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- 丿灬東赫銀塵丶 2017-08-07 00:00:00
- diyi:生物芯片技術(shù)還只是在研發(fā)階段,并沒有轉(zhuǎn)化為商品進行大量的使用,是因為該技術(shù)仍存在許多問題。Z主要的問題是成本過高,目前的生物芯片技術(shù)需一系列昂貴的儀器,如光刻機器、寡核苷酸合成儀和激光共聚焦顯微器等設(shè)備,如 Affymetrix 的一套系統(tǒng)需要 13. 5 萬美元,對普通的實驗室來說開支較大,是生物芯片技術(shù)推廣的一大障礙。而且樣品制備和待測定靶標探針標記方法復(fù)雜,需專項技術(shù)人員才可以操作,這都導(dǎo)致研究成本相對較高,無法普及。第二,目前的芯片存在不同程度的假陽性,重復(fù)性也有差異,這可能與靶分子濃度、探針濃度、雜交雙方的序列組成、鹽濃度及溫度等對雜交的動力學存在影響有關(guān),因此需要充分研究這些物質(zhì)的物化性質(zhì),提高芯片的特異性。第三,是芯片的標準化問題,即如何將不同實驗室、不同操作人員做出的結(jié)果進行統(tǒng)一化、標準化,尤其對那些表達量低、差異不明顯的基因就更為重要,目前認為,這些誤差可以通過傳統(tǒng)的蛋白質(zhì)分析技術(shù)如酶譜、雙向電泳、免疫組織化學等方法進行驗證。第四,基因組學的資源庫還需要極大的豐富,信號檢測的靈敏度需要增加。芯片發(fā)展的Z終目標是實現(xiàn)從樣品制備、化學反應(yīng)到檢測的整個分析過程的集成化,組成微型全分析系統(tǒng),實現(xiàn)自動化。隨著新材料、新技術(shù)的不斷開發(fā),生物芯片的應(yīng)用領(lǐng)域必然會繼續(xù)從實驗室研究應(yīng)用擴展到臨床應(yīng)用等更廣的范圍。
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原文地址:http://www.easylabplus.com/index-news-describe-html-938.html
一張化合物的質(zhì)譜包含著有關(guān)化合物的豐富信息,大多數(shù)情況下,僅依靠質(zhì)譜就可以確定化合物的分子量、分子式和分子結(jié)構(gòu)。而且,質(zhì)譜分析的樣品用量極微,因此,質(zhì)譜法是進行有機物鑒定的有力工具。接下來咱們就利用具體的例子來解析質(zhì)譜圖。
當然,對于復(fù)雜的有機化合物的定性,還要借助于紅外光譜、紫外光譜、核磁共振等分析方法。
質(zhì)譜的解析是一種非常困難的事情。自從有了計算機聯(lián)機檢索之后,特別是數(shù)據(jù)庫越來越大的今天,盡管靠人工解析El質(zhì)譜已經(jīng)越來越少,但是,為了加深對化合物分子斷裂規(guī)律的了解,作為計算機檢索結(jié)果的檢驗和補充手段,質(zhì)譜圖的人工解析還有它的作用,特別是對于譜庫中不存在的化合物質(zhì)譜的解析。另外,在MS/MS分析中,對子離子譜的解析,目前還沒有現(xiàn)成的數(shù)據(jù)庫,主要靠人工解析。因此,學習一些質(zhì)譜解析方面的知識,在目前仍然是有必要的。
El質(zhì)譜的解析
一、分子量的確定
分子離子的質(zhì)荷比就是化合物的分子量。因此,在解析質(zhì)譜時首先要確定分子離子峰,通常判斷分子離子峰的方法如下:
1.分子離子峰一定是質(zhì)譜中質(zhì)量數(shù)Z大的峰,它應(yīng)處在質(zhì)譜的Z右端。
2.分子離子峰應(yīng)具有合理的質(zhì)量丟失。也即在比分子離子小4~14及20~25個質(zhì)量單位處,不應(yīng)有離子峰出現(xiàn)。否則,所判斷的質(zhì)量數(shù)Z大的峰就不是分子離子峰。因為一個有機化合物分子不可能失去4~14個氫而不斷鏈。如果斷鏈,失去的Z小碎片應(yīng)為CH3,它的質(zhì)量是15個質(zhì)量單位。同樣,也不可能失去20~25個質(zhì)量單位。
3.分子離子應(yīng)為奇電子離子,它的質(zhì)量數(shù)應(yīng)符合氮規(guī)則。所謂氮規(guī)則是指在有機化合物分子中含有奇數(shù)個氮時,其分子量應(yīng)為奇數(shù)。含有偶數(shù)個(包括0個)氮時,其分子量應(yīng)為偶數(shù)。這是因為組成有機化合物的元素中,具有奇數(shù)價的原子具有奇數(shù)質(zhì)量,具有偶數(shù)價的原子具有偶數(shù)質(zhì)量,因此,形成分子之后,分子量一定是偶數(shù)。而氮則例外,氮有奇數(shù)價而具有偶數(shù)質(zhì)量,因此,分子中含有奇數(shù)個氮,其分子量是奇數(shù),含有偶數(shù)個氮,其分子量一定是偶數(shù)。
如果某離子峰完全符合上述三項判斷原則,那么這個離子峰可能是分子離子峰;如果三項原則中有一項不符合,這個離子峰就肯定不是分子離子峰。應(yīng)該特別注意的是,有些化合物容易出現(xiàn)M-1峰或M+1峰,另外,在分子離子很弱時,容易和噪聲峰相混,所以,在判斷分子離子峰時要綜合考慮樣品來源、性質(zhì)等其他因素。
如果判斷沒有分子離子峰或分子離子峰不能確定,則需要采取軟電離方式,如化學電離源、場解吸源及電噴霧電離源等。要根據(jù)樣品特點選用合適的離子源。軟電離方式得到的往往是準分子離子,然后由準分子離子推斷出真正的分子量。
二、分子式的確定
利用一般的El質(zhì)譜很難確定分子式。在早期,曾經(jīng)有人利用分子離子峰的同位素峰來確定分子組成式。有機化合物分子都是由C、H、O、N等元素組成的,這些元素大多具有同位素,由于同位素的貢獻,質(zhì)譜中除了有質(zhì)量為M的分子離子峰外,還有質(zhì)量為M+1、M+2的同位素峰。
由于不同分子的元素組成不同,不同化合物的同位素豐度也不同,貝農(nóng)(Beynon)將各種化合物(包括C、H、O、N的各種組合)的M、M+1、M+2的強度值編成質(zhì)量與豐度表,如果知道了化合物的分子量和M、M+1、M+2的強度比,即可查表確定分子式。
例如,某化合物分子量M=150(豐度100%), M+1的豐度為9.9%,M+2的豐度為0.88%,求化合物的分子式。根據(jù)Beynon表可知,M=150化合物有29個,其中與所給數(shù)據(jù)相符的為C9H10O2。這種確定分子式的方法要求同位素峰的測定十分準確。而且只適用于分子量較小,分子離子峰較強的化合物,如果是這樣的質(zhì)譜圖,利用計算機進行庫檢索得到的結(jié)果一般都比較好,不需再計算同位素峰和查表。因此,這種查表的方法已經(jīng)不再使用。
利用高分辨質(zhì)譜儀可以提供分子組成式。因為碳、氫、氧、氮的原子量分別為12.000000、1.007825、15.994914、14.003074,如果能精確測定化合物的分子量,可以由計算機輕而易舉地計算出所含不同元素的個數(shù)。目前傅里葉變換質(zhì)譜儀、雙聚焦質(zhì)譜儀、飛行時間質(zhì)譜儀等都能給出化合物的元素組成。
三、分子結(jié)構(gòu)的確定
從前面的敘述可以知道,化合物分子電離生成的離子質(zhì)量與強度,與該化合物分子的本身結(jié)構(gòu)有密切關(guān)系。也就是說,化合物的質(zhì)譜帶有很強的結(jié)構(gòu)信息,通過對化合物質(zhì)譜的解析,可以得到化合物的結(jié)構(gòu)。
譜圖解析的一般流程
一張化合物的質(zhì)譜圖包含有很多的信息,根據(jù)使用者的要求,可以用來確定分子量、驗證某種結(jié)構(gòu)、確認某元素的存在,也可以用來對完全未知的化合物進行結(jié)構(gòu)鑒定。對于不同的情況解析方法和側(cè)ZD不同。質(zhì)譜圖一般的解析步驟如下:
(1)由質(zhì)譜的高質(zhì)量端確定分子離子峰,求出分子量,初步判斷化合物類型及是否含有CI、Br、S等元素。
(2)根據(jù)分子離子峰的高分辨數(shù)據(jù),給出化合物的組成式。
(3)由組成式計算化合物的不飽和度,即確定化合物中環(huán)和雙鍵的數(shù)目。計算方法為:
例如,苯的不飽和度
不飽和度表示有機化合物的不飽和程度,計算不飽和度有助于判斷化合物的結(jié)構(gòu)。
(4)研究高質(zhì)量端離子峰。質(zhì)譜高質(zhì)量端離子峰是由分子離子失去碎片形成的。從分子離子失去的碎片,可以確定化合物中含有哪些取代基。常見的離子失去碎片的情況有:
(5)研究低質(zhì)量端離子峰,尋找不同化合物斷裂后生成的特征離子和特征離子系列。例如,正構(gòu)烷烴的特征離子系列為m/z 15、29、43、57、71等,烷基苯的特征離子系列為m/z91、77、65、39等。根據(jù)特征離子系列可以推測化合物類型。
(6)通過上述各方面的研究,提出化合物的結(jié)構(gòu)單元。再根據(jù)化合物的分子量、分子式、樣品來源、物理化學性質(zhì)等,提出一種或幾種Z可能的結(jié)構(gòu)。必要時,可根據(jù)紅外光譜和核磁共振數(shù)據(jù)得出Z后結(jié)果。
(7)驗證所得結(jié)果。驗證的方法有:將所得結(jié)構(gòu)式按質(zhì)譜斷裂規(guī)律分解,看所得離子和所給未知物譜圖是否一致;查該化合物的標準質(zhì)譜圖,看是否與未知譜圖相同;尋找標樣,做標樣的質(zhì)譜圖,與未知物譜圖比較等各種方法。
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