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如何分析基因進化速率

26004531 2017-01-26 22:51:48 357  瀏覽
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  • 走巴走巴 2017-01-27 00:00:00
    自有測序技術(shù)以來,人們就發(fā)現(xiàn),同一個物種里的不同基因的進化速率差異很大。進化Z快和進化Z慢的基因,其進化速率可以有上千倍的差異。換句話說,進化Z快的基因里面發(fā)生了1000次氨基酸的替換,Z慢的基因才發(fā)生了一次替換。人們在嘗試解釋這個現(xiàn)象的時候,一般都會先入為主地認為,越"重要"(Functional Importance),或者說功能上受到“約束”(Functional Constraint)越大的基因,進化應(yīng)該越慢。但究竟基因的"重要性"/"功能約束"實際上是什么,如何定義,如何測量,都沒有人知道。結(jié)果人們都是反過來運用這個觀點,即:序列越保守的基因,其產(chǎn)物對生物的重要性越大。盡管這種做法有一定實用價值,但是卻無益于人們更深入地了解什么是基因的“重要性”/"功能約束"。要理解基因功能的"重要性"/"功能約束"的本質(zhì)是什么,其中一個途徑就是通過研究這個問題來提供相關(guān)的線索。這里需要提一句,功能重要性"Functional Importance"和功能約束"Functional Constraint"實際上是不一樣的,下面會講到它們之間的區(qū)別。 另一方面,對蛋白質(zhì)進化速率的研究至少還有兩個重要價值。首先,它催生了分子鐘理論(Molecular Clock),為確定沒有化石證據(jù)的生物存在的地質(zhì)年代,提供了重要的技術(shù)手段。其次,它是分子進化的中性理論(Neutral Theory)的基礎(chǔ),而中性理論是達爾文進化論提出以后Z重要的改進。

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