毛細管電泳儀將高壓直流電場當作驅動力，將彈性石英毛細管當作分離通道，以樣品中各組分的淌度（單位電場強度下的遷移速度）和分配行為的不同作為依據(jù)來分離各組分。

特點

1.廣泛的應用范圍（由無機離子至整個細胞）

2.良好的重現(xiàn)性

3.較高的進樣準確性

4.效率高（每米塔板數(shù)為十萬、百萬、千萬）

5.速度快（幾十秒內完成）

6.靈敏度高

7.樣品用量少

應用領域

1.生物分子

對于如蛋白質、核酸、糖類等生物大分子的檢測，CE具有較大的優(yōu)勢，同時在檢測生物小分子或代謝中間產(chǎn)物時也得到廣泛的使用。

2.手性拆分

手性拆分時可以使用CE，如分離小分子、藥物分子的對映體或氨基酸與比較和評價手性拆分劑。

3.環(huán)境監(jiān)測

毛細管電泳法能夠直接進樣未經(jīng)處理的污染水體，從而能夠對水體中的抗生素、激素或藥物以及重金屬離子快速的檢測。

4.醫(yī)學及臨床檢驗

患者的病理檢測、疾病診斷、疾病機理分析及體內代謝物分析等均為毛細管電泳在醫(yī)學及臨床檢驗中的應用。體液或組織中的藥物、疾病相關標志物和離子等都是分析的對象。

5.藥物及天然產(chǎn)物

合成藥物、蛋白藥物及植物有效成分均為CE分析檢測的藥物或天然產(chǎn)物。

6.食品及農(nóng)產(chǎn)品

CE用于食品安全和農(nóng)產(chǎn)品檢測的方法隨著對食品安全問題的越來越重視也逐年增多。食品添加劑、食品中某些組分或有害成分的檢測為食品安全檢測的主要檢測部分。農(nóng)藥殘留物和農(nóng)產(chǎn)品有效成分檢測都屬于農(nóng)產(chǎn)品檢測。