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2025-04-25 14:13:10高通量藻類表型成像分析平臺
高通量藻類表型成像分析平臺是一種集成了先進成像技術(shù)和自動化分析軟件的設(shè)備。該平臺能夠快速、高效地獲取大量藻類樣本的表型數(shù)據(jù),包括形態(tài)、顏色、生長狀態(tài)等。通過高通量成像,實現(xiàn)對藻類樣本的全面、客觀分析,有助于研究人員深入了解藻類的生理特性和基因功能。同時,自動化分析軟件的應(yīng)用大大提高了數(shù)據(jù)分析的準確性和效率,是藻類學研究和應(yīng)用領(lǐng)域的重要工具。

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PlantScreen高通量植物表型成像分析平臺(傳送帶版)(二)
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2023-05-26 10:03:56PhenoTron?-XYZ植物表型成像分析系統(tǒng)
PhenoTron?-XYZ植物表型成像分析系統(tǒng),是易科泰生態(tài)技術(shù)公司基于國際先進光譜成像傳感器技術(shù)和自主研發(fā)的XYZ植物表型自動掃描平臺,設(shè)計生產(chǎn)的一款適用于實驗室或溫室高通量植物表型分析系統(tǒng):國際知名高光譜成像技術(shù)公司Specim(芬蘭)高光譜成像傳感器Thermo-RGB?紅外熱成像與可見光成像融合分析技術(shù),可實現(xiàn)遙控和在線圖傳FluorCam葉綠素熒光成像技術(shù)平臺采用STP(Sensor-To-Plant)技術(shù)和在線視覺監(jiān)控可選配基于蒸滲儀技術(shù)的iPOT數(shù)字化培養(yǎng)盆,全面監(jiān)測重量變化、土壤水分與溫度,及葉片溫度、葉綠素熒光、莖流、光合作用等生理生態(tài)參數(shù)可選配臺面式表型分析平臺,XYZ安裝在樣品平臺上,特別適合實驗室組培苗和種苗表型分析、種質(zhì)資源檢測等應(yīng)用于種苗與組培苗表型檢測、作物表型研究分析、植物生理生態(tài)研究、光合生理研究、種質(zhì)資源檢測、脅迫與抗性評估與篩選等 自左至右依次為:PhenoTron?-XYZ植物表型成像分析系統(tǒng)(可移動)、臺面式PhenoTron?-XYZ植物表型成像分析系統(tǒng)、綠豆種苗高光譜成像分析(PRI)主要技術(shù)指標:1)平臺采用STP技術(shù),嵌入式主控系統(tǒng),全中文操作界面,觸控屏+PC端GUI軟件雙重控制,可無線控制2)XYZ三軸全自動運行,精 準定位掃描成像分析,運行精度1mm3)支持組合命令,可自定義Protocols,自動執(zhí)行XYZ三軸移動、停止、光源開閉、快門觸發(fā)等4)支持位置記憶,可一鍵注冊、記錄、保存、讀取XYZ坐標信息,自動移動精 準定位采集Thermo-RGB及FluorCam葉綠素熒光成像數(shù)據(jù)5)機器視覺監(jiān)控:監(jiān)控鏡頭經(jīng)過算法校準,在線監(jiān)視全域植物狀態(tài)和自動掃描成像,通過注冊XYZ自動定位采集RGB、紅外熱成像、FluorCam葉綠素熒光成像數(shù)據(jù),并在線監(jiān)控全過程6)標配臺面式XYZ三軸有效行程:X軸80cm,Y軸有效掃描長度180cm,Z軸可升降范圍30cm7)400-1000nm高光譜成像:a)光譜通道448,具備MROI功能,根據(jù)需求自由選擇感興趣光譜波段,減少數(shù)據(jù)冗余b)幀率:330FPS(滿幀),適應(yīng)多種測量場景,尤其對容易擺動的植物,保證最 佳的成像效果c)光譜分辨率 FWHM:5.5nmd)空間分辨率:1024像素e)信噪比400:1f)分析參數(shù):可成像測量分析作物生化、生理指標如葉綠素含量、花青素含量、胡蘿卜素含量、光利用效率、葉綠素熒光指數(shù)、健康指數(shù)、覆蓋度等近百種參數(shù)8)900-1700nm高光譜成像:a)光譜通道224,具備MROI功能,根據(jù)需求自由選擇感興趣光譜波段,減少數(shù)據(jù)冗余b)幀率:670FPS(滿幀)c)光譜分辨率 FWHM:8nmd)空間分辨率:640像素e)信噪比1000:1f)分析參數(shù):可成像測量分析NDNI歸一化N指數(shù)、NDWI歸一化水指數(shù)、MSI水分脅迫指數(shù)等9)SpectrAPP?高光譜成像分析軟件:a)具備偽彩色/灰度顯示、波段融合、ROI選區(qū)、光譜指數(shù)分析、光譜曲線繪制、光譜特征統(tǒng)計、直方圖統(tǒng)計、結(jié)果圖/表導出等功能b)可分析NDVI、PRI、DCNI、CRI、ARI、PSRI、NPQI、EVI、HI、WBI等數(shù)十種光譜指數(shù),可根據(jù)需求定制添加光譜指數(shù)  左:SpectrAPP?高光譜成像分析,右:綠豆幼苗葉綠素熒光成像分析10)Thermo-RGB成像:a)可見光-紅外熱成像雙鏡頭主機,出廠黑體多點校準并附校準證書,分辨率640×512像素b)測量溫度范圍-25℃-150℃,靈敏度0.03℃@30℃,c)紅外熱成像分析軟件具備調(diào)色板、差值技術(shù)、溫度范圍設(shè)置、等溫線模式、選區(qū)分析、溫度掃描、剖面溫度、時間圖、3D溫度圖、在線報告等功能d)Thermo-RGB?成像融合分析:可進行手動/自動ROI分析;光照/背光葉片長度、寬度、周長、凸包面積、圓度等形態(tài)分析;最 高、最 低、平均溫度、最 大溫差、中位數(shù)等溫度分析;R/G/B、H/S/V、綠視率等顏色分析,具備溫度直方圖統(tǒng)計、路勁分析、溫度轉(zhuǎn)換、圖/表導出等功能e) Thermo-RGB遙控并可在線圖像無線傳輸,實時監(jiān)測RGB及紅外熱成像畫面,測量最 大、最 小、中心點溫度信息等11)葉綠素熒光成像:a)專業(yè)高靈敏度葉綠素熒光成像CCD,幀頻50fps,分辨率720×560像素,像素大小8.6×8.3μmb)3色4組LED激發(fā)光源:620nm脈沖調(diào)制測量光,620nm紅色、5700K白色雙色光化學光源,735nm遠紅光用于測量Fo’等c)光化學光最 大1000μmol.m-2. s-1可調(diào),飽和脈沖3900μmol.m-2. s-1d)可自動運行Fv/Fm、Kautsky誘導效應(yīng)、熒光淬滅分析、光響應(yīng)曲線等protocolse)50多個葉綠素熒光自動測量分析參數(shù),包括:Fv/Fm、Fv’/Fm’、Y(II)、NPQ、qN、qP、Rfd、ETR等,自動形成葉綠素熒光參數(shù)圖f) 自動同步顯示葉綠素熒光參數(shù)及參數(shù)圖、葉綠素熒光動態(tài)曲線、葉綠素熒光參數(shù)頻率直方圖g) 可通過注冊定位自動精 準定位運行葉綠素熒光成像分析,單次成像面積35x46mmh)可對植物葉片、果實等不同組織進行葉綠素熒光成像分析i) 可選配GFP成像j) 配備便攜支架和葉夾,方便獨立使用
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2023-06-06 09:29:11崖州灣創(chuàng)新研究院茅云翔教授團隊發(fā)表紅藻高通量表型組學研究成果
       茅云翔教授團隊在Plant Phenomics發(fā)表成果構(gòu)建紅藻高通量表型組學研究技術(shù)(新聞鏈接:我院茅云翔教授團隊在Plant Phenomics發(fā)表成果構(gòu)建紅藻高通量表型組技術(shù)),該研究采用易科泰生態(tài)技術(shù)公司提供的MC 1000多通道藻類培養(yǎng)系統(tǒng)和易科泰光譜成像與無人機遙感研究中心設(shè)計生產(chǎn)的AlgaTech?高通量藻類表型分析平臺:AlgaTech?高通量藻類表型分析平臺       易科泰生態(tài)技術(shù)公司提供藻類高通量表型組學研究、藻類培養(yǎng)與在線監(jiān)測、藻類固碳光氧生物反應(yīng)器全面解決方案。
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2022-12-04 19:40:01高內(nèi)涵應(yīng)用案例——線粒體動力學檢測和表型分析
引言新陳代謝是生物體內(nèi)進行的化學變化的總稱,是生物最基本的生命活動過程。細胞從環(huán)境汲取能量、物質(zhì),在內(nèi)部進行各種化學變化,維持自身高度復雜的有序結(jié)構(gòu),保證生命活動的正常進行。作為細胞的“能量工廠”,線粒體在維持能量穩(wěn)態(tài)方面發(fā)揮重要作用,可以調(diào)控蛋白質(zhì)、脂質(zhì)、溶質(zhì)和代謝物產(chǎn)物的進出,并保護細胞質(zhì)免受有害線粒體產(chǎn)物的影響。線粒體通過不斷的分裂和融合,維持線粒體形態(tài)、分布和數(shù)量,維持細胞穩(wěn)態(tài),該過程被稱為線粒體動力學。線粒體自噬是機體清除細胞內(nèi)功能異常的線粒體的過程,是線粒體質(zhì)量控制的主要機制。線粒體動力學的病理改變可導致生物能量功能受損和線粒體介導的細胞死亡,并與多種病理機制相關(guān),包括缺血性心肌病,糖尿病,肺動脈高壓,帕金森氏病,亨廷頓氏病,骨骼肌萎縮癥、阿爾茨海默病等。線粒體大小和形狀取決于它們在細胞內(nèi)的位置以及不同細胞對能量的需求。當線粒體發(fā)生損傷時,它的形態(tài)和完整性會發(fā)生改變,如線粒體的數(shù)量、大小、長度和形狀等。線粒體形態(tài)、結(jié)構(gòu)和功能的檢測對于了解線粒體的穩(wěn)態(tài)以及功能狀態(tài)有重要意義。高內(nèi)涵成像分析系統(tǒng)非常適合進行線粒體表型和結(jié)構(gòu)的研究。共聚焦成像和水鏡可以提高成像質(zhì)量并更好地顯示線粒體結(jié)構(gòu),高內(nèi)涵的圖像分析工具可以幫助科研工作者獲得不同表型的數(shù)字特征,線粒體表型和結(jié)構(gòu)重排的分析模塊可用于線粒體動力學為基礎(chǔ)的細胞研究。 結(jié)果展示使用不同濃度的化合物,包括氯喹(抑 制線粒體循環(huán)),魚藤酮(氧化磷酸化抑 制劑)和纈氨霉素(鉀離子載體)處理 PC12(人神經(jīng)母細胞瘤細胞)。將活細胞用線粒體染料 MitoTracker Orange  和 Hoechst 進行染色,利用 ImageXpress Micro Confocal 系統(tǒng)(Molecular Devices)進行成像,使用共聚焦模式和 40X 水鏡拍攝活細胞的圖像,分辨單個線粒體并檢測線粒體形態(tài)變化。使用 MetaXpress 高內(nèi)涵圖像采集和分析軟件中的 Custom Module Editor(自定義模塊編輯器)分析圖像,使用“Granularity”模塊和“Find Fibers”模塊識別圓形顆粒和細長的線粒體(圖 1)。圖 1 .線粒體形狀的表型分析。Molecular Devices 高內(nèi)涵成像分析系統(tǒng)適用于各種細胞模型中化合物的藥物開發(fā)或毒性評估。不同化合物處理會導致線粒體形態(tài)變化,膜電位的損失、以及細胞的程序性死亡等。MetaXpress 軟件非常適合進行線粒體形態(tài)的測定,可以定義每個對象的數(shù)量、面積、強度、長度和形狀(表1,2)。使用具有共聚焦模式的 40X 水鏡對細胞進行成像,MetaXpress 自定義模塊編輯器分析圖像(圖 2)。這些檢測結(jié)果可以計算劑量反應(yīng)和各種化合物的有效濃度,以及用數(shù)字來表征線粒體結(jié)構(gòu)動力學(圖 3)。圖 2 .化合物對線粒體的作用。使用MitoTracker Orange對線粒體進行染色( 黃色 ),對照組(A)、纈霉素(B)、魚藤酮(C)。使用特定濃度的化合物(氯喹,魚藤酮和纈氨霉素)處理 PC12 細胞,對細胞進行染色和成像。通過圖像分析將線粒體結(jié)構(gòu)確定為“纖維”(頂部)或“顆?!保ㄖ胁浚?,底部為線粒體染色后熒光強度的變化。EC50的值取決于四個濃度依賴性復本和參數(shù)曲線的擬合(圖 3)。圖 3 .使用氯喹(綠色),魚藤酮(紅色)和纈氨霉素(藍色)處理 PC12 細胞。EC50的值取決于四個濃度依賴性復本和參數(shù)曲線的擬合。在分析過程中,我們比較了水鏡和空氣鏡對圖像質(zhì)量和分析的影響。結(jié)果顯示,使用水鏡可以提高圖像質(zhì)量,并且通常會導致 Z' 值增加( 表 3 )。圖 4 顯示了使用自定義模塊編輯對線粒體表型進行計數(shù)和分析,以評估線粒體的健康、代謝、循環(huán)、復合效應(yīng)和疾病狀態(tài)等。并且,自定義模塊編輯可以針對特定的細胞類型或疾病模型進行進一步的調(diào)整和修改。表 1 .用圖 3 所示的曲線定量 EC50。表 2 .不同的對照和化合物處理方法的比較。上面四列數(shù)據(jù)分別是對照,10 um 的氯喹,300 nm 的魚藤酮,和 10 nm 的纈氨酸霉素。表 3 .與空氣鏡相比,水鏡可以提高圖像質(zhì)量,獲得更高的Z’值。 圖 4 .自定義模塊編輯器(CME)。 總結(jié)Molecular Devices 高內(nèi)涵成像分析系統(tǒng)適用于各種細胞模型中化合物的藥物開發(fā)或毒性評估。使用高內(nèi)涵成像和高級圖像分析的線粒體動力學分析方法不僅可以量化線粒體的表型變化,而且這種多參數(shù)方法也可用于研究正常和病理結(jié)構(gòu)變化以表征疾病模型或復合效應(yīng)。 主要特點 獲得高質(zhì)量的圖像,更好地顯示線粒體形狀和結(jié)構(gòu)的變化以更有效、更精確的方式量化和測量線粒體的表型變化了解疾病的機制并評估各種細胞模型中的化合物毒性參考文獻:[1]. Gottlieb RA, Bernstein D. Mitochondrial remodeling: Rearranging, recycling, and reprogramming. Cell Calcium, 2016, 60(2): 88–101.[2]. Yoon Y, Krueger EW , Oswald BJ , et al. The Mitochondrial Protein hFis1 Regulates Mitochondrial Fission in Mammalian Cells through an Interaction with the Dynamin-Like Protein DLP1. Molecular & Cellular Biology, 2003, 23(15):5409-5420.[3]. McLelland GL, Soubannier V, Chen CX, et al. Parkin and PINK1 function in a vesicular trafficking pathway regulating mitochondrial quality control. Embo Journal. 2014, 33(4):282-295.[4]. Twig G, Elorza A, Molina AJ, et al. Fission and selective fusion govern mitochondrial segregation and elimination by autophagy. Embo Journal. 2008, 27:433–446.[5]. Longo DL , Archer SL . Mitochondrial dynamics--mitochondrial fission and fusion in human diseases. New England Journal of Medicine, 2013, 369(23):2236-2251.[6]. Qi X, Disatnik MH, Shen N, et al. Aberrant mitochondrial fission in neurons induced by protein kinase C{delta} under oxidative stress conditions in vivo. Molecular biology of the cell. 2011, 22(2):256–265.[7]. Yu T, Sheu SS, Robotham JL, Yoon Y. Mitochondrial fission mediates high glucose-induced cell death through elevated production of reactive oxygen species. Cardiovascular Research. 2008, 79:341–351.[8]. Ong SB, Subrayan S, Lim SY, et al. Inhibiting Mitochondrial Fission Protects the Heart Against Ischemia/Reperfusion Injury. Circulation, 121(18), 2012-2022.[9]. Suen DF, Norris KL, Youle RJ. Mitochondrial dynamics and apoptosis. Genes Dev. 2008, 22:1577-590.[10]. Konopka AR, Suer MK, Wolff CA, et al. Markers of Human Skeletal Muscle Mitochondrial Biogenesis and Quality Control: Effects of Age and Aerobic Exercise Training. The Journals of Gerontology. 2014, 69(4):371-378.
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2025-02-17 14:30:16核磁共振成像成像特點是什么?
核磁共振成像成像特點 核磁共振成像(MRI)作為一種非侵入性醫(yī)學成像技術(shù),在現(xiàn)代醫(yī)學中得到了廣泛應(yīng)用。與傳統(tǒng)的X射線和CT掃描不同,核磁共振成像通過利用強磁場和射頻脈沖,生成高分辨率的內(nèi)部圖像,能夠清晰地呈現(xiàn)身體各個組織和器官的結(jié)構(gòu)。本文將深入探討核磁共振成像的成像特點,并闡明其在臨床應(yīng)用中的優(yōu)勢。 高分辨率的軟組織成像 核磁共振成像顯著的特點之一是其在軟組織成像方面的優(yōu)越性。傳統(tǒng)的成像技術(shù)如X射線或CT掃描主要依賴于硬組織的密度差異,而MRI則能夠提供軟組織的細節(jié)圖像。無論是腦組織、肌肉、關(guān)節(jié)還是器官,核磁共振都能提供清晰的圖像,這使得醫(yī)生在診斷時能夠準確識別各種疾病,如腦部腫瘤、脊柱疾病、心血管疾病等。 無輻射危害 與X射線和CT掃描等影像技術(shù)不同,核磁共振成像不會使用任何形式的電離輻射,這使得其在許多臨床情境下成為一種更加安全的選擇。特別是在需要多次檢查的情況下(如癌癥隨訪或慢性病監(jiān)控),MRI因其零輻射特性而具有明顯的優(yōu)勢。MRI對孕婦和兒童等敏感人群更為友好,是其在兒科和產(chǎn)科中應(yīng)用的關(guān)鍵因素之一。 多平面成像能力 核磁共振成像具有獨特的多平面成像能力,即能夠在不同的平面(如橫截面、冠狀面、矢狀面等)上進行成像。這一特點使得MRI能夠從多角度、多方位獲取圖像,極大提高了疾病診斷的精確度和可靠性。通過多平面重建,醫(yī)生可以清晰地了解患者病變區(qū)域的空間關(guān)系,從而進行更有效的診斷和。 組織對比度良好 核磁共振成像提供了較為優(yōu)異的組織對比度,這使得不同類型的組織在圖像中的分辨更加明顯。例如,腫瘤和正常組織的對比度非常高,幫助醫(yī)生識別腫瘤的邊界和形態(tài)特征。MRI技術(shù)還可以通過使用不同的序列(如T1、T2加權(quán)成像)來突出顯示不同類型的組織結(jié)構(gòu),這對于臨床中的診斷工作至關(guān)重要。 動態(tài)成像和功能性成像 隨著技術(shù)的不斷發(fā)展,MRI不僅能夠提供靜態(tài)的解剖學圖像,還能夠進行動態(tài)成像和功能性成像。例如,通過使用功能性MRI(fMRI)技術(shù),醫(yī)生可以觀察到大腦在執(zhí)行特定任務(wù)時的活動情況,這對于神經(jīng)科學的研究和疾病的診斷具有重要意義。MRI還可以通過動態(tài)對比增強成像(DCE-MRI)評估腫瘤的血流情況,進一步提高腫瘤的評估精度。 總結(jié) 核磁共振成像憑借其高分辨率軟組織成像、無輻射危害、多平面成像能力、優(yōu)異的組織對比度以及動態(tài)成像和功能性成像等特點,已成為醫(yī)學影像學領(lǐng)域中不可或缺的重要技術(shù)。隨著技術(shù)的不斷進步,MRI將繼續(xù)在疾病診斷和中發(fā)揮著越來越重要的作用,尤其在軟組織成像和復雜疾病的早期發(fā)現(xiàn)中具有不可替代的優(yōu)勢。 這篇文章結(jié)構(gòu)緊湊,內(nèi)容詳實,使用了相關(guān)的SEO關(guān)鍵詞,適合于優(yōu)化網(wǎng)站排名。如果您有任何特定要求或修改意見,可以告訴我,我會根據(jù)您的需要進一步調(diào)整。
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2025-05-19 11:15:18透射電子顯微鏡怎么成像
透射電子顯微鏡(Transmission Electron Microscope, TEM)作為現(xiàn)代科學研究中的一項重要工具,廣泛應(yīng)用于材料科學、生物學、化學等領(lǐng)域。它的工作原理和成像技術(shù)為我們揭示了物質(zhì)的微觀結(jié)構(gòu),尤其是能夠深入到納米級別,觀察細胞內(nèi)部的精細結(jié)構(gòu)以及各類材料的晶體結(jié)構(gòu)。本文將詳細介紹透射電子顯微鏡如何進行成像,探討其成像原理、過程及其優(yōu)勢,為理解其在科研中的重要作用提供清晰的視角。 透射電子顯微鏡的成像原理 透射電子顯微鏡通過利用電子束與樣品的相互作用進行成像。與傳統(tǒng)光學顯微鏡不同,透射電子顯微鏡使用高能電子束而非光線,因為電子波長遠小于可見光,從而能夠觀察到比光學顯微鏡更為細微的物質(zhì)結(jié)構(gòu)。當電子束通過樣品時,部分電子被樣品中的原子散射或透過,另一部分則未受影響。通過檢測這些不同的電子束,電子顯微鏡能夠繪制出樣品的詳細影像。 成像過程 電子束的生成與聚焦 透射電子顯微鏡的電子束通常由一個加速器產(chǎn)生并通過電磁透鏡聚焦成極細的電子束。加速后的電子束具有極高的能量,可以穿透很薄的樣品。 樣品的制備 樣品必須足夠薄,以便電子束能夠透過。一般來說,樣品的厚度需要控制在100nm以下,這樣電子才能順利通過并獲得清晰的成像。 與樣品的相互作用 當電子束與樣品的原子發(fā)生相互作用時,部分電子會被散射,部分則通過樣品。這些散射電子和透過電子的不同程度為成像提供了信息。 成像與放大 整個透射過程通過一系列的透鏡系統(tǒng),將透過樣品的電子聚焦到熒光屏或相機上,從而形成樣品的高分辨率圖像。不同的電子透過樣品的路徑、散射程度以及強度變化構(gòu)成了圖像的細節(jié)。 透射電子顯微鏡的優(yōu)勢 高分辨率 透射電子顯微鏡的大優(yōu)勢在于其超高的分辨率,能夠觀察到原子級別的細節(jié)。由于電子的波長比可見光波長短,它能揭示光學顯微鏡無法捕捉到的微觀結(jié)構(gòu)。 納米尺度觀察 TEM不僅能夠看到納米尺度的細節(jié),還是觀察材料、細胞、病毒等微觀結(jié)構(gòu)的首選工具,廣泛應(yīng)用于科學研究及臨床診斷中。 多功能性 除了成像,透射電子顯微鏡還可以進行化學成分分析(如電子能量損失譜、X射線能譜等),進一步提高了其應(yīng)用的廣泛性和準確性。 結(jié)語 透射電子顯微鏡作為現(xiàn)代科研不可或缺的工具,其高分辨率和獨特的成像原理使其在微觀結(jié)構(gòu)觀察中具有無可替代的地位。無論是在材料科學還是生物學領(lǐng)域,TEM為我們提供了觀察微觀世界的新視角和深度,使我們得以深入探索細胞、材料和納米結(jié)構(gòu)的復雜性。
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高通量藻類表型成像分析平臺