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2025-01-10 10:50:43油菜內(nèi)源基因: “油菜內(nèi)源基因”指的是油菜植株自身攜帶的、控制其生長、發(fā)育、代謝等生命活動的基因。這些基因在油菜的遺傳信息中起著決定性作用，通過編碼特定的蛋白質(zhì)或RNA分子，調(diào)控油菜的多種性狀，如產(chǎn)量、抗逆性、品質(zhì)等。研究油菜內(nèi)源基因有助于揭示油菜的遺傳機制，為油菜的遺傳改良和分子育種提供理論基礎(chǔ)和基因資源。同時，也有助于理解油菜與環(huán)境之間的相互作用關(guān)系。

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油菜內(nèi)源基因問答

2023-05-26 09:35:19基因的陰暗面你了解嗎: 生命系統(tǒng)的進化從未停止，新事物的出現(xiàn)總是會伴隨著舊事物的退出，甚至是消亡，基因正是如此。而任何事物都具有雙面性，基因的進化也無法免于俗套。近期，來自麥克馬斯特大學(xué)、芝加哥大學(xué)、巴斯德研究所等的研究人員通過對曾經(jīng)保護人類免于黑死病的基因進行研究，發(fā)現(xiàn)這些基因如今跟克羅恩病、類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎等自身免疫性疾病的易感性增加有關(guān)。也就是說，基因的進化并不總是朝著有利的一面，其具有雙面性。傳染病是推動人類進化***強大的選擇壓力之一，包括歷史上有記錄以來的一次***大死亡事件——第二次瘟疫大流行的爆發(fā)，通常稱為黑死病，其由鼠疫耶爾森菌引起。這場瘟疫對非洲-亞歐大陸甚至產(chǎn)生了毀滅性的影響，造成多達(dá)30-50%的人口死亡，盡管已經(jīng)過去幾個世紀(jì)，但其影響似乎至今仍然在蔓延。黑死病在人類遺傳學(xué)上留下了持久的印記，改變了塑造我們免疫系統(tǒng)的頻率，對于現(xiàn)在的人類來說或許不是一件好事。為了確定可能在黑死病期間保護人類免于感染及死亡的基因，來自麥克邁斯特大學(xué)、芝加哥大學(xué)、巴斯德研究所的研究人員對來自黑死病出現(xiàn)之前、黑死病發(fā)展期間、黑死病發(fā)生之后兩個不同歐洲人群的206個古代DNA提取物的免疫相關(guān)基因進行了遺傳變異的特征。通過一系列研究，他們發(fā)現(xiàn)保護性變體與如今自身免疫性疾病易感性增加有關(guān)的等位基因重疊，為黑死病在塑造如今的疾病易感性方面所起的作用提供了經(jīng)驗性證據(jù)。相關(guān)研究成果以“Evolution of immune genes is associated with the Black Death”為題，發(fā)表在Nature上。這項進行了長達(dá)七年的研究獲取了從倫敦、丹麥出土的三組不同骨骼遺骸中提取的DNA，包括黑死病受害者、黑死病發(fā)生之前死亡的人、瘟疫發(fā)生后10到100年死亡的人，***終研究人員篩選出516個DNA樣本。為了檢測可能對鼠疫桿菌具有保護作用或易感性的等位基因，研究人員在候選區(qū)域（免疫基因和GWAS基因座）內(nèi)搜索了在黑死病發(fā)生前后DNA樣本之間等位基因頻率出現(xiàn)極大變化的變體。相對于一組非免疫基因座，高分化位點的免疫基因座強烈富集，暗示了免疫基因的正向選擇。終研究人員鎖定了四個基因，這些基因會在病原體入侵人類免疫系統(tǒng)時提供保護，并且發(fā)現(xiàn)這些基因中有的等位基因具有保護性有的則使人易感。研究人員所確定的***強關(guān)聯(lián)是rs2549794和ERAP2表達(dá)之間的關(guān)聯(lián)，其中保護性等位基因與ERAP2的表達(dá)增加5倍有關(guān)。***終通過實驗發(fā)現(xiàn)，ERAP2與***鼠疫桿菌感染的能力之間存在關(guān)聯(lián)性，表明ERAP2與鼠疫菌感染的反應(yīng)有關(guān)，進而支持了黑死病期間ERAP2等位基因頻率的變化可能是鼠疫菌誘導(dǎo)的自然選擇所致這一觀點。如果一個人攜帶兩個保護性ERAP2等位基因，則其在黑死病發(fā)生期間存活下來的可能性將增加40%-50%。因為擁有兩份ERAP2基因拷貝的人，其免疫系統(tǒng)能產(chǎn)生更多功能性蛋白質(zhì)，進而擁有強于擁有一份ERAP2基因的人的識別感染的能力。但凡事皆有雙面性，研究人員發(fā)現(xiàn)，鼠疫菌對ERAP2的選擇可能會影響對其他病原體或疾病的免疫反應(yīng)。選擇有利的ERAP2變體是如今克羅恩病的風(fēng)險因素，同時，擁有rs11571319遺傳變體的基因CTLA4與類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎、紅斑狼瘡的風(fēng)險增加有關(guān)。綜上，通過對黑死病受害者和幸存者數(shù)百年前的DNA進行分析，確定了幫助人們在瘟疫中幸存下來的關(guān)鍵基因差異。而這些差異繼續(xù)塑造了今天的人類免疫系統(tǒng)，曾經(jīng)保護人類免于黑死病的基因如今與更易換上克羅恩病和類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎等自身免疫性疾病有關(guān)。基因進化的雙面性：成也蕭何，敗也蕭何！以上研究分析了黑死病發(fā)生期間對基因產(chǎn)生了一定影響，而這影響至今仍有所體現(xiàn)，說明基因的選擇性進化具有雙面性。無獨有偶，一項發(fā)表在Nature Reviews Genetics上，題為“The transition to modernity and chronic disease: mismatch and natural selection”的研究表明，現(xiàn)代化帶來了一個完全有別于過去的環(huán)境，與以往環(huán)境具有更高適配性的基因，在現(xiàn)代生活中未必也是如此，甚至可能會使人更易患病，比如阿爾茨海默癥、癌癥以及心血管疾病。在現(xiàn)代化進程中，人類進化的能力與快速變化的環(huán)境之間出現(xiàn)了不匹配，對人類健康產(chǎn)生了很大影響。由拮抗多效性（指的是能同時具有有利和不利影響的基因）介導(dǎo)的先前進化的遺傳效應(yīng)現(xiàn)在可能占非傳染性疾病負(fù)擔(dān)的很大部分，目前這些疾病造成了世界上超過63%的死亡。威廉姆斯提出，衰老是由許多基因的綜合作用引起的，這些基因具有多效性，也就是說其在年輕時帶來好處但在年長時會付出代價。已經(jīng)有幾項研究提供了直接及間接證據(jù)，表明與老年疾病風(fēng)險增加相關(guān)的基因與青少年存活率、生育能力及繁殖成功率增加有關(guān)。 RNA提取磁珠屬于納米生物磁珠的一種，主要作用是用于核酸提取過程中的RNA提取，粒徑分布在500nm左右，是洛陽吉恩特生物自主研發(fā)生產(chǎn)的高分子納米磁性微球，該磁珠懸浮時間長，磁響應(yīng)時間迅速，對DNA甲基化過程中的提取環(huán)節(jié)提供良好的支持，可明顯縮短實驗時間，提高實驗效率，并在提取結(jié)果上保持穩(wěn)定，配合核酸提取儀，更能實現(xiàn)快速的RNA提取。

2023-05-16 09:54:10【病例研究】眼部基因治療視網(wǎng)膜下注射: 術(shù)中光學(xué)相干斷層掃描（OCT）輔助下Leber先天性黑矇（LCA）黃斑修復(fù)術(shù)病例研究的內(nèi)容Leber先天性黑矇（LCA）是一組先天性視網(wǎng)膜營養(yǎng)不良，可導(dǎo)致早年出現(xiàn)重度視力損傷?；颊咄ǔ１憩F(xiàn)為眼球震顫、瞳孔反應(yīng)遲鈍或近乎缺失、視力嚴(yán)重下降、畏光和高度遠(yuǎn)視[1]。眼部基因治療可極大改善這些患者的視力[2]。通過術(shù)中視網(wǎng)膜下注射AAV載體完成基因傳遞。視網(wǎng)膜下眼部基因治療注射對準(zhǔn)確度水平有較高要求。因此，術(shù)中光學(xué)相干斷層掃描（OCT）是一項必不可少的工具。術(shù)中OCT可向眼科醫(yī)生提供實時信息，支持氣泡管理，并可用于確認(rèn)預(yù)期的載體量是否到達(dá)視網(wǎng)膜下間隙。術(shù)中OCT還有助于預(yù)防并發(fā)癥，例如載體注射期間術(shù)中形成的黃斑裂孔。病例研究中值得期待的內(nèi)容學(xué)習(xí)要點了解21歲視網(wǎng)膜變性及2型Leber先天性黑矇（LCA）患者的手術(shù)治療發(fā)現(xiàn)視網(wǎng)膜下眼部基因治療注射的不同步驟理解術(shù)中OCT在黃斑修復(fù)術(shù)中的作用眼部基因治療病例描述1例21歲西班牙裔女性，自出生以來視力不良，包括夜盲癥、視野收縮、視力下降和色覺下降?；颊咦⒁獾匠霈F(xiàn)緩慢的進行性功能性退減。盡管已完成高中學(xué)業(yè)，但她的方向感日益惡化，并且由于視力限制無法獨立生活和工作。圖1：圖注：黃斑OCT和超寬視野眼底圖像顯示基線色素性視網(wǎng)膜病變和相對保留中央凹的感光器改變。圖像由A博士提供診斷與術(shù)前評估雙眼術(shù)前視力均為20/150?；颊弑憩F(xiàn)為典型彌散性視網(wǎng)膜變性，黃斑相對保留?；驒z測顯示雙等位基因RPE65變異導(dǎo)致視網(wǎng)膜變性，并提示2型Leber先天性黑矇。鑒于可獲得視網(wǎng)膜活細(xì)胞且考慮到眼部基因治療的潛在受益，對雙眼進行了視網(wǎng)膜下注射治療。兩次手術(shù)之間間隔兩周。黃斑OCT和超寬視野眼底圖像顯示基線色素性視網(wǎng)膜病變和相對保留中央凹的感光器改變。圖2：進行黃斑掃描以記錄注射前解剖結(jié)構(gòu)，圖像由A博士提供掃碼下載完整版【病例研究】（英文）

2023-05-30 10:12:19【白皮書下載】術(shù)中OCT輔助基因治療（英）: 術(shù)中OCT提高視網(wǎng)膜下基因增強治療的手術(shù)安全性和治療準(zhǔn)確性基因增強治療是一種眼部基因轉(zhuǎn)移方法，用于治療當(dāng)功能蛋白不足表現(xiàn)為遺傳病時的常染色體隱性或X性染色體連鎖視網(wǎng)膜營養(yǎng)不良。這些基因缺陷引發(fā)特定視力障礙和/或視網(wǎng)膜變性。近期，基因治療在視網(wǎng)膜營養(yǎng)不良中的應(yīng)用引發(fā)了人們巨大的興趣。視網(wǎng)膜下基因治療藥物注射術(shù)的技術(shù)要求較高，具有一定難度。術(shù)中光學(xué)相干斷層掃描（術(shù)中OCT）可提供實時信息并向外科醫(yī)生提供反饋，包括對眼后段結(jié)構(gòu)的滲透深度、注射液的分布和傳播、載體回流以及術(shù)中黃斑中心凹的完整性。掃碼下載完整英文白皮書您是否想要進一步了解視網(wǎng)膜下基因治療藥物注射術(shù)治療視網(wǎng)膜營養(yǎng)不良？輸入您的信息后可下載完整白皮書。

2023-02-23 09:07:02科學(xué)家揭示人類特有高清視覺的基因秘密: 榮登封面的這項研究成果來自哈佛***神經(jīng)科學(xué)家Joshua Sanes教授領(lǐng)銜的科學(xué)家團隊。研究人員采用高通量單細(xì)胞基因測序的方法，創(chuàng)建了靈長類動物的視網(wǎng)膜細(xì)胞型態(tài)分類圖譜，揭示為我們帶來敏銳視覺的細(xì)胞有哪些特殊的基因特征。這項研究同時為理解人類視覺在疾病情況下如何被破壞提供了重要的基礎(chǔ)。凹：讓我們看得清清楚楚明明白白真真切切人類的視覺在哺乳動物中出類拔萃，比如我們能夠閱讀，分辨人臉。這些功能可不簡單，需要視覺能夠分辨極細(xì)微的差異，并能迅速對焦。高清視覺全得歸功于視網(wǎng)膜中間一個極小的特殊區(qū)域——***凹，也就是眼底黃斑的中心。凹的直徑不到1.5毫米，面積只占視網(wǎng)膜的不到1%，但大腦獲得的視覺信息卻有50%來自這里。凹的特殊，還不僅是因為視線的“焦點”落在此處提供清晰影像，要知道哺乳動物中只有部分靈長類生物進化出了這個結(jié)構(gòu)，比如人類?！澳牵╢ovea）是個稀罕物，豈是什么生物都能有的？” 凹為人類提供了視力的同時，卻讓科學(xué)家在解決人類視覺疾病時面臨一個難題。就拿實驗“勞?！毙∈髞碚f，雖然它們?yōu)槿祟惖目茖W(xué)研究提供了無數(shù)疾病模型，但它們“鼠目寸光”，視網(wǎng)膜沒有***凹！這種 “先天缺陷”讓它們在視覺相關(guān)疾病的模型上幫不上什么忙。再加上***凹結(jié)構(gòu)太微小了，過去科學(xué)家在靈長類動物上的研究也止于形態(tài)解剖學(xué)的描述。終，他們在凹和外周視網(wǎng)膜中均鑒定出了近70種不同類型的細(xì)胞，并且還知道了每一個類型的細(xì)胞表達(dá)哪些基因。詳盡的細(xì)胞分類圖譜給科學(xué)家們提供了許多過去不知道的信息。用Sanes教授的話說，“我們現(xiàn)在弄清楚了凹特別在哪里?！薄嫉募?xì)胞和外周視網(wǎng)膜類型相似，但組成卻不同盡管細(xì)胞類型九成相同，但***凹和外周視網(wǎng)膜的細(xì)胞類型組成不同。更關(guān)鍵的是，在同類型的細(xì)胞中，***凹處的細(xì)胞檢測到表達(dá)與外周不一樣的基因。非常有意思的是，這些基因的表達(dá)和***凹獨特的視覺信息處理極為相關(guān)，科學(xué)家們相信，可能這才是***凹功能特殊的原因。核酸提取產(chǎn)品對細(xì)胞篩選的方法已日漸成熟，原理是將包被一抗的磁珠與細(xì)胞表面對應(yīng)的分子特異性結(jié)合，或者將包被二抗的磁珠與已經(jīng)與細(xì)胞表面分子特異性結(jié)合的一抗結(jié)合。核酸提取磁珠攜帶與之結(jié)合的細(xì)胞吸附與分離柱或試管上，實現(xiàn)陽性細(xì)胞或陰性細(xì)胞的分離。洛陽吉恩特生物自主研發(fā)生產(chǎn)了各類核酸提取磁珠，可以實現(xiàn)穩(wěn)定的實驗結(jié)果。

2023-04-11 09:07:10日有所思夜有所夢？Cell子刊揭示：做夢的關(guān)鍵基因: 做夢——人在睡眠時自然發(fā)生的一個過程。來自日本理化學(xué)研究所的科學(xué)家發(fā)現(xiàn)，做夢這件事歸功于Chrm1 和 Chrm3 兩個關(guān)鍵基因。當(dāng)敲除這兩個基因時，人在快速眼動(REM)睡眠期的睡眠水平會下降，且不再做夢、記憶減退。人在睡覺過程中，腦電圖會發(fā)生各種隨著睡眠深度不同而不同的變化。根據(jù)腦電圖的不同特征，睡眠分為兩種狀態(tài)：非眼球快速運動睡眠（NREM睡眠）和眼球快速運動睡眠（REM睡眠），夢境通常發(fā)生在REM睡眠期。此前研究表明，乙酰膽堿受體（可產(chǎn)生副交感神經(jīng)興奮效應(yīng)，即心臟活動、消化腺分泌增加、瞳孔縮小等）參與了REM睡眠的調(diào)節(jié)，為了揭示REM睡眠背后的分子機制，在***新一項研究中，通訊作者Hiroki Ueda及其團隊在小鼠模型中實驗了膽堿能神經(jīng)元，這種神經(jīng)元布滿乙酰膽堿受體。DOI：http://www.giant-bio.com/home-newsinfo-id-4263.html在發(fā)表于《Cell Reports》雜志上題為“Muscarinic Acetylcholine Receptors Chrm1 and Chrm3 Are Essential for REM Sleep”的這篇文章中，研究人員首先通過突觸抑制這些神經(jīng)元來識別對睡眠至關(guān)重要的神經(jīng)元群體。之后使用CRISPR基因編輯技術(shù)系統(tǒng)地禁用乙酰膽堿受體基因。讓人意外的是，當(dāng)敲除了乙酰膽堿受體基因Chrm1和Chrm3后，他們發(fā)現(xiàn)，REM睡眠期幾乎喪失，而失去了這一睡眠階段也就意味著不再產(chǎn)生做夢現(xiàn)象。另一方面， NREM睡眠可分為I、II、III、IV四個階段，其中I、II期稱“淺睡眠”，III、IV期稱為“深睡眠”。II期非快眼動睡眠期占總睡眠時間的50%左右。研究人員據(jù)此認(rèn)為該實驗中小鼠睡眠時間的縮短或是由于NREM睡眠時間縮短造成，這就表明，膽堿能調(diào)節(jié)對NREM睡眠也很重要。通過進一步研究，作者繼而得出，REM睡眠受損也會縮短NREM睡眠的持續(xù)時間。一般來說，當(dāng)REM睡眠出現(xiàn)障礙時，會出現(xiàn)一系列問題，如精神壓抑、過度飲酒、腦血管疾病和變性性神經(jīng)系統(tǒng)疾病等。然而在這項研究中，作者們觀察到，當(dāng)廣泛分布于不同大腦區(qū)域的Chrm1和Chrm3基因被敲除時，盡管小鼠幾乎完全不再經(jīng)歷REM睡眠，但仍然存活了下來。作者、RIKEN研究員Yasutaka Niwa說:“令人驚訝的發(fā)現(xiàn)是，盡管REM睡眠幾乎完全喪失，小鼠還是可以存活的，這將使我們能夠嚴(yán)格驗證REM睡眠是否在學(xué)習(xí)和記憶等基本生物功能中發(fā)揮了關(guān)鍵作用。”總結(jié)來說，這些發(fā)現(xiàn)強烈暗示Chrm1 和 Chrm3基因?qū)艟骋约八哒{(diào)節(jié)的重要性，尤其是對REM睡眠發(fā)揮的作用。生物磁珠對細(xì)胞篩選的方法已日漸成熟，原理是將包被一抗的磁珠與細(xì)胞表面對應(yīng)的分子特異性結(jié)合，或者將包被二抗的磁珠與已經(jīng)與細(xì)胞表面分子特異性結(jié)合的一抗結(jié)合。磁珠攜帶與之結(jié)合的細(xì)胞吸附與分離柱或試管上，實現(xiàn)陽性細(xì)胞或陰性細(xì)胞的分離。洛陽吉恩特生物自主研發(fā)生產(chǎn)了各類生物磁珠，可以實現(xiàn)穩(wěn)定的實驗結(jié)果