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問答社區(qū)

對細胞dna同時進行甲基化和全外顯子測序有意義嗎

252731590 2017-05-27 11:58:14 559  瀏覽
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全部評論(1條)

  • 一只小鳥5711 2017-05-28 00:00:00
    外顯子捕獲測序和轉錄組測序都是針對基因組上轉錄區(qū)域進行測序,但是外顯子捕獲測序針對已有基因組信息的物種,而轉錄組分析既能針對已有基因組信息的物種,也能針對沒有基因組信息的新物種,因此,兩者的分析存在一定的差異: (1)分析的目標區(qū)域有所不同。外顯子捕獲測序只針對基因組上已知的編碼區(qū),而轉錄組測序不僅針對基因組上已知的編碼區(qū),還能夠檢測非編碼RNA等轉錄組的信息。 (2) 分析的手段所有不同。外顯子捕獲測序只需要把測序結果比對基因組,分析序列差異。轉錄組測序既可以把測序結果比對基因組,也可以進行從頭(de Novo)拼接。 (3) 得到的結果有所不同。外顯子捕獲測序可以得到序列變異的信息,而轉錄組測序不僅可以獲得已知序列的變異信息和新的轉錄本信息(針對從頭拼接),還可以得到表達譜信息。除此以外,轉錄組測序還能夠分析mRNA的可變剪接,而外顯子捕獲測序的樣品來源是基因組,不能夠進行mRNA的可變剪接分析,只能夠得到外顯子上的序列變化。

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