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- lfv的春天 2017-01-21 00:00:00
- 提取核酸時(shí),加入蛋白酶后為什么要加熱到65攝氏度 請注意:SDS對于脫氧核糖核酸酶以及核糖核酸酶均有YZ作用. 這里提供的是由Marmur于1961年建立,經(jīng)Dale等人簡化和發(fā)展,此方法略加修改后可用于其他細(xì)菌種類.主要原理是:采用去垢劑破碎細(xì)菌細(xì)胞,酚-氯仿萃取蛋白,使用核糖核酸酶和蛋白酶K進(jìn)行進(jìn)一步的純化,所提取的DNA無RNA和蛋白質(zhì)污染,可用于限制性內(nèi)切酶消化,分子克隆. ⑴材料 ①20倍SSC緩沖液:3mol/l NaCl; 0.3mol/l 醋酸鈉;pH 7.0(高壓滅菌后,4攝氏度保存可長期使用) ②酚/氯仿(1:1):一般市售的酚需要重蒸處理,市售的酚常含有雜質(zhì)而呈粉色和淡黃色,需要重蒸二次,收集沸點(diǎn)160℃部分,小瓶分裝,瓶內(nèi)空腔充氮?dú)?,?0℃密封保存,以免氧化,用前從冰箱中取出,68℃蒸餾水飽和,加入8—羥基喹啉(100g酚加0.1g),酚變?yōu)辄S色.8—羥基喹啉是抗氧化劑,并能部分YZ核糖核酸酶,含8—羥基喹啉的酚用等體積1.0mol/L pH 8.0Tris 緩沖液抽提,再用0.1mol/L pH 8.0含0.2%β-巰基乙醇的Tris緩沖液抽提數(shù)次,酚溶液的pH應(yīng)大于7.6.此酚溶液在平衡緩沖液覆蓋下4℃可保存一個(gè)月,純化和制備酚溶液都要帶手套,以免損傷皮膚. ③核糖核酸酶:無DNA酶污染,將胰RNA酶(RNA酶A)溶于10mmol/LTris-Cl(pH 7.5)15mmol/L Nacl 溶液中,濃度為10mg/ml.于100℃加熱15分鐘,緩慢冷卻至室溫,分裝后于-20℃保存. ④蛋白酶K ⑤TES緩沖液:10mmol/L Tris-HCl, pH 8.0; 10mmol/L NaCl;1mmol/l EDTA ⑵方法 ①取單菌落接種于5mlLB培養(yǎng)液中,37℃振蕩培養(yǎng)過夜.(使用試管) ②將上述菌液接種于200mlLB培養(yǎng)液中,37℃振蕩培養(yǎng)過夜.(使用500ml或1000ml三角瓶) ③離心,收集沉淀(5000r/m,10分鐘) ④將沉淀懸浮于20ml 20倍SSC緩沖液中,混勻. ⑤加入200mg SDS,室溫下振蕩過夜,使細(xì)菌細(xì)胞充分裂解,裂解液呈粘稠狀 ⑥加入等體積的酚/氯仿溶液,溫和地混勻,細(xì)心地回收上層水相(注意不要觸及二相之界面),重復(fù)萃取三次 ⑦加入2倍體積無水乙醇,此時(shí)可見到絮狀DNA沉淀或用玻璃棒繞取收集 ⑧將DNA溶于15ml 2倍SSC溶液中,加入核糖核酸酶(Z終濃度50ug/ml),37℃保溫1小時(shí) ⑨加入蛋白酶K(50ug/ml),繼續(xù)保溫1小時(shí) ⑩加入等體積苯酚萃取一次,在回收的水相中加入2.5倍體積的無水乙醇,-20℃靜止過夜 25000g,4℃,離心15分鐘,收集沉淀,用-20℃無水乙醇洗滌一次;將DNA在真空干燥器中抽干,溶于10mlTES緩沖液中,4℃保存?zhèn)溆?
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