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請問真菌的分子生物學(xué)鑒定一般方法步驟

晴爺233 2010-03-25 09:38:37 882  瀏覽
  • Z近分出來一株真菌,大概是霉菌,想要用分子生物學(xué)的方法進(jìn)行鑒定。但是以前沒有做過任何分子生物學(xué)的實(shí)驗(yàn)。網(wǎng)上查閱了一些資料,感覺已經(jīng)有點(diǎn)混亂。本人上無師姐師兄下午師弟師妹,... Z近分出來一株真菌,大概是霉菌,想要用分子生物學(xué)的方法進(jìn)行鑒定。但是以前沒有做過任何分子生物學(xué)的實(shí)驗(yàn)。網(wǎng)上查閱了一些資料,感覺已經(jīng)有點(diǎn)混亂。本人上無師姐師兄下午師弟師妹,所以來請教做過真菌鑒定的高人,真菌鑒定的一般步驟。請從真菌分純好開始講。。。。。。謝謝。。痛哭流涕。 展開

參與評(píng)論

全部評(píng)論(3條)

  • t5H95H1xXd 2018-07-02 00:00:00
    霉菌一般生長速率都很快,挑邊緣菌絲不斷轉(zhuǎn)接可以純化,當(dāng)你有一株真菌時(shí),測序有以下步驟:提取DNA,PCR,電泳,紫外拍照(檢查PCR是否成功),送出去測序。回來在NCBI比對(duì),得出Z相近菌種。如果經(jīng)費(fèi)充足,直接把真菌樣品送出去公司全部可以搞定。

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    評(píng)論

  • 墮獄之心 2010-03-26 00:00:00
    給你個(gè)論文,希望對(duì)你有幫助 現(xiàn)代真菌鑒定分型方法 北京大學(xué)diyi醫(yī)院(100434) 王端禮 真菌 的 鑒 定不僅是臨床的需要,在植物病理學(xué)、生物退化、生物技術(shù)和環(huán)境的研究都很重要。許多真菌已經(jīng)鑒定到種,但是分類學(xué)家仍在忙于新種的描述和其分類的研究。有些菌種由于經(jīng)濟(jì)學(xué)的關(guān)系或是病理學(xué)的重要性,有深人的研究,其他則需要現(xiàn)代手段來進(jìn)行研究。 一 、 形 態(tài)學(xué) 用表 型 特 征來進(jìn)行分類鑒定,是過去和現(xiàn)在都普遍應(yīng)用的方法。致病真菌的鑒定,需要光鏡,現(xiàn)在更加上熒光顯微鏡和細(xì)胞化學(xué),還有各種染色法,如子囊泡子染色法。真菌在宿主體內(nèi)鑒定比較困難,如菌絲只能看到有無分隔,有無色素。需要培養(yǎng)來鑒定菌種。某些病例用種特異性抗體探針非常有用,但此種技術(shù)尚未在醫(yī)真菌學(xué)領(lǐng)域內(nèi)作為常規(guī)技術(shù)使用。合適的培養(yǎng)基培養(yǎng)鑒定菌種,是常用的方法。 醫(yī)學(xué) 真 菌 學(xué)家常見到的是半知菌,要看抱子形態(tài)和抱子發(fā)生,看產(chǎn)抱細(xì)胞,即分生抱子梗。有兩種型,一是芽生抱子發(fā)生,在產(chǎn)抱細(xì)胞上有一小點(diǎn)產(chǎn)生分生抱子,另一是葉狀抱子發(fā)生,整個(gè)細(xì)胞是產(chǎn)抱細(xì)胞,分成一至數(shù)個(gè)細(xì)胞?;诔⒔Y(jié)構(gòu)觀察,有許多詞語,但未能普遍應(yīng)用。有的真菌沒有分生抱子,但仍有一些特征,如菌核(sclerotia)、厚壁抱子和一些特殊的菌絲結(jié)構(gòu),如皮膚癬菌。在少數(shù)情況下,一些機(jī)會(huì)真菌產(chǎn)生有性結(jié)構(gòu),有許多特點(diǎn)用于菌種鑒定,如子囊菌、擔(dān)子菌和結(jié)合菌。 電鏡 , T EM是觀察菌的斷面,子囊菌酵母和擔(dān)子菌酵母的橫隔不同,SEM在實(shí)際應(yīng)用有許多發(fā)現(xiàn),如子囊菌的表面結(jié)構(gòu)可以鑒定到種。 現(xiàn) 代 形 態(tài)學(xué)技術(shù),如自動(dòng)成像分析、電子顆粒體積、分?jǐn)?shù)幾何學(xué)分析形態(tài)學(xué)的特點(diǎn)。 由于 表 型 各種詞語沒有一定的標(biāo)準(zhǔn),有很大的主觀性,某些表型特征也不穩(wěn)定,受環(huán)境影響,有的不能在人工培養(yǎng)基上生長,有一些真菌尚未分類,分類概念有待近一步建立。 二 、分 子 生物學(xué) 表型 分 類 受限,生理生化技術(shù)在絲狀真菌鑒定方面,或是費(fèi)時(shí)費(fèi)事或是結(jié)果不準(zhǔn)。分子生物學(xué)非常適用。有兩種技術(shù),diyi,PCR技術(shù),可以分析少量真菌細(xì)胞,甚至單個(gè)真菌抱子。第二,選擇通用寡核昔酸對(duì)真菌種特異性引物,測定其核昔酸序列。分子生物學(xué)的研究目的由于生物多樣性有四個(gè)目的。I)系統(tǒng)發(fā)生研究。2)分類學(xué)的研究,在屬、種水平。3)鑒定應(yīng)用,即決定明確的分類名稱。4)流行病學(xué)和群體的遺傳學(xué)研究。具體方法不再詳述。 三 、其 他 : I,生 理 學(xué) 和生物化學(xué) 在純 培 養(yǎng) 上真菌生長比較快,可以使用生理、生化方法來鑒定菌種。如黑酵母的鑒定。不同的生長溫度也用于鑒定。有性和無性是一個(gè)輔助工具。在一定的培養(yǎng)基上,有對(duì)照,其生長速度也可用于鑒定,如青霉。AP[系統(tǒng)也用于絲狀真菌的鑒定。 2. 次 級(jí) 代謝產(chǎn)物 次級(jí) 代 謝 產(chǎn)物既不是為了生長需要,也不是介導(dǎo)基本代謝,常常發(fā)現(xiàn)它是一個(gè)與分了有關(guān)的混合物,有特殊的和極罕見的化學(xué)結(jié)構(gòu)。常見的是固醇、菇、類堿、香豆素等,某些是真菌毒素。將小量從培養(yǎng)皿切下來的標(biāo)本,直接進(jìn)行層析色譜法檢查,比傳統(tǒng)濃縮抽取提純法簡單易行。此法用于地衣的鑒定較好。很少用于真菌分類,由于對(duì)環(huán)境有一定影響,而且比較難,較少應(yīng)用,但有人用于子囊菌的分類。 3. 泛 酉昆 系統(tǒng) 是一 種 初 級(jí)代謝產(chǎn)物,起重要作用。泛釀即輔酶Q,是呼吸系統(tǒng)電子傳播鏈的攜帶者。一些異戊二烯(isoprene)接觸醒核各有不同,對(duì)鑒定到屬或?qū)僖韵滤胶苡袔椭V饕b定細(xì)菌和酵母,也用于黑酵母和絲狀真菌。 (Ya ma da Y ,e tal. In t.J.Genet 1989;5 6:309 Y ag uchiJ > e tal .M ycoscience 1996;3 7:55)0 4. 脂 肪 酸組成 此法 在 細(xì) 菌學(xué)方面是常規(guī)應(yīng)用的。一是成分,二是相對(duì)濃度。極少用于真菌分類。使用熱解氣相色譜法、熱解塊狀光譜儀、氣相色譜儀、隔膜水相聚合物雙相系統(tǒng)等,主要應(yīng)用這些方法。近來應(yīng)用氣相色譜法合并多變量統(tǒng)計(jì)分析方法,成功地用于絲狀真菌,包括卵菌、擔(dān)子菌、結(jié)合菌、甚至只有菌絲的真菌。用于種間水平。應(yīng)注意許多變化,如培養(yǎng)狀態(tài)和溫度是Z主要的。 5. 細(xì) 胞 壁組成 子 囊 菌 和擔(dān)子菌含有幾丁質(zhì)和葡萄糖,結(jié)合菌含有脫乙酞幾丁質(zhì)(chitosen)和葡聚糖醛酸。不同的皮膚癬菌含有不同的糖分,醉母細(xì)胞壁或是缺乏或是含有少量其他多糖(如巖藻搪、乳糖、鼠李糖、木搪等)。 6. 蛋 白 質(zhì)組成 用 電 泳 方法可以產(chǎn)生同工酶,可鑒定到屬或種。電泳、免疫學(xué)方法、蛋白質(zhì)分析等可解決種間特性。同工酶分析是一個(gè)經(jīng)濟(jì)和實(shí)用技術(shù)。等位基因酶(allozyme)通常用于系統(tǒng)發(fā)生的研究。

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  • kuct12345 2010-03-26 00:00:00
    直接讓TAKARA公司去測就行了!

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