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為什么講生物質(zhì)譜是蛋白質(zhì)組學研究的主要工具

Errity 2016-10-13 20:39:22 435  瀏覽
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  • 瘋狗* 2016-10-14 00:00:00
    蛋白質(zhì)組學(Proteomics)研究生物質(zhì)譜技術(shù) 對分離的蛋白質(zhì) 進行鑒定是蛋白質(zhì)組研究的重要內(nèi)容,蛋白質(zhì)微量測序、氨基酸組成分析等傳統(tǒng)的蛋白質(zhì)鑒定技術(shù)不能滿足高通量和GX率的要求,生物質(zhì)譜技術(shù)是蛋白質(zhì)組學(Proteomics)的另一支撐技術(shù)。 生物質(zhì)譜技術(shù)在離子化方法上主要有兩種軟電離技術(shù),即基質(zhì)輔助激光解吸電離(matrix―assisted laser desorption/ionization,MALDl)和電噴霧電離(electrospray ionization,ESl)。MALDI是在激光脈沖的激發(fā)下,使樣品從基質(zhì)晶體中揮發(fā)并離子化。ESI使分析物從溶液相中電離,適合與液相分離手段(如液相色譜和毛細管電泳(capillary electrophoresis))聯(lián)用。MALDI適于分析簡單的肽混合物,而液相色譜與ESI―MS的聯(lián)用(LC―MS)適合復(fù)雜樣品的分析。 軟電離技術(shù)的出現(xiàn)拓展了質(zhì)譜的應(yīng)用空間,而質(zhì)量分析器的改善也推動了質(zhì)譜儀技術(shù)的發(fā)展。生物質(zhì)譜的質(zhì)量分析器主要有4種:離子阱(iontrap,IT)、飛行時間(TOF)、四極桿(quadrupole)和傅立葉變換離子回旋共振(Fourier transform ion cyclotron resonance,F(xiàn)TICR)。它們的結(jié)構(gòu)和性能各不相同,每一種都有自己的長處與不足。它們可以單獨使用,也可以互相組合形成功能更強大的儀器。 離子阱質(zhì)譜靈敏度較高,性能穩(wěn)定,具備多級質(zhì)譜能力,因此被廣泛應(yīng)用于蛋白質(zhì)組學(Proteomics)研究,不足之處是質(zhì)量精度較低。與離子阱相似,傅立葉變換離子回旋共振(FTICR)質(zhì)譜也是一種可以“捕獲”離子的儀器,但是其腔體內(nèi)部為高真空和高磁場環(huán)境,具有高靈敏度、寬動態(tài)范圍、高分辨率和質(zhì)量精度(質(zhì)量準確度可很容易地小于1mg/L),這使得它可以在一次分析中對數(shù)百個完整蛋白質(zhì)分子進行質(zhì)量測定和定量。FTICR―MS的一個重要功能是多元串級質(zhì)譜,與通常的只能選一個母離子的串級質(zhì)譜方式不同,F(xiàn)TICR―MS可以同時選擇幾個母離子進行解離,這無疑可以大大增加蛋白質(zhì)鑒定工作的通量。但是它的缺點也很明顯,操作復(fù)雜、肽段斷裂效率低、價格昂貴等,這些缺點限制了它在蛋白質(zhì)組學(Proteomics)中的廣泛應(yīng)用。MALDI通常與TOF質(zhì)量分析器聯(lián)用分析肽段的精確質(zhì)量,而ESI常與離子阱或三級四極桿質(zhì)譜聯(lián)用,通過碰撞誘導(dǎo)解離(collision―induceddissociation,CID)獲取肽段的碎片信息。

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1 前言

生物質(zhì)炭是指由富含碳的生物質(zhì)在無氧或缺氧條件下經(jīng)過高溫裂解生成的一種具有高度芳香化、富含碳素的多孔固體顆粒物質(zhì)。它含有大量的碳和植物營養(yǎng)物質(zhì)、具有豐富的孔隙結(jié)構(gòu)、較大的比表面積且表面含有較多的含氧活性基團,是一種多功能材料。它不僅可以改良土壤、增加肥力,吸附土壤或污水中的重金屬及有機污染物,而且對碳氮具有較好的固定作用,施加于土壤中,可以減少 CO2、N2O、CH4 等溫室氣體的排放,減緩變暖。生物質(zhì)炭中的重金屬檢測是非常重要的,如果超標的話,就會污染土壤。為了檢測生物質(zhì)炭中的重金屬含量,可采用微波消解的方法對其進行前處理,本方法消解迅速,酸用量少,酸霧污染小,有利于 AAS、ICP 等對痕量重金屬元素的準確快速測定。


2 儀器與試劑

2.1 儀器

新儀 TANK PLUS 微波消解儀,TK-20 趕酸器,分析天平(十萬分之一),移液管等。


2.2 試劑

硝酸(68%)、過氧化氫(30%)氫氟酸(40%)


3 實驗方法

3.1 樣品制備

樣品顆粒越,越有利于消解處理。


3.2 消解條件的探究

3.2.1 消解溫度

硝酸的常用溫度為 180℃,通過實驗發(fā)現(xiàn) 180℃,樣品中的碳幾乎不會被消解,溫度需提高至 210℃。

                                           150℃                                                       210℃


3.2.2 酸體系

只使用硝酸消解樣品,底部存在白色沉淀,添加少量氫氟酸,沉淀消失。為提高硝酸氧化能力,添加少量過氧化氫,消解效果更佳。

氟硼酸對硅也有一定的溶解能力,而且酸性比氫氟酸小,對人體危害較小。用氟硼酸代替氫氟酸進行實驗,實驗結(jié)果并不令人滿意消解液底部仍存在白色沉淀。


3.2.3 取樣量

生物質(zhì)炭樣品消解時會生成大量二氧化碳,取樣量控制在 0.1g 左右。


4 實驗結(jié)論

經(jīng)過實驗,推薦消解生物質(zhì)炭樣品,取樣量 0.1g 左右,加入 6mL 硝酸、1mL 過氧化氫和 1mL 的氫氟酸,210℃保溫 20 分鐘。



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