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干貨分享 | 光纖記錄技術(shù)深度解析,揭開拓展實(shí)驗(yàn)研究的奧秘

深圳市瑞沃德生命科技有限公司 2021-10-26 10:28:11 1523  瀏覽
  • 光纖記錄(Fiber photometry)通過(guò)時(shí)間相關(guān)單光子計(jì)數(shù)(TCSPC)的光纖光學(xué)來(lái)測(cè)量熒光分子在大腦中發(fā)出的光信號(hào)。基于基本原理,使用直徑較小的光纖探頭就能實(shí)現(xiàn)傳輸并收集熒光信號(hào),將采集到的發(fā)射信號(hào)通過(guò)二色鏡進(jìn)行光譜分離,并通過(guò)濾波器聚焦到探測(cè)器上,即可檢測(cè)出熒光的實(shí)時(shí)動(dòng)態(tài)變化。


    所以光纖記錄方法的優(yōu)勢(shì)主要在于:

    1. 植入的光纖探頭體積小且柔韌性好,使得周圍組織損傷較?。?/p>

    2. 因?yàn)橹踩牍饫w體積小,方便同時(shí)記錄多個(gè)大腦區(qū)域的信號(hào);

    3. 基于TCSPC的光纖是檢測(cè)發(fā)射光的超靈敏工具,滿足在低強(qiáng)度激發(fā)光下即可檢測(cè)熒光,從而減少了光漂白的機(jī)會(huì),并延長(zhǎng)了記錄時(shí)間。

    目前光纖記錄常用于檢測(cè)鈣信號(hào)及神經(jīng)遞質(zhì)信號(hào)變化,背后原理是通過(guò)給實(shí)驗(yàn)動(dòng)物注射基因編碼型的熒光探針/生物傳感器,隨后通過(guò)光纖記錄即可檢測(cè)到對(duì)應(yīng)神經(jīng)信號(hào)的變化?;蚓幋a生物傳感器是一類生物分子信號(hào)介質(zhì),它被整合到細(xì)胞的基因組中,然后由細(xì)胞的分子機(jī)制產(chǎn)生。這些蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)可以被設(shè)計(jì)成在化學(xué)物質(zhì)存在或細(xì)胞環(huán)境變化時(shí)改變構(gòu)象,從而產(chǎn)生熒光信號(hào)。


    常見的基因編碼型的生物傳感器根據(jù)應(yīng)用場(chǎng)景主要分為:

    1、膜去極化。一旦動(dòng)作電位(AP)被激活,AP將沿軸突向下傳播,并使突觸前鈕扣對(duì)應(yīng)的膜去極化(從?65 mV到+40 mV或更大)。這種膜去極化作為神經(jīng)元激活的分子特征,可以通過(guò)遺傳編碼的電壓指示探針(GEVIs)檢測(cè);

    2、電壓門控Ca2+通道激活和輸入。當(dāng)膜去極化發(fā)生在突觸前活躍區(qū),電壓門控Ca2+通道打開,導(dǎo)致Ca2+快速內(nèi)流。這種升高的細(xì)胞質(zhì)Ca2+濃度(從~100-~400nM)的變化可以持續(xù)約50-150毫秒,通過(guò)基因編碼Ca2+指示劑(GECIs)即可檢測(cè);

    3、膜泡融合/胞外分泌。胞質(zhì)Ca2+水平升高觸發(fā)易于釋放的突觸囊泡的胞外排泄,這些突觸囊泡充滿了神經(jīng)遞質(zhì)。在胞外分泌過(guò)程中,當(dāng)突觸囊泡與質(zhì)膜融合時(shí),細(xì)胞外介質(zhì)(pH ~ 7.4)中和囊泡腔(pH ~ 5.5)的酸性pH值,這種中和作用可以通過(guò)pH值指標(biāo)探針檢測(cè),如pHluorin;

    4、神經(jīng)遞質(zhì)傳遞。一旦神經(jīng)遞質(zhì)被釋放到突觸,它們的功能根據(jù)遞質(zhì)類型而異,可以通過(guò)神經(jīng)遞質(zhì)(NT)指標(biāo)檢測(cè),如iAChSnFR和 dLight。基因編碼型乙酰膽堿(ACh)探針iAChSnFR用于檢測(cè)不同生物樣品中的ACh瞬變。它被設(shè)計(jì)成在膽堿結(jié)合時(shí)發(fā)出熒光,并被證實(shí)可用于測(cè)量小鼠體內(nèi)獎(jiǎng)勵(lì)活動(dòng)中海馬ACh傳遞的反應(yīng)。dLight是一種基于受體的遺傳編碼多巴胺(DA)熒光探針。它是通過(guò)用環(huán)狀排列的綠色熒光蛋白(cpGFP)取代DA受體(DAR)的第三個(gè)胞內(nèi)環(huán)(Intracellular Loop 3,ICL3)的位置而構(gòu)建的。dLight產(chǎn)生不同的熒光強(qiáng)度對(duì)應(yīng)于DA與DAR的結(jié)合量。

    圖1所示:光纖記錄系統(tǒng)原理和基因編碼熒光探針。

    A.光纖記錄裝置和信號(hào)處理的原理圖。在該模型中,將基因編碼的熒光探針病毒注射到腹側(cè)被蓋區(qū)(VTA),投射的信號(hào)從伏隔核(NAc)和前額皮質(zhì)(PFC)記錄下來(lái)。

    B.四種不同的基因編碼型探針及其對(duì)應(yīng)的神經(jīng)傳遞分子信號(hào)的示意圖表示。隨著動(dòng)作電位(AP)的傳播,電壓門控鈣(Ca2+)通道被觸發(fā)打開,導(dǎo)致快速的Ca2+內(nèi)流;隨即誘導(dǎo)突觸囊泡的胞吐,突觸囊泡將神經(jīng)遞質(zhì)(NTs)釋放到突觸間隙,在突觸間隙中神經(jīng)遞質(zhì)可以與相應(yīng)的受體結(jié)合并激活突觸后神經(jīng)元,這些分子特征可以通過(guò)電壓指標(biāo)(GEVIs) ,Ca2+探針(GECIs), pH值指標(biāo)探針(如pHluorin),NT指標(biāo)探針(G protein-coupled受體,GCPR)進(jìn)行檢測(cè)。示意圖非真實(shí)比例。


    光纖記錄實(shí)驗(yàn)操作較為簡(jiǎn)便,目前在神經(jīng)環(huán)路分子機(jī)制探究上應(yīng)用越發(fā)廣泛,同時(shí)越來(lái)越多的實(shí)驗(yàn)室將光纖記錄與其他實(shí)驗(yàn)技術(shù)進(jìn)行聯(lián)合應(yīng)用。

    1、光纖記錄與光遺傳

    光遺傳學(xué)是一種以光作為工具特異性激活或抑制神經(jīng)傳遞的方法。研究人員經(jīng)常使用光遺傳學(xué)以極大的時(shí)間精確度來(lái)研究確定的神經(jīng)元亞群對(duì)特定行為的影響。但是光照的作用僅僅通過(guò)動(dòng)物行為的檢測(cè)評(píng)估是不完善的,很有可能存在“假陽(yáng)性”和“假陰性”,且不能排除自然行為的干擾。而光纖記錄即可提供足夠的證據(jù)支撐。光遺傳學(xué)結(jié)合光纖記錄的方法使研究人員能夠研究特定細(xì)胞、它們的投射關(guān)系的功能意義。

    2、光纖記錄與核磁

    一般認(rèn)為,血氧水平檢測(cè)(BOLD) fMRI(功能性磁共振成像)通過(guò)血管耦合機(jī)制與神經(jīng)傳遞在時(shí)空上相關(guān)。為了更深入地了解神經(jīng)元對(duì)BOLD信號(hào)的貢獻(xiàn),電生理學(xué)技術(shù)已被納入功能磁共振成像研究。雖然這些研究提供了關(guān)于神經(jīng)元環(huán)路更具體的信息,但功能磁共振成像(fMRI)所需要的磁場(chǎng)會(huì)在電生理信號(hào)中產(chǎn)生偽影。

    而近幾年的研究中將光纖記錄和fMRI相結(jié)合,證明了Ca2+峰值和不同大腦區(qū)域的BOLD信號(hào)之間的聯(lián)系,同時(shí)有文獻(xiàn)證明星形膠質(zhì)細(xì)胞Ca2+水平的變化與BOLD信號(hào)也有關(guān)聯(lián)。fMRI技術(shù)與光纖記錄相結(jié)合,使fMRI掃描具有細(xì)胞分辨率。這種綜合技術(shù)有潛力闡明單個(gè)神經(jīng)元亞群對(duì)大腦回路的貢獻(xiàn)。

    圖2所示:將BOLD fMRI技術(shù)與細(xì)胞-特異性病毒傳遞的GCaMP6(一種遺傳編碼的鈣指示劑,GECI)的光學(xué)檢測(cè)技術(shù)相結(jié)合(Schlegel et al .,Nature protocols(2018))

    3、光纖記錄與電生理

    目前,電生理學(xué)是研究行為與自由行為動(dòng)物體內(nèi)神經(jīng)元?jiǎng)恿W(xué)關(guān)系的金標(biāo)準(zhǔn)分析技術(shù)。電生理學(xué)允許同時(shí)記錄數(shù)百或數(shù)千個(gè)細(xì)胞、離子通道和神經(jīng)元活動(dòng),電極可以落在單個(gè)細(xì)胞上,記錄細(xì)胞內(nèi)信號(hào)變化,或者落在細(xì)胞外空間,監(jiān)測(cè)整個(gè)大腦區(qū)域的電生理信號(hào)。它測(cè)量的電信號(hào)(電流或電位)以高時(shí)間分辨率的毫秒級(jí)離子通量導(dǎo)出。

    電極陣列記錄來(lái)自電極尖端附近所有細(xì)胞的信號(hào),不能直接區(qū)分細(xì)胞種類。由于光纖記錄方法缺乏較高的時(shí)間分辨率,在體電生理學(xué)缺乏細(xì)胞類型特異性,二者結(jié)合有助于高時(shí)空分辨率下研究不同的大腦區(qū)域特定環(huán)路和行為狀態(tài)。

    R820三色光纖記錄系統(tǒng),可記錄GCaMP、dLight等綠色熒光指示劑或遞質(zhì)探針,及RCaMP、jrGECO1a等紅色指示劑或遞質(zhì)探針信號(hào),同時(shí)特有的410nm光源用于獲取對(duì)照信號(hào),有效排除噪聲。靈活的TTL信號(hào)輸入輸出設(shè)置,更方便拓展實(shí)驗(yàn)應(yīng)用。

    R820三色多通道光纖記錄系統(tǒng)

    免費(fèi)試用

    識(shí)別上方二維碼,快來(lái)申請(qǐng)?jiān)囉冒?/p>


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干貨分享 | 光纖記錄技術(shù)深度解析,揭開拓展實(shí)驗(yàn)研究的奧秘

光纖記錄(Fiber photometry)通過(guò)時(shí)間相關(guān)單光子計(jì)數(shù)(TCSPC)的光纖光學(xué)來(lái)測(cè)量熒光分子在大腦中發(fā)出的光信號(hào)?;诨驹恚褂弥睆捷^小的光纖探頭就能實(shí)現(xiàn)傳輸并收集熒光信號(hào),將采集到的發(fā)射信號(hào)通過(guò)二色鏡進(jìn)行光譜分離,并通過(guò)濾波器聚焦到探測(cè)器上,即可檢測(cè)出熒光的實(shí)時(shí)動(dòng)態(tài)變化。


所以光纖記錄方法的優(yōu)勢(shì)主要在于:

  1. 植入的光纖探頭體積小且柔韌性好,使得周圍組織損傷較??;

  2. 因?yàn)橹踩牍饫w體積小,方便同時(shí)記錄多個(gè)大腦區(qū)域的信號(hào);

  3. 基于TCSPC的光纖是檢測(cè)發(fā)射光的超靈敏工具,滿足在低強(qiáng)度激發(fā)光下即可檢測(cè)熒光,從而減少了光漂白的機(jī)會(huì),并延長(zhǎng)了記錄時(shí)間。

目前光纖記錄常用于檢測(cè)鈣信號(hào)及神經(jīng)遞質(zhì)信號(hào)變化,背后原理是通過(guò)給實(shí)驗(yàn)動(dòng)物注射基因編碼型的熒光探針/生物傳感器,隨后通過(guò)光纖記錄即可檢測(cè)到對(duì)應(yīng)神經(jīng)信號(hào)的變化?;蚓幋a生物傳感器是一類生物分子信號(hào)介質(zhì),它被整合到細(xì)胞的基因組中,然后由細(xì)胞的分子機(jī)制產(chǎn)生。這些蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)可以被設(shè)計(jì)成在化學(xué)物質(zhì)存在或細(xì)胞環(huán)境變化時(shí)改變構(gòu)象,從而產(chǎn)生熒光信號(hào)。


常見的基因編碼型的生物傳感器根據(jù)應(yīng)用場(chǎng)景主要分為:

1、膜去極化。一旦動(dòng)作電位(AP)被激活,AP將沿軸突向下傳播,并使突觸前鈕扣對(duì)應(yīng)的膜去極化(從?65 mV到+40 mV或更大)。這種膜去極化作為神經(jīng)元激活的分子特征,可以通過(guò)遺傳編碼的電壓指示探針(GEVIs)檢測(cè);

2、電壓門控Ca2+通道激活和輸入。當(dāng)膜去極化發(fā)生在突觸前活躍區(qū),電壓門控Ca2+通道打開,導(dǎo)致Ca2+快速內(nèi)流。這種升高的細(xì)胞質(zhì)Ca2+濃度(從~100-~400nM)的變化可以持續(xù)約50-150毫秒,通過(guò)基因編碼Ca2+指示劑(GECIs)即可檢測(cè);

3、膜泡融合/胞外分泌。胞質(zhì)Ca2+水平升高觸發(fā)易于釋放的突觸囊泡的胞外排泄,這些突觸囊泡充滿了神經(jīng)遞質(zhì)。在胞外分泌過(guò)程中,當(dāng)突觸囊泡與質(zhì)膜融合時(shí),細(xì)胞外介質(zhì)(pH ~ 7.4)中和囊泡腔(pH ~ 5.5)的酸性pH值,這種中和作用可以通過(guò)pH值指標(biāo)探針檢測(cè),如pHluorin;

4、神經(jīng)遞質(zhì)傳遞。一旦神經(jīng)遞質(zhì)被釋放到突觸,它們的功能根據(jù)遞質(zhì)類型而異,可以通過(guò)神經(jīng)遞質(zhì)(NT)指標(biāo)檢測(cè),如iAChSnFR和 dLight。基因編碼型乙酰膽堿(ACh)探針iAChSnFR用于檢測(cè)不同生物樣品中的ACh瞬變。它被設(shè)計(jì)成在膽堿結(jié)合時(shí)發(fā)出熒光,并被證實(shí)可用于測(cè)量小鼠體內(nèi)獎(jiǎng)勵(lì)活動(dòng)中海馬ACh傳遞的反應(yīng)。dLight是一種基于受體的遺傳編碼多巴胺(DA)熒光探針。它是通過(guò)用環(huán)狀排列的綠色熒光蛋白(cpGFP)取代DA受體(DAR)的第三個(gè)胞內(nèi)環(huán)(Intracellular Loop 3,ICL3)的位置而構(gòu)建的。dLight產(chǎn)生不同的熒光強(qiáng)度對(duì)應(yīng)于DA與DAR的結(jié)合量。

圖1所示:光纖記錄系統(tǒng)原理和基因編碼熒光探針。

A.光纖記錄裝置和信號(hào)處理的原理圖。在該模型中,將基因編碼的熒光探針病毒注射到腹側(cè)被蓋區(qū)(VTA),投射的信號(hào)從伏隔核(NAc)和前額皮質(zhì)(PFC)記錄下來(lái)。

B.四種不同的基因編碼型探針及其對(duì)應(yīng)的神經(jīng)傳遞分子信號(hào)的示意圖表示。隨著動(dòng)作電位(AP)的傳播,電壓門控鈣(Ca2+)通道被觸發(fā)打開,導(dǎo)致快速的Ca2+內(nèi)流;隨即誘導(dǎo)突觸囊泡的胞吐,突觸囊泡將神經(jīng)遞質(zhì)(NTs)釋放到突觸間隙,在突觸間隙中神經(jīng)遞質(zhì)可以與相應(yīng)的受體結(jié)合并激活突觸后神經(jīng)元,這些分子特征可以通過(guò)電壓指標(biāo)(GEVIs) ,Ca2+探針(GECIs), pH值指標(biāo)探針(如pHluorin),NT指標(biāo)探針(G protein-coupled受體,GCPR)進(jìn)行檢測(cè)。示意圖非真實(shí)比例。


光纖記錄實(shí)驗(yàn)操作較為簡(jiǎn)便,目前在神經(jīng)環(huán)路分子機(jī)制探究上應(yīng)用越發(fā)廣泛,同時(shí)越來(lái)越多的實(shí)驗(yàn)室將光纖記錄與其他實(shí)驗(yàn)技術(shù)進(jìn)行聯(lián)合應(yīng)用。

1、光纖記錄與光遺傳

光遺傳學(xué)是一種以光作為工具特異性激活或抑制神經(jīng)傳遞的方法。研究人員經(jīng)常使用光遺傳學(xué)以極大的時(shí)間精確度來(lái)研究確定的神經(jīng)元亞群對(duì)特定行為的影響。但是光照的作用僅僅通過(guò)動(dòng)物行為的檢測(cè)評(píng)估是不完善的,很有可能存在“假陽(yáng)性”和“假陰性”,且不能排除自然行為的干擾。而光纖記錄即可提供足夠的證據(jù)支撐。光遺傳學(xué)結(jié)合光纖記錄的方法使研究人員能夠研究特定細(xì)胞、它們的投射關(guān)系的功能意義。

2、光纖記錄與核磁

一般認(rèn)為,血氧水平檢測(cè)(BOLD) fMRI(功能性磁共振成像)通過(guò)血管耦合機(jī)制與神經(jīng)傳遞在時(shí)空上相關(guān)。為了更深入地了解神經(jīng)元對(duì)BOLD信號(hào)的貢獻(xiàn),電生理學(xué)技術(shù)已被納入功能磁共振成像研究。雖然這些研究提供了關(guān)于神經(jīng)元環(huán)路更具體的信息,但功能磁共振成像(fMRI)所需要的磁場(chǎng)會(huì)在電生理信號(hào)中產(chǎn)生偽影。

而近幾年的研究中將光纖記錄和fMRI相結(jié)合,證明了Ca2+峰值和不同大腦區(qū)域的BOLD信號(hào)之間的聯(lián)系,同時(shí)有文獻(xiàn)證明星形膠質(zhì)細(xì)胞Ca2+水平的變化與BOLD信號(hào)也有關(guān)聯(lián)。fMRI技術(shù)與光纖記錄相結(jié)合,使fMRI掃描具有細(xì)胞分辨率。這種綜合技術(shù)有潛力闡明單個(gè)神經(jīng)元亞群對(duì)大腦回路的貢獻(xiàn)。

圖2所示:將BOLD fMRI技術(shù)與細(xì)胞-特異性病毒傳遞的GCaMP6(一種遺傳編碼的鈣指示劑,GECI)的光學(xué)檢測(cè)技術(shù)相結(jié)合(Schlegel et al .,Nature protocols(2018))

3、光纖記錄與電生理

目前,電生理學(xué)是研究行為與自由行為動(dòng)物體內(nèi)神經(jīng)元?jiǎng)恿W(xué)關(guān)系的金標(biāo)準(zhǔn)分析技術(shù)。電生理學(xué)允許同時(shí)記錄數(shù)百或數(shù)千個(gè)細(xì)胞、離子通道和神經(jīng)元活動(dòng),電極可以落在單個(gè)細(xì)胞上,記錄細(xì)胞內(nèi)信號(hào)變化,或者落在細(xì)胞外空間,監(jiān)測(cè)整個(gè)大腦區(qū)域的電生理信號(hào)。它測(cè)量的電信號(hào)(電流或電位)以高時(shí)間分辨率的毫秒級(jí)離子通量導(dǎo)出。

電極陣列記錄來(lái)自電極尖端附近所有細(xì)胞的信號(hào),不能直接區(qū)分細(xì)胞種類。由于光纖記錄方法缺乏較高的時(shí)間分辨率,在體電生理學(xué)缺乏細(xì)胞類型特異性,二者結(jié)合有助于高時(shí)空分辨率下研究不同的大腦區(qū)域特定環(huán)路和行為狀態(tài)。

R820三色光纖記錄系統(tǒng),可記錄GCaMP、dLight等綠色熒光指示劑或遞質(zhì)探針,及RCaMP、jrGECO1a等紅色指示劑或遞質(zhì)探針信號(hào),同時(shí)特有的410nm光源用于獲取對(duì)照信號(hào),有效排除噪聲。靈活的TTL信號(hào)輸入輸出設(shè)置,更方便拓展實(shí)驗(yàn)應(yīng)用。

R820三色多通道光纖記錄系統(tǒng)

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2021-10-26 10:28:11 1523 0
光纖記錄詳解,一文帶你詳細(xì)了解光纖記錄實(shí)驗(yàn)!

一、光纖記錄工作原理

人類的大腦擁有約900億個(gè)神經(jīng)元,神經(jīng)元之間通過(guò)突觸相互連接形成了復(fù)雜的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),并由此產(chǎn)生各種復(fù)雜的功能。大腦能夠合成和釋放上百種神經(jīng)遞質(zhì),神經(jīng)信號(hào)通過(guò)突觸釋放的神經(jīng)遞質(zhì)從而在神經(jīng)元之間進(jìn)行傳遞(圖1)。

圖1

當(dāng)神經(jīng)興奮傳導(dǎo)到突觸末端時(shí),會(huì)刺激突觸上鈣離子通道打開促使鈣離子大量?jī)?nèi)流,胞內(nèi)鈣離子濃度瞬時(shí)上升,驅(qū)動(dòng)突觸小泡將神經(jīng)遞質(zhì)釋放到突觸間隙中,釋放出的神經(jīng)遞質(zhì)隨即與突觸后膜上的受體結(jié)合,將遞質(zhì)信號(hào)傳遞給下一個(gè)神經(jīng)元,從而進(jìn)行信息的逐級(jí)傳遞(圖2)。這些神經(jīng)元以復(fù)雜的通路投射到多個(gè)腦區(qū),產(chǎn)生了學(xué)習(xí)認(rèn)知、情感、控制、動(dòng)機(jī)、獎(jiǎng)勵(lì)等豐富的功能。光纖記錄系統(tǒng)則可以通過(guò)檢測(cè)鈣離子和神經(jīng)遞質(zhì)的熒光變化程度來(lái)表征群體神經(jīng)元的活動(dòng)情況。

圖2

那么光纖記錄是如何檢測(cè)神經(jīng)活動(dòng)的呢?

以鈣離子熒光信號(hào)檢測(cè)為例,光纖記錄系統(tǒng)的技術(shù)原理是借助鈣離子濃度變化與神經(jīng)元活動(dòng)之間的嚴(yán)格對(duì)應(yīng)關(guān)系,利用特殊的熒光染料或者蛋白質(zhì)熒光探針,將神經(jīng)元中鈣離子的濃度通過(guò)熒光強(qiáng)度表現(xiàn)出來(lái),并被光纖記錄系統(tǒng)捕捉,從而達(dá)到檢測(cè)神經(jīng)元活動(dòng)的目的。

在神經(jīng)系統(tǒng)中,靜息狀態(tài)時(shí)神經(jīng)元胞內(nèi)鈣離子濃度為50-100nM,而在神經(jīng)元興奮時(shí)胞內(nèi)鈣離子濃度能上升10-100倍,因此我們可以通過(guò)注射鈣離子基因編碼指示劑(Calcium indicator,如GCaMPs、RCaMPs等)來(lái)標(biāo)記鈣離子。鈣離子指示劑帶有熒光蛋白(如GFP、RFP等)及其變異體的蛋白質(zhì),可與鈣調(diào)蛋白(CaM)和肌球蛋白輕鏈激酶M13域結(jié)合(圖3左)。當(dāng)神經(jīng)活動(dòng)增強(qiáng)時(shí)鈣離子通道打開,大量鈣離子內(nèi)流并與CaM結(jié)合,導(dǎo)致M13和CaM結(jié)構(gòu)域相互作用,引發(fā)cpEGFP結(jié)構(gòu)重排,從而增強(qiáng)綠色熒光信號(hào)(圖3 右)。

因此我們可以通過(guò)檢測(cè)鈣信號(hào)的變化來(lái)表征神經(jīng)元的活動(dòng),進(jìn)而研究神經(jīng)元活動(dòng)與動(dòng)物行為的相關(guān)性,探究復(fù)雜行為背后的調(diào)控機(jī)制。

圖3

(Marisela Morales, et al. Neuron, 2020)

圖4:VTA-VGluT2神經(jīng)元編碼先天逃避反應(yīng)

光纖記錄檢測(cè)神經(jīng)遞質(zhì)信號(hào)的原理與上述方法相同,把cpEGFP嵌入特定的神經(jīng)遞質(zhì)受體,受體與神經(jīng)遞質(zhì)結(jié)合后會(huì)引發(fā)受體構(gòu)象改變并發(fā)出熒光信號(hào)(圖5)。通過(guò)病毒注射、轉(zhuǎn)染等技術(shù)手段,可以將這種可遺傳編碼的探針表達(dá)在細(xì)胞或小鼠腦部,借助成像技術(shù),觀察神經(jīng)遞質(zhì)濃度的實(shí)時(shí)變化。

圖5

(Yulong Li, et al. Cell, 2018)

圖6:條件反射實(shí)驗(yàn)中伏隔核Nac腦區(qū)的DA釋放


二、光纖記錄實(shí)驗(yàn)方法

在光纖記錄實(shí)驗(yàn)中,首先要選擇合適的熒光病毒。熒光染料或指示劑是通過(guò)病毒載體轉(zhuǎn)入目標(biāo)腦區(qū),常用載體為AAV病毒。根據(jù)實(shí)驗(yàn)的不同,需要選擇特異啟動(dòng)子或者Cre-FloxP系統(tǒng)來(lái)特異標(biāo)記目標(biāo)神經(jīng)元,無(wú)特異性的GCaMPs表達(dá)雖然可以觀測(cè)群體神經(jīng)元活動(dòng)但無(wú)神經(jīng)元特異性,光纖記錄的作用在于觀測(cè)特異類型神經(jīng)元群體的活動(dòng)。

實(shí)驗(yàn)流程:

1、在目標(biāo)腦區(qū)注射鈣熒光病毒,并在注射位點(diǎn)埋植光纖插針,用于收集熒光;

圖7:病毒注射與陶瓷插針埋植

2、待2-3周鈣熒光病毒表達(dá)后,連接光纖,使用光纖記錄系統(tǒng)采集動(dòng)物在行為學(xué)實(shí)驗(yàn)中大腦的鈣熒光信號(hào);

圖8:病毒表達(dá)

3、通過(guò)分析軟件處理鈣熒光信號(hào)數(shù)據(jù),并結(jié)合行為學(xué)視頻對(duì)動(dòng)物的行為進(jìn)行分析。

圖9:光纖記錄結(jié)合高架十字迷宮實(shí)驗(yàn)


三、光纖記錄數(shù)據(jù)分析

以瑞沃德R820三色光纖記錄系統(tǒng)記錄的數(shù)據(jù)為例。

1、數(shù)據(jù)預(yù)處理。R820三色光纖記錄系統(tǒng)軟件集信號(hào)采集與數(shù)據(jù)分析于一體,在數(shù)據(jù)分析中,數(shù)據(jù)預(yù)處理過(guò)程包含平滑處理,基線矯正,運(yùn)動(dòng)矯正等功能。

平滑處理可以將數(shù)據(jù)中的過(guò)多雜信號(hào)去除,最大限度的突出目標(biāo)peak?;€矯正多數(shù)針對(duì)的是熒光信號(hào)因長(zhǎng)時(shí)間記錄導(dǎo)致漂白信號(hào)逐步下降,或者光纖的自發(fā)熒光在長(zhǎng)期記錄下逐步被漂白基線逐步下降等情況。此情形的數(shù)據(jù)因?yàn)檎w呈現(xiàn)下降趨勢(shì),不利于后續(xù)數(shù)據(jù)作圖分析,所以需要進(jìn)行基線矯正。運(yùn)動(dòng)矯正用于采用410nm對(duì)照通道的數(shù)據(jù),410nm數(shù)據(jù)可以用于反應(yīng)背景噪音信號(hào),運(yùn)動(dòng)矯正即將410nm數(shù)據(jù)與470nm數(shù)據(jù)進(jìn)行擬合,通過(guò)算法從470數(shù)據(jù)中去除410nm數(shù)據(jù)的波動(dòng),得到真實(shí)的熒光數(shù)據(jù)。

圖10:光纖記錄數(shù)據(jù)預(yù)處理

2. 將熒光數(shù)據(jù)與動(dòng)物行為數(shù)據(jù)同步對(duì)比,選擇事件標(biāo)記或者增加事件標(biāo)記,事件相關(guān)信號(hào)分析作圖。

圖11:事件分析

3. 將不同組的數(shù)據(jù)進(jìn)行組間對(duì)比,即可分析不同處理因素下熒光數(shù)據(jù)的差異。此外,還可結(jié)合行為學(xué)視頻同步分析動(dòng)物的運(yùn)動(dòng)軌跡。

圖12:不同數(shù)據(jù)組間分析

通過(guò)以上步驟,原始的熒光數(shù)據(jù)就可以直接出圖啦。

光纖記錄實(shí)驗(yàn)的工作原理,實(shí)驗(yàn)方法以及數(shù)據(jù)分析已經(jīng)全部講完啦….

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2022-02-16 17:31:31 1673 0
深度解析!vocs廢氣治理中的熱分解技術(shù)

熱分解工藝一般分為直燃(TO)、蓄熱燃燒(RTO)、催化燃燒(CO)、蓄熱催化燃燒(RCO)4種,只是燃燒方式和換熱方式的兩兩不同組合,主要可以用于處理吸附濃縮氣,也可以用于直接處理廢氣濃度>3.5g/m3的中高濃度廢氣。

1)TO是將高濃廢氣送入燃燒室直接燃燒(燃燒室內(nèi)一般有一股長(zhǎng)明火),廢氣中有機(jī)物在750℃以上燃燒生成CO2和水,高溫燃燒氣通過(guò)換熱器與新進(jìn)廢氣間接換熱后排掉,換熱效率一般≤60%導(dǎo)致運(yùn)行成本很高,只在少數(shù)能有效利用排放余熱或有副產(chǎn)燃?xì)獾钠髽I(yè)中應(yīng)用。

2)RTO的燃燒方式與TO相同,只是將換熱器改為蓄熱陶瓷,高溫燃燒氣與新進(jìn)廢氣交替進(jìn)入蓄熱陶瓷直接換熱,熱量利用率可提高到90%以上,理念先進(jìn),運(yùn)行成本較低,是目前國(guó)家主推的廢氣治理工藝。

3)CO是采用貴重金屬催化劑降低廢氣中有機(jī)物與O2的反應(yīng)活化能,使得有機(jī)物可以在250~350℃較低的溫度就能充分氧化生成CO2和H2O,屬無(wú)焰燃燒,高溫氧化氣通過(guò)換熱器與新進(jìn)廢氣間接換熱后排掉,熱量利用率一般≤75%,常用于處理吸附劑再生脫附出來(lái)的高濃廢氣。

4)RCO燃燒方式與CO相同,換熱方式與RTO相同,由于投資堪比RTO,能處理的廢氣種類受催化劑影響又比RTO少,所以很少用企業(yè)采用RCO工藝。熱分解以RTO和CO的應(yīng)用例子較多,如果用于處理吸附脫附的濃縮氣,兩者差別不大,但若直接處理中高濃度廢氣時(shí)有很大區(qū)別,需要企業(yè)認(rèn)真對(duì)待。

 RTO與CO在處理中高濃度廢氣中各方面的異同

現(xiàn)就廢氣適用種類、廢氣濃度、廢氣流量、輔助能源、儀表自控、安全風(fēng)險(xiǎn)、環(huán)保風(fēng)險(xiǎn)、動(dòng)力負(fù)荷、主設(shè)備投資、運(yùn)行成本等方面進(jìn)行比較。

2.1廢氣適用種類

兩種工藝都可以用于處理烷烴、芳香烴、酮、醇、酯、醚、部分含氮化合物等有機(jī)廢氣。含硫磷類廢氣會(huì)使催化劑中毒,不適合用CO處理,而如果忽略含硫磷廢氣燃燒時(shí)對(duì)設(shè)備儀表的少量腐蝕,可以限制性的使用RTO處理。

由于處理溫度均<1150℃,兩種工藝都不能用于處理含鹵代烴廢氣以避免產(chǎn)生二噁英。部分類似硅烷類的廢氣因?yàn)槿紵笊傻墓腆w塵灰會(huì)堵塞催化劑或蓄熱陶瓷或切換閥密封面,所以RTO和CO都不能使用。

含漆霧粉塵類廢氣要預(yù)過(guò)濾以避免切換閥關(guān)不緊、蓄熱體阻塞等現(xiàn)象,RTO的預(yù)處理要過(guò)濾到至少F6級(jí);而CO處理廢氣主流通道上無(wú)切換閥,加上可以采用讓廢氣流速較高粉塵不易結(jié)存、定期給整個(gè)系統(tǒng)升溫回火將粉塵剝離分解等方法,因此CO的預(yù)處理只需簡(jiǎn)單過(guò)濾到G4級(jí)。

此外,因?yàn)楹鬃跃塾袡C(jī)物(如丁二烯、丙烯酸酯等)廢氣會(huì)影響到切換閥的有效開閉,同時(shí)也可能在位于廢氣進(jìn)口處的蓄熱體上低溫沉積,使用RTO處理該類廢氣時(shí)會(huì)有安全隱患,而CO則不受影響。


2020-06-16 14:54:21 501 0
大成學(xué)堂 | 膜片鉗技術(shù)解析與經(jīng)驗(yàn)分享直播,帶你輕松破解實(shí)驗(yàn)難題!

在日常膜片鉗實(shí)驗(yàn)時(shí),你是否也被這些問(wèn)題困擾?

操作十分復(fù)雜,一不小心就出錯(cuò)

注意事項(xiàng)多,包括如何排除噪音、提高封接成功率等等

想要借鑒該領(lǐng)域?qū)<医?jīng)驗(yàn),一直苦尋不到……

8月23日(周二)19:00,「大成學(xué)堂」特邀南京大學(xué)張洋潯博士做客直播間,為大家?guī)?lái)“膜片鉗技術(shù)解析與經(jīng)驗(yàn)分享”。通過(guò)本次直播課程,你可以收獲膜片鉗技術(shù)的詳細(xì)解析、多年實(shí)驗(yàn)操作經(jīng)驗(yàn)、日常操作注意事項(xiàng)等方面的專業(yè)知識(shí),還可在線提問(wèn)獲得詳細(xì)解答。 


課程內(nèi)容
膜片鉗技術(shù)解析
實(shí)驗(yàn)操作經(jīng)驗(yàn)分享
實(shí)驗(yàn)注意事項(xiàng)

直播時(shí)間
8月23日(周二)19:00

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張洋潯 博士

南京大學(xué)博士,致力于研究?jī)?nèi)源性神經(jīng)遞質(zhì)/調(diào)質(zhì)系統(tǒng)及外源性藥物對(duì)前庭代償?shù)挠绊懠吧窠?jīng)機(jī)制,擅長(zhǎng)應(yīng)用全細(xì)胞膜片鉗記錄、環(huán)路示蹤、光/化學(xué)遺傳學(xué)操控方法、光纖記錄等實(shí)驗(yàn)技術(shù)。相關(guān)研究成果發(fā)表在Journal of Neuroscience, Biomedicine & Pharmacotherapy, Neuroscience Bulletin等學(xué)術(shù)期刊。


8月23日(周二)19:00

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2022-08-22 10:20:55 394 0
實(shí)操技巧|光纖記錄實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)處理操作方法

你在進(jìn)行光纖記錄實(shí)驗(yàn)時(shí),是否有如下煩腦:

◆ 記錄好的數(shù)據(jù)看著很雜亂,不知如何整理?

◆ 數(shù)據(jù)處理包含哪些步驟?

◆ 如何確定數(shù)據(jù)分析的baseline

◆ ΔF/F指的是什么?

◆ 信號(hào)出現(xiàn)了“漂白效應(yīng)”怎么辦?

無(wú)需困惑,對(duì)以上問(wèn)題,我們最近總結(jié)了一份實(shí)操步驟,這份操作指南可幫你迅速上手?jǐn)?shù)據(jù)處理


常見光纖記錄數(shù)據(jù)處理過(guò)程

讓我們來(lái)看一張?jiān)紨?shù)據(jù)案例圖,下圖顯示數(shù)據(jù)整體波動(dòng)過(guò)于密集,其中410nm對(duì)照通道數(shù)據(jù)不夠穩(wěn)定;對(duì)應(yīng)事件標(biāo)記(線條標(biāo)記處)的peak也不是很突出,針對(duì)這種數(shù)據(jù)情況,我們立刻開始數(shù)據(jù)處理吧。

(▲本文實(shí)操分析案例圖)

(*以下分析過(guò)程以瑞沃德雙色多通道光纖記錄系統(tǒng)操作界面為主要示例)

01.第 一步

我們將數(shù)據(jù)根據(jù)需要分析的時(shí)間段進(jìn)行裁剪,此步驟也可跳過(guò)。

02.第二步

數(shù)據(jù)預(yù)處理。常見數(shù)據(jù)預(yù)處理過(guò)程包含平滑處理,基線矯正,運(yùn)動(dòng)矯正。平滑處理可以將數(shù)據(jù)中的過(guò)多雜信號(hào)去除,ZD限度的突出目標(biāo)peak。如下圖所示,原始數(shù)據(jù)經(jīng)平滑處理后目標(biāo)peak更加突出,更容易觀察分析。

基線矯正多數(shù)針對(duì)的是熒光信號(hào)因長(zhǎng)時(shí)間記錄導(dǎo)致漂白信號(hào)逐步下降,或者光纖的自發(fā)熒光在長(zhǎng)期記錄下逐步被漂白基線逐步下降等情況。此情形的數(shù)據(jù)因?yàn)檎w呈現(xiàn)下降趨勢(shì),不利于后續(xù)數(shù)據(jù)作圖分析,所以需要進(jìn)行基線矯正。如下圖所示,基線矯正可以直接將下降趨勢(shì)的數(shù)據(jù)通過(guò)算法擬合后恢復(fù)成平整狀態(tài)。

運(yùn)動(dòng)矯正用于采用410nm對(duì)照通道的數(shù)據(jù),410nm數(shù)據(jù)可以用于反應(yīng)背景噪音信號(hào),運(yùn)動(dòng)矯正即將410nm數(shù)據(jù)與470nm數(shù)據(jù)進(jìn)行擬合,通過(guò)算法從470數(shù)據(jù)中去除410nm數(shù)據(jù)的波動(dòng),得到真實(shí)的熒光數(shù)據(jù)。當(dāng)不選擇運(yùn)動(dòng)矯正功能或者實(shí)驗(yàn)未記錄410nm的數(shù)據(jù),可以選擇一定時(shí)間范圍內(nèi)的信號(hào)作為對(duì)照進(jìn)行算法處理。

03.第三步

數(shù)據(jù)預(yù)處理后即可得到整體數(shù)據(jù)的ΔF/F或者Z-score,用于反應(yīng)數(shù)據(jù)的波動(dòng)幅度。二者采用了不同的算法,數(shù)據(jù)的呈現(xiàn)結(jié)果略有不同。

ΔF/F=(F-F1)/F0:

(1)當(dāng)數(shù)據(jù)進(jìn)行基線矯正后:

◆ 若對(duì)照選擇為410,F(xiàn)1=fitted410,F(xiàn)0=median(raw data)

◆ 若對(duì)照選擇非410:F1為基線矯正曲線值,F(xiàn)0=median(Baseline)

(2)當(dāng)數(shù)據(jù)未進(jìn)行基線矯正:

◆ 若數(shù)據(jù)對(duì)照為410,則F1=F0=fitted410,

◆ 若數(shù)據(jù)對(duì)照非410,則F1=F0=median(Baseline)

Z-score:

使用標(biāo)準(zhǔn)分?jǐn)?shù)計(jì)算方式,即z-score=(x-mean)/std,x=ΔF/F,mean為ΔF/F的均值,std為相應(yīng)標(biāo)準(zhǔn)差。

04.第四步

將熒光數(shù)據(jù)與動(dòng)物行為數(shù)據(jù)同步對(duì)比,選擇事件標(biāo)記或者增加事件標(biāo)記。

05.第五步

選擇事件分析的時(shí)間區(qū)間和baseline區(qū)間,用于事件相關(guān)信號(hào)分析作圖。

06.第六步

將不同組的數(shù)據(jù)進(jìn)行組間對(duì)比,即可分析不同處理因素下熒光數(shù)據(jù)的差異。

通過(guò)以上步驟,原始的熒光數(shù)據(jù)就可以直接出圖啦。


空軍軍醫(yī)大學(xué)光纖記錄系統(tǒng)培訓(xùn)現(xiàn)場(chǎng)

(▲瑞沃德雙色多通道光纖記錄系統(tǒng))(▲瑞沃德雙色多通道光纖記錄系統(tǒng))


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2021-07-01 17:05:59 1246 0
光纖記錄實(shí)驗(yàn)過(guò)程中需要全程避光嗎?

2022-11-24 09:30:59 238 0
是研究機(jī)器視覺還是研究深度學(xué)習(xí)
 
2018-11-16 08:45:58 404 0
如何跳出WB設(shè)下的陷阱-干貨分享

做蛋白研究的小伙伴都知道,一個(gè)完整的Western Blot包括了很多個(gè)步驟,從蛋白提取到配膠、上樣電泳,再到轉(zhuǎn)膜、封閉,Z后孵育一抗二抗后才能去進(jìn)行檢測(cè)。時(shí)間跨度非常長(zhǎng),而且這中間的每一步都包含了很多的小細(xì)節(jié),稍有不慎就會(huì)導(dǎo)致結(jié)果出錯(cuò),然后又得從頭來(lái)過(guò)。所以,關(guān)于WB,幾乎每一位經(jīng)驗(yàn)豐富的實(shí)驗(yàn)老手都有著一本厚厚的血淚史。


今天,小編就帶領(lǐng)大家簡(jiǎn)要梳理一遍WB流程中的一些細(xì)節(jié),避免因某一環(huán)節(jié)出現(xiàn)差錯(cuò)而導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)重做。

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一:樣品的獲取與制備

一般來(lái)說(shuō)我們檢測(cè)的樣品主要為細(xì)胞或者是組織,制備過(guò)程中盡量保持低溫。其次在制備時(shí)一定要根據(jù)目的蛋白的特性選擇合適的裂解液,比如對(duì)膜蛋白的提取、胞漿蛋白的提取和組織蛋白的提取等。


二:配膠、上樣及蛋白電泳

配置凝膠時(shí)一定要將膠板清洗干凈,用ddH2O或者無(wú)水乙醇潤(rùn)洗。晾干后根據(jù)蛋白分子量進(jìn)行不同濃度凝膠配制。上樣時(shí)需對(duì)蛋白進(jìn)行煮沸變性,如果進(jìn)行定量分析一定要將所有蛋白上樣量調(diào)至相同。電泳時(shí)低壓(80V)跑濃縮膠,高壓(120v)跑分離膠,至溴酚藍(lán)即將跑出膠面時(shí)終止電泳。


三:轉(zhuǎn)膜及封閉


轉(zhuǎn)膜時(shí)需提前配置好轉(zhuǎn)膜液并低溫放置。關(guān)于印跡膜來(lái)說(shuō),目前大多實(shí)驗(yàn)室用的是PVDF膜,根據(jù)目的蛋白大小選擇合適的孔徑,大于20KDa的蛋白選用0.45μm的膜,小于20KDa的蛋白選用0.2μm的膜。PVDF膜在使用時(shí)需用甲醇處理活化膜上的正電基團(tuán),使其更容易與帶負(fù)電的蛋白結(jié)合。轉(zhuǎn)膜時(shí)一定要注意膜和凝膠的正反問(wèn)題,除此之外一定要注意凝膠和轉(zhuǎn)印膜間不要留有氣泡。封閉液可選擇5%的BSA或5%的脫脂奶粉,可以室溫封閉1-2h或者4℃過(guò)夜封閉。封閉時(shí)一定要注意對(duì)磷酸化的抗體或生物素標(biāo)記的抗體不能用脫脂奶粉封閉膜,只能用5%BSA。

四:抗體的孵育和檢測(cè)


一抗二抗的選擇一定要注意種屬來(lái)源問(wèn)題,如果這一步出錯(cuò)那前面的努力就相當(dāng)于白費(fèi)了。檢測(cè)方法可以選擇靈敏度超高的化學(xué)發(fā)光方法或者現(xiàn)在比較流行的熒光WB法。相較于傳統(tǒng)的化學(xué)發(fā)光方法,熒光WB能夠?qū)崿F(xiàn)更jing準(zhǔn)的定量,還可以進(jìn)行多重檢測(cè),只需要將不同的目的蛋白標(biāo)記上不同的熒光就可以了。基于目前各大期刊雜志對(duì)WB發(fā)表的要求,全蛋白定量是一種新的趨勢(shì),熒光WB同樣可以實(shí)現(xiàn)全蛋白歸一化。




Azure600多功能分子成像如何幫助您獲得定量WB數(shù)據(jù)



? Azure600可同時(shí)在一張印跡膜上進(jìn)行4通道熒光成像 ,同時(shí)也具有高靈敏化學(xué)發(fā)光檢測(cè)功能,靈敏度可達(dá)fg級(jí)。

? Azure600近紅外采用激光光源,激發(fā)強(qiáng)度大,單色性好,減少光泄漏,在更短的時(shí)間內(nèi)達(dá)到更好的信噪比,Western Blotjing準(zhǔn)定量的金標(biāo)準(zhǔn)。

? Azure600配合AzureRed總蛋白熒光染色劑可以做總蛋白歸一化和定量三個(gè)靶標(biāo)蛋白,生成可以信賴的定量Western Blot數(shù)據(jù)。

? Azure600標(biāo)配9.1MP的高分辨CCD,動(dòng)態(tài)范圍可達(dá)4.8OD,保證結(jié)果的準(zhǔn)確性。

? Azure600可做彩色Marker與化學(xué)發(fā)光條帶的自動(dòng)整合,分子量查看更直觀。

? Azure600提供原始數(shù)據(jù)16bit的tiff圖給到期刊,這里的tiff原始數(shù)據(jù)是指未經(jīng)裁剪,像素修改,對(duì)比度調(diào)整等任何操作的圖,保證結(jié)果的真實(shí)性和可靠性。


Azure600除了進(jìn)行熒光印跡膜,化學(xué)發(fā)光印跡膜檢測(cè)外,還可以進(jìn)行普通凝膠成像,EMSA檢測(cè),菌落篩選,小動(dòng)物成像,植物成像等。


2020-04-03 11:48:58 532 0

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