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儀器網(wǎng)/ 應(yīng)用方案/ 植物根系表型研究新技術(shù)——高光譜成像技術(shù)

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根系是植物的重要組成部分,植物吸收土壤中的水分與養(yǎng)分全依賴根系,所以根系的研究對于植物各學(xué)科來說都關(guān)重要,但是根系分布在地面以下,而且是動態(tài)生長的,這就給根系的監(jiān)測帶來了很多困難?!禢ature》雜志于2004年6月出版了一本專輯認(rèn)為“人類對自己腳下土壤的了解遠(yuǎn)遠(yuǎn)不及對宇宙的了解”,更是佐證了地下生態(tài)學(xué)的研究難度之大。所以,根系研究方法的選擇,相對于對地上部分而言對研究結(jié)果具有更大的影響。

廣大科研工作者為了研究根系,應(yīng)用了很多方法,從傳統(tǒng)的挖掘法、根鉆法、玻璃壁法、容器法等等,到現(xiàn)代的根窗法、微根管法等等,取得了很多科研成果。隨著科技的發(fā)展,越來越多的現(xiàn)代高精尖技術(shù)應(yīng)用到根系研究中來,高光譜成像技術(shù)就是其中一種,它集光譜和圖像為一體,含有海量的光譜信息和空間信息,這些信息體現(xiàn)了植物各種器官、組織的諸多表型特性,該技術(shù)圖譜合一的特性使其在根系表型方面具有較大潛力。

奧地利自然資源與生命科學(xué)大學(xué)(University of Natural Resources and Life Sciences)作物科學(xué)系的Gernot Bodner等利用高光譜成像系統(tǒng)對根系進(jìn)行成像研究,取得了前瞻性的成果。

該研究以硬粒小麥(Triticum durum)為研究對象,將小麥種植在一面透明的根盒內(nèi),使用Specim 公司的ImSpector N17E(完整系統(tǒng)型號為SPECIM FX17)高光譜成像系統(tǒng),該系統(tǒng)能夠以5nm的光譜分辨率(900nm-1700 nm之間256個(gè)光譜帶)進(jìn)行成像,空間分辨率達(dá)0.1mm,定期通過根窗透明面對根系成像分析。

原始光譜圖像經(jīng)過一系列算法處理后得到目標(biāo)根系圖像,隨后進(jìn)行閾值分割、模糊聚類等模型分析,得到根系的形態(tài)學(xué)數(shù)據(jù)。

傳統(tǒng)的RGB成像技術(shù)是利用顏色識別根系,前提是根系和土壤之間要有比較明顯的色差,但實(shí)際根系生長在土壤中,顏色差異并不明顯,這樣根系識別可能會造成比較大的誤差,RGB成像技術(shù)使用就會受限。Gernot Bodner將高光譜成像技術(shù)和傳統(tǒng)的RGB成像技術(shù)進(jìn)行了對比,顯示高光譜成像技術(shù)基于光譜特征在根系識別上的明顯優(yōu)勢,并且對高光譜成像另一項(xiàng)無可比擬的功能進(jìn)行了初步探討——即光譜特征對于根系生化特性的識別(例如細(xì)根發(fā)生、成熟、衰老、死亡的周轉(zhuǎn)過程;例如根際分泌物成分的變化等),顯示了高光譜成像技術(shù)在根系研究領(lǐng)域的巨大潛力。

1649-1447 nm光譜反射率和根系衰變過程的關(guān)系

易科泰生態(tài)技術(shù)公司為各領(lǐng)域應(yīng)用提供高光譜成像技術(shù)全面解決方案:

ü Specim IQ 手持式VNIR高光譜成像儀

ü Specim FX10/FX17輕便型高光譜成像儀

ü Specim AisaIBIS葉綠素?zé)晒飧吖庾V成像儀

ü sisuCHEMA高光譜成像分析系統(tǒng)

ü SpectraScan高光譜成像分析系統(tǒng)

廣泛應(yīng)用于:

? 植物/作物表型組學(xué)研究分析

? 根系分析

蛋白組學(xué)研究分析

? 代謝組學(xué)研究分析

? 藻類表型研究分析

作物育種與種子品質(zhì)檢測

? 植物/作物脅迫生理響應(yīng)

? 作物病理學(xué)分析與病原檢測

? 食品檢測

中藥成分分析與品質(zhì)檢測

? 海洋科學(xué)研究

地質(zhì)地球科學(xué)、生態(tài)與環(huán)境科學(xué)及工業(yè)領(lǐng)域等?

?


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