DNA Methylation Bisulfite Kit（磁珠法：12227ES）便是基于此技術開發(fā)優(yōu)化而成，可以在98°C 5min條件下可完成＞99.5%的胞嘧啶轉化，并且極大的降低了DNA損傷，更好的保證了DNA片段的完整性，約30 min可完成BS轉化全流程，轉化后的產物適用于PCR擴增和DNA測序等下游應用。
實驗流程
圖3.Superfast BS轉化實驗流程
產品亮點
產品亮點一：
優(yōu)異的轉化率
投入不用量的293gDNA，293gDNA參入0.5% λ DNA，使用12227（磁珠法）與競品1轉化試劑盒進行頭對頭對比，同時采用雙鏈甲基化DNA建庫（12214ES），如圖4所示：12227（磁珠法）對不同投入量的DNA中 λ DNA C的轉化率≥99.5%，轉化時間適當延長，能進一步提高轉化效率。
圖4.12227和競品的轉化率
產品亮點二：優(yōu)異的樣本兼容率
10 ng cf DNA和50 ng FFPE DNA，cf DNA和FFPE DNA都參入0.5% λ DNA，使用12227（磁珠法）與競品1轉化試劑盒進行頭對頭對比，同時采用雙鏈甲基化DNA建庫（12214ES），如圖5所示：12227（磁珠法）對不同樣本中 λ DNA C的轉化率≥99.5%，轉化時間適當延長，能進一步提高轉化效率。
圖5
產品亮點三：
優(yōu)異的回收率
投入不同量的293 DNA，使用12225和12227與競品1轉化試劑盒進行頭對頭對比，轉化后采用Qubit ssDNA定量，計算回收率，如圖6所示：12225的樣本回收率能穩(wěn)定達到60%以上，并且當樣本量大于200 ng，回收率能超過70%，磁珠法轉化試劑在高投入量下，回收率略低于柱式法，1 μg以內，磁珠法的回收率能達到60%。
圖6.競品1為磁珠法
產品亮點四：適用于單細胞甲基化建庫
在微流控的自動化單細胞DNA甲基化平臺上，進行單細胞甲基化轉化實驗，樣本中單細胞DNA轉化率在99%左右。
產品推薦
翌圣DNA甲基化解決方案
翌圣生物
翌圣生物科技（上海）股份有限公司是一家聚焦生命科學產業(yè)鏈上游核心原料，從事分子、蛋白和細胞三大品類生物試劑的研發(fā)、生產與銷售的高新技術企業(yè)。核心產品覆蓋qPCR系列、NGS系列、逆轉錄系列、核酸提取與純化系列、PCR系列、分子克隆系列、體外轉錄系列、抗體、蛋白純化系列、蛋白分析系列、重組蛋白、細胞分析系列、細胞培養(yǎng)系列、細胞轉染系列、報告基因檢測系列等多個品類，廣泛應用于生命科學研究、診斷檢測和生物醫(yī)藥等領域。
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