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- 灌水丶澆花 2012-05-24 00:00:00
- 蛋白無濃縮膠,跑的很難看
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- 伍祖加 2012-05-24 00:00:00
- DNA分子量大,就算是100bp,差不多是12K,分開很容易,條帶比較單一。而蛋白相對來說就小了些,30到40K的蛋白,很常見,而且各蛋白間相差小。多半是大大小小的蛋白混合物。相差小。 并且DNA結(jié)構(gòu)簡單,由四種堿基組成,同樣100bp速度接近。而蛋白由20種AA組成,各蛋白組成差別大。 所以DNA電泳,不用濃縮膠就可以跑得很好。沒必要用濃縮膠。 而蛋白電泳,本身的原因,再加上進(jìn)入電泳孔的時間不同,如果不用濃縮膠,分跑得很寬而分不開。有了濃縮膠,會在進(jìn)入分離膠時,讓所有的蛋白在同一起跑線上,這一條線,很細(xì)很細(xì)。染料在濃縮膠中可以觀察得到。
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- 為什么蛋白電泳需要濃縮膠而DNA電泳不用
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- DNA電泳常見問題分析
一、DNA帶模糊
原因:
1.DNA降解;
2.電泳緩沖液陳舊;
3.所用電泳條件不合適;
4.DNA上樣量過多;
5.DNA樣含鹽過高;
6.有蛋白污染;
7.DNA變性。
解決辦法:
1.避免核酸酶污染;
2.電泳緩沖液多次使用后,離子強(qiáng)度降低,pH值上升,緩沖能力減弱,從而影響電泳效果。建議經(jīng)常更換電泳緩沖液;
3.電泳時電壓不應(yīng)超過20V/cm,溫度<30℃;巨大DNA鏈電泳,溫度應(yīng)<15℃;核查所用電泳緩沖液是否有足夠的緩沖能力;
4.減少凝膠中DNA上樣量;
5.電泳前通過乙醇沉淀去除過多的鹽;
6.電泳前酚抽提去除蛋白;
7.電泳前勿加熱,用20mM NaCI緩沖液稀釋DNA。
二、帶弱或無DNA帶
原因:
1.DNA的上樣量不夠;
2.DNA降解;
3.DNA走出凝膠;
4.對于EB染色的DNA,所用光源不合適。
解決辦法:
1.增加DNA的上樣量;聚丙烯酰胺凝膠電泳比瓊脂糖電泳靈敏度稍高,上樣量可適當(dāng)降低;
2.避免DNA的核酸酶污染;
3.縮短電泳時間,降低電壓,增強(qiáng)凝膠濃度;
4.應(yīng)用短波長(254nm)的紫外光源。
三、DNA帶缺失
原因:
1.小DNA帶走出凝膠;
2.分子大小相近的DNA帶不易分辨;
3.DNA 變性;
4.DNA鏈巨大,常規(guī)凝膠電泳不合適。
解決辦法:
1.縮短電泳時間,降低電壓,增強(qiáng)凝膠濃度;
2.增加電泳時間,核準(zhǔn)正確的凝膠濃度;
3.電泳前請勿高溫加熱DNA鏈,以20mM NaCl Buffer稀釋DNA;
4.在脈沖凝膠電泳上分析。
- 600bp的DNA大概要配多少濃度的膠跑電泳
- 我拿到上海生工去測序說有重疊峰,打算跑高濃度電泳,但不知道應(yīng)該如何控制膠的濃度和電泳電壓時間。。。。希望有經(jīng)驗的人給個參考。。謝謝
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