如圖1所示， 總結(jié)了250 pg和500 pg兩種上樣量的 K562 酶解樣品中蛋白和肽段的鑒定和定量結(jié)果，在單細胞水平250 pg上樣量條件下，重復采集三針，鑒定出超過4,900個蛋白和35,000條肽段，其中大約 70% 的蛋白（>3,400） 和 54% 的肽段（>19,000）定量結(jié)果CV <20%。將上樣量增加到 500 pg，蛋白鑒定數(shù)超過5,500，肽段鑒定數(shù)超過43,000，同樣，定量結(jié)果上，70% 的蛋白和 56% 的肽段 CV <20%。

圖2顯示了ACTG_HUMAN蛋白的代表性肽段AVFPSIVGR 的譜圖，上圖是三針重復進樣的y6碎片離子的提取離子流色譜圖（XIC），下圖是250 pg和500 pg上樣量下的相應MS/MS譜圖。可以看到，即使在低上樣量下，信號強度、重現(xiàn)性和MS/MS譜圖質(zhì)量也很高。當樣品上樣量從250 pg增加到500 pg時，觀察到XIC峰高、峰面積和MS/MS碎片離子強度明顯增加了兩倍。這些結(jié)果凸顯了 ZenoTOF 8600 系統(tǒng)上 Zeno SWATH DIA 的靈敏度和準確度，表明了其適用于低上樣量樣品或單細胞蛋白質(zhì)組學應用。

本文介紹了使用 ZenoTOF 8600系統(tǒng)進行單細胞水平的定量蛋白質(zhì)組學工作流程，該方法利用高靈敏度的Zeno SWATH DIA數(shù)據(jù)采集，使用納升液相分離，能夠以每天40個樣品（SPD）的通量從250 pg的人細胞樣品中鑒定超過4,900個蛋白和35,000條肽段。ZenoTOF 8600 系統(tǒng)的高靈敏度有助于從單細胞水平皮克樣品量中發(fā)現(xiàn)和定量可靠的生物標志物，使其成為單細胞蛋白質(zhì)組學應用的理想平臺。

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