有關(guān)實驗“DNA的提取及檢測”的問題
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一·實驗原理 二·實驗材料 三·藥品的配制方法 四·實驗步驟 (提取DNA的具體方法電泳法,純度和含量的鑒定方法) 五·實驗結(jié)果
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- aaaaa44444a4 2010-12-21 00:00:00
- 實驗準(zhǔn)備工作: 1 所用離心管、槍頭要洗凈、烘干(Z好滅菌)。 2 試劑配制: 1 M Tris-HCl (pH 8.0): 稱取Tris-Base 121g, 加入約800 ml 水在磁力攪拌器上攪拌,使其充分溶解后加入濃鹽酸調(diào)整pH至8.0后加水定溶至1000 ml. 滅菌后于室溫保存。 0.5 M EDTA (pH 8.0): 稱取EDTA-Na2鹽 187 g 加入約 800 ml水,在磁力攪拌器上邊攪拌邊加入固體NaOH,當(dāng)EDTA和NaOH均完全溶解,溶液變清時其pH值剛好達(dá)到8.0左右,再用pH試紙略加調(diào)整即可, 滅菌后于室溫保存。 5.0 M NaCl: 稱取NaCl 300 g, 加入蒸餾水約800 ml 于磁力攪拌器上充分?jǐn)嚢?,約5分鐘后停止攪拌,靜止2~3分鐘,倒出上清液,再加入100 ml蒸餾水重復(fù)前面的步驟,直到NaCl充分溶解后定溶至1000 ml., 滅菌后于室溫保存。 酚:氯仿:異戍醇(25:24:1)的配制:可參考《分子克隆》亦可按如下方法配制取重蒸酚100 ml ,蒸餾水50 ml,8-羥基喹嚀0.05g 加入500 ml玻璃燒杯于磁力攪拌器上邊加熱邊攪拌,待酚達(dá)到水飽和后加入18 g Tris-Base,等Tris-Base 完全溶解后加入100 ml氯仿:異戌醇(24:1),攪拌10~20分鐘,靜止約10分鐘,除去上層水相后,裝入棕色瓶,Z后加入20 ml 0.1M的Tris-HCl保護(hù)液于4℃保存。 DNA Buffer的配制: 1 M Tris-HCl (pH 8.0) 100 ml 0.5 M EDTA (pH 8.0): 100 ml 5.0 M NaCl: 300 ml H2O 500 ml 滅菌后于室溫下保存3個月左右,用時按1.5%往Buffer中加入CTAB,在電爐上燒開;在通風(fēng)櫥里加入1%的巰基乙醇( 現(xiàn)配現(xiàn)用)。 DNA的提?。? 1 取2~5 g葉片或愈傷組織,加入適量液氮研碎,轉(zhuǎn)入預(yù)冷的50ml離心管,加入20 ml DNA提取緩沖液充分搖勻,于65℃水浴60~90 min,中途輕輕搖勻兩次。 2 加入15 ml 氯仿:異戍醇(24:1)輕輕搖勻10分鐘,于BECKMAN離心機中4000 rpm離心15分鐘。 3 取上清液于另一50 ml離心管加入10 ml 氯仿:異戍醇(24:1)重復(fù)步驟2。 4 吸上清液于一干凈的50 ml 離心管,加入15 ml 冷凍的異丙醇,輕輕搖勻后于-20℃冷凍半小時,4000 rpm離心10分鐘。棄上清液,加入5 ml 76%的乙醇(含10 mM NH4Ac)浸泡5 h(或過夜),中途換乙醇2-3次。 5 棄乙醇風(fēng)干沉淀約半小時,加入3.0 ml TE緩沖液(10 mM Tris-HCl pH 8.0;1 mM EDTA , pH 8.0),20 µl RNase A(10 mg/ml),37℃溫浴過夜。 6 溶液轉(zhuǎn)入一10 ml離心管,加入3.0 ml苯酚:氯仿:異戊醇(25:24:1)充分顛倒混勻,4000 rpm離心15 min,吸上清液于另一10 ml的離心管中,(可重復(fù)一次)。 7 加入1 ml 5.0 M的NaCl和3.0 ml水飽和,充分混勻,4000 rpm離心5 min。 8 棄,用20 µl槍頭擋住離心管管口內(nèi)側(cè),用力下壓槍頭,使槍頭與管壁間形成一狹縫,讓下清液從縫中流入另一10 ml離心管。 9 加入5 ml冷凍的異丙醇,輕輕搖勻后于-20℃冷凍半小時,4000 rpm離心10分鐘。棄上清液,加入3 ml 70%的乙醇浸泡4~6 h(或過夜),中途換乙醇2-3次。風(fēng)干乙醇,加入500 µl TE溶解,或浸在乙醇中長期保存。 DNA檢測 1 取DNA原液15 µl稀釋至3.0 ml,用UV-1601型紫外分光光度計測定230 nm、 260 nm及280 nm的吸光值。 高質(zhì)量的DNA要求:A260/A230>2.0; 1.7<A260/A280<1.9 2 將DNA原液適當(dāng)稀釋后,用1 Χ TAE,0.8%瓊脂糖凝膠2V/cm電泳1 h進(jìn)行質(zhì)量檢測。 3 向一定量的DNA中加入限制性內(nèi)切酶EcoR I至4-5U/μg DNA,37℃消化過夜,用0.5 Χ TBE,0.8%瓊脂糖凝膠2.5V/cm電泳3 h進(jìn)行檢測。 CTAB法微量提取DNA 1. 藥品的配制: CTAB提取液: (1)100mM Tris-HCl(PH 8.0),1.5M NaCl,50mM EDTA(PH 8.0) (2)1% PVP,2% CTAB (3)取少許(1)加到(2)中,攪拌成糊狀,后加(1)至足量,65℃水浴充分溶解備用。使用前要在65℃溫浴一會兒,然后加入1-4%巰基乙醇,混均勻。 苯酚:氯仿:異戊醇(25∶24∶1): 重蒸酚65℃水浴溶解,在燒杯中加入80ml溫?zé)岬恼麴s水,加入少許8-羥基喹啉,溶解后加入100ml重蒸酚,再加入100ml氯仿:異戊醇(24:1),加入20克Tris Base,磁力攪拌器上攪拌1.5 h左右至停止攪拌后很快分層,然后裝入棕色瓶中,4℃冰箱中儲存?zhèn)溆谩? 2. 材料的采取與保存: 在超凈工作臺上,取試管苗葉片,放入無菌的1.5 ml離心管中,置于冰盒中,然后把裝有葉片的離心管一起裝在紗布袋中,置液氮中冷凍10分鐘,取出后置于—70℃冰箱中可長期保存,需要用時,取出置于冰盒中。 3.DNA的粗提 在裝有葉片的離心管中加入石英砂少許(約0.07克),用事先滅過菌的—20℃冰箱中預(yù)冷的尖頭玻棒將材料戳到底部,先壓后研磨,研細(xì)后加入600 ul CTAB提取液,再繼續(xù)研磨一會兒使其懸浮均勻,然后在65℃水浴鍋中溫浴60-90分鐘,隔30分鐘取出上下輕輕顛倒幾次,水浴之后,加入700ul苯酚:氯仿:異戊醇(25:24:1),,上下晃動10分鐘以上,其間置于37℃水浴鍋中溫浴一會(冬季),使之充分混勻,然后10000-12000rpm離心5-10分鐘,吸取上清液轉(zhuǎn)至另一離心管中,加入60 ul 5M NaCl,再加入-20℃冰凍無水乙醇1ml,輕輕顛倒數(shù)次,混合均勻后冰凍30分鐘沉淀DNA,然后8000-10000rpm離心5分鐘,棄上清液,加入1 ml 70%酒精浸泡2小時或過夜,8000rpm離心5分鐘,棄酒精之后在工作臺上風(fēng)干DNA,注意不要過干,否則會使以后溶解困難。 4. DNA的純化: 向風(fēng)干后的DNA中加入500 ul 1xTE,37℃水浴15-30分鐘至DNA完全溶解,然后加入700ul苯酚:氯仿:異戊醇(25:24:1),上下顛倒離心管約10分鐘,至充分混勻,其間置于37℃水浴鍋中溫浴一會(冬季);10000-12000 rpm離心5分鐘,吸取上層液至另一離心管中,加入700ul氯仿:異戊醇(24:1),顛倒10分鐘(方法同上),10000 -12000rpm離心5分鐘,吸取上層液至另一離心管中,加入60 ul 5M NaCl,再加入1ml冷凍的無水乙醇,輕輕顛倒,然后在-20℃冰箱中置30分鐘沉淀DNA,8000-10000 rpm離心2-3分鐘,使DNA分散狀緊貼在管壁上,棄酒精,加70%酒精1ml浸泡,2小時后換一次,后浸泡過夜,8000rpm離心3分鐘后棄酒精,風(fēng)干,加50-100ul1xTE充分溶解,然后每管加5ul 5mg/ml Rnase,37℃水浴6小時或過夜。 5. DNA檢測: (1)0.8%瓊脂糖凝膠電泳30-60分鐘: TAE 100ml,EB 30ul,樣品3-5ul,電壓90V, 觀察A:DNA是否跑出,帶型是否整齊劃一;B:RNA是否除盡 (2)分光光度計檢測D260/D280的比值:在1.8-2.0的范圍內(nèi)認(rèn)為純度較高上述方法提取的DNA比值在1.65-1.95之間。濃度=30000xOD260(DNA樣品為5ul時)。 不知道你說的是動物的還是植物的,我當(dāng)年做的是動物的。用的是雞血,因為在學(xué)校,沒有生物書,只能粗略的查一下了 1、實驗中兩次使用蒸餾水。 diyi次,取血細(xì)胞液時加蒸餾水,目的是讓血細(xì)胞吸水漲破 第二次是在析出含DNA的粘稠物后,目的是稀釋NACL溶液,使DNA逐漸析出 2、加3次NACL, diyi次,在溶解核內(nèi)DNA時,加入NACL后充分?jǐn)嚢瑁铀偃旧|(zhì)中DNA與蛋白質(zhì)的分離,使DNA充分游離并融入NACL中 第二次在DNA粘稠物在溶解時,家NACL是使DNA再溶解 第三次是在DNA的鑒定中,目的是溶解DNA 3、過濾3次 diyi次在提取血細(xì)胞核物質(zhì)時進(jìn)行過濾,取得的濾液中含有染色質(zhì),而濾出的是細(xì)胞膜、核膜和細(xì)胞器等的破碎結(jié)構(gòu) 第二次在濾去含有DNA粘稠物只能夠,濾液中含有仍然溶解在NACL中的細(xì)胞中的一些成分,如蛋白質(zhì)等 第三次在過濾含DNA的2mol/L的NACL溶液時,過濾后的濾液中含有DNA
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