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問答社區(qū)

土壤微生物做高通量 土壤dna濃度應(yīng)該是多少

645182810a 2017-07-20 14:39:06 727  瀏覽
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參與評(píng)論

全部評(píng)論(1條)

  • kongxinzhu空 2017-07-21 00:00:00
    計(jì)算土壤微生物數(shù)量,常見的有兩種方法,一種是傳統(tǒng)的培養(yǎng)法,即平板法,將一定質(zhì)量的土壤制成懸浮液,稀釋后涂到培養(yǎng)基上,培養(yǎng)18-24h,在顯微鏡下找菌落數(shù)目,乘以稀釋倍數(shù),粗略估算細(xì)菌數(shù)量。但這種方法只能得到可培養(yǎng)的微生物數(shù)目,僅占土壤總細(xì)菌的1%,另外99%的微生物是不可培養(yǎng)的,用這種方法得到的值只是參考數(shù)值; 第二種方法是高通量測(cè)序的方法,提取土壤總DNA,通過測(cè)定土壤中所有DNA的堿基序列,與細(xì)菌的堿基序列數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì),得到細(xì)菌的名稱(操作分類單位,OTU),根據(jù)序列的條數(shù)大概估算這類微生物所占的比例。但這種方法無法區(qū)分死亡的細(xì)菌和活著的細(xì)菌,也有一定的局限性。

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