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轉(zhuǎn)錄組測序 為什么選擇多個時間點

angd538 2017-06-10 22:30:52 336  瀏覽
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  • 晧瀚 2017-06-11 00:00:00
    轉(zhuǎn)錄組學(xué)的研究對象包括mRNA和非編碼RNA等。新一代高通量測序技術(shù)可以全面快速地獲得特定細(xì)胞或組織在某一個狀態(tài)下幾乎所有轉(zhuǎn)錄本的序列信息和表達(dá)信息,從而準(zhǔn)確地分析基因表達(dá)差異、基因結(jié)構(gòu)變異、篩選分子標(biāo)記(SNPs或SSR)等生命科學(xué)的重要問題。基因表達(dá)譜測序是直接對某一物種或特定細(xì)胞在某一功能狀態(tài)下產(chǎn)生的mRNA進(jìn)行高通量測序,可以用來研究基因的表達(dá)差異情況。該技術(shù)結(jié)合了轉(zhuǎn)錄組測序建庫的實驗方法,與轉(zhuǎn)錄組測序相比,基因表達(dá)譜測序要求的讀長更短,測序通量更小,但僅可用于基因表達(dá)差異的研究。轉(zhuǎn)錄組測序是RNA水平測序,相當(dāng)于DNA水平的基因組測序,是一個框架。表達(dá)譜主要研究的是基因表達(dá)量的變化,上調(diào)或下降。先要有轉(zhuǎn)錄組或是基因組才可以做表達(dá)譜,否則沒有Ref做參考。轉(zhuǎn)錄組測序和表達(dá)譜測序其實都是通過高通量測序技術(shù)進(jìn)行的,轉(zhuǎn)錄組測序主要是針對沒有參考基因組(即基因組未完成測序)的物種,側(cè)重于獲得你材料的全部轉(zhuǎn)錄組信息;而表達(dá)譜則側(cè)重于檢測各個基因的表達(dá)量。

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