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2025-01-10 17:05:48自動化與機(jī)器學(xué)習(xí): “自動化與機(jī)器學(xué)習(xí)”是兩個緊密相連的技術(shù)領(lǐng)域。自動化側(cè)重于利用技術(shù)手段實(shí)現(xiàn)流程、任務(wù)的自主執(zhí)行，提高效率與準(zhǔn)確性。而機(jī)器學(xué)習(xí)，作為人工智能的一個分支，專注于讓計算機(jī)系統(tǒng)通過數(shù)據(jù)學(xué)習(xí)并改進(jìn)其性能，無需進(jìn)行明確編程。機(jī)器學(xué)習(xí)算法能夠識別數(shù)據(jù)中的模式與規(guī)律，從而做出預(yù)測或決策，為自動化過程提供智能支持。兩者結(jié)合，推動了從制造到數(shù)據(jù)分析等多個領(lǐng)域的智能化、高效化發(fā)展。

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重磅！攜手浙大，賽默飛自動化大力推動國內(nèi)合成生物學(xué)研究

眾所周知，合成生物學(xué)研究涉及許多高通量和高精度的實(shí)驗(yàn)流程，因此對自動化的需求較高。

賽默飛世爾科技實(shí)驗(yàn)室產(chǎn)品 680
2022-08-02
iBioFoundry合成生物學(xué)自動化系統(tǒng) 自動化生物酶篩選系統(tǒng) DNA組裝技術(shù)研究平臺自動化與機(jī)器學(xué)習(xí)

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自動化與機(jī)器學(xué)習(xí)問答

2022-03-21 15:25:38直播預(yù)告：掌握Aivia 機(jī)器學(xué)習(xí)，輕松精準(zhǔn)分析各類圖像: 內(nèi)容簡介：研究者辛苦得到了實(shí)驗(yàn)樣本，但是拍出的圖片可能有背景太高、人工分析繁瑣等的問題。這些不太理想的2D到5D（xy→xyztl）的data，可以使用Aivia機(jī)器學(xué)習(xí)功能進(jìn)行分析——pixel classifier 和object classifier 工具可以迅速地自動識別感興趣結(jié)構(gòu)，并進(jìn)行計數(shù)、位置關(guān)系、信號強(qiáng)度等分析，幫助研究者快速得到可靠的結(jié)果，從數(shù)據(jù)中發(fā)現(xiàn)隱藏的細(xì)節(jié)。這次培訓(xùn)我們選取了三個有代表性的圖片，來向大家展示Aivia的強(qiáng)大數(shù)據(jù)分析能力。1、高背景厚樣本2、結(jié)構(gòu)不規(guī)則的熒光圖像3、依賴于手動分析的電鏡圖片數(shù)據(jù)來源：廈門大學(xué)生物醫(yī)學(xué)儀器共享平臺，電鏡室姚路明博士、吳彩明博士掃碼報名即可觀看直播時間：2022年4月19日 14:30-15:30 主講包沈源博士畢業(yè)于華東理工大學(xué)先進(jìn)材料與制備技術(shù)專業(yè)。博士后工作于華東理工大學(xué)物理化學(xué)專業(yè)。現(xiàn)任職于徠卡顯微系統(tǒng)材料電鏡制樣工程師，長期從事材料制備和電鏡圖像分析工作，從理論基礎(chǔ)到分析表征都具有豐富經(jīng)驗(yàn)。

2023-01-10 12:42:52貝克曼庫爾特Biomek NGeniuS與IDT文庫制備自動化解決方案: 隨著基因組測序和數(shù)據(jù)分析方法的廣泛普及，越來越多的實(shí)驗(yàn)室正在探索下一代測序（Next-Generation Sequencing，NGS）作為研究工具的可行性。然而，NGS文庫的手動制備過程單調(diào)乏味，根據(jù)所構(gòu)建文庫的類型而異，耗時從數(shù)小時到數(shù)天時間不等，并且操作過程中必須小心謹(jǐn)慎，以避免人工出錯導(dǎo)致的制備失敗，浪費(fèi)寶貴樣本。Biomek NGeniuS系統(tǒng)是一款全自動文庫制備系統(tǒng)，幫助我們從第一步即確保正確無誤。DNA樣品上機(jī)，撥動轉(zhuǎn)盤，按下按鈕，運(yùn)行過程無需值守，每批次可支持運(yùn)行4-24任意數(shù)量的樣品，是實(shí)驗(yàn)室追求靈活性和自動化的理想之選。圖1 Biomek NGeniuS全自動文庫制備系統(tǒng)IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit 便是一款支持自動化的試劑盒。該試劑盒提供高一致性的文庫制備方法，獨(dú)特的兩步連接法能夠有效抑制接頭二聚體和模板DNA自連，因而可有效提高文庫轉(zhuǎn)換率，尤其適用于cfDNA和FFPE等低質(zhì)量樣品，有助于研究人員發(fā)現(xiàn)和表征腫瘤樣品中出現(xiàn)的低頻變異位點(diǎn)。圖2 IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit工作流程我們使用Biomek NGeniuS系統(tǒng)對三種不同類型的樣品，cfDNA、FFPE和gDNA，分別構(gòu)建24個、10個和4個文庫。cfDNA 樣品所得文庫平均濃度為16.67ng/μL。cfDNA樣品連接后擴(kuò)增片段平均長度為362bp，長度分布一致且呈正態(tài)。與參考基因組相比，該樣品組從NGeniuS實(shí)驗(yàn)中獲得的所有文庫比對率為99.49%，配對的reads比對到參考基因組的比對率為99.84%。23份樣品中reads平均重復(fù)率為0.46%。圖3 以cfDNA為起始樣品，在Biomek NGeniuS 系統(tǒng)上使用IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit所制備文庫的分析結(jié)果。FFPE樣品構(gòu)建的文庫平均片段長度為378 bp，長度呈正態(tài)分布。與參考基因組相比，該樣品組從NGeniuS實(shí)驗(yàn)中獲得的所有文庫比對率為99.8%，配對的reads比對到參考基因組的比對率為99.84%。10份樣品中reads平均重復(fù)率為0.37%。圖4 以FFPE DNA為起始樣品，在Biomek NGeniuS 系統(tǒng)上使用IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit所制備文庫的分析結(jié)果。gDNA樣品制備的文庫平均片段長度為391bp，長度分布與 IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit 的預(yù)期一致。與參考基因組相比，該樣品組從 NGeniuS實(shí)驗(yàn)中獲得的所有文庫的比對率為99.2%，配對的reads比對到參考基因組的比對率為99.3%。3份樣品中reads平均重復(fù)率為0.56%。圖5 以gDNA為起始樣品，在Biomek NGeniuS 系統(tǒng)上使用IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit所制備文庫的分析結(jié)果。在Biomek NGeniuS全自動文庫制備系統(tǒng)上使用IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep kit構(gòu)建文庫，所得文庫片段大小分布一致，并符合IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit說明書建議的文庫大小范圍。對三種不同濃度的樣品重復(fù)進(jìn)行測序，結(jié)果表明，平均文庫大小為362~391bp。所獲文庫比對率>99.2%，配對的reads比對到參考基因組的比對率>99.3%，重復(fù)率

2023-05-29 09:51:53數(shù)據(jù)可視化，分析自動化: Chromeleon CDS隨著工業(yè)4.0的發(fā)展，各行各業(yè)都面臨著數(shù)字化轉(zhuǎn)型、智能化生產(chǎn)的挑戰(zhàn)和機(jī)遇，尋求建立更加靈活的數(shù)字化產(chǎn)品與服務(wù)的生產(chǎn)模式，打破傳統(tǒng)行業(yè)界限，實(shí)現(xiàn)多領(lǐng)域合作和發(fā)展。而在以色譜儀器為主導(dǎo)的實(shí)驗(yàn)室中，色譜數(shù)據(jù)系統(tǒng)（CDS）作為關(guān)鍵的軟件工具同樣被寄予了更高的期望。Chromeleon CDS作為業(yè)界領(lǐng)先的色譜數(shù)據(jù)系統(tǒng)，從儀器控制、數(shù)據(jù)采集到分析處理、報告，提供了多樣化的智能工具，不僅幫助使用者優(yōu)化操作流程，還可以直接通過圖形化功能實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)和信息的可視化深度挖掘。（點(diǎn)擊查看大圖）一鍵生成實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)分析圖表日常實(shí)驗(yàn)過程中，在Chromeleon的處理方法和報告中可一鍵生成實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的分析圖表，例如，進(jìn)樣間組分的保留時間變化，峰面積、含量差異等，或者直接調(diào)用軟件中分析測試模版，如含量均勻度，包含數(shù)據(jù)分析圖的報告。圖表顯示的數(shù)據(jù)范圍、格式均可根據(jù)需要進(jìn)行自定義設(shè)置，比如僅顯示序列中測試樣品的結(jié)果。同時，可以自動計算統(tǒng)計值結(jié)果，包括：偏差σ上下限度、平均值、線性趨勢以及線性函數(shù)方程等?；贑hromeleon動態(tài)鏈接的特點(diǎn)，分析圖中的數(shù)據(jù)點(diǎn)和對應(yīng)的數(shù)據(jù)對象及結(jié)果自動關(guān)聯(lián)，聯(lián)動查看，幫助操作者更加直觀準(zhǔn)確的分析數(shù)據(jù)?；瑒硬榭锤?nbsp;歷史數(shù)據(jù)的趨勢分析和回顧分析對于歷史數(shù)據(jù)的趨勢分析和回顧分析能為實(shí)驗(yàn)工作提供可靠的數(shù)據(jù)支持。通過Chromeleon數(shù)據(jù)查詢結(jié)合圖表分析功能，可以實(shí)現(xiàn)在大量數(shù)據(jù)中進(jìn)行快速分析。首先，基于Chromeleon內(nèi)置的搜索編輯器，設(shè)置全變量范圍的搜索條件，以及多條件間“and”或“or”的邏輯組合，結(jié)合比較運(yùn)算符的選擇可實(shí)現(xiàn)精確或模糊查找，將符合條件的進(jìn)樣全部羅列顯示，這些數(shù)據(jù)可能來自于不同的測試時間，不同的路徑或不同的操作者，但都可以一鍵整合到虛擬序列中進(jìn)行共性差異化分析，自動生成趨勢分析圖，根據(jù)需要選擇圖表顯示內(nèi)容。并且軟件中提供了多樣化圖表類型的選擇，滿足不同實(shí)驗(yàn)室的查看需求。滑動查看更多進(jìn)一步擴(kuò)展實(shí)驗(yàn)室工作效率統(tǒng)計在Chromeleon中，圖形化分析不僅應(yīng)用于實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)，還能進(jìn)一步擴(kuò)展到實(shí)驗(yàn)室工作效率統(tǒng)計，同樣通過查詢先鎖定需要統(tǒng)計的數(shù)據(jù)范圍，再結(jié)合靈活的報告編輯對目標(biāo)數(shù)據(jù)進(jìn)行自動計算，生成統(tǒng)計表格，基于統(tǒng)計結(jié)果一鍵生成圖表。查詢創(chuàng)建后可隨時啟用執(zhí)行，隨著數(shù)據(jù)的更新，查詢結(jié)果以及所關(guān)聯(lián)的統(tǒng)計結(jié)果會自動更新，從而實(shí)現(xiàn)了工作效率的實(shí)時統(tǒng)計。內(nèi)容基于自定義編輯可包括但不限于：儀器使用（占用）率、人員工作量、環(huán)比周期間對比等；在色譜軟件內(nèi)輕松實(shí)現(xiàn)實(shí)驗(yàn)室信息 Dashboard 的靈活運(yùn)用，幫助管理者實(shí)時把控實(shí)驗(yàn)室運(yùn)營狀態(tài)，及時合理調(diào)配資源?；瑒硬榭锤?nbsp; 總結(jié) 自動化圖表作為Chromeleon CDS軟件內(nèi)置的標(biāo)準(zhǔn)功能，直接將原始數(shù)據(jù)和結(jié)果轉(zhuǎn)化至圖形化分析，避免了使用者借助額外的程序所帶來的數(shù)據(jù)一致性風(fēng)險。同時結(jié)合軟件的數(shù)據(jù)查詢和靈活的報告編輯，將圖形化分析從數(shù)據(jù)擴(kuò)展到實(shí)驗(yàn)室管理，滿足各行業(yè)實(shí)驗(yàn)室自動化分析的多樣化需求，迎合法規(guī)趨勢，進(jìn)一步確保實(shí)驗(yàn)室數(shù)據(jù)流的及時jingzhun交付，為實(shí)驗(yàn)室數(shù)字化轉(zhuǎn)型和智能化發(fā)展奠定基礎(chǔ)。

2023-04-12 15:12:46數(shù)據(jù)可視化，分析自動化: 隨著工業(yè)4.0的發(fā)展，各行各業(yè)都面臨著數(shù)字化轉(zhuǎn)型、智能化生產(chǎn)的挑戰(zhàn)和機(jī)遇，尋求建立更加靈活的數(shù)字化產(chǎn)品與服務(wù)的生產(chǎn)模式，打破傳統(tǒng)行業(yè)界限，實(shí)現(xiàn)多領(lǐng)域合作和發(fā)展。而在以色譜儀器為主導(dǎo)的實(shí)驗(yàn)室中，色譜數(shù)據(jù)系統(tǒng)（CDS）作為關(guān)鍵的軟件工具同樣被寄予了更高的期望。Chromeleon CDS作為業(yè)界領(lǐng)先的色譜數(shù)據(jù)系統(tǒng)，從儀器控制、數(shù)據(jù)采集到分析處理、報告，提供了多樣化的智能工具，不僅幫助使用者優(yōu)化操作流程，還可以直接通過圖形化功能實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)和信息的可視化深度挖掘。一鍵生成實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)分析圖表日常實(shí)驗(yàn)過程中，在Chromeleon的處理方法和報告中可一鍵生成實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的分析圖表，例如，進(jìn)樣間組分的保留時間變化，峰面積、含量差異等，或者直接調(diào)用軟件中分析測試模版，如含量均勻度，包含數(shù)據(jù)分析圖的報告。圖表顯示的數(shù)據(jù)范圍、格式均可根據(jù)需要進(jìn)行自定義設(shè)置，比如僅顯示序列中測試樣品的結(jié)果。同時，可以自動計算統(tǒng)計值結(jié)果，包括：偏差σ上下限度、平均值、線性趨勢以及線性函數(shù)方程等?；贑hromeleon動態(tài)鏈接的特點(diǎn)，分析圖中的數(shù)據(jù)點(diǎn)和對應(yīng)的數(shù)據(jù)對象及結(jié)果自動關(guān)聯(lián)，聯(lián)動查看，幫助操作者更加直觀準(zhǔn)確的分析數(shù)據(jù)。進(jìn)一步擴(kuò)展實(shí)驗(yàn)室工作效率統(tǒng)計在Chromeleon中，圖形化分析不僅應(yīng)用于實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)，還能進(jìn)一步擴(kuò)展到實(shí)驗(yàn)室工作效率統(tǒng)計，同樣通過查詢先鎖定需要統(tǒng)計的數(shù)據(jù)范圍，再結(jié)合靈活的報告編輯對目標(biāo)數(shù)據(jù)進(jìn)行自動計算，生成統(tǒng)計表格，基于統(tǒng)計結(jié)果一鍵生成圖表。查詢創(chuàng)建后可隨時啟用執(zhí)行，隨著數(shù)據(jù)的更新，查詢結(jié)果以及所關(guān)聯(lián)的統(tǒng)計結(jié)果會自動更新，從而實(shí)現(xiàn)了工作效率的實(shí)時統(tǒng)計。內(nèi)容基于自定義編輯可包括但不限于：儀器使用（占用）率、人員工作量、環(huán)比周期間對比等；在色譜軟件內(nèi)輕松實(shí)現(xiàn)實(shí)驗(yàn)室信息 Dashboard 的靈活運(yùn)用，幫助管理者實(shí)時把控實(shí)驗(yàn)室運(yùn)營狀態(tài)，及時合理調(diào)配資源。總結(jié) 自動化圖表作為Chromeleon CDS軟件內(nèi)置的標(biāo)準(zhǔn)功能，直接將原始數(shù)據(jù)和結(jié)果轉(zhuǎn)化至圖形化分析，避免了使用者借助額外的程序所帶來的數(shù)據(jù)一致性風(fēng)險。同時結(jié)合軟件的數(shù)據(jù)查詢和靈活的報告編輯，將圖形化分析從數(shù)據(jù)擴(kuò)展到實(shí)驗(yàn)室管理，滿足各行業(yè)實(shí)驗(yàn)室自動化分析的多樣化需求，迎合法規(guī)趨勢，進(jìn)一步確保實(shí)驗(yàn)室數(shù)據(jù)流的及時精準(zhǔn)交付，為實(shí)驗(yàn)室數(shù)字化轉(zhuǎn)型和智能化發(fā)展奠定基礎(chǔ)。