單細(xì)胞篩選系統(tǒng)是一種用于生物學(xué)、農(nóng)學(xué)領(lǐng)域的分析儀器。單細(xì)胞分選儀可以在顯微鏡直接觀察下,根據(jù)細(xì)胞形態(tài)學(xué),熒光標(biāo)記或位置,從貼 壁,懸浮和三維細(xì)胞培養(yǎng)系統(tǒng),快速精確采集感興趣的單細(xì)胞或細(xì)胞團(tuán)。本儀器可 以在實驗室常規(guī)使用的細(xì)胞培養(yǎng)器皿上直接采集細(xì)胞。
單細(xì)胞篩選系統(tǒng)常用單細(xì)胞分選方法:
1.有限稀釋法
有限稀釋法是一種常用的單克隆培養(yǎng)方法,也可用于獲取單個細(xì)胞。其原理主要是基于細(xì)胞懸浮液中細(xì)胞的分布及濃度進(jìn)行計算,逐步稀釋細(xì)胞懸浮液,Z 終達(dá)到一定體積中只存在單個細(xì)胞。為了提高單細(xì)胞獲得率,需要盡可能地進(jìn)行稀釋,在統(tǒng)計學(xué)上,以每單位0.5-0.9個細(xì)胞為宜。
優(yōu)點(diǎn):操作簡便,無需特殊儀器設(shè)備,成本低。
缺點(diǎn):對于濃度的計算易存在誤差,基于泊松分布原理,即使在理想狀態(tài)下,單細(xì)胞比例也只有約1/3,假陽性率高。
2.顯微操作法
顯微操作法是通過鏡檢,對單個細(xì)胞進(jìn)行人工挑選的方法。在制備好適宜濃度的細(xì)胞懸浮液后,可置于顯微鏡下觀察,利用口吸管(可由玻璃毛細(xì)管拉制而成)將目標(biāo)細(xì)胞吸取出來。條件允許的話,還可使用顯微操作儀,該儀器對口吸管、注射儀、毛細(xì)針有一定的固定、調(diào)節(jié)功能,可在一定程度上增加操作的通量以及穩(wěn)定性。在生殖領(lǐng)域相關(guān)的研究中,多采取顯微操作法獲得單個細(xì)胞。
優(yōu)點(diǎn):儀器設(shè)備要求不高,可準(zhǔn)確獲取形態(tài)完整的活性較高的單細(xì)胞。
缺點(diǎn):對操作人員技術(shù)要求高,有人為因素干擾,通量較低。
3.流式細(xì)胞分選
如果對通量要求較高,同時目標(biāo)細(xì)胞有適宜的熒光標(biāo)記,可利用流式細(xì)胞儀完成單細(xì)胞分選。經(jīng)熒光染色或標(biāo)記的單細(xì)胞懸液,被高壓壓入流動室內(nèi),在鞘液的包裹和推動下,細(xì)胞被排成單列,以一定速度從流動室噴口噴出。通過相應(yīng)熒光檢測及充電,獲得目的細(xì)胞,實現(xiàn)單細(xì)胞分離。進(jìn)行免疫方面的研究時,流式細(xì)胞分選為首 選分離方法。
優(yōu)點(diǎn):通量較高,可分選單個細(xì)胞。
缺點(diǎn):需要具有分選功能的流式細(xì)胞儀,有穩(wěn)定可用的熒光標(biāo)記或熒光染料,需制備一定量的細(xì)胞懸浮液,不適用于微量樣本。
4.激光顯微切割
激光顯微切割適用于組織樣本的細(xì)胞分選,組織切片經(jīng)染色后,在顯微鏡下進(jìn)行觀察,鎖定目標(biāo)區(qū)域,利用激光進(jìn)行切割、分選。某些型號的儀器還可以直接進(jìn)行活體組織的細(xì)胞切割分選(如Leica LMD7000),無需先制備冰凍切片。
優(yōu)點(diǎn):可對組織樣本進(jìn)行細(xì)胞分選,可結(jié)合免疫組化信息。
缺點(diǎn):需要激光顯微切割平臺,操作較復(fù)雜,包括固定染色等步驟,對核酸產(chǎn)生潛在的損害。
5.微流控分選
微流控分選基于流體力學(xué)原理實現(xiàn)細(xì)胞分選,適用于高通量、大規(guī)模的單細(xì)胞研究。近兩年大熱的10x Genomics ChromiumTM就平臺就是利用微流控技術(shù)進(jìn)行單個細(xì)胞分選,其技術(shù)核心是含有75萬種Barcode的油滴包裹的凝膠珠(GEMs),能在10分鐘內(nèi)自動完成多至80,000個細(xì)胞的捕獲,目前廣泛應(yīng)用于細(xì)胞分群相關(guān)的研究中。
優(yōu)點(diǎn):分選通量高,成本低,采用商業(yè)化儀器操作簡便。
缺點(diǎn):對細(xì)胞懸浮液活性要求較高(至少>85%),細(xì)胞總量要求較高,若采用Barcode+UMI擴(kuò)增原理,無法檢測全長轉(zhuǎn)錄本。
以上5種單細(xì)胞篩選系統(tǒng)單細(xì)胞分選方法,各有利弊,研究者可以根據(jù)不同的科研需求及樣本情況進(jìn)行選擇。目前,要實現(xiàn)單細(xì)胞的分選,第 一步往往需要制備細(xì)胞懸浮液,對于流式細(xì)胞分選以及微流控分選來說,對細(xì)胞懸浮液的總量以及活性都有一定的要求。
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