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核酸和蛋白質(zhì)序列分析的內(nèi)容和方法有哪些

鞏雪880 2016-12-31 11:11:45 462  瀏覽
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參與評(píng)論

全部評(píng)論(1條)

  • sunrain2003 2017-01-01 00:00:00
    核酸和蛋白質(zhì)序列分析的內(nèi)容和方法有哪些 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析方法:X射線晶體衍射分析和核磁共振 x 射線衍射法的分辨率可達(dá)到原子的水平,使它可以測(cè)定亞基的空間結(jié)構(gòu)、各亞基間的相對(duì)拓?fù)洳季?,還可清楚的描述配體存在與否對(duì)蛋白質(zhì)的影響。多維核磁共振波譜技術(shù)已成為確定蛋白質(zhì)和核酸等生物分子溶液三維結(jié)構(gòu)的唯yi有效手段。NM R技術(shù)Z大的優(yōu)點(diǎn)不在于它的分辨率,而在于它能對(duì)溶液中和非晶態(tài)的蛋白質(zhì)進(jìn)行測(cè)量。 蛋白質(zhì)的序列結(jié)構(gòu)測(cè)定: 1.到目前為止,Z經(jīng)典的蛋白質(zhì)的氨基酸序列分析方法是,sarI等人基于Edman降解原理研制的液相蛋白質(zhì)序列儀,及后來發(fā)展的固相和氣相的蛋白質(zhì)序列分析儀。 2.質(zhì)譜:早期的質(zhì)譜電離的方式主要是電子轟擊電離(EI),它要求樣品的揮發(fā)性好,一般與 氣相色譜聯(lián)用。但使用G C/M S分析,肽的長(zhǎng)度受到限制,只能分析小的肽段。近年來, 在離子化的技術(shù)及儀器方面取得了突破性進(jìn)展,使得質(zhì)譜所能測(cè)定的分子量的范圍大大超 出了10k u。因此,軟離子化技術(shù)、基質(zhì)輔助的激光解吸/離子化(MALDI)和電噴霧離子化(E SI)顯得尤為有前途。通過串聯(lián)質(zhì)譜技術(shù)(MS/MS)和源后衰減基質(zhì)輔助的激光解吸/離子化(PSD—MAIDI—MS),人們就可以從質(zhì)譜分析中獲得肽及蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)信息。

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便攜多通道蛋白質(zhì)分析之P4SPR分析儀-蛋白質(zhì)-核酸相互作用

介紹

DNA、RNA和PNA等核酸可以采用與蛋白質(zhì)活性位點(diǎn)結(jié)合的活性結(jié)構(gòu)。與蛋白質(zhì)-抗體結(jié)合類似, 蛋白質(zhì)-核酸 (NA) 結(jié)合表現(xiàn)出各種親和力,這可以通過改變NA的序列來調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)-NA對(duì)的親和力。這種設(shè)計(jì)NA序列以與靶蛋白達(dá)到特定親和力范圍的篩選策略被用于新興的應(yīng)用,例如個(gè)性化YL。SPR(Surface Plasmon Resonance)是一種功能強(qiáng)大的無標(biāo)記技術(shù),可以提供蛋白質(zhì)-NA結(jié)合動(dòng)力學(xué)數(shù)據(jù),以便支持學(xué)術(shù)和臨床研究,從而理解和調(diào)節(jié)核心細(xì)胞過程,如轉(zhuǎn)錄調(diào)控。

 

Affinité的P4SPR

Affinité的P4SPR具有獨(dú)特的方法來識(shí)別DNA 上的結(jié)合配體、定量靶蛋白以及確定結(jié)合親和力和結(jié)合動(dòng)力學(xué)。NA固定的簡(jiǎn)單性和儀器的易用性使這種方法在培訓(xùn)后的幾分鐘內(nèi)對(duì)任何人(從本科生到宇航員、高級(jí)化學(xué)家到科學(xué)家)都是直觀的。

 

 

Affinité的技術(shù)已用于測(cè)定蛋白質(zhì)-DNA相互作用。  在該測(cè)定中,雙鏈DNA片段在SPR芯片上雜交,以無標(biāo)記方法監(jiān)測(cè)與可溶性蛋白質(zhì)的相互作用。該方法適用于任何硫醇化核酸鏈的應(yīng)用。

 

Lacl repressor protein / dsDNA

 
 

使用dsDNA對(duì)蛋白質(zhì)進(jìn)行分步檢測(cè)

 


SPR分析儀P4SPR簡(jiǎn)要介紹

便攜4通道表面等離子體共振儀(P4SPR)可以在任何需要的地方提供高質(zhì)量的表面等離子體共振SPR數(shù)據(jù)。其專有的光學(xué)設(shè)計(jì)沒有移動(dòng)部件,使其更加緊湊和堅(jiān)固。此外,P4SPR建立在Z先進(jìn)設(shè)備中的基準(zhǔn)SPR技術(shù)基礎(chǔ)上:薄金屬膜傳感器。使用USB供電的P4SPR進(jìn)行的每次實(shí)驗(yàn)分析都會(huì)同時(shí)進(jìn)行三次測(cè)量樣品并記錄高精度數(shù)據(jù)的參考信號(hào)。您可以使用TraceDrawer或喜歡的數(shù)據(jù)處理軟件快速處理文本文件中的輸出數(shù)據(jù),以提取定性和定量信息如濃度、結(jié)合、選擇性、動(dòng)力學(xué)和親和力等。大多數(shù)SPR應(yīng)用目前都是針對(duì)生物分子的相互作用。革新性SPR分析儀P4SPR使SPR解決方案更容易為現(xiàn)有和潛在用戶所用,同時(shí)也正在開發(fā)新興應(yīng)用如測(cè)量和監(jiān)測(cè)小分子和納米粒子。

 

購買P4SPR分析儀時(shí),包含的物品如下:

l  P4SPR儀器(1

l  USB線纜(1個(gè)USB 2.0 mini-B,1個(gè)USB 2.0 micro-B

l  P4SPR操作軟件

l  金(Au)芯片(10

l  PDMS流體通道(3

l  硬質(zhì)塑料外殼

l  導(dǎo)管和連接器

l  帶有P4SPR控制軟件的USB密鑰

l  TraceDrawer生物分子分析許可證(可選)

 

技術(shù)規(guī)格

規(guī)格參數(shù)

物理尺寸(L×W×H

175 × 155 × 55 mm,

6.9 × 6.1 × 2.2 inch

重量

1.3千克(2.9磅)

光源

多色光源

微流體池

4通道PDMS

流動(dòng)池體積

20 μL

樣品體積

大于50 μL

靈敏度

2750 nm/RIU

CV系數(shù)(3通道)

0.6%

折射率分辨率

1μ RIU

折射率范圍

1.30 – 1.39

親和力范圍(蛋白質(zhì))

10^-10 ~ 10^-5 M

濃度范圍(生物分子和小分子)

10^-15 ~ 10^-3 M

電源要求

USB供電(<200 mA

計(jì)算器和平臺(tái)要求

Window XP/7/8/10,有2個(gè)USB端口

 

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