- 2025-01-10 10:53:30染色質(zhì)免疫沉淀
- 染色質(zhì)免疫沉淀(Chromatin Immunoprecipitation, ChIP)是一種用于研究DNA與蛋白質(zhì)相互作用的實(shí)驗(yàn)技術(shù)。該技術(shù)通過(guò)特定抗體與染色質(zhì)上結(jié)合的蛋白質(zhì)進(jìn)行免疫沉淀,從而富集與該蛋白質(zhì)結(jié)合的DNA片段。ChIP可用于分析特定基因在染色質(zhì)上的位置、研究蛋白質(zhì)-DNA相互作用在基因表達(dá)調(diào)控中的作用,以及探索表觀遺傳標(biāo)記如組蛋白修飾與DNA序列的關(guān)系。ChIP結(jié)合高通量測(cè)序技術(shù)(ChIP-seq)可揭示全基因組范圍內(nèi)的蛋白質(zhì)-DNA相互作用模式。
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染色質(zhì)免疫沉淀問(wèn)答
- 2018-11-26 18:04:49染色質(zhì)的成分
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- 2018-11-30 11:31:54染色質(zhì)免疫共沉淀的一般流程
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- 2019-07-03 14:25:10精神分裂癥的新發(fā)突變支持染色質(zhì)重塑在精神性疾病中的作用
- 精神分裂癥是一種嚴(yán)重且復(fù)雜的心理疾病,其致病機(jī)理尚未明確。Z近的一項(xiàng)研究1,在一組精神分裂癥病人中進(jìn)行新發(fā)突變(de novo mutation)的掃描,并將結(jié)果與其他精神性疾病如孤獨(dú)癥、智力低下等的突變進(jìn)行了比較,發(fā)現(xiàn)了這些疾病之間擁有相似的遺傳學(xué)背景,可能通過(guò)影響 大腦的表觀調(diào)控導(dǎo)致疾病發(fā)生。此次研究的樣本來(lái)自57個(gè)疾病患者家庭,其中15個(gè)家庭有家族性精神分裂史,其他病人為后發(fā)性精神分裂。對(duì)這些家庭的父母與患兒3人組,利用NimbleGen SeqCap EZ Exome v2.0捕獲人外顯子組序列,共完成了171個(gè)全外顯子組測(cè)。每個(gè)樣品平均獲得94.2M條序列,外顯子組的平均深度 67x,90%的序列有10x以上的覆蓋。在測(cè)序深度>10x的序列中發(fā)現(xiàn)的SNP,通過(guò)與其父母樣本中的突變、Exome Variant Server 6500及1000 Genomes的數(shù)據(jù)比較后,挑選出患者基因組中的新發(fā)突變,其中59個(gè)新發(fā)突變及6個(gè)Indel都通過(guò)了sanger測(cè)序驗(yàn)證。健康人群的外顯子組比較后發(fā)現(xiàn),在后發(fā)型精神分裂病人中發(fā)現(xiàn)異義突變頻率未有顯著提高,而無(wú)義新發(fā)突變頻率增加了3.5倍,且這些無(wú)義突變會(huì)使所在基因有更大的可能性發(fā)生單倍劑量不足。另外,從基因功能分析,這些無(wú)義突變所在的基因?qū)τ谕蛔內(nèi)萑潭鹊停≧VIS值高)。 表:前15%的RVIS(Residual variation intolerance score) 基因列表。摘自SE McCarthy et al. De novo mutations in schizophrenia implicate chromatin remodeling and support a genetic overlap with autism and intellectual disability. Mol Psychiatry. Molecular Psychiatry (2014), 17新發(fā)突變所在基因中,有一些已知與孤獨(dú)癥相關(guān),如AUTS2,CHD8 及MECP2;還有一些與智力低下有關(guān),如HUWE1及TRAPPC9,表明這三種疾病在疾病遺傳學(xué)背景上相互交錯(cuò)。在功能學(xué)上,CHD8,MECP2及HUWE1都在轉(zhuǎn)錄的表觀遺傳路徑中起到一定的作用,說(shuō)明表觀遺傳學(xué)的改變可能在疾病發(fā)SF展中起作用。這次研究的分析結(jié)果與其他神經(jīng)發(fā)育異常的外顯子組測(cè)序有相似的結(jié)論,即精神性疾病相關(guān)基因突變可能影響了大腦發(fā)育及認(rèn)知形成過(guò)程中表觀遺傳學(xué)的調(diào)控,這可能是致病機(jī)制的ZX,也可能是此類疾病ZL的靶點(diǎn)。1. SE McCarthy, J Gillis, M Kramer, J Lihm, S Yoon, Y Berstein, M Mistry, P Pavlidis, R Solomon, E Ghiban, E Antoniou, E Kelleher, C O’Brien, G Donohoe, M Gill, DW Morris, WR McCombie and A Corvin. De novo mutations in schizophrenia implicate chromatin remodeling and support a genetic overlap with autism and intellectual disability. Mol Psychiatry. advance online publication 29April2014; doi: 10.1038/mp.2014.29僅用于科研,不用于診斷
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- 2018-11-22 12:04:37蛋白酶的免疫沉淀,細(xì)胞裂解時(shí)要加蛋白酶YZ劑嗎
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- 2018-01-30 15:02:09蛋白酶的免疫沉淀,細(xì)胞裂解時(shí)要加蛋白酶YZ劑嗎
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