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研究分享:XDR 200 MO反應(yīng)器在大腸桿菌質(zhì)粒發(fā)酵中的應(yīng)用

來(lái)源:Cytiva(思拓凡) 更新時(shí)間:2025-02-20 18:15:11 閱讀量:209
導(dǎo)讀:關(guān)注Cytiva學(xué)堂,獲取更多實(shí)驗(yàn)真知

基于大腸桿菌在5 L玻璃反應(yīng)器中的發(fā)酵經(jīng)驗(yàn),以此在XDR 200 MO一次性反應(yīng)器中進(jìn)行80 L以及160 L的放大培養(yǎng)。

在此我們使用DH5α大腸桿菌來(lái)生產(chǎn)用于慢病毒包裝的大小為4180 bp的pLP2質(zhì)粒。

不同體積的發(fā)酵結(jié)果通過(guò)OD600、質(zhì)粒產(chǎn)量、SC比例來(lái)進(jìn)行對(duì)比。


放大培養(yǎng)過(guò)程中使用Setpoint Table對(duì)補(bǔ)料流速進(jìn)行程序化自動(dòng)控制,使用Lookup Table將DO與攪拌、空氣、氧氣全自動(dòng)關(guān)聯(lián)。

另外,XDR 200 MO反應(yīng)器的槳葉設(shè)計(jì)(上層Pitch軸流槳、下層Rushton槳)也為高密度菌體發(fā)酵培養(yǎng)提供有效的支持。

我們的研究成果證實(shí)了XDR 200 MO反應(yīng)器對(duì)上游大腸桿菌培養(yǎng)的適用性,為基因治療等行業(yè)的質(zhì)粒生產(chǎn)提供有效手段。

介紹

基因治療包括mRNA和DNA疫苗這些新興療法都會(huì)使用到質(zhì)粒,這些質(zhì)?;径际峭ㄟ^(guò)大腸桿菌發(fā)酵而得。

一般而言,病毒載體和mRNA所需要的質(zhì)粒生產(chǎn)規(guī)模為百升級(jí)別。一次性反應(yīng)器快速的批間切換能力以及降低交叉污染風(fēng)險(xiǎn)的特性,更適用于多種質(zhì)粒的快速放大生產(chǎn)。

這篇文章的主要目的是:

建立質(zhì)粒放大生產(chǎn)工藝;

考察XDR 200 MO反應(yīng)器在160 L規(guī)模下質(zhì)粒的放大生產(chǎn)性能;

確認(rèn)XDR 200 MO與5 L玻璃罐在質(zhì)粒產(chǎn)量和SC比例方面是否具有可比性。

過(guò)程與結(jié)論

5 L玻璃發(fā)酵罐中大腸桿菌發(fā)酵過(guò)程開(kāi)發(fā)

5 L玻璃發(fā)酵罐的初始接種密度OD600為0.02,初始培養(yǎng)體積2.5 L。

在接種8.7 h后,DO值降低至設(shè)定值30%,之后開(kāi)啟級(jí)聯(lián)溶氧的空氣和氧氣的自動(dòng)調(diào)節(jié)控制。初始的補(bǔ)料速率為0.2 mL/min,之后每1.5-2 h調(diào)節(jié)補(bǔ)料速率以維持菌體比生長(zhǎng)速率在0.06-0.08 h-1

生長(zhǎng)曲線如圖1所示,培養(yǎng)后期最高OD600達(dá)到89.2。

圖1:(A)5 L玻璃反應(yīng)器的菌體生長(zhǎng)OD600和比生長(zhǎng)速率/h-1

圖1:(B)5 L玻璃反應(yīng)器質(zhì)粒的瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果

左右滑動(dòng)查看完整

每4小時(shí)留樣一次,并且儲(chǔ)存于-20℃冰箱中。樣品檢測(cè)之前先解凍,并且稀釋至1.0至1.5 OD之間,通過(guò)分光光度法和瓊脂糖凝膠電泳(見(jiàn)圖1B)分析質(zhì)粒產(chǎn)量和SC超螺旋比例。

在瓊脂糖凝膠電泳圖片中,SC質(zhì)粒為3000 bp標(biāo)記物遷移,而開(kāi)環(huán)形(OC)質(zhì)粒為4000 bp標(biāo)記物遷移,SC比例為92.2%。

大腸桿菌發(fā)酵放大至XDR 200 MO 發(fā)酵罐

80 L體積

發(fā)酵過(guò)程放大至200 L規(guī)模所使用的通氣策略與5 L反應(yīng)器保持一致,采用相同的VVM,即每分鐘通氣量與培養(yǎng)體積的比例保持一致,最高VVM控制在0.2-0.3之間。

初始接種密度為0.02 OD600,初始體積為68 L。DO設(shè)定值30%,級(jí)聯(lián)空氣與氧氣流速。當(dāng)氧氣流速達(dá)到9-10 Lpm,提高轉(zhuǎn)速15 rpm以維持DO。

在接種后的6.5小時(shí),DO值第一次降低至30%,此時(shí)空氣和氧氣開(kāi)啟級(jí)聯(lián),以自動(dòng)控制溶氧至30%。

發(fā)酵18小時(shí)后開(kāi)啟補(bǔ)料,初始速率為5.6 mL/min,之后每1.5-2 h調(diào)節(jié)補(bǔ)料速率,以維持菌體比生長(zhǎng)速率在0.06-0.08 h-1(圖2)。

圖2:XDR 200 MO 80 L體積培養(yǎng)參數(shù)

藍(lán)色曲線為溶氧,紫色為攪拌速率

圖3:XDR200 MO裝液80 L體積

(A)菌體生長(zhǎng)OD600和比生長(zhǎng)速率/h-1

圖3:XDR200 MO裝液80 L體積

(B)質(zhì)粒的瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果

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大腸桿菌發(fā)酵放大至XDR 200 MO 發(fā)酵罐

160 L體積

160 L培養(yǎng)體積下的攪拌以及補(bǔ)料控制都與之前批次相同。XDR 200 MO反應(yīng)器采用先進(jìn)的DO控制模式。

在DO控制回路中,您可以根據(jù)DO值不同的CV(控制變量)級(jí)聯(lián)到空氣流速、O2流速和攪拌速率(圖4A)。

這種終端用戶可根據(jù)工藝需求自我靈活配置的策略不僅能穩(wěn)定DO,還能有效控制泡沫以及袋壓。

在該批次中,DO完全自動(dòng)控制,并使用Lookup Table級(jí)聯(lián)到空氣流速、O2流速和攪拌轉(zhuǎn)速(圖4B)。

圖4:XDR 200 MO 160 L裝液量的設(shè)置

 (A) DO控制策略

圖4:XDR 200 MO 160 L裝液量的設(shè)置

(B) DO與MFC1(空氣)、MFC6(氧氣)、AGT1(轉(zhuǎn)速)相級(jí)聯(lián)

圖4:XDR 200 MO 160 L裝液量的設(shè)置

 (C) 補(bǔ)料速率的程序化設(shè)定

左右滑動(dòng)查看完整

此次實(shí)驗(yàn)中,使用Setpoint Table對(duì)補(bǔ)料速率進(jìn)行程序化自動(dòng)控制(圖4C),培養(yǎng)中的最大補(bǔ)料速率為35 mL/min(Step_12),整個(gè)過(guò)程中的補(bǔ)料速率都自動(dòng)調(diào)整并記錄在控制軟件中,降低了人為操作的風(fēng)險(xiǎn)并且更滿足生產(chǎn)法規(guī)需求。

溶氧的控制采用自動(dòng)化級(jí)聯(lián)模式(圖4A、圖4B),以維持穩(wěn)定的溶氧狀態(tài)。

發(fā)酵過(guò)程中的關(guān)鍵工藝參數(shù)如圖5所示,這些工藝參數(shù)(DO-藍(lán)線、pH-綠線、溫度-紅線)在整個(gè)過(guò)程中非常穩(wěn)定,且波動(dòng)很小。在該體積培養(yǎng)下,這些參數(shù)都能得到很好的控制,以此體現(xiàn)XDR 200 MO穩(wěn)定且高效的參數(shù)控制性能。

圖5:XDR 200 MO 160 L裝液量的關(guān)鍵工藝參數(shù)曲線

(DO-藍(lán)線、pH-綠線、溫度-紅線)

整個(gè)培養(yǎng)過(guò)程中,通過(guò)自動(dòng)調(diào)節(jié)補(bǔ)料速率控制菌體比生長(zhǎng)速率在0.06-0.08 h-1,最終收獲液為167 kg,OD600達(dá)到95.8(圖6A),SC比例為91.75%。

圖6:XDR 200 MO裝液160 L體積

(A)菌體生長(zhǎng)OD600和比生長(zhǎng)速率/h-1

圖6:XDR 200 MO裝液160 L體積

(B)質(zhì)粒的瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果

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5 L玻璃罐和XDR 200 MO反應(yīng)器的結(jié)果比較

5 L玻璃反應(yīng)器和XDR 200 MO反應(yīng)器(裝液量80 L、160 L)能達(dá)到的最高OD600分別是89.2、93.4、95.8。質(zhì)粒均一化產(chǎn)量和SC比例如表1所示。

表1:1. 5 L發(fā)酵罐和XDR200 MO反應(yīng)器(裝液量80 L、160 L)的質(zhì)粒均一化產(chǎn)量和SC比例

總結(jié)

 1 

XDR 200 MO反應(yīng)器能提供高kLa,支持大腸桿菌的高密度發(fā)酵,本實(shí)驗(yàn)中最高OD600可達(dá)到95。

 

XDR 200 MO能重現(xiàn)5 L 規(guī)模的發(fā)酵結(jié)果,達(dá)到具有可比性的OD600、質(zhì)粒產(chǎn)量和超螺旋質(zhì)粒比例(SC%),具有好的放大重現(xiàn)性。

 3 

XDR 200 MO在培養(yǎng)過(guò)程中能保持溶氧、pH、溫度等重要工藝參數(shù)穩(wěn)定,滿足培養(yǎng)需求。

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XDR 200 MO在大腸桿菌質(zhì)粒發(fā)酵中的應(yīng)用



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