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- 深夜孤燈1 2013-11-14 00:00:00
- 摘 要:目的:建立一系列適用于藥物篩選的微孔板抗氧化實驗方法。方法:采用SpectraMax M5連續(xù)光譜酶標(biāo)測試儀,建立抗DPPH氧化活性、清除羥自由基實驗方法(鄰二氮菲-Fe2+氧化法)、還原能力測定及抗脂質(zhì)過氧化微孔板抗氧化實驗方法。結(jié)果:這四種抗氧化微孔板實驗方法具有穩(wěn)定性好,所需試劑種類少、耗材量少,方法簡便及可重復(fù)性強等共同特點;相對而言,抗DPPH氧化和還原實驗兩種實驗方法在這幾方面更具優(yōu)勢,更適合于作為抗氧化藥物的大規(guī)模初篩基礎(chǔ)試驗方法。結(jié)論:這四種微孔板抗氧化實驗方法,可以廣泛應(yīng)用于藥物篩選,特別是高通量藥物篩選研究。
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在任何藥物研發(fā)進程中,實驗方法的設(shè)計和優(yōu)化對新藥研發(fā)的成功性而言至關(guān)重要。我們需要考慮的因素包括:選擇Z合適的檢測技術(shù),讀取模式,和實驗?zāi)P停ㄉ锘瘜W(xué),細胞或動物)。通常,這些因素會影響數(shù)據(jù)質(zhì)量,生物相關(guān)性以及ZL的可預(yù)測性,Z終將影響整個臨床前藥物開發(fā)工作的成敗。
方法技術(shù)的選擇
diyi步是確立解決實驗問題的技術(shù),例如激活,YZ或調(diào)控靶標(biāo)、闡明MOA(作用機制)、確定受體 - 配體或蛋白質(zhì) - 蛋白質(zhì)的相互作用、鑒定和定量疾病特異性生物標(biāo)志物或血漿中的生物標(biāo)志物成分。
樣本基質(zhì)的兼容性
生物標(biāo)志物測定旨在檢測或定量生物學(xué)中的靶標(biāo)樣本(例如,復(fù)雜基質(zhì))中的含量,這種負(fù)責(zé)基質(zhì)涵蓋范圍有:細胞培養(yǎng)中的分泌蛋白,細胞裂解液,組織提取物,唾液,尿液,血清,血漿,血液的上清液,或其他液體(例如,CSF,BALF)。分析技術(shù)可能并非總是如此。某些實驗方法在某些基質(zhì)中存在干擾而不適用。例如,在血清,血漿或血液中的血紅蛋白表現(xiàn)出廣泛的可見光譜吸光度,即在350和600nm之間。檢測方法中,依賴于這些波長的激發(fā)或發(fā)射將容易發(fā)生干擾。基于洗滌的檢測方法可以避免由于過多復(fù)雜基質(zhì)引起的干擾,因為干擾物質(zhì)在洗滌過程中被沖走。為了確定基質(zhì)的相容性,在合適的稀釋液中的加標(biāo)回收和標(biāo)準(zhǔn)曲線是傳統(tǒng)的驗證方法。
同時,在復(fù)雜體系中的抗體選擇也是非常重要的,靶標(biāo)蛋白可能被修飾或者酶切,影響抗原識別位點,因此,加入蛋白酶YZ劑也是有必要的。
實驗效果 :靈敏度和動態(tài)范圍
一個實驗的靈敏度決定了其在動態(tài)范圍內(nèi)的對其靶點的檢測的“分辨率”,同時預(yù)警了不同批次批次之間的Z低檢測范圍的差異性。靈敏度同時也依賴于檢測樣本。血清中的檢測難度高于細胞水平。同時“珍貴樣品”如有限的細胞或者組織會決定測試的容許體積等。方法技術(shù)也會影響檢測靈敏度,如發(fā)光和熒光的模式比吸收光的模式的靈敏度要好。
動態(tài)范圍定義了檢測下限和上限。例如下圖所示,不同的檢測技術(shù)對于腫瘤壞死因子TNF的檢測動態(tài)范圍達到了數(shù)量級的差異。因此,當(dāng)樣品含量超過了其實驗方法的動態(tài)范圍,其濃度,動力學(xué)參數(shù),活性,結(jié)合力將不準(zhǔn)確。因此,需要預(yù)先滴定檢測窗口以免達到飽和。
下圖展示了不同實驗技術(shù)對于不同的親和力的適用范圍:
特異性
特異性對于確保篩選靶向的靶點或表型非常重要。對于免疫分析,需要考慮針對靶向分析物特異性的抗體,特別是對于靶向蛋白質(zhì)的部分修飾新表位變化,結(jié)合/未結(jié)合或活性/非活性狀態(tài)。此外,還需要考慮物種和靶點的交叉反應(yīng)性。
穩(wěn)定性和準(zhǔn)確性
盡管信號強度和和性噪比(S/B)通常被用來評估一個實驗的質(zhì)量,可重復(fù)性和準(zhǔn)確性也是非常重要的。Z’是一個非常好的評判標(biāo)準(zhǔn)。例如,相對而言,高Z’而低信噪比的實驗方法好于低Z’高性噪比的實驗方法。與此同時,實驗發(fā)法應(yīng)當(dāng)具有高重復(fù)性,定量實驗應(yīng)該有標(biāo)準(zhǔn)品做參照。設(shè)置好對照,好的標(biāo)品,抗體,陽性化合物對于建立可靠的實驗是非常重要的。
試劑和其他耗材
對于免疫實驗來說,高靈敏度和搞特異性的抗體非常重要,同時還有對應(yīng)的酶或重組蛋白。通常,所有的實驗成分,例如細胞、蛋白、酶、輔因子、底物、激動劑,拮抗劑等都需要進行濃度滴定以確定Z優(yōu)濃度。該過程能夠確保穩(wěn)定的動力學(xué)研究以及防止過飽和濃度而產(chǎn)生的試劑浪費。(如下圖)
細胞模型
在選擇細胞模型時,應(yīng)考慮使用原代細胞與重組/永生化細胞系的優(yōu)缺點,以及研究內(nèi)源性與重組表達的靶蛋白。同時需要評估目標(biāo)蛋白的表達水平,因為過多或過少的表達會影響靈敏度和分析質(zhì)量。細胞傳代和培養(yǎng)條件也會影響實驗質(zhì)量。
微孔板的選擇
正確選擇微孔板可以減少交叉效應(yīng)、降低背景、降低信號吸收或放大信號強度。下表顯示了基于檢測方法的微孔板選擇矩陣。
眾所周知,藥物研發(fā)花費巨大,耗時長。優(yōu)化已知影響數(shù)據(jù)質(zhì)量、生物相關(guān)性和ZL可預(yù)測性的實驗因素Z終推動整個臨床前藥物開發(fā)工作的成功。選擇Z合適的分析技術(shù)、讀取模式和實驗?zāi)P鸵约皟?yōu)化實驗方案為成功和經(jīng)濟有效的藥物開發(fā)奠定基礎(chǔ)。
我們珀金埃爾默能夠提供多種實驗方法開發(fā)的解決方案。例如,我們擁有的均相的Alpha技術(shù)以及TRFRET技術(shù),時間分辨defia技術(shù),化學(xué)發(fā)光技術(shù),細胞增殖和毒性試劑盒,各類GPCR以及動物模型的探針細胞株,微孔板等試劑耗材,能夠助力您新藥研發(fā)的各個環(huán)節(jié)。
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當(dāng)前,COVID-19疫情已在全世界范圍蔓延,國內(nèi)形勢逐漸轉(zhuǎn)好但也絕不能松懈,全民復(fù)工復(fù)產(chǎn)推動經(jīng)濟運轉(zhuǎn)是自救也是對其他國家的支持。特別是YL和制藥行業(yè),在疫情開始階段就投入研發(fā)和生產(chǎn),加速藥物篩選、臨床診斷和疫苗研發(fā)仍然是藥企復(fù)工后的重中之重,也是今后長期持久的工作。從各地ZL方案的報道來看,不僅僅考慮對新冠肺炎的治LX果,更考慮到患者治愈后的生活質(zhì)量,用藥較SARS時期更為謹(jǐn)慎。這也提示,經(jīng)過此次“戰(zhàn)疫”,對于藥效、作用機制和副作用的研究要求更為明確,國家可能對新藥審批和監(jiān)管更為嚴(yán)格。
疫情之下,珀金埃爾默積極行動,基于在藥物研發(fā)領(lǐng)域積累的經(jīng)驗和對法規(guī)的理解,我們從藥物高通量篩選(HTS)的層面出發(fā),為藥企提供設(shè)備、軟件和服務(wù)全流程方案。
利器加速研發(fā)成果轉(zhuǎn)化
01 利用類病毒顆粒報告基因系統(tǒng)進行藥物篩選
EBOV trVLP類病毒顆粒報告基因系統(tǒng)可以很好的模擬病毒生命周期,可用于高通量非靶點(target-free)藥物篩選,通過EnVision檢測報告基因熒光素酶和底物結(jié)合釋放的化學(xué)發(fā)光信號來評價化合物的抗病毒活性;同時研究化合物是如何影響病毒進入細胞、復(fù)制以及分泌。[1]
p1細胞檢測藥物對病毒進入、復(fù)制和轉(zhuǎn)錄的YZ作用。p1細胞給藥后的細胞上清被轉(zhuǎn)移至p2細胞,用以檢測病毒組裝和分泌。
02 病毒空斑檢測
病毒空斑檢測是臨床前和臨床研究中評價抗病毒 藥物和疫苗效果的一種通用方法。利用熒光免疫染色和EnSight多功能微孔板檢測對96孔板中的RSV(呼吸道合胞病毒)侵染HEp-2細胞產(chǎn)生的空斑成像,通過Kaleido分析軟件自動識別病毒空斑并計數(shù),檢測RSV滴度,以及抗RSV中和抗體滴度。[2][3]
病毒空斑自動計數(shù)。A. 細胞明場成像和免疫熒光成像識別到的病毒空斑。B. 軟件自動識別的空斑,紫色表示溶斑空洞ZX,相應(yīng)的噬斑顯示為紅色;非裂解空斑以藍綠色表示。算法可同時識別裂解(lytic)和非裂解(non-lytic)兩種病毒空斑并自動計數(shù)。
03 細胞活力和細胞毒性檢測
細胞活力或毒性檢測是臨床前評價藥物安全性的重要方法。 ATPlite 1step檢測系統(tǒng)將ATP代謝活性作為細胞活力的檢測指標(biāo),通過Victor Nivo化學(xué)發(fā)光檢測模式對ATP水平定量,當(dāng)細胞的ATP濃度下降,表示細胞處于凋亡或壞死狀態(tài)。這種快速靈敏的方法也用于檢測化合物誘導(dǎo)的細胞毒效應(yīng)。[4]
04 細胞因子風(fēng)暴監(jiān)測
在新冠肺炎ZL過程中發(fā)現(xiàn),有些急重癥病人在免疫系統(tǒng)被激發(fā)后,過量細胞因子釋放會導(dǎo)致細胞因子風(fēng)暴,危機病人生命。通過多色AlphaPlex技術(shù)可以同時檢測細胞因子IL6和IL8的含量,從而開發(fā)提升LX或YZ細胞因子風(fēng)暴產(chǎn)生的方案,幫助患者度過危險期。檢測細胞因子釋放也是評價治LX果及安全性的重要指標(biāo)。[5]
掃平合規(guī)之路
將一種新藥或ZL方法推向市場,是一個繁瑣而復(fù)雜的過程——必須遵守FDA 21 CFR Part 11或EU Annex 11指南。使用我們針對珀金埃爾默多模式讀板儀的增強安全軟件,遵守法規(guī)就簡單多了。該軟件提供了所有兼容的工具,包括:
高級用戶管理
審計追蹤
電子簽名
導(dǎo)出文件認(rèn)證
全流程驗證和確認(rèn)
在多模式微孔板檢測系統(tǒng)的使用壽命周期中,會執(zhí)行多次確認(rèn)測試。這些測試可以確保儀器達到Z佳性能。珀金埃爾默執(zhí)行這些確認(rèn)測試,并為您提供證書,作為GxP合規(guī)的證明。
制藥和生物技術(shù)公司,包括臨床研究機構(gòu),需要定義明確的SOPs、可靠的儀器、兼容的軟件、經(jīng)過驗證的檢測方法等,以確保一切都處于高水平運行。將我們的產(chǎn)品和服務(wù)與您的SOPs結(jié)合起來,成為一個完整的合規(guī)性解決方案。因此您可以專注于真正重要的事情——您的科學(xué)研究。
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參考文獻
1. Lee N, Shum D, K?nig A, et al. High-throughput drug screening using the Ebola virus transcription-and replication-competent virus-like particle system[J]. Antiviral research, 2018, 158: 226-237.
2. Wen Z, Citron M, Bett A J, et al. Development and application of a higher throughput RSV plaque assay by immunofluorescent imaging[J]. Journal of virological methods, 2019, 263: 88-95.
3. 快速GX判斷病毒活性,何懼“疫”軍突起https://mp.weixin.qq.com/s/vEPswHUqS1juaRgmXS4HBQ
4. Kuzikov M, Kanke R, ScreeningPort F I M E. Measuring Cell Proliferation and Cytotoxicity using the ATPlite 1step System and the VICTOR Nivo Multimode Plate Reader[J].
5. Ruby P, Groves K. Simultaneous Detection of IL-6 and IL-8 Secretion by Cell Lines using AlphaPlex Technology.
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