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IVIS視角——IVIS系統(tǒng)在植物領(lǐng)域的應(yīng)用(一)

珀金埃爾默 2019-11-28 13:14:54 365  瀏覽
  • 在往期分享中,我們介紹了IVIS成像系統(tǒng)在動(dòng)物水平的眾多應(yīng)用,其實(shí)IVIS同樣可以用于全植物成像。此次我們就分享IVIS在水稻氮代謝研究中的應(yīng)用。

    氮是植物生長(zhǎng)發(fā)育所必需的養(yǎng)分,但其在土壤中的濃度往往達(dá)不到Z佳作物生長(zhǎng)濃度。因此,提高作物氮素利用率被認(rèn)為是農(nóng)業(yè)生物技術(shù)的一個(gè)主要目標(biāo)。然而,關(guān)于作物氮代謝仍有許多需要了解的地方。

    在此,研究人員開(kāi)發(fā)了一個(gè)分子傳感器系統(tǒng)來(lái)監(jiān)測(cè)水稻中氮的狀態(tài),該方法發(fā)表在《Frontiers in Plant Science》雜志上。研究中首先利用該系統(tǒng)研究了尿囊素的作用,尿囊素分解為尿囊素衍生的代謝物,在低濃度下作為氮源使用。參與尿素代謝的兩個(gè)基因尿囊素酶(OsALN)和尿素滲透酶1 (OsUPS1),對(duì)氮狀態(tài)高度敏感,在低氮條件下,OsALN迅速上調(diào),而高氮條件下OsUPS1表達(dá)上調(diào)?;谏鲜鰴C(jī)制,研究人員培育了含有氮分子傳感器系統(tǒng)的[proALN::ALN-LUC2]和[proUPS1::UPS1-LUC2]轉(zhuǎn)基因水稻。這種轉(zhuǎn)基因的表達(dá)可以模擬內(nèi)源性的轉(zhuǎn)錄調(diào)控,即OsALN和OsUPS1基因?qū)ν庠碞狀態(tài)的響應(yīng)。

    文中使用兩種方法來(lái)測(cè)定分子氮傳感器的能力:

    方法一:在長(zhǎng)期培養(yǎng)中,轉(zhuǎn)基因水稻植株在高濃度氮源培養(yǎng)基(GM+N)或不含氮源的生長(zhǎng)培養(yǎng)基(GM-N)中培養(yǎng)5天,隨后使用IVIS活體成像系統(tǒng)進(jìn)行成像及定量。

    結(jié)果顯示,生長(zhǎng)在GM+N培養(yǎng)基中的 proUPS1::UPS1-LUC2 水稻植株表現(xiàn)出更高的熒光素酶活性(圖1A)。為了對(duì)發(fā)光信號(hào)進(jìn)行定量,研究人員測(cè)定了5個(gè)獨(dú)立的純合系(具有單個(gè)基因拷貝)。生長(zhǎng)在GM+N培養(yǎng)基中的proUPS1::UPS1-LUC2 植株發(fā)光信號(hào)強(qiáng)于GM-N組20倍,而強(qiáng)于對(duì)照組約2,800倍(圖1B)。

    方法二:在短期培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)中,轉(zhuǎn)基因水稻植株先在GM-N培養(yǎng)基中培養(yǎng)4天,第5天在加入100nM硫酸銨。結(jié)果顯示,同長(zhǎng)期實(shí)驗(yàn)結(jié)果一樣,生長(zhǎng)在后期加 氮培養(yǎng)基中proUPS1::UPS1-LUC2 植株,發(fā)光信號(hào)更強(qiáng)(圖1C)。同樣對(duì)5株獨(dú)立的純合系進(jìn)行了定量,生長(zhǎng)在后期加N培養(yǎng)基中的proUPS1::UPS1-LUC2 植株生物發(fā)光信號(hào)強(qiáng)于GM-N培養(yǎng)基中約50倍,而強(qiáng)于對(duì)照組13,000倍(下圖1D)。

     

    圖1.在高氮培養(yǎng)條件下,proUPS1::UPS1-LUC2 具有很強(qiáng)的發(fā)光信號(hào)。

    (A)對(duì)照組和proUPS1::UPS1-LUC2 植株在GM+N或者GM–N培養(yǎng)基 中培養(yǎng)5天;

    (B)5個(gè)獨(dú)立的純合子proUPS1::UPS1-LUC2 在(A)條件下,發(fā)光定量結(jié)果;

    (C)對(duì)照組和proUPS1::UPS1-LUC2 植株在GM–N生長(zhǎng)5天, 或者在GM–N培養(yǎng)基中生長(zhǎng)4天,然后加入100 mM硝酸銨培養(yǎng)1天;

    (D)5個(gè)獨(dú)立的純合子proUPS1::UPS1-LUC2 在(C)條件下的定量結(jié)果,以對(duì)照組作為基準(zhǔn)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化 。

    這些結(jié)果說(shuō)明,proUPS1::UPS1-LUC2 傳感器能夠通過(guò)發(fā)光信號(hào)水平檢測(cè)外源氮的情況。

    同樣在研究中對(duì)proALN::ALN-LUC2 植株進(jìn)行了相同的處理。結(jié)果顯示,在長(zhǎng)時(shí)間的培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)中,GM+N和GM-N培養(yǎng)基生長(zhǎng)的proALN::ALN-LUC2 沒(méi)有明顯差異(圖2A)。對(duì)5株獨(dú)立的純品系進(jìn)行發(fā)光信號(hào)定量,相比GM+N培養(yǎng)基,GM-N培養(yǎng)基生長(zhǎng)的proALN::ALN-LUC2 植株發(fā)光信號(hào)要高約1.8倍,比對(duì)照組高約17倍(圖2B)。因此很難鑒定GM+N和GM-N培養(yǎng)基對(duì)生長(zhǎng)的影響。而在短時(shí)間培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)中,連續(xù)生長(zhǎng)在GM-N培養(yǎng)基中的proALN::ALN-LUC2,發(fā)光信號(hào)要強(qiáng)于加高氮培養(yǎng)1天的。

     

    圖2.在低氮培養(yǎng)條件下,proALN::ALN-LUC2 植株顯示強(qiáng)的生物發(fā)光信號(hào)。

    (A)對(duì)照組和proALN::ALN-LUC2 植株,在GM+N or GM–N培養(yǎng)基中培養(yǎng).;

    (B)A組相對(duì)定量結(jié)果;

    (C)對(duì)照和proALN::ALN-LUC2 植株在 GM–N中培養(yǎng)5天,或者在GM–N培養(yǎng)基中培養(yǎng)4天,然后加入100 mM 硝酸銨再培養(yǎng)1天 ;

    (D)C組相對(duì)定量結(jié)果;GM–N培養(yǎng)基生長(zhǎng)的對(duì)照組植株作為基準(zhǔn)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化。

    此外,在文章中,還利用IVIS活體成像系統(tǒng),探討了該傳感器對(duì)于氮源是否具有選擇性及對(duì)于氮源的敏感性。結(jié)果顯示proUPS1::UPS1-LUC2 和proALN::ALN-LUC2 對(duì)于氮源無(wú)特異性,可以廣泛的作為水稻等植株中分子氮的傳感器。并且proUPS1: UPS1-LUC2 植株在硝酸銨、硫酸銨或硝酸鉀濃度> 1mM即表現(xiàn)出強(qiáng)烈的生物發(fā)光信號(hào),而低氮濃度(< 0.01mM)信號(hào)減弱。0.1mM硝酸鉀proUPS1:: UPS1-LUC2 植株誘導(dǎo)強(qiáng)烈的生物發(fā)光信號(hào),而0.1mM硝酸銨和硫酸銨則沒(méi)有。這表明, proUPS1::UPS1-LUC2 傳感器監(jiān)測(cè)高氮狀態(tài),低氮狀態(tài)。proALN::ALNLUC2 在低氮濃度(<0.1 mM)下表現(xiàn)出較強(qiáng)的熒光素酶活性,而在高氮濃度下表現(xiàn)出較弱的活性(> 10mM)。

    綜上,分子氮傳感器的信號(hào)反映了分子氮的內(nèi)部狀態(tài)。結(jié)合IVIS活體成像技術(shù),proALN::ALN-LUC2和proUPS1::UPS1-LUC2 可作為分子傳感器在不同研究中監(jiān)測(cè)大米內(nèi)部氮狀態(tài)。

    文獻(xiàn)來(lái)源:Dong-Keun Lee, Mark C. F. R. Redillas, Harin Jung, Seowon Choi, Youn Shic Kim and Ju-Kon Kim. A Nitrogen Molecular Sensing System, Comprised of the ALLANTOINASE and UREIDE PERMEASE 1 Genes, Can Be Used to Monitor N Status in Rice. Front. Plant Sci, 18 April 2018.


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IVIS視角——IVIS系統(tǒng)在植物領(lǐng)域的應(yīng)用(一)

在往期分享中,我們介紹了IVIS成像系統(tǒng)在動(dòng)物水平的眾多應(yīng)用,其實(shí)IVIS同樣可以用于全植物成像。此次我們就分享IVIS在水稻氮代謝研究中的應(yīng)用。

氮是植物生長(zhǎng)發(fā)育所必需的養(yǎng)分,但其在土壤中的濃度往往達(dá)不到Z佳作物生長(zhǎng)濃度。因此,提高作物氮素利用率被認(rèn)為是農(nóng)業(yè)生物技術(shù)的一個(gè)主要目標(biāo)。然而,關(guān)于作物氮代謝仍有許多需要了解的地方。

在此,研究人員開(kāi)發(fā)了一個(gè)分子傳感器系統(tǒng)來(lái)監(jiān)測(cè)水稻中氮的狀態(tài),該方法發(fā)表在《Frontiers in Plant Science》雜志上。研究中首先利用該系統(tǒng)研究了尿囊素的作用,尿囊素分解為尿囊素衍生的代謝物,在低濃度下作為氮源使用。參與尿素代謝的兩個(gè)基因尿囊素酶(OsALN)和尿素滲透酶1 (OsUPS1),對(duì)氮狀態(tài)高度敏感,在低氮條件下,OsALN迅速上調(diào),而高氮條件下OsUPS1表達(dá)上調(diào)?;谏鲜鰴C(jī)制,研究人員培育了含有氮分子傳感器系統(tǒng)的[proALN::ALN-LUC2]和[proUPS1::UPS1-LUC2]轉(zhuǎn)基因水稻。這種轉(zhuǎn)基因的表達(dá)可以模擬內(nèi)源性的轉(zhuǎn)錄調(diào)控,即OsALN和OsUPS1基因?qū)ν庠碞狀態(tài)的響應(yīng)。

文中使用兩種方法來(lái)測(cè)定分子氮傳感器的能力:

方法一:在長(zhǎng)期培養(yǎng)中,轉(zhuǎn)基因水稻植株在高濃度氮源培養(yǎng)基(GM+N)或不含氮源的生長(zhǎng)培養(yǎng)基(GM-N)中培養(yǎng)5天,隨后使用IVIS活體成像系統(tǒng)進(jìn)行成像及定量。

結(jié)果顯示,生長(zhǎng)在GM+N培養(yǎng)基中的 proUPS1::UPS1-LUC2 水稻植株表現(xiàn)出更高的熒光素酶活性(圖1A)。為了對(duì)發(fā)光信號(hào)進(jìn)行定量,研究人員測(cè)定了5個(gè)獨(dú)立的純合系(具有單個(gè)基因拷貝)。生長(zhǎng)在GM+N培養(yǎng)基中的proUPS1::UPS1-LUC2 植株發(fā)光信號(hào)強(qiáng)于GM-N組20倍,而強(qiáng)于對(duì)照組約2,800倍(圖1B)。

方法二:在短期培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)中,轉(zhuǎn)基因水稻植株先在GM-N培養(yǎng)基中培養(yǎng)4天,第5天在加入100nM硫酸銨。結(jié)果顯示,同長(zhǎng)期實(shí)驗(yàn)結(jié)果一樣,生長(zhǎng)在后期加 氮培養(yǎng)基中proUPS1::UPS1-LUC2 植株,發(fā)光信號(hào)更強(qiáng)(圖1C)。同樣對(duì)5株獨(dú)立的純合系進(jìn)行了定量,生長(zhǎng)在后期加N培養(yǎng)基中的proUPS1::UPS1-LUC2 植株生物發(fā)光信號(hào)強(qiáng)于GM-N培養(yǎng)基中約50倍,而強(qiáng)于對(duì)照組13,000倍(下圖1D)。

 

圖1.在高氮培養(yǎng)條件下,proUPS1::UPS1-LUC2 具有很強(qiáng)的發(fā)光信號(hào)。

(A)對(duì)照組和proUPS1::UPS1-LUC2 植株在GM+N或者GM–N培養(yǎng)基 中培養(yǎng)5天;

(B)5個(gè)獨(dú)立的純合子proUPS1::UPS1-LUC2 在(A)條件下,發(fā)光定量結(jié)果;

(C)對(duì)照組和proUPS1::UPS1-LUC2 植株在GM–N生長(zhǎng)5天, 或者在GM–N培養(yǎng)基中生長(zhǎng)4天,然后加入100 mM硝酸銨培養(yǎng)1天;

(D)5個(gè)獨(dú)立的純合子proUPS1::UPS1-LUC2 在(C)條件下的定量結(jié)果,以對(duì)照組作為基準(zhǔn)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化 。

這些結(jié)果說(shuō)明,proUPS1::UPS1-LUC2 傳感器能夠通過(guò)發(fā)光信號(hào)水平檢測(cè)外源氮的情況。

同樣在研究中對(duì)proALN::ALN-LUC2 植株進(jìn)行了相同的處理。結(jié)果顯示,在長(zhǎng)時(shí)間的培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)中,GM+N和GM-N培養(yǎng)基生長(zhǎng)的proALN::ALN-LUC2 沒(méi)有明顯差異(圖2A)。對(duì)5株獨(dú)立的純品系進(jìn)行發(fā)光信號(hào)定量,相比GM+N培養(yǎng)基,GM-N培養(yǎng)基生長(zhǎng)的proALN::ALN-LUC2 植株發(fā)光信號(hào)要高約1.8倍,比對(duì)照組高約17倍(圖2B)。因此很難鑒定GM+N和GM-N培養(yǎng)基對(duì)生長(zhǎng)的影響。而在短時(shí)間培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)中,連續(xù)生長(zhǎng)在GM-N培養(yǎng)基中的proALN::ALN-LUC2,發(fā)光信號(hào)要強(qiáng)于加高氮培養(yǎng)1天的。

 

圖2.在低氮培養(yǎng)條件下,proALN::ALN-LUC2 植株顯示強(qiáng)的生物發(fā)光信號(hào)。

(A)對(duì)照組和proALN::ALN-LUC2 植株,在GM+N or GM–N培養(yǎng)基中培養(yǎng).;

(B)A組相對(duì)定量結(jié)果;

(C)對(duì)照和proALN::ALN-LUC2 植株在 GM–N中培養(yǎng)5天,或者在GM–N培養(yǎng)基中培養(yǎng)4天,然后加入100 mM 硝酸銨再培養(yǎng)1天 ;

(D)C組相對(duì)定量結(jié)果;GM–N培養(yǎng)基生長(zhǎng)的對(duì)照組植株作為基準(zhǔn)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化。

此外,在文章中,還利用IVIS活體成像系統(tǒng),探討了該傳感器對(duì)于氮源是否具有選擇性及對(duì)于氮源的敏感性。結(jié)果顯示proUPS1::UPS1-LUC2 和proALN::ALN-LUC2 對(duì)于氮源無(wú)特異性,可以廣泛的作為水稻等植株中分子氮的傳感器。并且proUPS1: UPS1-LUC2 植株在硝酸銨、硫酸銨或硝酸鉀濃度> 1mM即表現(xiàn)出強(qiáng)烈的生物發(fā)光信號(hào),而低氮濃度(< 0.01mM)信號(hào)減弱。0.1mM硝酸鉀proUPS1:: UPS1-LUC2 植株誘導(dǎo)強(qiáng)烈的生物發(fā)光信號(hào),而0.1mM硝酸銨和硫酸銨則沒(méi)有。這表明, proUPS1::UPS1-LUC2 傳感器監(jiān)測(cè)高氮狀態(tài),低氮狀態(tài)。proALN::ALNLUC2 在低氮濃度(<0.1 mM)下表現(xiàn)出較強(qiáng)的熒光素酶活性,而在高氮濃度下表現(xiàn)出較弱的活性(> 10mM)。

綜上,分子氮傳感器的信號(hào)反映了分子氮的內(nèi)部狀態(tài)。結(jié)合IVIS活體成像技術(shù),proALN::ALN-LUC2和proUPS1::UPS1-LUC2 可作為分子傳感器在不同研究中監(jiān)測(cè)大米內(nèi)部氮狀態(tài)。

文獻(xiàn)來(lái)源:Dong-Keun Lee, Mark C. F. R. Redillas, Harin Jung, Seowon Choi, Youn Shic Kim and Ju-Kon Kim. A Nitrogen Molecular Sensing System, Comprised of the ALLANTOINASE and UREIDE PERMEASE 1 Genes, Can Be Used to Monitor N Status in Rice. Front. Plant Sci, 18 April 2018.


2019-11-28 13:14:54 365 0
IVIS視角:“餓死”那些癌細(xì)胞——饑餓療法在腫瘤ZL領(lǐng)域的應(yīng)用

腫瘤在體內(nèi)只有一個(gè)目標(biāo),就是不停地生長(zhǎng)!生長(zhǎng)!生長(zhǎng)!在生長(zhǎng)的過(guò)程中不可避免的要消耗掉大量的氧氣和營(yíng)養(yǎng)物質(zhì),所以腫瘤會(huì)構(gòu)建自身的血管網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)用于養(yǎng)分和氧氣的輸送,這些腫瘤內(nèi)部搭建的血管就是腫瘤的能量供應(yīng)站。因此切斷腫瘤的主動(dòng)營(yíng)養(yǎng)供應(yīng),破壞腫瘤的能量代謝系統(tǒng),就能YZ腫瘤細(xì)胞的增殖,從而“餓死”癌細(xì)胞。

但是,這種能量切斷不是廣義上的讓病人減少進(jìn)食,或者少吃營(yíng)養(yǎng)的東西,這樣會(huì)使正常組織得不到足夠的能量導(dǎo)致免疫力下降。真正的饑餓療法具有選擇性,可以特異性的YZ腫瘤細(xì)胞的代謝過(guò)程(圖1),實(shí)現(xiàn)對(duì)腫瘤的jing準(zhǔn)致命打擊。

 

圖1 特異性YZ腫瘤細(xì)胞能量代謝

級(jí)聯(lián)納米酶靶向腫瘤“饑餓”環(huán)境

通過(guò)級(jí)聯(lián)納米催化藥物的設(shè)計(jì),將葡萄糖氧化酶(GOx)和過(guò)氧化氫酶(CAT)通過(guò)pH響應(yīng)的聚合物交聯(lián)形成級(jí)聯(lián)納米酶,通過(guò)血清蛋白將納米酶和抗腫瘤前藥復(fù)合形成納米藥物。腫瘤的酸性環(huán)境可以將納米酶釋放,COx迅速消耗腫瘤細(xì)胞內(nèi)的葡萄糖和氧氣,產(chǎn)生饑餓和缺氧環(huán)境,切斷腫瘤能量供應(yīng)的同時(shí)提升前藥系統(tǒng)的化學(xué)治LX果,并且消耗葡萄糖產(chǎn)生的毒副產(chǎn)物H2O2也可以快速被CAT分解,以避免產(chǎn)生全身毒性。這種結(jié)合靶向饑餓環(huán)境并結(jié)合缺氧化學(xué)ZL的方案可以有效YZ腫瘤細(xì)胞的增殖,不會(huì)產(chǎn)生毒副作用,通過(guò)小動(dòng)物光學(xué)成像可以清楚的看到級(jí)聯(lián)納米酶顆粒在腫瘤部位的富集隨時(shí)間的變化情況,以及48小時(shí)后納米酶顆粒在各個(gè)臟器中的分布情況。

 

圖2 基于級(jí)聯(lián)納米酶的納米藥物設(shè)計(jì)以及在體內(nèi)的靶向分布情況

參考文獻(xiàn)

Ma Y, Zhao Y, Bejjanki N K, et al. Nanoclustered Cascaded Enzymes for Targeted Tumor Starvation and Deoxygenation-Activated Chemotherapy without Systemic Toxicity[J]. ACS nano, 2019, 13(8): 8890-8902.

光照誘導(dǎo)腫瘤能量代謝阻斷

通過(guò)新型納米顆粒的構(gòu)建,利用腫瘤細(xì)胞高表達(dá)組織蛋白酶B的特性,設(shè)計(jì)酶剪切開(kāi)關(guān),將載有光敏劑的介孔納米硅和和定位序列修飾的氧化鎢顆粒偶聯(lián)在一起形成行星-衛(wèi)星結(jié)構(gòu)。被腫瘤細(xì)胞攝取后納米顆??梢员桓弑磉_(dá)的組織蛋白酶B剪切,行星-衛(wèi)星結(jié)構(gòu)分開(kāi),配合不同波段的光照同時(shí)引發(fā)光動(dòng)力和光熱效應(yīng),切斷腫瘤氧化磷酸化和糖酵解過(guò)程,阻斷能量供應(yīng),YZ腫瘤的增殖。通過(guò)小動(dòng)物活體光學(xué)成像進(jìn)行肝部轉(zhuǎn)移腫瘤的體內(nèi)表征,實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明這種納米顆粒配合光照可以有效誘導(dǎo)腫瘤細(xì)胞產(chǎn)生“饑餓”環(huán)境,通過(guò)YZ腫瘤細(xì)胞能量供應(yīng)清除體內(nèi)的轉(zhuǎn)移腫瘤。而正常細(xì)胞內(nèi)組織蛋白酶B含量不足,行星-衛(wèi)星結(jié)構(gòu)無(wú)法分開(kāi),在光照過(guò)程中光動(dòng)力產(chǎn)生的單線態(tài)氧可以進(jìn)一步氧化納米氧化鎢顆粒,阻礙光熱反應(yīng)的發(fā)生,不會(huì)影響到正常組織的代謝過(guò)程,證實(shí)了可以基于能量代謝的腫瘤選擇性jing準(zhǔn)ZL策略的可行性。

 

圖3 光照切斷腫瘤細(xì)胞能量供應(yīng)

參考文獻(xiàn)

Huo D, Zhu J, Chen G, et al. Eradication of unresectable liver metastasis through induction of tumour specific energy depletion[J]. Nature communications, 2019, 10(1): 1-17.


2020-03-19 13:09:07 1018 0
IVIS視角 | 穿上 “細(xì)胞膜吉利服”的納米載體在體內(nèi)必將威力大增

      眾所周知,多功能納米載體可以有效識(shí)別腫瘤細(xì)胞并且在體外具有良好的抗腫瘤效果。但是目光轉(zhuǎn)向體內(nèi),這些納米載體往往在免疫系統(tǒng)的攻擊下集體失靈。因?yàn)?,人體免疫系統(tǒng)將會(huì)感知納米載體的入侵,并且非常努力的把我們精心設(shè)計(jì)的載體清除掉。一旦納米載體被清除掉,藥物就很難到達(dá)目標(biāo)腫瘤區(qū)域,很難實(shí)現(xiàn)殺傷腫瘤的效果。因此,納米醫(yī)學(xué)的一個(gè)非常重要的課題就是在不破壞免疫系統(tǒng)的前提下,讓納米載體躲避免疫系統(tǒng)的攻擊。


      傳統(tǒng)的解決方案我們都是通過(guò)在納米載體表面攜帶各種偽裝工具,盡量和免疫細(xì)胞捉迷藏,能躲則躲,絕不露面。但是這些載體也很容易迷路, 到達(dá)深層腫瘤部位的很少,并且在和免疫系統(tǒng)的斗智斗勇中,還會(huì)激發(fā)免疫系統(tǒng)產(chǎn)生新的抗體從而加速納米載體的清除,因此很難達(dá)到ZL的效果。而隨著仿生納米醫(yī)學(xué)的發(fā)展,科學(xué)家們可以讓納米載體穿上“吉利服”,不但可以在免疫系統(tǒng)中潛伏下來(lái),還可以大搖大擺的從免疫細(xì)胞的眼皮底下蒙混過(guò)關(guān),發(fā)揮極大功效。這種“吉利服”就是細(xì)胞膜提取物,不同種類細(xì)胞提取的細(xì)胞膜包覆在納米載體表面還可以表現(xiàn)出特殊的功效,像紅細(xì)胞膜或者一些免疫細(xì)胞膜可以提高納米載體的體內(nèi)循環(huán)時(shí)間,腫瘤細(xì)胞膜可以特異識(shí)別同源腫瘤等。穿上“細(xì)胞膜吉利服”之后,納米載體將顯現(xiàn)各方面的優(yōu)勢(shì)和潛力,從而成為近年來(lái)多功能納米載體領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)之一。

1、T細(xì)胞膜包裹下仿生納米藥物的免疫識(shí)別增強(qiáng)

      通過(guò)糖代謝技術(shù),獲取嵌入疊氮基團(tuán)(N3)的功能化T細(xì)胞,并提取功能化T細(xì)胞膜包裹在吲哚菁綠/聚合物納米載體表面,構(gòu)建仿生納米光敏劑。功能化T細(xì)胞膜上不但原本的抗原受體可以賦予納米光敏劑識(shí)別腫瘤細(xì)胞的能力,并且N3基團(tuán)可以識(shí)別腫瘤細(xì)胞糖代謝靶點(diǎn),從而實(shí)現(xiàn)納米載體在腫瘤內(nèi)部的富集,通過(guò)小動(dòng)物光學(xué)成像可以清楚的看到T細(xì)胞膜包裹下仿生納米藥物在腫瘤部位的靶向作用,從而進(jìn)一步實(shí)現(xiàn)腫瘤的jing準(zhǔn)可視化ZL。

 

功能化T細(xì)胞膜仿生納米顆粒實(shí)現(xiàn)特異性的腫瘤靶向和jing準(zhǔn)光熱ZL

參考文獻(xiàn):T Cell Membrane Mimicking Nanoparticles with Bioorthogonal Targeting and Immune Recognition for Enhanced Photothermal Therapy.  Advanced Science. 2019: 1900251.

2、生物學(xué)重編程全抗原細(xì)胞膜助力納米疫苗的研發(fā)

      將腫瘤細(xì)胞和樹(shù)突細(xì)胞融合細(xì)胞的生物學(xué)重編程細(xì)胞膜包覆在金屬有機(jī)化合物表面,構(gòu)建腫瘤疫苗可以在融合細(xì)胞膜表面表達(dá)大量免疫刺激分子,從而使得包裹融合細(xì)胞膜的納米載體像抗原呈遞細(xì)胞一樣直接作用T細(xì)胞從而激活免疫反應(yīng)。通過(guò)小動(dòng)物光學(xué)成像,可以看到重編程細(xì)胞膜包覆的納米載體在體內(nèi)長(zhǎng)循環(huán)到達(dá)腫瘤部位的過(guò)程。到達(dá)腫瘤部位的納米載體還可以被樹(shù)突細(xì)胞識(shí)別,從而誘導(dǎo)樹(shù)突細(xì)胞成熟,增強(qiáng)免疫效果,Z終消除腫瘤,從而拓展腫瘤ZL平臺(tái)。

 

生物學(xué)重編程細(xì)胞膜包裹納米載體的過(guò)程以及腫瘤免疫的激活

參考文獻(xiàn): Cytomembrane nanovaccines show therapeutic effects by mimicking tumor cells and antigen presenting cells. Nature Communications. 2019, 10(1): 3199.

3、腫瘤細(xì)胞膜包裹的黑磷納米載體拓寬光熱腫瘤免疫ZL

      手術(shù)切除的腫瘤組織含有對(duì)患者特異性的新抗原,是成為制備個(gè)體化腫瘤疫苗Z好的材料來(lái)源。作者利用細(xì)胞膜封裝的方式在二維光熱黑磷量子點(diǎn)(BPQDs)表面包裹腫瘤組織的細(xì)胞膜,從而制備具有光熱效應(yīng)的納米腫瘤疫苗(BPQD-CCNVs),并且把納米腫瘤疫苗和集落刺激因子(GM-CSF)裝入熱敏水凝膠中。皮下注射水凝膠后可以在紅外光的作用下持續(xù)釋放納米疫苗以及集落刺激因子,招募并激活DC細(xì)胞,從而捕獲腫瘤抗原并激活腫瘤特異性T細(xì)胞。同時(shí),尾靜脈注射PD-1YZ劑,阻斷PD-1/PD-L1免疫檢查點(diǎn)通路,增強(qiáng)T細(xì)胞抗腫瘤免疫應(yīng)答效應(yīng)。通過(guò)活體光學(xué)成像我們可以對(duì)腫瘤進(jìn)行生物發(fā)光標(biāo)記,從而長(zhǎng)期連續(xù)監(jiān)測(cè)腫瘤在體內(nèi)的發(fā)展情況。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明通過(guò)光熱免疫ZL可以有效清除實(shí)體腫瘤同時(shí)YZ術(shù)后轉(zhuǎn)移的復(fù)發(fā)。

 

(A)光熱腫瘤免疫實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)思路;

(B)FITC標(biāo)記的水凝膠在體內(nèi)的降解情況;

(C)個(gè)性化光熱腫瘤免疫ZL可以有效YZ術(shù)后實(shí)體腫瘤的復(fù)發(fā);

(D)個(gè)性化光熱腫瘤免疫ZL可以有效YZ術(shù)后腫瘤的轉(zhuǎn)移。

參考文獻(xiàn):Surgical Tumor-Derived Personalized Photothermal Vaccine Formulation for Cancer Immunotherapy. ACS nano. 2019, 13(3): 2956-2968.

珀金埃爾默擁有先進(jìn)的分子影像技術(shù),其小動(dòng)物活體成像系統(tǒng)為生物醫(yī)學(xué)的各種研究領(lǐng)域(包括腫瘤、干細(xì)胞、傳染病、炎癥、免疫性疾病、神經(jīng)疾病、心血管疾病、代謝疾病、基因ZL、納米材料、新藥研發(fā)、植物學(xué)等)提供了完整的成像解決方案。

 

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2019-08-02 16:43:57 570 0
IVIS視角 | 活體成像助力隱孢子蟲(chóng)感染可視化模型構(gòu)建

隨著生活水平和YL衛(wèi)生狀況的不斷提升,寄生蟲(chóng)感染在我們?nèi)粘I钪兴坪跻讶諠u陌生。但在一些欠發(fā)達(dá)地區(qū),由于貧困和不良的衛(wèi)生習(xí)慣造成的寄生蟲(chóng)感染仍然威脅著無(wú)數(shù)生命。隱孢子蟲(chóng)作為一種常見(jiàn)的人畜共患寄生蟲(chóng)感染性疾病,是導(dǎo)致腹瀉病的主要原因。由于其經(jīng)由糞便傳播,所以常經(jīng)由水體污染而在衛(wèi)生條件較差的地區(qū)發(fā)生群體性感染。感染通常是自限性的,健康的成年人在發(fā)生第 一階段的較嚴(yán)重的腹瀉之后便可恢復(fù),但糞便仍可能具有傳染性。新生兒或免疫力低下的如艾滋病患者或經(jīng)免疫YZZL的病人在感染后病情較嚴(yán)重,是兒童早期死亡、營(yíng)養(yǎng)不良和生長(zhǎng)遲緩的重要原因,也是艾滋病人并發(fā)腹瀉死亡的主要原因。


現(xiàn)今發(fā)現(xiàn)的隱孢子蟲(chóng)共有15個(gè)亞種,分別感染人、家禽、寵物、牲畜以及一些野生動(dòng)物。由于不了解其致病機(jī)制,目前的ZL方案往往是對(duì)癥用藥而非對(duì)因用藥。由于不同物種間感染模式差異,在實(shí)驗(yàn)動(dòng)物(主要為牛等家畜)上應(yīng)對(duì)隱孢子蟲(chóng)感染的有效疫苗往往對(duì)預(yù)防人的感染收效甚微。

針對(duì)以上問(wèn)題,來(lái)自美國(guó)賓大獸醫(yī)學(xué)院的研究人員發(fā)現(xiàn)了一種可用在小鼠模型中模擬與人患隱孢子蟲(chóng)病相似病癥的隱孢子蟲(chóng)(Cryptosporidium tyzzeri), 同時(shí)利用IVIS小動(dòng)物活體成像系統(tǒng)幫助他們?cè)隗w研究隱孢子蟲(chóng)的感染以及宿主經(jīng)寄生蟲(chóng)或疫苗免疫激活后的抗感染現(xiàn)象。該研究于近期發(fā)表在Cell子刊Cell Host & Microbe上。


要在小鼠體內(nèi)模擬人患隱孢子蟲(chóng)病的合理模型,首先就需要找到相應(yīng)的隱孢子蟲(chóng)。作者在農(nóng)場(chǎng)收集了大量小家鼠糞便,經(jīng)由測(cè)序,鑒定出一株與感染人的兩種隱孢子蟲(chóng)(C. parvum和C. hominis)Z接近的一種鼠隱孢子蟲(chóng)(C. tyzzeri)。同時(shí)為了后續(xù)在體觀察其感染模式以及宿主抗感染效果,作者通過(guò)CRISPR-Cas9技術(shù)將Luciferase基因和mCherry熒光蛋白導(dǎo)入到隱孢子蟲(chóng)的基因組中,構(gòu)建了一株可以進(jìn)行活體以及顯微觀察的隱孢子蟲(chóng)。

 

圖一C. tyzzeri的鑒定以及基因編輯 (上:隱孢子蟲(chóng)種間基因組相似性比較,AB為常見(jiàn)感染人的兩種隱孢子蟲(chóng),C為常見(jiàn)感染鼠的隱孢子蟲(chóng))

構(gòu)建好的隱孢子蟲(chóng)就可以進(jìn)行活體觀察了,由于有活力的隱孢子蟲(chóng)可以表達(dá)Luciferase,在底物熒光素的作用下便可自發(fā)熒光,通過(guò)IVIS活體成像系統(tǒng)來(lái)實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)體內(nèi)隱孢子蟲(chóng)的繁殖情況。作者將這一光學(xué)觀察方式與傳統(tǒng)的糞便qPCR檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證,二者具有很好的一致性。作者除了觀察到這一新鑒定的隱孢子蟲(chóng)感染和人患隱孢子蟲(chóng)病的感染部位以及病理表征一致之外,還觀察到了具有免疫缺陷的鼠(IFN-γ、Rag基因的敲除鼠 )也更易受到隱孢子蟲(chóng)的危害,這一點(diǎn)與臨床上免疫缺陷病人的高發(fā)病致死率也剛好吻合。

 

圖二  C. tyzzeri感染模式觀察

有了這一能夠很好模擬人隱孢子蟲(chóng)感染的實(shí)驗(yàn)動(dòng)物模型之后,便可以利用這一模型進(jìn)行隱孢子蟲(chóng)的ZL以及疫苗的開(kāi)發(fā)。由于臨床上隱孢子蟲(chóng)高發(fā)地區(qū)人們?cè)诟腥救笤俣雀腥镜母怕蚀蟠蠼档停虼俗髡呤紫葯z驗(yàn)了蟲(chóng)體是否可以直接作為疫苗來(lái)進(jìn)行感染的預(yù)防。利用未經(jīng)Luciferase標(biāo)記的C. tyzzeri進(jìn)行第 一次感染,同時(shí)實(shí)驗(yàn)組使用滅活的蟲(chóng)體作為疫苗進(jìn)行第 一次免疫,在感染后用廣譜抗蟲(chóng)藥巴龍霉素殺滅后用Luc標(biāo)記C. tyzzeri進(jìn)行二次感染,能夠觀察到接觸活蟲(chóng)的小鼠幾乎不會(huì)發(fā)生二次感染,而使用滅活蟲(chóng)體作為疫苗無(wú)法激活體內(nèi)免疫系統(tǒng)進(jìn)行后續(xù)的抗感染作用。

 

圖三 使用滅活的C. tyzzeri無(wú)法預(yù)防感染

因此作者想到可以使用減毒的活蟲(chóng)對(duì)宿主進(jìn)行第 一次免疫。通過(guò)射線進(jìn)行寄生蟲(chóng)減毒處理,可以降低其感染力至無(wú)害水平。在減毒活蟲(chóng)感染后30天,在使用Luc標(biāo)記的C. tyzzeri進(jìn)行感染,能夠觀察到該方法與野生型活蟲(chóng)二次感染模型有著相同的抗感染作用,說(shuō)明減毒的疫苗是一種行之有效的預(yù)防隱孢子蟲(chóng)感染的方式。但是由于要調(diào)動(dòng)自身免疫系統(tǒng),這一方法在免疫缺陷的小鼠身上仍不奏效。

 

圖四 使用減毒疫苗可以有效對(duì)隱孢子蟲(chóng)進(jìn)行預(yù)防

雖然這篇文章也并未真正解決隱孢子蟲(chóng)的抗感染問(wèn)題,但是構(gòu)建出針對(duì)這一寄生蟲(chóng)病的實(shí)驗(yàn)小鼠模型已經(jīng)為后續(xù)的科研工作者嘗試更多ZL方案和預(yù)防措施提供了可操作可監(jiān)控的實(shí)驗(yàn)工具。

參考文獻(xiàn)

1. A Genetically Tractable, Natural Mouse Model of Cryptosporidiosis Offers Insights into Host Protective Immunity. Adam Sateriale et al., 2019, Cell Host & Microbe 26, 1–12

https://doi.org/10.1016/j.chom.2019.05.00

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2019-09-09 15:54:20 542 0
Orbitrap在植物蛋白質(zhì)組領(lǐng)域的應(yīng)用

蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)已經(jīng)成為植物科學(xué)研究中重要的工具,以O(shè)rbitrap為代表的高分辨質(zhì)譜技術(shù)已在植物蛋白質(zhì)研究領(lǐng)域產(chǎn)生重要的科研成果,發(fā)表在Nature Plant,Plant Cell 等核心期刊上。

利用Orbitrap質(zhì)譜可針對(duì)植物樣本描繪細(xì)胞和亞細(xì)胞蛋白定位,以及追蹤蛋白之間的相互作用,鑒定不同細(xì)胞亞結(jié)構(gòu)的蛋白組分。同時(shí)可以利用TMT標(biāo)記蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)進(jìn)行定量植物蛋白質(zhì)組學(xué)分析,此外,基于Orbitrap的多組學(xué)研究策略可以結(jié)合蛋白質(zhì)組和代謝組學(xué),整合基因組信息針對(duì)植物從多分子層面的大數(shù)據(jù)重新定義樣本的分型、挖掘蛋白水平上與相關(guān)基因突變、表達(dá)關(guān)系及關(guān)鍵分子調(diào)控機(jī)制。

讓我們以幾篇經(jīng)典文章為例,一探orbitrap助力的植物蛋白質(zhì)組學(xué)前沿發(fā)現(xiàn):


1

植物蛋白質(zhì)定性定量研究以及

相關(guān)蛋白藥物靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)


Roman Lagoutte利用炔基標(biāo)記的去氧地膽草素類似物與SILAC蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù),鑒定去氧地膽草素在多種癌細(xì)胞中的作用靶點(diǎn)蛋白。作者首先合成了一系列具有kang癌作用的去氧地膽草素的類似物并對(duì)這些化合物的細(xì)胞毒性進(jìn)行分析篩選,且證明了去氧地膽草素的細(xì)胞毒性是由細(xì)胞凋亡而非細(xì)胞壞死引起;接著利用帶有炔基標(biāo)簽的去氧地膽草素類似物,在多種細(xì)胞系中通過(guò)SILAC標(biāo)記定量和無(wú)標(biāo)定量(Label-Free)的蛋白質(zhì)組學(xué)方法對(duì)去氧地膽草素的靶點(diǎn)進(jìn)行分析,在MCF7細(xì)胞中鑒定出11個(gè)新的去氧地膽草素的靶蛋白。該研究成果發(fā)表在Nature Communication雜志上。


2

植物相關(guān)蛋白質(zhì)水平翻譯化修飾研究


上海逆境生物學(xué)研究ZX研究團(tuán)隊(duì)運(yùn)用蛋白質(zhì)組學(xué)等技術(shù),揭示了植物雷帕霉素靶蛋白(TOR)激酶和脫落酸(ABA)受體偶聯(lián)的信號(hào)途徑間通過(guò)相互磷酸化修飾,介導(dǎo)植物生長(zhǎng)發(fā)育和脅迫應(yīng)答的平衡。該策略是利用磷酸化組學(xué)分析研究植物逆境機(jī)理的案例。

該研究成果發(fā)表在Molecular Cell雜志上,如下圖所示:


3

TMT定量蛋白質(zhì)組學(xué)

深入研究植物生長(zhǎng)發(fā)育衰老過(guò)程


華南農(nóng)業(yè)大學(xué)研究人員為了研究花瓣衰老過(guò)程中蛋白質(zhì)變化過(guò)程泛素化修飾的變化。用乙烯處理可以廣泛地改變植物中的轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組譜。泛素化是真核生物中的主要翻譯化,在蛋白質(zhì)降解中起重要作用。

在本研究中,作者首先通過(guò)RNA測(cè)序獲得參考矮牽牛(Petunia hybrida)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。構(gòu)建的蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)庫(kù),然后對(duì)乙烯處理后的矮牽?;ü趗biquitylome進(jìn)行定量。在乙烯處理后16小時(shí),共有3,606個(gè)蛋白質(zhì)和2,270個(gè)遍在蛋白化位點(diǎn)進(jìn)行定量。乙烯處理后,發(fā)現(xiàn)284個(gè)下調(diào)蛋白和233個(gè)上調(diào)蛋白,320個(gè)上調(diào)和127個(gè)下調(diào)泛素化位點(diǎn)(P <0.05),表明在矮牽牛的乙烯介導(dǎo)的花冠衰老過(guò)程中全泛素化水平有所提升。泛素連接酶在蛋白質(zhì)和轉(zhuǎn)錄水平上調(diào)。此外呢,全蛋白質(zhì)組和Ubiquitylome是負(fù)相關(guān)的,乙烯介導(dǎo)的花冠衰老過(guò)程中泛素化促進(jìn)蛋白質(zhì)的降解。

該研究成果發(fā)表在Plant Physiol雜志上,如下圖所示:


4

基于Orbitrap多組學(xué)研究

多層面解析植物蛋白

和代謝物以及基因表達(dá)關(guān)系


Fionn McLoughlin利用orbitrap超高分辨質(zhì)譜分析蛋白組學(xué)數(shù)據(jù),以及代謝組數(shù)據(jù)與轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果,進(jìn)行多組學(xué)分析。在多組學(xué)上分析玉米自噬與缺氮脅迫的聯(lián)系,研究者選用了自噬受損突變體,基因敲低與野生型作為實(shí)驗(yàn)材料,在富氮、缺氮條件下進(jìn)行培養(yǎng)。選擇了玉米幼苗的第二片葉和第四片葉進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組、蛋白組、代謝組探討自噬對(duì)于細(xì)胞穩(wěn)態(tài)的影響。蛋白與轉(zhuǎn)錄層面,缺氮條件下,缺氮脅迫的通路轉(zhuǎn)錄上調(diào),葉綠體組分的表達(dá)受到Y(jié)Z。在第二片葉和第四片葉中分別鑒定到了3,327和3,801個(gè)蛋白。分析結(jié)果顯示,自噬作用相對(duì)于缺氮脅迫,對(duì)于蛋白組的調(diào)控變化影響更大。該研究成果發(fā)表在Nature Plant雜志上。

2020-09-08 17:20:06 545 0
IVIS視角——[Nature]亞克隆合作通過(guò)修飾局部和全身的免疫微觀環(huán)境驅(qū)動(dòng)腫瘤轉(zhuǎn)移

腫瘤異質(zhì)性及轉(zhuǎn)移性

人類大多數(shù)腫瘤是異質(zhì)性的,由具有不同性質(zhì)的細(xì)胞克隆組成,呈現(xiàn)出不同的特點(diǎn)。高度異質(zhì)性腫瘤具有較差的臨床LX,但其潛在機(jī)制仍不清楚。腫瘤的轉(zhuǎn)移性是大多數(shù)癌癥患者死亡的原因。因此,了解轉(zhuǎn)移進(jìn)程的驅(qū)動(dòng)因子是改善臨床結(jié)果的關(guān)鍵。


癌癥基因組測(cè)序研究已經(jīng)確定了原發(fā)性和轉(zhuǎn)移性腫瘤之間具有極小的遺傳差異,并顯示原位腫瘤和遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移病灶具有顯著的亞克隆異質(zhì)性。Z近的一些研究表明:微觀環(huán)境變化是腫瘤轉(zhuǎn)移傳播和生長(zhǎng)的主要媒介,從而突出了在腫瘤進(jìn)展中的非細(xì)胞自發(fā)因子的作用。


本期IVIS視角小編帶您探究一下NatureZ近發(fā)表的論文:《亞克隆合作通過(guò)修飾局部和全身的免疫微觀環(huán)境驅(qū)動(dòng)腫瘤轉(zhuǎn)移》


 

本文揭示了表達(dá)IL11和FIGF (VEGFD)的乳腺癌細(xì)胞的小亞克隆協(xié)同作用促進(jìn)轉(zhuǎn)移進(jìn)展并產(chǎn)生了驅(qū)動(dòng)性和中性亞克隆組成的多克隆轉(zhuǎn)移。單克隆、多克隆原發(fā)灶和轉(zhuǎn)移灶的上皮細(xì)胞及基質(zhì)細(xì)胞表達(dá)譜分析顯示了這種協(xié)同作用是間接的,是通過(guò)局部和系統(tǒng)微環(huán)境介導(dǎo)的。作者確定中性粒細(xì)胞為主的白細(xì)胞群受表達(dá)IL11小亞克隆的調(diào)節(jié),敲除中性粒細(xì)胞的表達(dá),可以阻止腫瘤轉(zhuǎn)移的生長(zhǎng)。來(lái)自原發(fā)性腫瘤、血液和肺的CD45陽(yáng)性細(xì)胞群的單細(xì)胞RNA-seq顯示IL11作用于骨 髓間充質(zhì)基質(zhì)細(xì)胞,可誘導(dǎo)產(chǎn)生致瘤性和轉(zhuǎn)移性中性粒細(xì)胞前體。本文結(jié)合IVIS活體成像系統(tǒng)研究發(fā)現(xiàn)了非細(xì)胞自發(fā)因子和小亞克隆在腫瘤轉(zhuǎn)移中起著關(guān)鍵作用。


探究驅(qū)動(dòng)轉(zhuǎn)移的亞克隆協(xié)同作用分子機(jī)制

本文用人類乳腺癌細(xì)胞系(MDAMB-468)的腫瘤(來(lái)源于異質(zhì)性腫瘤異種移植模型),研究亞克隆在腫瘤表型之間的相互作用。作者之前已經(jīng)證實(shí)一個(gè)小的亞克隆通過(guò)非細(xì)胞自主的相互作用可以驅(qū)動(dòng)腫瘤生長(zhǎng)。本文測(cè)試了18個(gè)亞克隆,每一種表達(dá)一種與轉(zhuǎn)移和血管再生有關(guān)的分泌蛋白。并發(fā)現(xiàn)具有全部18個(gè)亞克隆的多克隆腫瘤生長(zhǎng)Z快(上圖a)。相反只有白細(xì)胞介素11 (IL11) 和趨化因子 (C-C motif) 配體5在單克隆腫瘤能夠促進(jìn)腫瘤生長(zhǎng)。我們還確定了表達(dá)IL11和低聚果糖誘導(dǎo)生長(zhǎng)因子(FIGF也被稱為VEGFD)的亞克隆兩者的混合物在很大程度上能夠復(fù)制腫瘤這種生長(zhǎng)特點(diǎn)。


 

克隆之間合作導(dǎo)致多克隆轉(zhuǎn)移

Nature Cell Biology :Published: 01 July 2019

https://www.nature.com/articles/s41556-019-0346-x

IL11缺失的多克隆腫瘤阻止了腫瘤的生長(zhǎng),揭示了IL11和FIGF因子在腫瘤生長(zhǎng)中的協(xié)同作用。此外,多克隆腫瘤和僅包括IL11和FIGF亞克隆的腫瘤具有高度的轉(zhuǎn)移性(上圖b)。


本文首先驗(yàn)證含有IL11+和FIGF+驅(qū)動(dòng)因子的原發(fā)性轉(zhuǎn)移瘤MDA-MB-468的克隆能力,像中性子亞克隆。單克隆或綠色熒光蛋白 (GFP)的多克隆混合物熒光素酶表達(dá)親本細(xì)胞,紅色熒光蛋白 (RFP)植入v5標(biāo)記的IL11+細(xì)胞、RFP+FIGF+細(xì)胞植入到免疫缺陷NOG小鼠的乳腺脂肪墊。我們每周用卡尺測(cè)量原發(fā)腫瘤的生長(zhǎng)情況并通過(guò)每周生物發(fā)光觀察轉(zhuǎn)移病灶成像。多克隆腫瘤(含5% IL11+、5%的FIGF+RFP+細(xì)胞和90%的GFP+親本細(xì)胞)生長(zhǎng)較快,轉(zhuǎn)移性更強(qiáng)與單克隆和親本腫瘤相比(如下圖a)。


 

中性粒細(xì)胞的系統(tǒng)性表達(dá)降低YZ了由IL11+和FIGF+亞克隆驅(qū)動(dòng)的多克隆腫瘤的轉(zhuǎn)移擴(kuò)散(或生長(zhǎng)),因此,中性粒細(xì)胞的表型和功能特點(diǎn)取決于宿主環(huán)境。


CD45+細(xì)胞群的單細(xì)胞分析

鑒于作者之前的結(jié)果表明,中性粒細(xì)胞促進(jìn)腫瘤轉(zhuǎn)移。作者比較了DOX+或DOX-誘導(dǎo)小鼠血液和肺中性粒細(xì)胞單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組特點(diǎn)。IL11和FIGF誘導(dǎo)上調(diào)了幾個(gè)信號(hào)通路如:TGFβ和JAK-STAT信號(hào)通路,它們與中性粒細(xì)胞的免疫系統(tǒng)中腫瘤預(yù)生成和預(yù)轉(zhuǎn)移有關(guān),這些特征來(lái)自肺部,而不是來(lái)自血液。盡管中性粒細(xì)胞在肺部有變化,作者通過(guò)single-cell RNA-seq沒(méi)有檢測(cè)到IL11或GIGF受體的表達(dá)。然而,IL11RA的細(xì)胞轉(zhuǎn)錄本在單獨(dú)的細(xì)胞組中明顯存在,這些細(xì)胞不能歸為中性粒細(xì)胞或其他白細(xì)胞亞群。


這些IL11RA陽(yáng)性細(xì)胞表達(dá)編碼GP130和SATA3的IL6ST基因,GP130是IL11信號(hào)通路中所必需的共同受體。STAT3是LI11下游的作用因子?;诩?xì)胞群中基因表達(dá)情況,其中還包括細(xì)胞外基質(zhì)和發(fā)育相關(guān)蛋白,作者將該群體標(biāo)記為和IL11反應(yīng)的間充質(zhì)基質(zhì)細(xì)胞 (MStrCs)。雖然這個(gè)群體沒(méi)有表達(dá)典型的間充質(zhì)干細(xì)胞 (MSC)標(biāo)記物,但其表現(xiàn)了普遍存在于干細(xì)胞相關(guān)基因的顯著特征,這表明它可能是一種未特征化的間充質(zhì)干細(xì)胞前體。之前的研究已經(jīng)描述過(guò)間充質(zhì)干細(xì)胞與白細(xì)胞之間的相互作用由多種細(xì)胞因子和趨化因子調(diào)節(jié)的。


在本文的研究中,作者著重于研究?jī)蓚€(gè)分泌因子,選擇的基礎(chǔ)是基于作者之前的數(shù)據(jù),它是由較小的亞克隆表達(dá)的且協(xié)同作用促進(jìn)轉(zhuǎn)移。IL11屬于IL6家族的細(xì)胞因子,并在多種癌癥的耐藥性進(jìn)展中起著重要的作用,包括前列腺癌和結(jié)腸癌。在乳腺癌中,IL11被認(rèn)為和ZL的耐藥性和骨轉(zhuǎn)移相關(guān),以及作為不良預(yù)后的標(biāo)志物。FIGF是VEGFR2和VEGFR3的配體,可以刺激血管生成和淋巴管生成。


本文發(fā)現(xiàn)白細(xì)胞可能不是IL11直接作用的細(xì)胞靶點(diǎn),但可通過(guò)間充質(zhì)基質(zhì)細(xì)胞分泌因子(MStrCs)間接影響IL11。有趣的是,這些基質(zhì)細(xì)胞也表達(dá)PLXDC2和ANTXR1,這在腫瘤相關(guān)的內(nèi)皮細(xì)胞中是高表達(dá)的。因此,這些IL11RA陽(yáng)性的間充質(zhì)基質(zhì)細(xì)胞可能是產(chǎn)生多種細(xì)胞類型的祖細(xì)胞。對(duì)中性粒細(xì)胞亞型的進(jìn)一步認(rèn)識(shí)和開(kāi)發(fā)導(dǎo)致腫瘤轉(zhuǎn)移的中性粒細(xì)胞靶向工具結(jié)合抗腫瘤細(xì)胞靶點(diǎn)的藥物,有可能被用于預(yù)防乳腺癌轉(zhuǎn)移研究。


PerkinElmer IVIS小動(dòng)物活體成像系統(tǒng)在該研究中提供了支持,如需了解詳情歡迎與我們的工程師取得聯(lián)系。

復(fù)制右方鏈接了解IVIS小動(dòng)物活體成像系統(tǒng):https://url.cn/5fSl2r4


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2019-10-10 13:07:16 429 0
邁克耳孫干涉儀在哪些領(lǐng)域應(yīng)用
 
2016-03-20 06:47:38 422 1
日立電鏡ZT(一)|日立電鏡在生命科學(xué)領(lǐng)域的多維度應(yīng)用

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日立電鏡在生命科學(xué)領(lǐng)域的多維度應(yīng)用

【時(shí)間: 2020/4/15  下午15:00】


課程大綱:

       1. 高反差TEM介紹

       2. 高分辨冷場(chǎng)電鏡介紹

       3. 病毒觀察應(yīng)用介紹

       4. 病理診斷應(yīng)用介紹

       5. 在線解答及應(yīng)用實(shí)例


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2020-04-02 11:06:09 326 0
相差顯微鏡技術(shù)在細(xì)胞生物學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用
 
2016-03-28 06:18:26 810 1
拉曼光譜在筆跡鑒定領(lǐng)域的應(yīng)用

1引言

      隨著市場(chǎng)經(jīng)濟(jì)的不斷發(fā)展和人們法律意識(shí)的不斷提高,涉及經(jīng)濟(jì)合同的案件越來(lái)越多,其中包括油墨的鑒定、筆跡的添加和涂改、公章印文的真?zhèn)?、噴墨和激光打印字跡的鑒定、筆畫(huà)先后順序及朱墨時(shí)序的鑒定等。由于刑偵鑒定檢材有限,且有重要的證據(jù)價(jià)值,以往采用的鑒定技術(shù)和方法,有的對(duì)文件物證造成一定損壞,尋找一種快速、準(zhǔn)確、無(wú)損的檢驗(yàn)方法顯得尤為重要。而拉曼光譜技術(shù)不僅可以實(shí)現(xiàn)對(duì)檢材的零破壞,并且能夠快速、有效檢出字跡的異同點(diǎn),從而鑒定不同的筆跡,在司法文書(shū)鑒定中取得了令人滿意的結(jié)果,鑒定結(jié)果可以為法庭訴訟提供科學(xué)依據(jù)。

2 拉曼光譜鑒定原理

      拉曼光譜技術(shù)是一種分子散射光譜技術(shù),具有快速、靈敏和無(wú)損檢驗(yàn)的特點(diǎn),近些年來(lái)在許多領(lǐng)域得到了廣泛的應(yīng)用。拉曼光譜技術(shù)主要是借助物質(zhì)分子的振動(dòng)譜峰來(lái)識(shí)別物質(zhì)的不同成分,因?yàn)椴煌奈镔|(zhì)其分子結(jié)構(gòu)不同,因此其振動(dòng)譜峰也會(huì)有所不同,而振動(dòng)譜峰的位置可以非常靈敏地反映出不同物質(zhì)的成分變化。應(yīng)用拉曼光譜技術(shù)還可以對(duì)被檢客體的物質(zhì)成分進(jìn)行定量分析,即通過(guò)測(cè)定振動(dòng)譜峰所涵蓋的曲線積分面積大小來(lái)分析被檢客體中所含物質(zhì)組分的含量多少。因此,應(yīng)用拉曼光譜技術(shù)可以實(shí)現(xiàn)對(duì)物質(zhì)成分的識(shí)別及定量的分析。檢驗(yàn)字跡正是利用了這一點(diǎn),對(duì)筆畫(huà)進(jìn)行拉曼光譜掃描,確定二者是否存在成分差異,若存在差異,則證明筆跡是偽造的。

      日常書(shū)寫(xiě)所使用的黑色簽字筆的書(shū)寫(xiě)色料成分有三種類型,diyi類色料是全部由炭黑組成;第二類色料是不含炭黑成分,全部由多種顏色的染料拼制而成;第三類色料是含有部分炭黑成分和其他染料組成?;诖?,書(shū)寫(xiě)人在進(jìn)行偽造字跡時(shí)使用了色料成分不同類型的筆,那么偽造部分筆畫(huà)和原筆畫(huà)的色料拉曼光譜一定不一致,即使是使用了色料類型相同的筆,其色料成分也會(huì)因?yàn)槠放?、型?hào)的差異導(dǎo)致二者拉曼光譜圖不一致,從而區(qū)分開(kāi)來(lái),但僅含炭黑的除外。

3 拉曼光譜筆跡鑒定方案

      拉曼光譜技術(shù)是一種無(wú)損傷、靈敏度高、操作簡(jiǎn)捷的測(cè)試手段,實(shí)驗(yàn)設(shè)備采用我公司的“Finder Vista”微曼系列顯微共聚焦拉曼光譜儀系統(tǒng);激光器波長(zhǎng)為532nm;光譜儀參數(shù):500焦距,600g/mm;掃描物鏡100X。采集時(shí)間與采集次數(shù)根據(jù)樣本的拉曼光譜情況而定。

      采用對(duì)比試驗(yàn)方案,檢測(cè)紅、藍(lán)、黑3組顏色的筆跡。實(shí)驗(yàn)采用不同廠家、品牌、型號(hào)的簽字筆。實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)如表1。

表1 不同型號(hào)、不同品牌中性筆實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)方案

筆跡編號(hào)型號(hào)品牌
實(shí)驗(yàn)一(黑色)黑1號(hào)樣GP-1212晨光
黑2號(hào)樣A4501
黑3號(hào)樣AGP13902
實(shí)驗(yàn)二(紅色)紅1號(hào)樣GP-1212晨光
紅2號(hào)樣GP-1280
紅3號(hào)樣0221B真彩
實(shí)驗(yàn)二(藍(lán)色)藍(lán)1號(hào)樣GP-1212晨光
藍(lán)2號(hào)樣GP-1280
藍(lán)1號(hào)樣
以恒

4 拉曼光譜分析

4.1 黑色中性筆的拉曼光譜分析

      實(shí)驗(yàn)時(shí)采用532nm激光器激發(fā)檢測(cè)3種型號(hào)的黑色中性筆。圖一中3組樣品分別代表了3中型號(hào)黑色中性筆的拉曼光譜。

圖1 黑色中性筆拉曼光譜圖

      從圖1中我們可以發(fā)現(xiàn),黑色1、2、3號(hào)樣品的拉曼光譜之間存在著顯著差異。1、2號(hào)樣品位于高波段3000cm-1附近的拉曼峰存在顯著區(qū)別,1號(hào)樣品在該波段存在2個(gè)拉曼特征峰,分別為2896、2950 cm-1。而2號(hào)樣品只能檢測(cè)到2892 cm-1特征峰。3號(hào)樣品相較于1、2號(hào)樣品,是較為純凈的炭黑中性筆,只能檢測(cè)到位于1360、1590 cm-1附近的碳元素的拉曼特征峰。

這些光譜存在差異主要是由于不同型號(hào)的黑色中性筆油墨成分不盡相同,因此,拉曼特征峰也就有所差異。

圖2 紅色中性筆拉曼光譜圖

      不同品牌、不同型號(hào)的紅色中性筆拉曼光譜圖如圖2所示。從圖中可以發(fā)現(xiàn),紅色中性筆的拉曼特征峰基本相同,說(shuō)明3組物質(zhì)的組成物質(zhì)基本相似,但是,紅色1、2號(hào)樣品相較于3號(hào)樣品。拉曼特征峰較為明顯,說(shuō)明,1、2號(hào)樣所含的油墨成分較多。同時(shí)紅色3號(hào)樣品位于1100 cm-1附近的兩個(gè)特征峰缺失,其產(chǎn)生的原因仍值得繼續(xù)深入研究。

圖3 藍(lán)色中性筆拉曼光譜圖

      不同品牌、不同型號(hào)的藍(lán)色中性筆拉曼光譜圖如圖3所示。從圖中可以發(fā)現(xiàn),藍(lán)色中性筆的拉曼特征峰峰位基本相同,說(shuō)明3組物質(zhì)的組成物質(zhì)基本相似,但是,拉曼特征峰的相對(duì)強(qiáng)度仍有一定區(qū)別。如位于1397 cm-1的拉曼特征在藍(lán)色2、3有很強(qiáng)的拉曼信號(hào),而藍(lán)色1號(hào)樣該峰消失,表明該組分物質(zhì)藍(lán)色1號(hào)樣品種沒(méi)有添加。1210、1436、1457 cm-1的拉曼特征峰相對(duì)強(qiáng)度在3組樣品中也呈現(xiàn)類似現(xiàn)象,因此,這4組拉曼特征峰可以作為區(qū)分藍(lán)色中性筆的指標(biāo)之一。

5結(jié)論

      在法庭科學(xué)領(lǐng)域,物證檢驗(yàn)要求盡量無(wú)損檢材,與其它分析技術(shù)相比,拉曼光譜技術(shù)優(yōu)勢(shì)在于其非破壞性和幾乎無(wú)需樣品制備,適合對(duì)未知固體、液體進(jìn)行快速無(wú)損分析,因此該技術(shù)在物證鑒定方面的應(yīng)用越來(lái)越廣泛。

      本次研究運(yùn)用Finder Vista 激光顯微拉曼光譜鑒定黑、紅、藍(lán)三種市面常見(jiàn)的中性筆,并取得了一定成果,即可實(shí)現(xiàn)對(duì)紙張上的不同廠家、不同型號(hào)的中性筆進(jìn)行定性分析。拉曼光譜法準(zhǔn)確率高、分析速度快、圖譜易辨認(rèn),特別是具有樣品用量少,無(wú)損傷檢測(cè)等優(yōu)勢(shì),因此,在筆記鑒定領(lǐng)域具有很高的實(shí)用價(jià)值。

6參考文獻(xiàn)

[1] 徐徹, 湯純, 楊延勇. 顯微激光拉曼光譜法鑒別黑色圓珠筆油墨的初步研究[J]. 刑事技術(shù), 2000, 16(4): 244-245.

[2] 林建成, 李開(kāi)開(kāi), 黃建同. 拉曼光譜技術(shù)檢驗(yàn)黑色簽字筆添改字跡研究[J]. 光散射學(xué)報(bào), 2014, 26(1): 68-72.



(來(lái)源:北京卓立漢光儀器有限公司)

2019-07-12 14:10:04 1038 0
微型CT在植物學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用

一、前言

Micro CT作為一種三維斷層掃描成像方法,可以根據(jù)植物不同組織對(duì)X線的吸收與透過(guò)率的不同,重建獲得植物組織的斷面或立體圖像,發(fā)現(xiàn)其中的細(xì)小組織結(jié)構(gòu)變化,從而無(wú)損探索植物各組織內(nèi)部的結(jié)構(gòu)。因而在植物研究中,Micro CT的應(yīng)用也逐漸增多。

二、應(yīng)用

1.    根系

植物根系的分枝結(jié)構(gòu)是植物生命力的決定因素,根系的生長(zhǎng)形態(tài)與植物的土壤環(huán)境和植物的基因型息息相關(guān),因此根系的3D形態(tài)學(xué)分析是評(píng)估不同植物競(jìng)爭(zhēng)優(yōu)勢(shì)的重要工具。由于植物的根生長(zhǎng)在各種不透明的媒介中,這成為限制觀察植物根系在土壤中的生長(zhǎng)情況的主要因素,是獲得原位的根系生長(zhǎng)情況的一個(gè)巨大挑戰(zhàn)和障礙。傳統(tǒng)的洗根掃描法能夠清晰地展現(xiàn)根系,但卻破壞了其原有的狀態(tài);微根窗法能夠解決原位測(cè)量的問(wèn)題,但卻無(wú)法展示探索土壤內(nèi)部的根系分布。

隨著Micro CT的發(fā)展和應(yīng)用,研究者們發(fā)現(xiàn),利用Micro CT掃描可以無(wú)損地原位探索土壤中不同植物的根系變化,可以測(cè)量根系的3D結(jié)構(gòu),獲取根系的形態(tài)學(xué)以及剖面等內(nèi)部性狀,是根系原位研究的重要工具。同時(shí),根系的算法分割也一直是Micro CT根系原位掃描中需要突破的難點(diǎn)。

1平生公司的NEMO?Micro CT在原位狀態(tài)下掃描的水稻根系展示如下,通過(guò)CT 三維重建,可觀察到根系的完整拓?fù)浣Y(jié)構(gòu),并對(duì)其內(nèi)部剖面進(jìn)行觀察:

  

2.     種子

目前國(guó)際上使用的很多研究種子的先進(jìn)技術(shù)大多是利用熒光法研究種子活力或其萌發(fā)率,這些方法能夠高通量地達(dá)到某些研究目的,但始終無(wú)法得知種皮內(nèi)部的結(jié)構(gòu)和動(dòng)態(tài)變化過(guò)程。

而種子內(nèi)部的形態(tài)學(xué)信息參數(shù),以及胚芽和胚乳區(qū)域的瑕疵率等,是評(píng)估種子的出芽率和質(zhì)量的關(guān)鍵信息。傳統(tǒng)方法常采用內(nèi)窺鏡來(lái)分析種子內(nèi)部的形態(tài),然而這種方法只能獲得有限的投影,受種子放置方位的影響,很多缺陷無(wú)法體現(xiàn)。

Micro CT通過(guò)投影重建、三維成像功能,可提供種子的不同角度的觀察,對(duì)于種子內(nèi)部結(jié)構(gòu)展現(xiàn)更加全面,例如裂隙、內(nèi)部萌芽情況評(píng)估、病蟲(chóng)害情況等等。

2以下是利用平生公司的NEMO?Micro CT對(duì)一粒水稻種子進(jìn)行掃描成像,并利用平生自己開(kāi)發(fā)的圖像分析軟件Avatar?進(jìn)行分析處理。在圖像中可清晰觀察到種皮,胚乳、胚牙等內(nèi)部結(jié)構(gòu),并可給出這些組織的體積分析結(jié)果

3:玉米種子(XX農(nóng)業(yè)大學(xué)提供樣本,NEMO? Micro CT掃描結(jié)果)

4:麥穗(XXX植物基因研究ZX提供樣本,NEMO? Micro CT掃描結(jié)果)

3.  果實(shí)

使用Micro CT對(duì)果實(shí)的無(wú)損掃描,也可觀察到果實(shí)的內(nèi)部結(jié)構(gòu),在營(yíng)養(yǎng)學(xué)研究與蛀蟲(chóng)病檢測(cè)方面有極大的幫助。(Super Nova? Micro CT掃描結(jié)果)

4.    莖、葉

通過(guò)高分辨率的Micro CT系統(tǒng)的掃描,為研究植物莖流和植物水分方面提供更直觀的3D的觀測(cè)方式。NEMO? Micro CT掃描結(jié)果)

 

三、        總述

由此可見(jiàn),Micro CT不僅在活體動(dòng)物和離體組織的分析研究中具有重要的應(yīng)用,也在植物方面有著特殊的應(yīng)用價(jià)值。可廣泛應(yīng)用于植物種子三維結(jié)構(gòu)研究,無(wú)損探索種子腔體、胚和胚乳的變化;分析原位研究土壤中根系的三維形態(tài)結(jié)構(gòu);研究果實(shí)內(nèi)部結(jié)構(gòu)變化;以及植物莖流和植物水分等


2020-05-28 10:05:52 800 0

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