本文由 賽默飛色譜及質(zhì)譜 整理匯編

2018-08-10 10:58 663閱讀次數(shù)

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• 賽默飛極ng確修飾位點(diǎn)譜圖庫(kù)的建立與磷酸化 蛋白質(zhì)組的 DIA 解析

  數(shù)據(jù)非依賴(lài)采集（Data-IndependentAcquisition,DIA）是當(dāng)前Z熱門(mén)的質(zhì)譜采集技術(shù)之一，它以非目標(biāo)的方式將質(zhì)量范圍分為若干窗口，依次并循環(huán)采集窗口內(nèi)所有母離子的二級(jí)碎片[1,2]。DIA與SRM類(lèi)似，也是基于子離子（transition）定量，相比傳統(tǒng)蛋白質(zhì)組學(xué)定量方法具有更好的選擇性和更高的準(zhǔn)確度。然而，目前DIA在翻譯后修飾分析上仍有較大瓶頸。DIA依賴(lài)于DDA建立譜圖庫(kù)，而DDA數(shù)據(jù)在搜庫(kù)鑒定時(shí)，修飾位點(diǎn)定位錯(cuò)誤的概率較高，特別是磷酸化修飾發(fā)生在常見(jiàn)的S/T/Y上，若肽段含有2個(gè)或以上位置接近的S/T/Y，位點(diǎn)就容易找錯(cuò)。將含有錯(cuò)誤位點(diǎn)信息的鑒定結(jié)果作為譜圖庫(kù)，就會(huì)導(dǎo)致翻譯后修飾DIA解析結(jié)果的不可靠[3]。因此，DIA尚難用于大規(guī)模的翻譯后修飾樣本分析。針對(duì)修飾位點(diǎn)的打分算法使修飾位點(diǎn)的定位更加準(zhǔn)確，ProteomeDiscoverer軟件中整合的phosphoRS/ptmRS模塊[4]和MaxQuant軟件的算法[5]都可以實(shí)現(xiàn)位點(diǎn)可信度（SiteProbability）的計(jì)算，從而獲得可靠的位點(diǎn)定位信息。本文基于上述軟件對(duì)翻譯后修飾DDA數(shù)據(jù)進(jìn)行位點(diǎn)可信度分析，篩選具有準(zhǔn)確位點(diǎn)定位的譜圖建立譜圖庫(kù)，導(dǎo)入Skyline軟件，進(jìn)而實(shí)現(xiàn)可靠的翻譯后修飾DIA解析。將該流程應(yīng)用于磷酸化樣本DIA數(shù)據(jù)分析，成功提取6401條高可信度的磷酸化肽段（Q<0.01），占譜圖庫(kù)肽段總數(shù)的98.4%，其中可用于準(zhǔn)確定量的肽段（CV<20%）占86.9%，有效解決了翻譯后修飾DIA定量的難題。產(chǎn)品關(guān)鍵詞：OrbitrapFusion質(zhì)譜儀[詳細(xì)]

  2018-08-10 10:58

  產(chǎn)品樣冊(cè)

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• 極ng確修飾位點(diǎn)譜圖庫(kù)的建立與磷酸化蛋白質(zhì)組的 DIA 解析

  極ng確修飾位點(diǎn)譜圖庫(kù)的建立與磷酸化蛋白質(zhì)組的 DIA 解析[詳細(xì)]

  2015-12-29 00:00

  選購(gòu)指南

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• 賽默飛基于Q Exactive-GC建立高分辨極ng確質(zhì)量數(shù)據(jù)庫(kù)

  本研究基于氣相色譜-四極桿-靜電場(chǎng)軌道阱高分辨質(zhì)譜（ThermoScientificTMQExactive-GC），并結(jié)合相應(yīng)的數(shù)據(jù)處理軟件，研究極ng確質(zhì)量數(shù)據(jù)庫(kù)建立以及利用數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行目標(biāo)化合物快速篩查的流程。實(shí)驗(yàn)中的數(shù)據(jù)，均在60,000FWHM（200m/z）及以上的分辨率下采集，且數(shù)據(jù)的質(zhì)量準(zhǔn)確度保證在2ppm范圍內(nèi)，所以，其超高的性能特點(diǎn)保證了數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性和可靠性?？焖俸Y查方法同時(shí)對(duì)極ng確質(zhì)量數(shù)偏差、保留時(shí)間窗口、同位素分布與同位素豐度信息等參數(shù)進(jìn)行了優(yōu)化，Z*程度的降低假陽(yáng)性以及假陰性結(jié)果的干擾，從而獲得Z準(zhǔn)確的篩查結(jié)果。關(guān)鍵詞QExactive-GC；高分辨極ng確質(zhì)量數(shù)據(jù)庫(kù)；目標(biāo)化合物篩查[詳細(xì)]

  2018-08-10 10:58

  產(chǎn)品樣冊(cè)

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• 賽默飛世爾 RTEliteTM系列極ng確控制電熱板 SP136420-33產(chǎn)品樣冊(cè)

  賽默飛世爾 RTEliteTM系列極ng確控制電熱板 SP136420-33產(chǎn)品樣冊(cè)[詳細(xì)]

  2024-09-28 00:38

  應(yīng)用文章

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• 賽默飛全新GC-MS具有超高分辨率和亞ppm級(jí)的極ng確質(zhì)量能力

  前言ThermoScientific?QExactive?GC組合型四極桿Orbitrap質(zhì)譜儀是一款全新的臺(tái)式質(zhì)譜，致力于將氣相色譜（GC）的高分離能力與Orbitrap高分辨極ng確質(zhì)量數(shù)（HR/AM）能力wan美結(jié)合。高質(zhì)量數(shù)精度的質(zhì)譜儀（MS）對(duì)于復(fù)雜基質(zhì)下的目標(biāo)化合物和非目標(biāo)化合物測(cè)量非常關(guān)鍵，在進(jìn)行化合物識(shí)別和確認(rèn)時(shí)，對(duì)于提高測(cè)量結(jié)果的可靠性也非常關(guān)鍵。對(duì)于前者，獲得穩(wěn)定高質(zhì)量數(shù)精度可以使用相對(duì)較窄的質(zhì)量數(shù)提取窗口，充分利用該儀器的質(zhì)量數(shù)解析能力優(yōu)勢(shì)；對(duì)于后者，提供足夠準(zhǔn)確的測(cè)量化合物質(zhì)量數(shù)，允許化學(xué)家可靠預(yù)測(cè)元素組成和同位素比，以識(shí)別物質(zhì)的化學(xué)結(jié)構(gòu)。結(jié)果證實(shí)，在使用QExactiveGC質(zhì)譜儀的高分辨率時(shí)，即使在很寬的濃度范圍和復(fù)雜化學(xué)背景下，也能獲得出色且穩(wěn)定的質(zhì)量精度。[詳細(xì)]

  2018-08-10 10:58

  產(chǎn)品樣冊(cè)

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• 提高分析極ng確度的方法

  提高分析極ng確度的方法[詳細(xì)]

  2007-01-14 00:00

  應(yīng)用文章

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• 激光干涉儀極ng確測(cè)量的局限性

  激光干涉儀極ng確測(cè)量的局限性[詳細(xì)]

  2015-10-18 00:00

  期刊論文

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• 如何檢測(cè)移液器的極ng確度

  如何檢測(cè)移液器的極ng確度[詳細(xì)]

  2013-12-09 00:00

  課件

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• 如何解讀電導(dǎo)率儀的極ng確度？

  如何解讀電導(dǎo)率儀的極ng確度？[詳細(xì)]

  2024-09-26 04:42

  課件

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• 賽默飛數(shù)據(jù)非依賴(lài)采集DIA解決方案

  賽默飛數(shù)據(jù)非依賴(lài)采集DIA解決方案[詳細(xì)]

  2015-06-11 00:00

  應(yīng)用文章

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• 功能強(qiáng)大完整極ng確的圖像采集，分析與顯示軟件包粒子

  功能強(qiáng)大完整極ng確的圖像采集，分析與顯示軟件包粒子[詳細(xì)]

  2024-09-12 16:03

  專(zhuān)利

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• 如何極ng確巧妙的收集密度梯度組分

  如何極ng確巧妙的收集密度梯度組分[詳細(xì)]

  2015-05-27 00:00

  期刊論文

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• 如何選擇極ng確度高的篩網(wǎng)

  如何選擇極ng確度高的篩網(wǎng)[詳細(xì)]

  2013-12-27 00:00

  課件

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• 如何快速檢測(cè)移液器的極ng確度

  如何快速檢測(cè)移液器的極ng確度[詳細(xì)]

  2014-09-04 00:00

  產(chǎn)品樣冊(cè)

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• 賽默飛提供數(shù)據(jù)非依賴(lài)采集DIA 解決方案

  隨著生命科學(xué)的快速發(fā)展，蛋白質(zhì)組學(xué)的關(guān)注焦點(diǎn)和研究趨勢(shì)已經(jīng)逐漸從定性轉(zhuǎn)向定量。定量蛋白質(zhì)組學(xué)是對(duì)細(xì)胞、組織乃至完整生物體的蛋白質(zhì)表達(dá)量及差異進(jìn)行分析，對(duì)于生物過(guò)程機(jī)理的探索和臨床診斷標(biāo)志物的發(fā)現(xiàn)與驗(yàn)證具有重要意義?；陟o電場(chǎng)軌道阱Orbitrap的數(shù)據(jù)非依賴(lài)采集（DataIndependentAcquisition,DIA）是賽默飛為用戶(hù)帶來(lái)的一項(xiàng)全新的、全息式的質(zhì)譜技術(shù)。DIA將質(zhì)譜整個(gè)全掃描范圍分為若干個(gè)窗口，高速、循環(huán)地對(duì)每個(gè)窗口中的所有離子進(jìn)行選擇、碎裂、檢測(cè)，從而無(wú)遺漏、無(wú)差異地獲得樣本中所有離子的全部碎片信息（圖1）。[詳細(xì)]

  2018-08-10 10:58

  產(chǎn)品樣冊(cè)

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• Duke COUNT-CAL極ng確標(biāo)準(zhǔn)顆粒

  Duke COUNT-CAL極ng確標(biāo)準(zhǔn)顆粒[詳細(xì)]

  2013-11-06 00:00

  應(yīng)用文章

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• InLab系列電極極ng確之源

  制造具有zhuo越性能的高品質(zhì)電極不僅需要技術(shù)技能和專(zhuān)業(yè)知識(shí)，而且需要深入了解各種客戶(hù)應(yīng)用及其具體要求。在過(guò)去幾十年，梅特勒-托利多已積累了豐富的經(jīng)驗(yàn)和知識(shí)，從而能夠提供全面的電極組合，為您的任何應(yīng)用提供專(zhuān)業(yè)支持。[詳細(xì)]

  2018-08-25 10:00

  產(chǎn)品樣冊(cè)

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• 化學(xué)要求對(duì)需要的試劑極ng確稱(chēng)重

  化學(xué)要求對(duì)需要的試劑極ng確稱(chēng)重[詳細(xì)]

  2007-08-24 00:00

  安裝說(shuō)明

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• 化學(xué)要求對(duì)需要的試劑極ng確稱(chēng)重

  化學(xué)要求對(duì)需要的試劑極ng確稱(chēng)重[詳細(xì)]

  2007-08-24 00:00

  應(yīng)用文章

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• AP 066如何快速極ng確的測(cè)定真密度

  美國(guó)麥克儀器的AccuPyc系列真密度儀是一款全自動(dòng)真密度儀。該儀器采用對(duì)樣品無(wú)任何損害的氣體置換法進(jìn)行分析，能夠檢測(cè)各種粉末，泥漿，固體，塑料薄膜等材料的真實(shí)密度。[詳細(xì)]

  2018-08-31 10:10

  產(chǎn)品樣冊(cè)

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