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如何預測多肽的二級結構

dcfgferete 2012-08-05 00:18:13 413  瀏覽
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全部評論(2條)

  • 意猶未盡lele 2012-08-06 00:00:00
    二級結構通常為α螺旋、β折疊、β轉角等構成。 可以根據(jù)氨基酸排列順序大致預測多肽的二級結構。如丙氨酸、谷氨酸、亮氨酸、甲硫氨酸殘基傾向于形成α螺旋,脯氨酸、甘氨酸、絲氨酸、酪氨酸則不利于形成α螺旋。一般來說,具有脯氨酸殘基的位置均難形成α螺旋、β折疊、β轉角等結構,只形成自由卷曲,氨基酸殘基的R基側鏈過大,或側鏈基團帶同種電荷均難以形成穩(wěn)定的α螺旋、β折疊、β轉角。

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  • 惟惜戀鬼飄飄 2012-08-06 00:00:00
    預測結構主要是根據(jù)序列的特點。 對于現(xiàn)有的科技來說,還是無法準確預測多肽的二級結構,畢竟肽鏈是經(jīng)過加工后形成的,不是完全依照分子間相互作用和力的大小形成穩(wěn)定的構象。所以,對肽鏈二級結構的預測多數(shù)是依靠通過多肽、氨基酸序列的和已知蛋白的同源性來判斷的,功能相似、同源性高則結構就比較相似。 另外,通過氨基酸自身的特點,包括形成螺旋或者折疊的能力,還有通過紅外、拉曼光譜則能有效檢測特征二級結構的存在。然后確定多肽的結構特點。

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