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目的蛋白能同時(shí)存在于上清和包涵體中嗎

Miseft967 2016-12-17 03:15:55 450  瀏覽
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參與評(píng)論

全部評(píng)論(1條)

  • jscuan123 2016-12-18 00:00:00
    目的蛋白能同時(shí)存在于上清和包涵體中 1)你應(yīng)該是沒(méi)有明白什么是包涵體,簡(jiǎn)單的說(shuō)就是翻譯的蛋白沒(méi)有正確折疊而聚集在一起形成的,主要的是疏水作用.實(shí)際上就是很多個(gè)蛋白分子,這些蛋白并不是交聯(lián)在一起的,用高濃度的尿素和鹽酸胍可以使他們變性,解聚. 2)用沉淀跑電泳可以確定目的蛋白是否在包涵體? 包涵體是不溶于水的,比較總蛋白.沉淀,及上清中的誘導(dǎo)帶就可以知道上清中有沒(méi)有你想要的可溶蛋白了 3)電泳檢測(cè)的話(huà),可以用SDS-PAGE檢測(cè),在上樣之前,需要用上樣緩沖液處理樣品,處理后,包涵體也就解聚了,每個(gè)蛋白分子與SDS結(jié)合,形成了可溶物. 4)質(zhì)量大的話(huà)怎么可以用電泳來(lái)確定呢? 為什么不可以呢?DNA電泳,蛋白電泳不都可以嗎? 5)電泳的原理就是根據(jù)蛋白質(zhì)量大小來(lái)將不同的蛋白分開(kāi)的呀? 不通種電泳的原理個(gè)不相同.SDS-PAGE可以簡(jiǎn)單的認(rèn)為是根據(jù)蛋白質(zhì)量來(lái)區(qū)分蛋白的. 你想不明白應(yīng)該是不知道什么是包涵體,或者什么是電泳,電泳的原理,你自己還是在網(wǎng)上好好看看這些內(nèi)容,應(yīng)該不難理解. 上樣緩沖液中有巰基乙醇,SDS,樣品還要加熱,破壞了包涵體之間蛋白的相互作用力,Z好還是看看是怎么行成的包涵體吧

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在生命科學(xué)領(lǐng)域中,包涵體復(fù)體的研究占據(jù)了重要的地位。但隨著研究的深入,一些問(wèn)題逐漸浮現(xiàn)。本文將對(duì)包涵體復(fù)體研究中常見(jiàn)的挑戰(zhàn)進(jìn)行解析,以及為研究者提供一些解決思路。

 

 

①包涵體復(fù)性原則:

低濃度,平緩梯度,低溫。

 

②怎樣洗滌包涵體?

通常的洗滌方法一般是洗不干凈的,可以先把包涵體用6M鹽酸胍溶解充分,過(guò)濾除去未溶解的物質(zhì),注意留樣跑電泳,然后用水稀釋到4M,離心把沉淀和上清分別跑電泳,如此類(lèi)推可以一直稀釋到合適的濃度,可以找到一個(gè)合適去除雜質(zhì)的辦法,其實(shí)這就是梯度沉淀的方法,比通常的直接洗脫效果好。

 

③對(duì)于尿素和鹽酸胍該怎么選擇

尿素和鹽酸胍屬中強(qiáng)度變性劑,易經(jīng)透析和超濾除去。它們對(duì)包涵體氫鍵有較強(qiáng)的可逆性變性作用,所需濃度尿素8-10M,鹽酸胍6-8M。尿素溶解包涵體較鹽酸胍慢而弱,溶解度為70-90%,尿素在作用時(shí)間較長(zhǎng)或溫度較高時(shí)會(huì)裂解形成氰酸鹽,對(duì)重組蛋白質(zhì)的氨基進(jìn)行共價(jià)修飾,但用尿素溶解具有不電離,呈中性,成本低,蛋白質(zhì)復(fù)性后除去不會(huì)造成大量蛋白質(zhì)沉淀以及溶解的包涵體可選用多種色譜法純化等優(yōu)點(diǎn),故目前已被廣泛采用。

 

鹽酸胍溶解能力達(dá)95%以上,且溶解作用快而不造成重組蛋白質(zhì)的共價(jià)修飾。但它也有成本高、在酸性條件下易產(chǎn)生沉淀、復(fù)性后除去可能造成大量蛋白質(zhì)沉淀和對(duì)蛋白質(zhì)離子交換色譜有干擾等缺點(diǎn)。

 

④8M尿素溶解的包涵體溶液應(yīng)如何保存?

在4度放置半個(gè)月,都沒(méi)什么問(wèn)題 。在室溫放置超過(guò)48小時(shí),可能會(huì)對(duì)目的蛋白有影響,因?yàn)槟蛩卦趬A性條件下可使一些氨基酸?;栽缧┨幚鞡I溶液比較好。

 

⑤復(fù)性時(shí)的蛋白濃度

一般使用濃度為0.1-1.0mg/ml,太高的濃度容易形成聚體沉淀,太低的濃度不經(jīng)濟(jì),而且很多蛋白在低濃度時(shí)不穩(wěn)定,很容易變性。

 

⑥蛋白復(fù)性后濃度低

蛋白可能是在復(fù)性的過(guò)程中發(fā)生降解了。

 

可以將復(fù)性好的蛋白濃縮一下泡膠看看。復(fù)性過(guò)程一般都是低濃度蛋白,需要保證分子間有足夠的折疊空間。一些未正確折疊的蛋白就存在于沉淀中,可能沉淀看不出來(lái),復(fù)性后的蛋白高速離心看看。

 

⑦復(fù)性中蛋白析出是怎么回事?該怎么處理?

出現(xiàn)蛋白析出,肯定是條件變化太劇烈了。

 

復(fù)性應(yīng)該采取復(fù)性液濃度和PH值逐漸變化的方法,例如根據(jù)包涵體的溶液成分,每隔1個(gè)PH或濃度值配置一種溶液,逐步透析到正常。此外透析時(shí)必須濃度極低,條件溫和,使蛋白質(zhì)能夠正確折疊。但是復(fù)性的比率應(yīng)該很低。

 

若加變性劑尿素可加到2M,鹽酸胍可加到1-1.5M;

 

另外可將甘油濃度增加,范圍可在≤30%,且在復(fù)性樣品中也可加適量甘油。

 

⑧復(fù)性效果的檢測(cè)

根據(jù)具體的蛋白性質(zhì)和需要,可以從生化、免疫、物理性質(zhì)等方面對(duì)蛋白質(zhì)的復(fù)性效率進(jìn)行檢測(cè)。

 

凝膠電泳:一般可以用非變性的聚丙烯酰胺凝膠電泳可以檢測(cè)變性和天然狀態(tài)的蛋白質(zhì),或用非還原的聚丙烯酰胺電泳檢測(cè)有二硫鍵的蛋白復(fù)性后二硫鍵的配對(duì)情況。

光譜學(xué)方法:可以用紫外差光譜、熒光光譜、圓二色性光譜(CD)等,利用兩種狀態(tài)下的光譜學(xué)特征進(jìn)行復(fù)性情況的檢測(cè),但一般只用于復(fù)性研究中的過(guò)程檢測(cè)。

色譜方法:如IEX、RP-HPLC、CE等,由于兩種狀態(tài)的蛋白色譜行為不同。

生物學(xué)活性及比活測(cè)定:一般用細(xì)胞方法或生化方法進(jìn)行測(cè)定,較好的反映了復(fù)性蛋白的活性,值得注意的是,不同的測(cè)活方法測(cè)得的結(jié)果不同,而且常常不能完全反映體內(nèi)活性。

黏度和濁度測(cè)定:復(fù)性后的蛋白溶解度增加,變性狀態(tài)時(shí)由于疏水殘基暴露,一般水溶性很差,大多形成可見(jiàn)的沉淀析出。

免疫學(xué)方法:如ELISA、WESTERN等,特別是對(duì)結(jié)構(gòu)決定簇的抗體檢驗(yàn),比較真實(shí)的反映了蛋白質(zhì)的折疊狀態(tài)。

 

⑨變性的融合蛋白可以制備多抗或者單抗嗎?

變性蛋白只是天然蛋白伸直的產(chǎn)物,用來(lái)免疫動(dòng)物具有更強(qiáng)的抗原性。只是天然蛋白中被包在內(nèi)部的抗原決定簇也會(huì)暴露出來(lái),如果用該變性抗原制備的抗體來(lái)檢測(cè)變性抗原是可以的,如果用來(lái)檢測(cè)天然蛋白,可能會(huì)有假陽(yáng)性。做單抗也可以,同樣道理,篩選出的單抗可能對(duì)抗的抗原決定簇處于天然抗原的內(nèi)部,是否能用還要看將來(lái)該單抗用來(lái)干什么。

 

⑩純化后的可溶性融合蛋白可以直接用于制備多抗嗎?

免疫動(dòng)物要求抗原體種盡量小。在這種小體積的情況下,緩沖液里的小分子成分只要沒(méi)毒影響就不大,可以不用考慮。

 

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