實操技巧|光纖記錄實驗數(shù)據(jù)處理操作方法
-
你在進行光纖記錄實驗時,是否有如下煩腦:
◆ 記錄好的數(shù)據(jù)看著很雜亂,不知如何整理?
◆ 數(shù)據(jù)處理包含哪些步驟?
◆ 如何確定數(shù)據(jù)分析的baseline
◆ ΔF/F指的是什么?
◆ 信號出現(xiàn)了“漂白效應(yīng)”怎么辦?
無需困惑,對以上問題,我們最近總結(jié)了一份實操步驟,這份操作指南可幫你迅速上手數(shù)據(jù)處理
常見光纖記錄數(shù)據(jù)處理過程
讓我們來看一張原始數(shù)據(jù)案例圖,下圖顯示數(shù)據(jù)整體波動過于密集,其中410nm對照通道數(shù)據(jù)不夠穩(wěn)定;對應(yīng)事件標記(線條標記處)的peak也不是很突出,針對這種數(shù)據(jù)情況,我們立刻開始數(shù)據(jù)處理吧。
(▲本文實操分析案例圖)
(*以下分析過程以瑞沃德雙色多通道光纖記錄系統(tǒng)操作界面為主要示例)
01.第 一步
我們將數(shù)據(jù)根據(jù)需要分析的時間段進行裁剪,此步驟也可跳過。
02.第二步
數(shù)據(jù)預(yù)處理。常見數(shù)據(jù)預(yù)處理過程包含平滑處理,基線矯正,運動矯正。平滑處理可以將數(shù)據(jù)中的過多雜信號去除,ZD限度的突出目標peak。如下圖所示,原始數(shù)據(jù)經(jīng)平滑處理后目標peak更加突出,更容易觀察分析。
基線矯正多數(shù)針對的是熒光信號因長時間記錄導(dǎo)致漂白信號逐步下降,或者光纖的自發(fā)熒光在長期記錄下逐步被漂白基線逐步下降等情況。此情形的數(shù)據(jù)因為整體呈現(xiàn)下降趨勢,不利于后續(xù)數(shù)據(jù)作圖分析,所以需要進行基線矯正。如下圖所示,基線矯正可以直接將下降趨勢的數(shù)據(jù)通過算法擬合后恢復(fù)成平整狀態(tài)。
運動矯正用于采用410nm對照通道的數(shù)據(jù),410nm數(shù)據(jù)可以用于反應(yīng)背景噪音信號,運動矯正即將410nm數(shù)據(jù)與470nm數(shù)據(jù)進行擬合,通過算法從470數(shù)據(jù)中去除410nm數(shù)據(jù)的波動,得到真實的熒光數(shù)據(jù)。當不選擇運動矯正功能或者實驗未記錄410nm的數(shù)據(jù),可以選擇一定時間范圍內(nèi)的信號作為對照進行算法處理。
03.第三步
數(shù)據(jù)預(yù)處理后即可得到整體數(shù)據(jù)的ΔF/F或者Z-score,用于反應(yīng)數(shù)據(jù)的波動幅度。二者采用了不同的算法,數(shù)據(jù)的呈現(xiàn)結(jié)果略有不同。
ΔF/F=(F-F1)/F0:
(1)當數(shù)據(jù)進行基線矯正后:
◆ 若對照選擇為410,F(xiàn)1=fitted410,F(xiàn)0=median(raw data)
◆ 若對照選擇非410:F1為基線矯正曲線值,F(xiàn)0=median(Baseline)
(2)當數(shù)據(jù)未進行基線矯正:
◆ 若數(shù)據(jù)對照為410,則F1=F0=fitted410,
◆ 若數(shù)據(jù)對照非410,則F1=F0=median(Baseline)
Z-score:
使用標準分數(shù)計算方式,即z-score=(x-mean)/std,x=ΔF/F,mean為ΔF/F的均值,std為相應(yīng)標準差。
04.第四步
將熒光數(shù)據(jù)與動物行為數(shù)據(jù)同步對比,選擇事件標記或者增加事件標記。
05.第五步
選擇事件分析的時間區(qū)間和baseline區(qū)間,用于事件相關(guān)信號分析作圖。
06.第六步
將不同組的數(shù)據(jù)進行組間對比,即可分析不同處理因素下熒光數(shù)據(jù)的差異。
通過以上步驟,原始的熒光數(shù)據(jù)就可以直接出圖啦。
空軍軍醫(yī)大學(xué)光纖記錄系統(tǒng)培訓(xùn)現(xiàn)場
(▲瑞沃德雙色多通道光纖記錄系統(tǒng))(▲瑞沃德雙色多通道光纖記錄系統(tǒng))
福利時間
如果你想要體驗操作
同款光纖記錄系統(tǒng)開展實驗
識別下方二維碼
即可申請免費SY喲▼
全部評論(0條)
熱門問答
- 實操技巧|光纖記錄實驗數(shù)據(jù)處理操作方法
你在進行光纖記錄實驗時,是否有如下煩腦:
◆ 記錄好的數(shù)據(jù)看著很雜亂,不知如何整理?
◆ 數(shù)據(jù)處理包含哪些步驟?
◆ 如何確定數(shù)據(jù)分析的baseline
◆ ΔF/F指的是什么?
◆ 信號出現(xiàn)了“漂白效應(yīng)”怎么辦?
無需困惑,對以上問題,我們最近總結(jié)了一份實操步驟,這份操作指南可幫你迅速上手數(shù)據(jù)處理
常見光纖記錄數(shù)據(jù)處理過程
讓我們來看一張原始數(shù)據(jù)案例圖,下圖顯示數(shù)據(jù)整體波動過于密集,其中410nm對照通道數(shù)據(jù)不夠穩(wěn)定;對應(yīng)事件標記(線條標記處)的peak也不是很突出,針對這種數(shù)據(jù)情況,我們立刻開始數(shù)據(jù)處理吧。
(▲本文實操分析案例圖)
(*以下分析過程以瑞沃德雙色多通道光纖記錄系統(tǒng)操作界面為主要示例)
01.第 一步
我們將數(shù)據(jù)根據(jù)需要分析的時間段進行裁剪,此步驟也可跳過。
02.第二步
數(shù)據(jù)預(yù)處理。常見數(shù)據(jù)預(yù)處理過程包含平滑處理,基線矯正,運動矯正。平滑處理可以將數(shù)據(jù)中的過多雜信號去除,ZD限度的突出目標peak。如下圖所示,原始數(shù)據(jù)經(jīng)平滑處理后目標peak更加突出,更容易觀察分析。
基線矯正多數(shù)針對的是熒光信號因長時間記錄導(dǎo)致漂白信號逐步下降,或者光纖的自發(fā)熒光在長期記錄下逐步被漂白基線逐步下降等情況。此情形的數(shù)據(jù)因為整體呈現(xiàn)下降趨勢,不利于后續(xù)數(shù)據(jù)作圖分析,所以需要進行基線矯正。如下圖所示,基線矯正可以直接將下降趨勢的數(shù)據(jù)通過算法擬合后恢復(fù)成平整狀態(tài)。
運動矯正用于采用410nm對照通道的數(shù)據(jù),410nm數(shù)據(jù)可以用于反應(yīng)背景噪音信號,運動矯正即將410nm數(shù)據(jù)與470nm數(shù)據(jù)進行擬合,通過算法從470數(shù)據(jù)中去除410nm數(shù)據(jù)的波動,得到真實的熒光數(shù)據(jù)。當不選擇運動矯正功能或者實驗未記錄410nm的數(shù)據(jù),可以選擇一定時間范圍內(nèi)的信號作為對照進行算法處理。
03.第三步
數(shù)據(jù)預(yù)處理后即可得到整體數(shù)據(jù)的ΔF/F或者Z-score,用于反應(yīng)數(shù)據(jù)的波動幅度。二者采用了不同的算法,數(shù)據(jù)的呈現(xiàn)結(jié)果略有不同。
ΔF/F=(F-F1)/F0:
(1)當數(shù)據(jù)進行基線矯正后:
◆ 若對照選擇為410,F(xiàn)1=fitted410,F(xiàn)0=median(raw data)
◆ 若對照選擇非410:F1為基線矯正曲線值,F(xiàn)0=median(Baseline)
(2)當數(shù)據(jù)未進行基線矯正:
◆ 若數(shù)據(jù)對照為410,則F1=F0=fitted410,
◆ 若數(shù)據(jù)對照非410,則F1=F0=median(Baseline)
Z-score:
使用標準分數(shù)計算方式,即z-score=(x-mean)/std,x=ΔF/F,mean為ΔF/F的均值,std為相應(yīng)標準差。
04.第四步
將熒光數(shù)據(jù)與動物行為數(shù)據(jù)同步對比,選擇事件標記或者增加事件標記。
05.第五步
選擇事件分析的時間區(qū)間和baseline區(qū)間,用于事件相關(guān)信號分析作圖。
06.第六步
將不同組的數(shù)據(jù)進行組間對比,即可分析不同處理因素下熒光數(shù)據(jù)的差異。
通過以上步驟,原始的熒光數(shù)據(jù)就可以直接出圖啦。
空軍軍醫(yī)大學(xué)光纖記錄系統(tǒng)培訓(xùn)現(xiàn)場
(▲瑞沃德雙色多通道光纖記錄系統(tǒng))(▲瑞沃德雙色多通道光纖記錄系統(tǒng))
福利時間
如果你想要體驗操作
同款光纖記錄系統(tǒng)開展實驗
識別下方二維碼
即可申請免費SY喲▼
- 光纖記錄詳解,一文帶你詳細了解光纖記錄實驗!
一、光纖記錄工作原理
人類的大腦擁有約900億個神經(jīng)元,神經(jīng)元之間通過突觸相互連接形成了復(fù)雜的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),并由此產(chǎn)生各種復(fù)雜的功能。大腦能夠合成和釋放上百種神經(jīng)遞質(zhì),神經(jīng)信號通過突觸釋放的神經(jīng)遞質(zhì)從而在神經(jīng)元之間進行傳遞(圖1)。
圖1
當神經(jīng)興奮傳導(dǎo)到突觸末端時,會刺激突觸上鈣離子通道打開促使鈣離子大量內(nèi)流,胞內(nèi)鈣離子濃度瞬時上升,驅(qū)動突觸小泡將神經(jīng)遞質(zhì)釋放到突觸間隙中,釋放出的神經(jīng)遞質(zhì)隨即與突觸后膜上的受體結(jié)合,將遞質(zhì)信號傳遞給下一個神經(jīng)元,從而進行信息的逐級傳遞(圖2)。這些神經(jīng)元以復(fù)雜的通路投射到多個腦區(qū),產(chǎn)生了學(xué)習(xí)認知、情感、控制、動機、獎勵等豐富的功能。光纖記錄系統(tǒng)則可以通過檢測鈣離子和神經(jīng)遞質(zhì)的熒光變化程度來表征群體神經(jīng)元的活動情況。
圖2
那么光纖記錄是如何檢測神經(jīng)活動的呢?
以鈣離子熒光信號檢測為例,光纖記錄系統(tǒng)的技術(shù)原理是借助鈣離子濃度變化與神經(jīng)元活動之間的嚴格對應(yīng)關(guān)系,利用特殊的熒光染料或者蛋白質(zhì)熒光探針,將神經(jīng)元中鈣離子的濃度通過熒光強度表現(xiàn)出來,并被光纖記錄系統(tǒng)捕捉,從而達到檢測神經(jīng)元活動的目的。
在神經(jīng)系統(tǒng)中,靜息狀態(tài)時神經(jīng)元胞內(nèi)鈣離子濃度為50-100nM,而在神經(jīng)元興奮時胞內(nèi)鈣離子濃度能上升10-100倍,因此我們可以通過注射鈣離子基因編碼指示劑(Calcium indicator,如GCaMPs、RCaMPs等)來標記鈣離子。鈣離子指示劑帶有熒光蛋白(如GFP、RFP等)及其變異體的蛋白質(zhì),可與鈣調(diào)蛋白(CaM)和肌球蛋白輕鏈激酶M13域結(jié)合(圖3左)。當神經(jīng)活動增強時鈣離子通道打開,大量鈣離子內(nèi)流并與CaM結(jié)合,導(dǎo)致M13和CaM結(jié)構(gòu)域相互作用,引發(fā)cpEGFP結(jié)構(gòu)重排,從而增強綠色熒光信號(圖3 右)。
因此我們可以通過檢測鈣信號的變化來表征神經(jīng)元的活動,進而研究神經(jīng)元活動與動物行為的相關(guān)性,探究復(fù)雜行為背后的調(diào)控機制。
圖3
(Marisela Morales, et al. Neuron, 2020)
圖4:VTA-VGluT2神經(jīng)元編碼先天逃避反應(yīng)
光纖記錄檢測神經(jīng)遞質(zhì)信號的原理與上述方法相同,把cpEGFP嵌入特定的神經(jīng)遞質(zhì)受體,受體與神經(jīng)遞質(zhì)結(jié)合后會引發(fā)受體構(gòu)象改變并發(fā)出熒光信號(圖5)。通過病毒注射、轉(zhuǎn)染等技術(shù)手段,可以將這種可遺傳編碼的探針表達在細胞或小鼠腦部,借助成像技術(shù),觀察神經(jīng)遞質(zhì)濃度的實時變化。
圖5
(Yulong Li, et al. Cell, 2018)
圖6:條件反射實驗中伏隔核Nac腦區(qū)的DA釋放
二、光纖記錄實驗方法
在光纖記錄實驗中,首先要選擇合適的熒光病毒。熒光染料或指示劑是通過病毒載體轉(zhuǎn)入目標腦區(qū),常用載體為AAV病毒。根據(jù)實驗的不同,需要選擇特異啟動子或者Cre-FloxP系統(tǒng)來特異標記目標神經(jīng)元,無特異性的GCaMPs表達雖然可以觀測群體神經(jīng)元活動但無神經(jīng)元特異性,光纖記錄的作用在于觀測特異類型神經(jīng)元群體的活動。
實驗流程:
1、在目標腦區(qū)注射鈣熒光病毒,并在注射位點埋植光纖插針,用于收集熒光;
圖7:病毒注射與陶瓷插針埋植
2、待2-3周鈣熒光病毒表達后,連接光纖,使用光纖記錄系統(tǒng)采集動物在行為學(xué)實驗中大腦的鈣熒光信號;
圖8:病毒表達
3、通過分析軟件處理鈣熒光信號數(shù)據(jù),并結(jié)合行為學(xué)視頻對動物的行為進行分析。
圖9:光纖記錄結(jié)合高架十字迷宮實驗
三、光纖記錄數(shù)據(jù)分析
以瑞沃德R820三色光纖記錄系統(tǒng)記錄的數(shù)據(jù)為例。
1、數(shù)據(jù)預(yù)處理。R820三色光纖記錄系統(tǒng)軟件集信號采集與數(shù)據(jù)分析于一體,在數(shù)據(jù)分析中,數(shù)據(jù)預(yù)處理過程包含平滑處理,基線矯正,運動矯正等功能。
平滑處理可以將數(shù)據(jù)中的過多雜信號去除,最大限度的突出目標peak?;€矯正多數(shù)針對的是熒光信號因長時間記錄導(dǎo)致漂白信號逐步下降,或者光纖的自發(fā)熒光在長期記錄下逐步被漂白基線逐步下降等情況。此情形的數(shù)據(jù)因為整體呈現(xiàn)下降趨勢,不利于后續(xù)數(shù)據(jù)作圖分析,所以需要進行基線矯正。運動矯正用于采用410nm對照通道的數(shù)據(jù),410nm數(shù)據(jù)可以用于反應(yīng)背景噪音信號,運動矯正即將410nm數(shù)據(jù)與470nm數(shù)據(jù)進行擬合,通過算法從470數(shù)據(jù)中去除410nm數(shù)據(jù)的波動,得到真實的熒光數(shù)據(jù)。
圖10:光纖記錄數(shù)據(jù)預(yù)處理
2. 將熒光數(shù)據(jù)與動物行為數(shù)據(jù)同步對比,選擇事件標記或者增加事件標記,事件相關(guān)信號分析作圖。
圖11:事件分析
3. 將不同組的數(shù)據(jù)進行組間對比,即可分析不同處理因素下熒光數(shù)據(jù)的差異。此外,還可結(jié)合行為學(xué)視頻同步分析動物的運動軌跡。
圖12:不同數(shù)據(jù)組間分析
通過以上步驟,原始的熒光數(shù)據(jù)就可以直接出圖啦。
光纖記錄實驗的工作原理,實驗方法以及數(shù)據(jù)分析已經(jīng)全部講完啦….
想體驗R820三色多通道光纖記錄系統(tǒng)
識別下方二維碼,即可免費試 用
讓實驗信號更強更準
- 測量員考試要不要考實操?
- 細胞爬片的操作方法以及技巧!
細胞爬片的操作方法以及技巧!
在醫(yī)學(xué)生物研究中,免疫熒光檢測等需用到細胞爬片。現(xiàn)有的細胞爬片多采用表面平整、光滑的透明玻璃玻片。但在做免疫熒光檢測時,為了節(jié)約抗體,需免疫組化筆在爬片上進行范圍的圈定,將抗體加入劃定區(qū)域,免疫組化筆中的疏水成分阻滯抗體溢出所圈定的范圍,從而達到節(jié)約抗體的目的。細胞爬片是細胞培養(yǎng)中比較經(jīng)常會用到的,現(xiàn)將自己操作的一些方法與技巧拿與大家分享。
細胞爬片的特點:
1.玻片表面經(jīng)過TC處理,雙面均可使用。
2.γ射線滅菌,保證無菌。
3.使用便捷,只需打開包裝,將爬片放入孔板內(nèi),將細胞懸液滴到爬片上即可培養(yǎng)。
4.爬片厚度為0.17mm,直徑為8mm/14mm/20mm/25mm.分別適用于48孔細胞培養(yǎng)板/24孔細胞培養(yǎng)板/12孔細胞培養(yǎng)板/6孔細胞培養(yǎng)板。
5.吸附:該玻片表面具有陽離子電荷,可以通過靜電作用吸附冰凍切片組織或細胞,使之粘附在玻片上,進而在玻璃和切片組織之間形成共價鍵.因此,無需粘黏劑或者蛋白包被,該玻片也能牢固的粘附切片或細胞。
爬片的準備:
1、爬片可用一般的蓋玻片,也可用專用爬片;
2、應(yīng)用蓋玻片,可根據(jù)自己的需要剪裁成合適的大小,以備置于6孔板、12孔板或24孔板;
3、將剪裁好的爬片,置于濃硫酸中浸泡并過夜,第二天先用自來水沖洗20遍,再用三蒸水沖洗3遍(個人認為主要目的是沖洗干凈就可以了),放在飯盒或者培養(yǎng)皿(一定是玻璃的哦,要不然就……)中烘干后進行高壓消毒。
培養(yǎng)板的準備:
1、泡酸過夜
2、沖洗,烘干(1、2步驟與前大致相同)
3、放入超凈工作臺用紫外線照1~2小時就可以用了(在照之前可以將爬片一并放入,若細胞貼壁能力不強,可經(jīng)多聚賴氨酸浸片后放入。貼壁能力強的話,就可以省略了,進行紫外線消毒)
注:此步自己的經(jīng)驗是爬片可以先浸入消毒后的PBS內(nèi),緊接著放入培養(yǎng)板內(nèi)。目的:浸過PBS的爬片依靠表面的液體,可以用培養(yǎng)板孔底貼和緊密,以利于細胞長到爬片上。(自己剛開始做的時候,經(jīng)常就是細胞全都長在了爬片與培養(yǎng)板之間,爬片上細胞罕見。)
細胞爬片:
1、胰酶消化細胞后計數(shù)
2、根據(jù)自己的需要選擇合適的細胞密度種入培養(yǎng)板內(nèi)即可
3、第二天即可進行干預(yù)措施 細胞爬片的操作方法以及技巧!先和大家介紹到這,如果想要了解更多細胞爬片的信息,可以關(guān)注天津本生,本生給生物醫(yī)藥客戶提供生物實驗室檢測試劑及耗材,歡迎廣大客戶來詢。
- 光纖記錄實驗過程中需要全程避光嗎?
- 空氣檢測一般都是如何實操的?
- 儀器分析實驗數(shù)據(jù)處理(氣相色譜儀)
- 1 標樣 出峰順序為:正庚烷、溶劑峰,苯,甲苯,對二甲苯,間二甲苯,正十二烷,鄰二甲苯 標準樣品內(nèi)標量:0.0200g 樣品內(nèi)標量:0.0200g 下圖為樣品數(shù)據(jù) 根據(jù)標準樣品的色譜圖 求出各組分的理論塔板數(shù)。定量校正因子。分離度 計算 甲苯二甲苯各自的質(zhì)量... 1 標樣 出峰順序為:正庚烷、溶劑峰,苯,甲苯,對二甲苯,間二甲苯,正十二烷,鄰二甲苯 標準樣品內(nèi)標量:0.0200g 樣品內(nèi)標量:0.0200g 下圖為樣品數(shù)據(jù) 根據(jù)標準樣品的色譜圖 求出各組分的理論塔板數(shù)。定量校正因子。分離度 計算 甲苯二甲苯各自的質(zhì)量分數(shù) 展開
- 吉時利靜電計Keithley 6430實操指南
近期,安泰測試給西安某研究所交付一臺高電阻/低電流靜電計Keithley6430,并為客戶提供了實操演示。吉時利靜電計Keithley 6430具有超低噪聲0.4fA p-p和前置放大器,廣泛用于低電平信號測量比如研究單電子器件、高電阻納米線和納米管、聚合物以及電化學(xué)等應(yīng)用。
6430源表輸出四象限示意圖
和其他型號的源表類似,Keithley 6430具備四象限輸出能力,在六位半的精度下實現(xiàn)1μV - 200V、10aA - 100mA、1μ? - >20T?的電壓,電流,電阻測量和0 - ±200V、 0 ±100mA的輸出能力。
吉時利靜電計6430源表實物照片
吉時利靜電計Keithley 6430操作方法:
從面板按鍵可以看出,6430源表的主要功能是電壓V、電流I、電阻R的測量,左邊是測量功能設(shè)置區(qū)域,右邊是源輸出設(shè)置區(qū)域
儀器背面板是接線端口,使用兩線制測量用INPUT/OUTPUT兩個極;四線制測量只需要連接好4-WireSENSE端口即可,內(nèi)部會識別自動進行四線制測量;
在實際加壓測流、或是加流測壓方式測電阻時,先設(shè)置好源輸出V(限制電壓)和I(恒流模式),或者輸出V(恒壓模式)和I(限制電流);然后設(shè)置DisplayMeasure界面,觀測電阻值;
如果需要同時監(jiān)控電阻和實際電流,或者電流和電壓值,可以設(shè)置Toggle,進行顯示。
6430前置放大器模塊
前置放大器的使用方法:
前置放大器是6430的特色設(shè)計,使得用戶可以直接, 或者近距離連接該信號,減少線纜噪聲的影響。前置放大器屬于雙向放大器,既可以放大測量信號,也可以對源輸出信號進行放大,用于測量或產(chǎn)生被測試器件的電流。
開箱后,將前置放大器接線端口蓋用螺絲刀拆開,一端連接主機背后的PreAMP端口,一端連接放大器模塊,放大器上有一頭是2個BNC端口,用于連接三同軸線纜;根據(jù)需要,通常連接Input/Output口進行兩線制測量。
前置放大器不需要特別對儀器設(shè)置,連接后自動識別可以直接使用。
注意:本設(shè)備具有高壓輸出能力,在連線時請關(guān)閉電源,切忌帶電操作。
本文由安泰測試整理發(fā)布,歡迎各位關(guān)注微信公眾號“安泰測試”留言探討。更多儀器知識歡迎訪問安泰測試網(wǎng)。
- 歐姆表設(shè)計實驗怎么數(shù)據(jù)處理
- 裂開!做光纖記錄實驗采不到熒光信號?注意事項在這里
光纖記錄實驗操作較為簡便,能夠長時間穩(wěn)定的動態(tài)檢測動物的神經(jīng)信號,目前在神經(jīng)科學(xué)研究中應(yīng)用越發(fā)廣泛。但是在做光纖記錄實驗中,有時會遇到采集不到熒光信號的情況,各位小伙伴是否也曾遇到過?今天,小沃帶大家梳理一遍采集不到信號的可能原因及實驗注意事項,助你實驗更順暢!
01病毒
1.病毒是否存在反復(fù)凍融現(xiàn)象,反復(fù)凍融會降低病毒滴度,從而影響病毒轉(zhuǎn)染效率。因此光纖記錄實驗中,病毒應(yīng)即拿即用,避免凍融。
2.病毒與目標腦區(qū)神經(jīng)元特異性結(jié)合程度也會影響熒光信號。
02病毒注射
1.手術(shù)前定位:通過預(yù)實驗對腦區(qū)精準定位(可通過臺盼藍注射定位)。在病毒注射前,我們可以先注射臺盼藍進行預(yù)實驗以達到練手的目的,提高后面實驗的成功率。
腦區(qū)坐標定位參考:調(diào)平時注意左右高度差小于0.03mm。
2.病毒注射:選擇較細直徑的玻璃電極可以減少注射損傷,對于淺層腦區(qū)注射,可減少病毒泄露。病毒注射后留針10min。
3.病毒注射檢測:切腦片看熒光表達。
熒光染色實驗拍不出帶有熒光的細胞,可能原因是顯微鏡聚焦未在神經(jīng)細胞這一層上(如上圖出現(xiàn)模糊團狀,可能會是細胞)、注射的腦區(qū)與病毒反應(yīng)的特異性神經(jīng)元數(shù)量太少、或是熒光淬滅掉了。
注意事項:
如果病毒沒注射成功,可能原因有手術(shù)中腦區(qū)定位有偏差導(dǎo)致病毒注射位置不對(目標腦區(qū)很小的話會常存在這個問題)、病毒注射后順著腦室流走、病毒注射后未留針導(dǎo)致病毒順著注射孔被析出。
03陶瓷插針埋植位置
1.病毒注射與陶瓷插針植入可以在同一個手術(shù)進行,避免二次手術(shù)對小鼠造成傷害;
2.選擇合適的夾持器,滿足不同深度及相對距離的植入手術(shù);
3.定期查看定位儀操作臂與夾持器的固定情況,防止角度偏差。
病毒注射表達區(qū)域與陶瓷插針的植入位置需要保持接近,根據(jù)文獻中數(shù)據(jù),超過100μm就會明顯影響信號強度。
HanQin et al., Neurophoton,2019
04耗材參數(shù)搭配
1.光纖記錄實驗對環(huán)境光比較敏感,建議實驗在光線相對穩(wěn)定、昏暗的環(huán)境下進行。光纖記錄更適合選擇黑色陶瓷插針與黑色陶瓷套管,可避免環(huán)境光對熒光信號的影響;
2.較大數(shù)值孔徑的耗材有助于熒光信號的傳輸,所有的配件耗材保持相同的芯徑、NA數(shù)值更有助于實驗記錄;
3.使用高強度的激光器對光纖進行漂白,使得光纖等耗材的自發(fā)熒光降低,減少噪聲干擾。
光纖漂白器
05光纖記錄參數(shù)設(shè)置
1.首先檢查線路連接:包括光纖與機器連接的端口,光纖與小鼠連接的端口(并使用酒精擦拭光纖端口和鏡頭)。
2.調(diào)高曝光時間:Cmos相機拍攝時間增加,有助于采集到熒光信號。
注意事項:
1.若未記錄到信號,可適當調(diào)高光源功率;
2.動物腦區(qū)較大,病毒注射量可適量增加;
3.病毒注射后也可先不埋植插針,待2-3周后病毒表達,陶瓷插針連接光纖一起植入,邊植入插針邊檢測鈣信號。
瑞沃德三色多通道光纖記錄系統(tǒng)
產(chǎn)品特點:
最大支持9通道同時采集,滿足多只動物或多個腦區(qū)位點同時實驗;
高靈敏雙檢測器,獨立分時序采集,避免熒光串擾;
專業(yè)集成信號采集、數(shù)據(jù)分析、行為學(xué)采集分析模塊;
輸出信號參數(shù)自定義調(diào)節(jié),可進行多種觸發(fā),實現(xiàn)刺激和記錄的閉環(huán)控制;
兼容光遺傳學(xué),實現(xiàn)同一位點記錄和刺激。
識別下方二維碼,即可申請免費試用
- 微課堂中藥農(nóng)殘檢測培訓(xùn)周:一周系統(tǒng)學(xué)習(xí)農(nóng)殘檢測核心關(guān)鍵點及樣品前處理實操技巧
- 干貨分享 | 光纖記錄技術(shù)深度解析,揭開拓展實驗研究的奧秘
光纖記錄(Fiber photometry)通過時間相關(guān)單光子計數(shù)(TCSPC)的光纖光學(xué)來測量熒光分子在大腦中發(fā)出的光信號?;诨驹?,使用直徑較小的光纖探頭就能實現(xiàn)傳輸并收集熒光信號,將采集到的發(fā)射信號通過二色鏡進行光譜分離,并通過濾波器聚焦到探測器上,即可檢測出熒光的實時動態(tài)變化。
所以光纖記錄方法的優(yōu)勢主要在于:
植入的光纖探頭體積小且柔韌性好,使得周圍組織損傷較??;
因為植入光纖體積小,方便同時記錄多個大腦區(qū)域的信號;
基于TCSPC的光纖是檢測發(fā)射光的超靈敏工具,滿足在低強度激發(fā)光下即可檢測熒光,從而減少了光漂白的機會,并延長了記錄時間。
目前光纖記錄常用于檢測鈣信號及神經(jīng)遞質(zhì)信號變化,背后原理是通過給實驗動物注射基因編碼型的熒光探針/生物傳感器,隨后通過光纖記錄即可檢測到對應(yīng)神經(jīng)信號的變化?;蚓幋a生物傳感器是一類生物分子信號介質(zhì),它被整合到細胞的基因組中,然后由細胞的分子機制產(chǎn)生。這些蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)可以被設(shè)計成在化學(xué)物質(zhì)存在或細胞環(huán)境變化時改變構(gòu)象,從而產(chǎn)生熒光信號。
常見的基因編碼型的生物傳感器根據(jù)應(yīng)用場景主要分為:
1、膜去極化。一旦動作電位(AP)被激活,AP將沿軸突向下傳播,并使突觸前鈕扣對應(yīng)的膜去極化(從?65 mV到+40 mV或更大)。這種膜去極化作為神經(jīng)元激活的分子特征,可以通過遺傳編碼的電壓指示探針(GEVIs)檢測;
2、電壓門控Ca2+通道激活和輸入。當膜去極化發(fā)生在突觸前活躍區(qū),電壓門控Ca2+通道打開,導(dǎo)致Ca2+快速內(nèi)流。這種升高的細胞質(zhì)Ca2+濃度(從~100-~400nM)的變化可以持續(xù)約50-150毫秒,通過基因編碼Ca2+指示劑(GECIs)即可檢測;
3、膜泡融合/胞外分泌。胞質(zhì)Ca2+水平升高觸發(fā)易于釋放的突觸囊泡的胞外排泄,這些突觸囊泡充滿了神經(jīng)遞質(zhì)。在胞外分泌過程中,當突觸囊泡與質(zhì)膜融合時,細胞外介質(zhì)(pH ~ 7.4)中和囊泡腔(pH ~ 5.5)的酸性pH值,這種中和作用可以通過pH值指標探針檢測,如pHluorin;
4、神經(jīng)遞質(zhì)傳遞。一旦神經(jīng)遞質(zhì)被釋放到突觸,它們的功能根據(jù)遞質(zhì)類型而異,可以通過神經(jīng)遞質(zhì)(NT)指標檢測,如iAChSnFR和 dLight?;蚓幋a型乙酰膽堿(ACh)探針iAChSnFR用于檢測不同生物樣品中的ACh瞬變。它被設(shè)計成在膽堿結(jié)合時發(fā)出熒光,并被證實可用于測量小鼠體內(nèi)獎勵活動中海馬ACh傳遞的反應(yīng)。dLight是一種基于受體的遺傳編碼多巴胺(DA)熒光探針。它是通過用環(huán)狀排列的綠色熒光蛋白(cpGFP)取代DA受體(DAR)的第三個胞內(nèi)環(huán)(Intracellular Loop 3,ICL3)的位置而構(gòu)建的。dLight產(chǎn)生不同的熒光強度對應(yīng)于DA與DAR的結(jié)合量。
圖1所示:光纖記錄系統(tǒng)原理和基因編碼熒光探針。
A.光纖記錄裝置和信號處理的原理圖。在該模型中,將基因編碼的熒光探針病毒注射到腹側(cè)被蓋區(qū)(VTA),投射的信號從伏隔核(NAc)和前額皮質(zhì)(PFC)記錄下來。
B.四種不同的基因編碼型探針及其對應(yīng)的神經(jīng)傳遞分子信號的示意圖表示。隨著動作電位(AP)的傳播,電壓門控鈣(Ca2+)通道被觸發(fā)打開,導(dǎo)致快速的Ca2+內(nèi)流;隨即誘導(dǎo)突觸囊泡的胞吐,突觸囊泡將神經(jīng)遞質(zhì)(NTs)釋放到突觸間隙,在突觸間隙中神經(jīng)遞質(zhì)可以與相應(yīng)的受體結(jié)合并激活突觸后神經(jīng)元,這些分子特征可以通過電壓指標(GEVIs) ,Ca2+探針(GECIs), pH值指標探針(如pHluorin),NT指標探針(G protein-coupled受體,GCPR)進行檢測。示意圖非真實比例。
光纖記錄實驗操作較為簡便,目前在神經(jīng)環(huán)路分子機制探究上應(yīng)用越發(fā)廣泛,同時越來越多的實驗室將光纖記錄與其他實驗技術(shù)進行聯(lián)合應(yīng)用。
1、光纖記錄與光遺傳
光遺傳學(xué)是一種以光作為工具特異性激活或抑制神經(jīng)傳遞的方法。研究人員經(jīng)常使用光遺傳學(xué)以極大的時間精確度來研究確定的神經(jīng)元亞群對特定行為的影響。但是光照的作用僅僅通過動物行為的檢測評估是不完善的,很有可能存在“假陽性”和“假陰性”,且不能排除自然行為的干擾。而光纖記錄即可提供足夠的證據(jù)支撐。光遺傳學(xué)結(jié)合光纖記錄的方法使研究人員能夠研究特定細胞、它們的投射關(guān)系的功能意義。
2、光纖記錄與核磁
一般認為,血氧水平檢測(BOLD) fMRI(功能性磁共振成像)通過血管耦合機制與神經(jīng)傳遞在時空上相關(guān)。為了更深入地了解神經(jīng)元對BOLD信號的貢獻,電生理學(xué)技術(shù)已被納入功能磁共振成像研究。雖然這些研究提供了關(guān)于神經(jīng)元環(huán)路更具體的信息,但功能磁共振成像(fMRI)所需要的磁場會在電生理信號中產(chǎn)生偽影。
而近幾年的研究中將光纖記錄和fMRI相結(jié)合,證明了Ca2+峰值和不同大腦區(qū)域的BOLD信號之間的聯(lián)系,同時有文獻證明星形膠質(zhì)細胞Ca2+水平的變化與BOLD信號也有關(guān)聯(lián)。fMRI技術(shù)與光纖記錄相結(jié)合,使fMRI掃描具有細胞分辨率。這種綜合技術(shù)有潛力闡明單個神經(jīng)元亞群對大腦回路的貢獻。
圖2所示:將BOLD fMRI技術(shù)與細胞-特異性病毒傳遞的GCaMP6(一種遺傳編碼的鈣指示劑,GECI)的光學(xué)檢測技術(shù)相結(jié)合(Schlegel et al .,Nature protocols(2018))
3、光纖記錄與電生理
目前,電生理學(xué)是研究行為與自由行為動物體內(nèi)神經(jīng)元動力學(xué)關(guān)系的金標準分析技術(shù)。電生理學(xué)允許同時記錄數(shù)百或數(shù)千個細胞、離子通道和神經(jīng)元活動,電極可以落在單個細胞上,記錄細胞內(nèi)信號變化,或者落在細胞外空間,監(jiān)測整個大腦區(qū)域的電生理信號。它測量的電信號(電流或電位)以高時間分辨率的毫秒級離子通量導(dǎo)出。
電極陣列記錄來自電極尖端附近所有細胞的信號,不能直接區(qū)分細胞種類。由于光纖記錄方法缺乏較高的時間分辨率,在體電生理學(xué)缺乏細胞類型特異性,二者結(jié)合有助于高時空分辨率下研究不同的大腦區(qū)域特定環(huán)路和行為狀態(tài)。
R820三色光纖記錄系統(tǒng),可記錄GCaMP、dLight等綠色熒光指示劑或遞質(zhì)探針,及RCaMP、jrGECO1a等紅色指示劑或遞質(zhì)探針信號,同時特有的410nm光源用于獲取對照信號,有效排除噪聲。靈活的TTL信號輸入輸出設(shè)置,更方便拓展實驗應(yīng)用。
R820三色多通道光纖記錄系統(tǒng)
免費試用
識別上方二維碼,快來申請試用吧
4月突出貢獻榜
推薦主頁
最新話題

深圳市瑞沃德生命科技有限公司




參與評論
登錄后參與評論