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- 厄爾多思2 2017-09-26 00:00:00
- “普通的基因測序”應該是指“常規(guī)DNA測序”吧,是用Sanger法(也就是雙脫氧法)進行測序的方法,目前非常普遍的是直接用ABI 3730xl 進行的自動測序,基本上可以做到600bp-800bp的讀長。 高通量測序的概念其實是一個相對的概念,在2000年的時候,3700、MegaBace等儀器上的測序也是高通量測序,是相對手工測序或者跑平板膠來說的。 不過到2005年以后,高通量測序就改指第二代測序(Next generation sequencing),454、Solexa(后改為Illumina)和SOLiD等第二代測序,比3730等diyi代測序的通量提高了成千上萬倍,甚至上億倍,所以稱為高通量測序。 NGS的特點主要有: 1、通量高。一個RUN能產(chǎn)生500Mb-600Gb的數(shù)據(jù)量。 2、讀長相對較短。454(約400-500bp),llumina(100-250bp),SOLiD(75-100)。 3、單位數(shù)據(jù)的成本非常低?,F(xiàn)在很多項目測序的費用。已經(jīng)非常低。生物信息分析成本變得更為重要了。
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