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如何從植物組織中提取基因組dna

__依依627 2016-04-03 00:58:38 443  瀏覽
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  • 是你岳岳Fl9 2016-04-04 00:00:00
    不同生物(植物、動(dòng)物、微生物)的基因組DNA的提取方法有所不同; 不同種類或同一種類的不同組織因其細(xì)胞結(jié)構(gòu)及所含的成分不同,分離方法也有差 異。在提取某種特殊組織的DNA時(shí)必須參照文獻(xiàn)和經(jīng)驗(yàn)建立相應(yīng)的提取方法, 以獲得可用的DNA大分子。尤其是組織中的多糖和酶類物質(zhì)對隨后的酶切、PCR反應(yīng)等有較強(qiáng)的YZ作用,因此用富含這類物質(zhì)的材料提取基因組DNA時(shí), 應(yīng)考慮除去多糖和酚類物質(zhì)。 本實(shí)驗(yàn)以水稻幼苗為材料,學(xué)習(xí)基因組DNA提取的一般方法。 DNA 一、材料 水稻幼苗 二、設(shè)備 移液器,冷凍高速離心機(jī),臺式高速離心機(jī),水浴鍋,陶瓷研缽,50ml離 心管(有蓋)及5ml和1.5ml離心管,彎成鉤狀的小玻棒。 三、試劑 1、提取緩沖液?:100mmol/L Tris?Cl, pH8.0, 20mmol/L EDTA, 500mmol/L NaCl, 1.5% SDS。 2、提取緩沖液?:18.6g葡萄糖,6.9g二乙基二硫代碳酸鈉,6.0gPVP,240ul巰基乙醇,加水至300ml。 3、80:4:16/氯仿:戊醇:乙醇 4、 RnaseA母液:配方見diyi章。 5、其它試劑:液氮、異丙醇、TE緩沖液,無水乙醇、70%乙醇、3mol/L NaAc。 四、操作步驟: (一)水稻幼苗或其它禾木科植物基因組DNA提取 1. 在50ml離心管中加入20ml提取緩沖液?, 60?水浴預(yù)熱。 2. 水稻幼苗或葉子5-10g, 剪碎, 在研缽中加液氮磨成粉狀后立即倒入預(yù)熱 的離心管中, 劇烈搖動(dòng)混勻, 60?水浴保溫30-60分鐘(時(shí)間長,DNA產(chǎn)量高), 不時(shí)搖動(dòng)。 3. 加入20ml氯仿/戊醇/乙醇溶液, 顛倒混勻(需帶手套, 防止損傷皮膚),室溫下靜置5-10分鐘, 使水相和有機(jī)相分層(必要時(shí)可重新混勻)。 4. 室溫下5000rpm離心5分鐘。 5. 仔細(xì)移取上清液至另一50ml離心管,加入1倍體積異丙醇,混勻,室溫下放置片刻即出現(xiàn)絮狀DNA沉淀。 6. 在1.5ml eppendorf中加入1ml TE。用鉤狀玻璃棒撈出DNA絮團(tuán),在干凈吸水紙上吸干,轉(zhuǎn)入含TE的離心管中,DNA很快溶解于TE。 7. 如DNA不形成絮狀沉淀,則可用5000rpm離心5分鐘, 再將沉淀移入TE管中。這樣收集的沉淀,往往難溶解于TE,可在60?水浴放置15分鐘以上,以幫助溶解。 8. 將DNA溶液3000rpm離心5分鐘, 上清液倒入干凈的5ml離心管。 9. 加入5μl RNaseA(10μg/μl), 37? 10分鐘, 除去RNA(RNA對DNA的操作、分析一般無影響,可省略該步驟)。 10. 加入1/10體積的3mol/L NaAc及2×體積的冰乙醇,混勻,-20?放置20分鐘左右,DNA形成絮狀沉淀。

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