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已經(jīng)有轉(zhuǎn)錄組測序結果,怎么看是否含有某個基因?

狐尼克的十七 2013-04-23 21:08:00 585  瀏覽
  • 已經(jīng)有轉(zhuǎn)錄組測序的完整結果,但是不知道怎么確定該植物是否含某個基因。查出來該基因的序列,要與測序結果中的所有序列一條條比對嗎,工作量好大

參與評論

全部評論(4條)

  • 林潔3334 2013-05-05 00:00:00
    用基因探針,可配對既含有某基因

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  • myv0999 2013-04-24 00:00:00
    貌似 木有什么工作量吧 就是一個比對而已

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  • 穩(wěn)穩(wěn)雯雯98 2013-04-24 00:00:00
    有專門的軟件,你找你們老師一問就知道了,非常簡單的。

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  • 厄爾多思2 2013-04-25 00:00:00
    是有參考基因組的還是de novo的結果,如果有參考基因組的,那么可以通過這個基因名稱在注釋結果中查找是否有這個基因,序列信息需要在參考基因組中查找,如果是沒有參考基因組的,那么拼接結果是一個fasta格式的文件,可以用blast軟件進行比對。

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