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小分子藥物研發(fā)中,篩選能有效結(jié)合目標(biāo)蛋白的分子是非常耗時耗(財)力的一個環(huán)節(jié),但又是必須進行的工作。高失敗率源于結(jié)合情況的錯綜復(fù)雜,體外生化實驗的結(jié)合效果,往往不能很好的在細胞水平進行重現(xiàn)。這其中可能是因為分子在穿越細胞膜時,出現(xiàn)了被修飾;也可能是因為純化蛋白和真實細胞環(huán)境的蛋白構(gòu)象不同。例如,在生化水平顯示很好結(jié)合效果的分子,在細胞水平可能結(jié)合的是另一個蛋白。是不是很崩潰……
試想,如果有一個高通量解決方案讓你可以直接在細胞水平進行小分子結(jié)合相應(yīng)靶向蛋白的驗證,開不開心,意不意外?
這個方案就是Alpha?-CETSA?!
什么是CETSA??
CETSA?是細胞熱遷移實驗(Cellular Thermal Shift Assay)的簡稱,是PELAGO公司2012年在歐洲注冊的ZL技術(shù)。該技術(shù)基于的原理是:每種蛋白質(zhì)都有自身的熱熔曲線(如下圖)。隨著溫度的升高,蛋白質(zhì)會發(fā)生降解(藍色曲線);當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)結(jié)合小分子以后,該復(fù)合蛋白的熱熔曲線會右移(紅色虛線),即相同溫度下,未降解蛋白的量會提高。CETSA?實驗的樣品來源十分靈活,可以是細胞,也可以是活體給藥以后的組織樣本。
傳統(tǒng)的CETSA?對于天然構(gòu)象蛋白的檢測模式主要有Western-Blot和MS方法,這兩種方法都無法實現(xiàn)高通量的篩選。2019年7月,PELAGO公司正式和PerkinElmer公司達成戰(zhàn)略合作協(xié)議,推出高通量,高靈敏度的CETSA?HT檢測方案,即Alpha?-CETSA?
Alpha?-CETSA?的操作
1.樣品和化合物進行孵育。
2.進行熱休克操作(建議在PCR儀上進行該操作)。
3.加入合適的裂解液。
4.加入Alpha? CETSA?檢測試劑。
5.在具有Alpha?功能的酶標(biāo)儀上檢測。
Z新酶標(biāo)儀加載Alpha?功能
PerkinElmer公司的Victor NIVOZ新款酶標(biāo)儀加載了Alpha?功能,這是目前可以開展Alpha?CETSA?檢測細胞水平蛋白-分子相互作用的Z小的儀器。
目前,PerkinElmer和PELAGO一起推出的蛋白靶點試劑盒有Akt1,BCL-2,EGFR,MEK1和p38 MAKP,工具微珠2套,方便客戶靈活使用這項技術(shù)。更多的商品化試劑盒也會陸續(xù)推出。
復(fù)制鏈接,了解更多https://www.perkinelmer.com.cn/category/alpha-CETSA-kits
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校準(zhǔn)實驗室在客戶現(xiàn)場開展計量校準(zhǔn)時,計量人員一般就當(dāng)成在自家實驗室一樣,進行計量活動,有一些可能跟固定場所不太相同或者干擾因素未能考慮進去,導(dǎo)致在重復(fù)性上出現(xiàn)較大問題,有些實驗室在外部評審時也被評審老師提出現(xiàn)場校準(zhǔn)不能提供充分的滿足規(guī)程規(guī)范要求的現(xiàn)場計量的證據(jù),而被開了不符合。故非固定場所的計量校準(zhǔn),設(shè)備要求還是蠻苛刻的,應(yīng)該引起重視。
實驗室如果需要開展非固定場所校準(zhǔn),那么他申請的能力一定要考慮這方面的描述。有些實驗室僅能在實驗室完成校準(zhǔn),但是給客戶出具報告還是寫了現(xiàn)場地點,出現(xiàn)不真實情況。
故如果申請非固定場所校準(zhǔn),實驗室必須能夠便于攜帶設(shè)備包括輔助設(shè)備,且設(shè)備符合實際預(yù)期要求,經(jīng)過計量溯源和計量確認驗證通過。
有些實驗室配備現(xiàn)場計量設(shè)備準(zhǔn)確度根本不符合規(guī)范要求的允差,但是實驗室還說這個設(shè)備我們在實驗室用標(biāo)準(zhǔn)器比對過,基本沒有誤差,故很準(zhǔn)確,不用考慮設(shè)備的允差是否超過規(guī)范要求。這種解釋還是比較任性和荒謬的。
首先非固定場所標(biāo)準(zhǔn)器設(shè)備必須滿足校準(zhǔn)方法要求,條款明確說明。校準(zhǔn)實驗室為在非固定場所實施校準(zhǔn)所配備的測量設(shè)備不符合校準(zhǔn)方法規(guī)定時,不應(yīng)實施相關(guān)校準(zhǔn)。
如果滿足了,現(xiàn)場校準(zhǔn)給出的不確定度可能并不會像在固定場所給出的不確定度那么小,這個也是比較現(xiàn)實可想而知的,一般情況下而言。
另外對校準(zhǔn)結(jié)果有直接影響的測量設(shè)備不應(yīng)由客戶提供,客戶僅可提供必要的工作條件(如場地、環(huán)境設(shè)施、電源等)和輔助工具。 實驗室哪些設(shè)備是必須自己攜帶,哪些設(shè)備是可以使用客戶的。這里也要注意,一些設(shè)備校準(zhǔn),可能對外部供電或者環(huán)境振動或者溫濕度波動度有要求,故校準(zhǔn)實驗室計量人員應(yīng)該注重這方面,如何去符合規(guī)范規(guī)程的要求進行現(xiàn)場計量。一般客戶工廠都會有自己的計量室,在那里可能有環(huán)境溫濕度以及條件較為好的設(shè)施設(shè)備提供,計量人員可以問詢客戶,到客戶計量科室進行現(xiàn)場計量。
校準(zhǔn)實驗室應(yīng)在非固定場所實施校準(zhǔn)所用設(shè)備的使用和管理要求,包括其包裝、運輸、存儲、安裝、驗證、使用、故障處理等。
上述條款是對非固定場所所使用的設(shè)備要求,主要是設(shè)備運輸儲存,安裝,最重要的就是設(shè)備前后輸運確認。一般采用穩(wěn)定性好的設(shè)備進行驗證。比如實驗室外出攜帶標(biāo)準(zhǔn)器功率計,那么實驗室可能拿出一個穩(wěn)定性較好的負載在運輸前后記錄負載相關(guān)的電壓或電流數(shù)據(jù),再設(shè)備帶回來時候進行前后比對,確認設(shè)備運輸前后無變化,這里主要是指設(shè)備功能無問題,設(shè)備設(shè)置的參量比如小數(shù)點位數(shù)或濾波是否開啟等有無變化。
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