DNA復(fù)制機制和共轉(zhuǎn)錄R環(huán)之間發(fā)生沖突時，會導(dǎo)致癌細胞基因組不穩(wěn)定性，進而影響DNA合成。本文中，我們展示了ATP依賴性染色質(zhì)重構(gòu)INO80復(fù)合體可以促進R環(huán)解析，防止癌細胞中的復(fù)制相關(guān)的DNA損傷。

我們使用STED超高分辨率顯微鏡進行測量，INO80和R環(huán)之間具有前所未有的精密共定位。

標(biāo)題圖像：INO80（藍色）和R環(huán)（黃色）的3D體表面模型

在我們的實驗中，相比共聚焦成像（250?nm），STED能達到大約50?nm的分辨率，這使我們能夠有較高的確定性區(qū)分真假共定位事件。使用STED可以輕松觀察到INO80亞基和R環(huán)亞基之間的共定位，而通過共聚焦成像觀察到的INO80和R環(huán)之間的多個共定位事件，經(jīng)STED觀察是分離的不同亞基。

在所有分析的細胞中，我們發(fā)現(xiàn)相比非共定位R環(huán)，INO80共定位的R環(huán)明顯更加緊密、體積和長度也更大。這些數(shù)據(jù)表明，INO80復(fù)合物與細胞核中最 大、最濃縮的R環(huán)域相關(guān)。

圖1：STED解析INO80和R環(huán)的相對位置。

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Prendergast L., McClurg U.L., Hristova R., Berlinguer-Palmini R., Greener S., Veitch K., Hernandez I., Pasero P., Rico D., Higgins J.M.G., Gospodinov A. & Papamichos-Chronakis M.:

Resolution of R-loops by INO80 promotes DNA replication and maintains cancer cell proliferation and viability

Nature Communications volume 11, Article number: 4534 (2020)

https://doi.org/10.1038/s41467-020-18306-x