手工測序以及自動測序均屬于DNA序列測定，手工測序可分為maxam-gilbert化學(xué)降解法與sanger雙脫氧鏈終止法，事實上，目前dna序列分析的主流是自動測序。373型、377型、310型、3700和3100型等多種型號DNA測序儀均已經(jīng)被美國pe abi公司生產(chǎn)出來了，在這幾款DNA測序儀中，臨床檢測實驗室使用Z多的一種型號要屬310型。

引物對測序質(zhì)量的影響

（1）引物二聚體

現(xiàn)象：后面比較正常，前面高于100bp，有較高的噪音

原因：沒有將引物二聚體去除干凈。

方法：將膠割掉，進行純化。

（2）雙引物結(jié)合

現(xiàn)象：有兩個峰從一開始就出現(xiàn)，和非單克隆有區(qū)別。

原因：有兩個引物結(jié)合位點在模板上，同時結(jié)合兩個引物。

方法：對兩個引物重新設(shè)計

（3）模板沒有引物結(jié)合位點

現(xiàn)象：特異性的峰圖不存在。

原因：引物不能和模板結(jié)合。

方法：對引物重新設(shè)計

（4）引物合成時多或者少一個堿基

現(xiàn)象：有相同熒光信號的小尾巴位于每個峰后面。

原因：引物合成時多或者少一個堿基

方法：將引物重新合成。

（5）引物不純

現(xiàn)象：整個峰圖均有較高的噪音

原因：有較多雜質(zhì)在引物中，引物具有比較低的純度。

方法：脫鹽純化的引物具有比較低的純度，不適合測序，然而可以用來做普通pcr；測序引物Z好使用PAGE或者HPLC純化過的。

在DNA測序商業(yè)化的浪潮下，完成5個以上有重大經(jīng)濟價值的基因或蛋白的轉(zhuǎn)化應(yīng)用、約500個新的功能基因的發(fā)現(xiàn)，10000種微生物、100種動植物基因組測序等目標在我國《生物產(chǎn)業(yè)發(fā)展“十二五”規(guī)劃》中被提出。根據(jù)30-50萬元為微生物進行“基因組完成圖”測序的大致費用而言，千億元級別為DNA測序帶來的市場容量，其還只是DNA測序商業(yè)應(yīng)用市場的冰山一角。

21世紀di一個十年里，DNA測序與生物云計算、個性化分子診斷、基因芯片、人類基因組計劃等等吸引無數(shù)眼球的熱門詞匯息息相關(guān)。在創(chuàng)意新天地里，生物技術(shù)和信息技術(shù)相互融合，相互作用，相互影響。