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真核生物上游啟動子元件包括哪些

7丶獸獸 2016-11-23 05:06:14 1171  瀏覽
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  • 雪已過六月 2016-11-24 00:00:00
    真核生物啟動子有三類,分別由RNA聚合酶Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ進行轉(zhuǎn)錄。 類別Ⅰ(class Ⅰ)啟動子: 只控制rRNA前體基因的轉(zhuǎn)錄,轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物經(jīng)切割和加工后生成各種成熟rRNA。 類別Ⅰ啟動子由兩部分保守序列組成: 核心啟動子(core promoter):位于轉(zhuǎn)錄起點附近,從-45至+20; 上游控制元件(upstream control element,UCE):位于-180至-107; RNA聚合酶Ⅰ對其轉(zhuǎn)錄需要2種因子參與: UBF1:一條M為97000的多肽鏈,結(jié)合在上述兩部分的富含GC區(qū); 1個TBP,即TATA結(jié)合蛋白(TATA-binding protein,TBP); SL1:一個四聚體蛋白,含有 3個不同的轉(zhuǎn)錄輔助因子TAFⅠ; 在SL1因子介導(dǎo)下RNA聚合酶Ⅰ結(jié)合在轉(zhuǎn)錄起點上并開始轉(zhuǎn)錄。 類別Ⅱ(class Ⅱ)啟動子: 類別Ⅱ啟動子涉及眾多編碼蛋白質(zhì)的基因表達的控制。 該類啟動子包含4類控制元件: 1基本啟動子(basal promoter):序列為ZX在-25至-30左右的7 bp保守區(qū),TATAAAA/T, 稱為TATA框或Goldberg-Hogness 框。與RNA聚合酶的定位有關(guān),DNA雙鏈在此解開并決定轉(zhuǎn)錄的起點位置。失去TATA框,轉(zhuǎn)錄將在許多位點上開始。 2起始子(initiator):轉(zhuǎn)錄起點位置處的一保守序列,共有序列為:PyPyANT(A)PyPy Py為嘧啶堿(C或T),N為任意堿基,A為轉(zhuǎn)錄的起點。DNA在此解開并起始轉(zhuǎn)錄。 3上游元件(upstream factor):普遍存在的上游元件有CAAT框、GC框和八聚體(octamer) 框等。CAAT框的共有序列是GCCAATCT,GC框的共有序列為GGGCGG和CCGCCC,八聚體框含有8bp,共有序列為ATGCAAAT; 4應(yīng)答元件(response element):誘導(dǎo)調(diào)節(jié)產(chǎn)生的轉(zhuǎn)錄激活因子與靶基因上的應(yīng)答元件結(jié)合。 如熱休克效應(yīng)元件 HSE 的共有序列是 CNNGAANNTCCNNG,可被熱休克因子HSF識別和作用;血清效應(yīng)元件SRE的共有序列CCATATTAGG,可被血清效應(yīng)因子SRF識別和作用。 參與RNA聚合酶Ⅱ轉(zhuǎn)錄起始的各類因子數(shù)目很大,可分為3類: 1通用因子(general factor):作用于基本啟動子上的輔助因子稱為通用(轉(zhuǎn)錄)因子(GTF), 或基本轉(zhuǎn)錄因子(basal transcription),為任何細胞類別Ⅱ啟動子起始轉(zhuǎn)錄所必需,以TFⅡⅩ來表示,其中Ⅹ按發(fā)現(xiàn)先后次序用英文字母定名,如TFⅡA、TFⅡD、TFⅡH。 2上游因子(upstream factor):或轉(zhuǎn)錄輔助因子(transcription ancillary factor),是指識別上 游元件的轉(zhuǎn)錄因子。 3可誘導(dǎo)因子(inducible factor):在真核生物中,與細胞類型和發(fā)育階段相關(guān)的基因表達, 主要通過轉(zhuǎn)錄因子的重新合成來進行調(diào)節(jié)的,是長期的過程。對外界刺激的快速反應(yīng)則主要通過轉(zhuǎn)錄激活物(transcription activator)的可誘導(dǎo)調(diào)節(jié)。這些誘導(dǎo)的轉(zhuǎn)錄激活因子與靶基因上所謂應(yīng)答元件相結(jié)合。 類別Ⅲ(class Ⅲ)啟動子: 類別Ⅲ啟動子為RNA聚合酶Ⅲ所識別,他涉及一些小分子RNA的轉(zhuǎn)錄。 RNA聚合酶Ⅲ的啟動子有3種類型結(jié)構(gòu): 1類型1基因內(nèi)啟動子:如5S rRNA 基因的啟動子,位于轉(zhuǎn)錄起點下游,即在基因內(nèi)部,是 下游啟動子,有兩個框架序列,被3種輔助因子所識別。5S rRNA基因的啟動子包括框架A(box A)、中間元件(intermediate element )和框架C(box C)3個元件組成。TFⅢA結(jié)合在框架A上,然后促使TFⅢC結(jié)合,后者結(jié)合導(dǎo)致TFⅢB結(jié)合到轉(zhuǎn)錄起點附近,并引導(dǎo)RNA聚合酶Ⅲ結(jié)合在起點上。TFⅢB使RNA聚合酶Ⅲ正確定位,起“定位因子”(positioning factor)作用。 2類型2基因內(nèi)啟動子:如tRNA基因的啟動子,有兩個控制元件,分別為框架A和框架B。 TFⅢC結(jié)合框架B,其結(jié)合區(qū)域包括框架A和框架B,然后導(dǎo)致TFⅢB結(jié)合到轉(zhuǎn)錄起點附近,并引導(dǎo)RNA聚合酶Ⅲ結(jié)合在起點上。 3上游啟動子:如snRNA基因的啟動子,位于轉(zhuǎn)錄起點上游。有3個上游元件:OCT(八 聚體基序 octamer motif)、PSE(鄰近序列元件 proximal sequence element)、TATA元件。在RNA聚合酶Ⅲ的上游啟動子中,只有靠近起點存在TATA元件,就能起始轉(zhuǎn)錄。然而PSE和OCT元件的存在將會增加轉(zhuǎn)錄效率。

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