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dna復(fù)制實驗中為什么用密度梯度離心

520025HR 2017-06-22 23:35:24 415  瀏覽
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  • afen75023039 2017-06-23 00:00:00
    DNA半保留復(fù)制實驗中為什么DNA有重有輕 證明DNA復(fù)制是半保留方式,主要就是要證明它不是全保留對不對? 如果我一個病毒(已用放射性同位素標(biāo)記,方法是用生活在含放射性同位素培養(yǎng)液里的大腸桿菌繁殖)在大腸桿菌內(nèi)繁殖出了6個新的病毒個體,然后這個大腸桿菌破裂, 此時總共有6個病毒個體在培養(yǎng)皿中. 我們統(tǒng)計含有放射性的病毒個體,如果發(fā)現(xiàn)只有1/6的病毒有放射性,那就是全保留復(fù)制了; 如果是2/6的有放射性,就是半保留復(fù)制.

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dna復(fù)制實驗中為什么用密度梯度離心
 
2017-06-22 23:35:24 415 1
癌細(xì)胞中的DNA復(fù)制

DNA復(fù)制機(jī)制和共轉(zhuǎn)錄R環(huán)之間發(fā)生沖突時,會導(dǎo)致癌細(xì)胞基因組不穩(wěn)定性,進(jìn)而影響DNA合成。本文中,我們展示了ATP依賴性染色質(zhì)重構(gòu)INO80復(fù)合體可以促進(jìn)R環(huán)解析,防止癌細(xì)胞中的復(fù)制相關(guān)的DNA損傷。


我們使用STED超高分辨率顯微鏡進(jìn)行測量,INO80和R環(huán)之間具有前所未有的精密共定位。


標(biāo)題圖像:INO80(藍(lán)色)和R環(huán)(黃色)的3D體表面模型


在我們的實驗中,相比共聚焦成像(250?nm),STED能達(dá)到大約50?nm的分辨率,這使我們能夠有較高的確定性區(qū)分真假共定位事件。使用STED可以輕松觀察到INO80亞基和R環(huán)亞基之間的共定位,而通過共聚焦成像觀察到的INO80和R環(huán)之間的多個共定位事件,經(jīng)STED觀察是分離的不同亞基。


在所有分析的細(xì)胞中,我們發(fā)現(xiàn)相比非共定位R環(huán),INO80共定位的R環(huán)明顯更加緊密、體積和長度也更大。這些數(shù)據(jù)表明,INO80復(fù)合物與細(xì)胞核中最 大、最濃縮的R環(huán)域相關(guān)。



圖1:STED解析INO80和R環(huán)的相對位置。


閱讀完整文章:

Prendergast L., McClurg U.L., Hristova R., Berlinguer-Palmini R., Greener S., Veitch K., Hernandez I., Pasero P., Rico D., Higgins J.M.G., Gospodinov A. & Papamichos-Chronakis M.:

Resolution of R-loops by INO80 promotes DNA replication and maintains cancer cell proliferation and viability

Nature Communications volume 11, Article number: 4534 (2020)

https://doi.org/10.1038/s41467-020-18306-x


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