手工測(cè)序以及自動(dòng)測(cè)序均屬于DNA序列測(cè)定，手工測(cè)序可分為maxam-gilbert化學(xué)降解法與sanger雙脫氧鏈終止法，事實(shí)上，目前dna序列分析的主流是自動(dòng)測(cè)序。373型、377型、310型、3700和3100型等多種型號(hào)DNA測(cè)序儀均已經(jīng)被美國(guó)pe abi公司生產(chǎn)出來了，在這幾款DNA測(cè)序儀中，臨床檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室使用Z多的一種型號(hào)要屬310型。

純化對(duì)測(cè)序質(zhì)量的影響

（1）熒光物質(zhì)污染

現(xiàn)象：存在異常高的紅色峰。

原因軟件將紅色的未知大分子熒光物質(zhì)污染誤認(rèn)為紅色峰。

方法：對(duì)膠引導(dǎo)塊、針筒進(jìn)行更換；對(duì)水、緩沖液、甲酰胺、測(cè)序膠、毛細(xì)管依次進(jìn)行更換。

（2）釘子峰

現(xiàn)象：有峰形銳利的尖峰四色并存突然拔起。

原因：有氣泡、灰塵、尿素結(jié)晶存在于毛細(xì)管中，全反射激光。

方法：

使用純化干凈的樣品；

當(dāng)有尿素結(jié)晶存在于膠內(nèi)的時(shí)候，留心不能將其往注射器內(nèi)吸入。

保持檢查窗口以及毛細(xì)管清潔。

先將樣品離心然后再上樣。

防止氣泡在灌膠時(shí)產(chǎn)生。

（3）有機(jī)物污染

現(xiàn)象：基線突然從高處下降。

原因：在毛細(xì)管中有有機(jī)物進(jìn)入，使一定波長(zhǎng)的熒光產(chǎn)生，將基線抬高。

方法：對(duì)膠引導(dǎo)塊、針筒進(jìn)行更換；對(duì)水、緩沖液、甲酰胺、測(cè)序膠、毛細(xì)管依次進(jìn)行更換。

（4）染色峰

特點(diǎn)：在序列的前100bp左右有殘余的A、T、C、G4個(gè)BigDye染料峰，其對(duì)其他序列的可靠性不會(huì)產(chǎn)生影響。

（5）酒精峰

特點(diǎn)：在序列的200bp-300bp堿基之間有酒精峰，透明抬高圖譜，其同樣不會(huì)對(duì)其它序列的可靠性產(chǎn)生影響。

DNA測(cè)序方法的飛速發(fā)展除了使人類的全基因組序列為我們所知曉，而且還使得我們充分掌握了小麥、水稻、家蠶以及很多細(xì)菌。此時(shí)，科學(xué)家們的新目標(biāo)也就變成了對(duì)一段序列所代表的生物學(xué)意義的探明。用于編碼基因僅僅只有1.5%存在于核苷酸組成的龐大序列中，除此以外，扮演調(diào)控基因表達(dá)的角色有少許，其中功能未知的“垃圾DNA”占絕大部分，這一發(fā)現(xiàn)是科學(xué)家通過分析人類基因組序列獲得的。由表面可知，人與人之間有著繽紛復(fù)雜的不同之處，然而，深入到DNA水平上，卻僅僅存在0.1%基因編碼序列上的不同。大多數(shù)時(shí)候，人與人之間在一條序列上的差異只有一個(gè)核苷酸，科學(xué)家將這種現(xiàn)象命名為單核苷酸多態(tài)性（Single Nucleotide Polymorphisms，簡(jiǎn)稱SNPs）。