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不準確為什么基因測序的結果一般會認為序列兩端不

yj7bq6 2017-04-03 10:37:58 523  瀏覽
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全部評論(1條)

  • sijie199396 2017-04-04 00:00:00
    不準確為什么基因測序的結果一般會認為序列兩端不 是有參考基因組的還是de novo的結果,如果有參考基因組的,那么可以通過這個基因名稱在注釋結果中查找是否有這個基因,序列信息需要在參考基因組中查找,如果是沒有參考基因組的,那么拼接結果是一個fasta格式的文件,可以用blast軟件進行比對。 克隆出來基因序列并測序之后,通常先要鑒定這個序列是不是符合我們要求的,通常用生物信息學的方法,去ncbi做一個blastx,通過比對結果來判斷這個序列是什么基因,此外,blastx結果會給出比對的方向,很容易就可以判定你測序的那條序列是正向的還是反向的,如果是反向的,那么就需要把它進行互補翻轉,就得到了編碼氨基酸的有義鏈了,許多軟件都可以實現(xiàn)互補翻轉的,如editseq,dnaman等.

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