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儀器網(wǎng)/ 應(yīng)用方案/ 上新!一種新型固相烷基化試劑,助力高效處理蛋白組學(xué)樣本

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背景

蛋白質(zhì)組學(xué)本質(zhì)上指的是在大規(guī)模水平上研究蛋白質(zhì)的特征,包括蛋白質(zhì)的表達(dá)水平、亞細(xì)胞定位、翻譯后的修飾、蛋白與蛋白相互作用等,由此獲得蛋白質(zhì)水平上的關(guān)于疾病發(fā)生、細(xì)胞代謝、生長發(fā)育以及各種脅迫反應(yīng)等過程的整體而全面的知識。


隨著生物質(zhì)譜技術(shù)迅速發(fā)展,質(zhì)譜技術(shù)已經(jīng)逐漸成為了蛋白質(zhì)組學(xué)分析的主流技術(shù)。質(zhì)譜儀器具有高靈敏度、高分辨率等特點,樣本前處理的質(zhì)量和可重復(fù)性顯著影響質(zhì)譜儀的分離和鑒定能力。


蛋白質(zhì)組學(xué)樣本前處理流程復(fù)雜、處理時間長(傳統(tǒng)蛋白質(zhì)組前處理需過夜),造成了樣品前處理不穩(wěn)定、樣品質(zhì)量參差不齊,重現(xiàn)性差等問題,急需一種高效、高回收率、抗干擾能力強(qiáng)的蛋白質(zhì)組學(xué)分析的前處理方法。



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蛋白質(zhì)組學(xué)分析流程


產(chǎn)品介紹

??萍瘓F(tuán)全新推出的蛋白組學(xué)樣本前處理試劑盒,其中的關(guān)鍵組分是一種新型固相烷基化試劑,與傳統(tǒng)的烷基化試劑相比,采用新型固相烷基化試劑,蛋白質(zhì)可與其它小分子(如糖、鹽、表面活性劑、脂類等)實現(xiàn)快速分離,提高蛋白質(zhì)的純度,顯著降低樣本復(fù)雜程度。同時,試劑表面親水性較好,可顯著提高蛋白質(zhì)或酶解產(chǎn)物的回收率。產(chǎn)品適用于處理各種來源的蛋白質(zhì)組樣品,如細(xì)胞、血漿、細(xì)菌、腫瘤組織等



睿科蛋白組學(xué)樣本前處理試劑盒

(新型固相烷基化試劑)



產(chǎn)品特點

一、高效

操作簡便、高效,一站式覆蓋蛋白質(zhì)組提取到消化的所有步驟


二、高回收率

蛋白質(zhì)組處理回收率高,可滿足納克至微克級別蛋白質(zhì)組樣品的處理需求


三、抗干擾

抗干擾能力強(qiáng),對樣品中表面活性劑、有機(jī)試劑、各種酸堿緩沖溶液等均可耐受


四、適配自動化

除手動操作外,可適配??谱詣踊疤幚碓O(shè)備

產(chǎn)品測試數(shù)據(jù)

使用試劑盒對293T細(xì)胞處理后進(jìn)行重復(fù)性驗證


材料:用 6M 鹽酸胍超聲裂解 293T 細(xì)胞離心獲得

實驗方法:隨機(jī)選取2批次試劑,將同一樣品分為6份,每批次試劑各做3個平行樣品,使用蛋白組學(xué)樣本前處理試劑盒流程處理后,將樣品進(jìn)行Q Exactive質(zhì)譜檢測。


Q Exactive質(zhì)譜檢測結(jié)果如下:


表1:不同批次前處理試劑處理293T蛋白樣品QE質(zhì)譜檢測蛋白數(shù)及零漏切率


圖1:不同批次試劑處理293T蛋白樣品質(zhì)譜檢測重復(fù)性Pearson Correlation Coefficient均>0.99


使用試劑盒對E. coli 樣本處理后進(jìn)行重復(fù)性驗證


材料:用 6M 鹽酸胍超聲解 E. coli 離心獲得

實驗方法:隨機(jī)選取2批次試劑,將同一樣品分為6份,每批次試劑各做3個平行樣品,使用蛋白組學(xué)樣本前處理試劑盒流程處理后,將樣品進(jìn)行Q Exactive質(zhì)譜檢測。


Q Exactive質(zhì)譜檢測結(jié)果如下:


表2:不同批次前處理試劑處理E.coli蛋白樣品QE質(zhì)譜檢測蛋白數(shù)及零漏切率

圖2:不同批次試劑處理E.coli 蛋白樣品質(zhì)譜檢測重復(fù)性Pearson Correlation Coefficient均>0.99


實驗總結(jié)

對293T 細(xì)胞和E. coli 樣本分別用兩批次試劑進(jìn)行前處理,批間的重復(fù)性測試表明可檢測到的蛋白數(shù)及零漏切率基本一致,達(dá)到預(yù)期要求;檢測結(jié)果皮爾斯相關(guān)系數(shù)介于0.991-0.996之間。說明不同批次試劑實驗結(jié)果重復(fù)性好。


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