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DNA模板、困難模板以及機(jī)器對(duì)測(cè)序質(zhì)量的影響

更新時(shí)間:2025-10-15 05:56:36 類(lèi)型: 閱讀量:1454
導(dǎo)讀:手工測(cè)序以及自動(dòng)測(cè)序均屬于DNA序列測(cè)定,手工測(cè)序可分為maxam-gilbert化學(xué)降解法與sanger雙脫氧鏈終止法,事實(shí)上,目前dna序列分析的主流是自動(dòng)測(cè)序。

手工測(cè)序以及自動(dòng)測(cè)序均屬于DNA序列測(cè)定,手工測(cè)序可分為maxam-gilbert化學(xué)降解法與sanger雙脫氧鏈終止法,事實(shí)上,目前dna序列分析的主流是自動(dòng)測(cè)序。373型、377型、310型、3700和3100型等多種型號(hào)DNA測(cè)序儀均已經(jīng)被美國(guó)pe abi公司生產(chǎn)出來(lái)了,在這幾款DNA測(cè)序儀中,臨床檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室使用Z多的一種型號(hào)要屬310型。


DNA模板、困難模板以及機(jī)器對(duì)測(cè)序質(zhì)量的影響

1、DNA模板

(1)雜合子

和正常峰值相比,雜合子信號(hào)處只有其一半的強(qiáng)度大小,同時(shí)大小相等。


(2)非單克隆

特點(diǎn):右邊全部如同雜合子,左邊非常清晰。

原因:挑克隆的時(shí),混合了兩個(gè)質(zhì)粒。

方法:將克隆重新挑,將DNA重新制作。


3.jpg


(3)儀碼突變

由于點(diǎn)突變導(dǎo)致在450bp的地方儀碼,又由于點(diǎn)突變?cè)?28bp的地方恢復(fù)。


(4)模板不純

現(xiàn)象:有其它顏色位于每個(gè)峰下面。

原因;測(cè)序時(shí)pcr助貸混合雜帶。

方法:凝膠電泳將主帶回收,將測(cè)序重新進(jìn)行。


(5)點(diǎn)突變

若有堿基在模板上突變,那么測(cè)序圖像中其它位點(diǎn)通常均是單一峰形,然后有重疊峰突然出現(xiàn)在某一位點(diǎn)。


2、機(jī)器影響

(1)毛細(xì)管

(2)其它


3、困難模板

(1)重復(fù)序列

(2)回文結(jié)構(gòu)

(3)高GC

(4)特殊結(jié)構(gòu)

(5)Ploy結(jié)構(gòu)


當(dāng)今世界,如果要評(píng)說(shuō)哪個(gè)地方會(huì)誕生傳奇,那么必定是高科技領(lǐng)域,從前DNA測(cè)序還作為一個(gè)前沿技術(shù)令人高山仰止,如今卻成為一個(gè)生命科學(xué)常規(guī)技術(shù),迅速地得到普及,目前為止,能夠和電腦芯片運(yùn)算能力增強(qiáng)的速度相媲美的也就只有DNA測(cè)序成本下降的速度,DNA測(cè)序的發(fā)展除了在降低成本方面得到了體現(xiàn),還在高通量測(cè)序大幅度提高了工作效率方面得以表現(xiàn),其鋪平了DNA測(cè)序產(chǎn)業(yè)化的道路。


從前將致病相關(guān)基因從數(shù)萬(wàn)個(gè)人類(lèi)基因中篩選出來(lái)猶如大海撈針。為了對(duì)這個(gè)基因究竟在何處想方設(shè)法的定位,科學(xué)家需要對(duì)同一個(gè)家族的多位患者的標(biāo)本進(jìn)行獲取。設(shè)計(jì)高通量藥物,致病或抑病基因的鑒定、疾病易感人群的篩查甚至個(gè)性化YL由于具備了如今快速測(cè)序技術(shù)和SNPs這個(gè)強(qiáng)有力的工具而不再是需要向往的事。


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