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質(zhì)粒提取 劇烈搖晃 是不是也不能太劇烈

*平上白度 2015-02-16 11:28:14 756  瀏覽
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參與評(píng)論

全部評(píng)論(2條)

  • goolring 2015-02-17 00:00:00
    抽提方法 編輯 實(shí)驗(yàn)前方法/試劑的選擇 shou選方法是堿裂解法。如果有問題,或者是大質(zhì)粒 (>15 kb),則用溫和的方法 SDS 裂解法。詳細(xì)情況見“分子克隆”。試劑盒幾乎都使用堿裂解法,所以都有一個(gè)通病,抽提大質(zhì)粒時(shí)效果不好。 關(guān)于堿裂解法 質(zhì)粒抽提Z常用的方法是堿裂解法,它具有得率高,適用面廣,快速,純度高等特點(diǎn)。關(guān)于堿裂解法的原理,復(fù)旦大學(xué)生化與分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室的網(wǎng)站有一篇專論,大家可以去看一下。這是一篇美文,非常有趣。文中提到了一個(gè)與幾乎所有能查到的資料不同的觀點(diǎn),也是非常有啟發(fā)的。 當(dāng)然,堿裂解法也有缺陷:容易導(dǎo)致不可逆的變性;不適合大質(zhì)粒的抽提。堿裂解法是很劇烈的方法,質(zhì)粒在堿性條件下會(huì)變性,時(shí)間一長,這種變性就成為不可逆的了 (電泳時(shí)在超螺旋前面一點(diǎn)點(diǎn),如果有一條帶,就是此變性的質(zhì)粒。)。所以,要降低不可逆的變性,就要控制好堿裂解的時(shí)間。 (似乎可以做這么一個(gè)推理:在堿性條件下,質(zhì)粒的兩條鏈從一點(diǎn)或者幾個(gè)點(diǎn)開始分開,隨著時(shí)間的延長,直到完全分開。理論上講,完全分開的兩條鏈要很快地配對(duì)復(fù)性,成功率肯定不可能是 的,而沒有完全分開的兩條鏈卻完全可能 配對(duì)復(fù)性。) 堿裂解法不適合大質(zhì)粒的抽提,原因也是因?yàn)樵摲椒ㄌ珓×遥钩菪壤^低。文獻(xiàn)推薦的抽提大質(zhì)粒的方法是溫和得多的方法,缺點(diǎn)是得率要低一些?,F(xiàn)在得問題是,大質(zhì)粒的拷貝數(shù)本來就低,如果抽提方法得率再不高的話,抽提起來就很費(fèi)力了。如果注意到在堿裂解法中,超螺旋比例隨著堿裂解時(shí)間的延長而降低,隨著粘稠度的增加而減低這個(gè)現(xiàn)象,完全可以使用堿裂解法來抽提大質(zhì)粒的:增加試劑的使用量,使加入 NaOH/SDS 液后,溶液在 1 分鐘內(nèi)就能變得很清澈;立即加入中和試劑。這個(gè)實(shí)驗(yàn)我們沒有做過,但 QIAGEN 抽提大質(zhì)粒用的就是堿裂解法。

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    評(píng)論

  • zky914 2015-02-17 00:00:00
    是啊,要輕柔的上下顛倒

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    評(píng)論

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