手工測(cè)序以及自動(dòng)測(cè)序均屬于DNA序列測(cè)定,手工測(cè)序可分為maxam-gilbert化學(xué)降解法與sanger雙脫氧鏈終止法,事實(shí)上,目前dna序列分析的主流是自動(dòng)測(cè)序。373型、377型、310型、3700和3100型等多種型號(hào)DNA測(cè)序儀均已經(jīng)被美國(guó)pe abi公司生產(chǎn)出來(lái)了,在這幾款DNA測(cè)序儀中,臨床檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室使用Z多的一種型號(hào)要屬310型。
HeliScope測(cè)序儀
Quake團(tuán)隊(duì)設(shè)計(jì)開(kāi)發(fā)了HeliScope 測(cè)序儀。
1、HeliScope 測(cè)序儀相同于454 測(cè)序儀,不同步完成測(cè)序,由每條模版的序列來(lái)決定測(cè)序速度,因?yàn)闈B入大量的未標(biāo)記堿基、不發(fā)光堿基和污染堿基,會(huì)有比較高的檢測(cè)確實(shí)突變的出錯(cuò)率,然而具有比較低的檢測(cè)堿基替換突變的誤差率。

2、精密的全內(nèi)反射顯微鏡技術(shù)為HeliScope測(cè)序儀所利用,在完成測(cè)序以后將延伸的合成鏈去掉,另一次測(cè)序從相反的方向再進(jìn)行,使得同一模板的第二個(gè)序列信息生成。原始數(shù)據(jù)準(zhǔn)確度由于雙向測(cè)序得到了顯著的提高。
3、熒光信號(hào)的增強(qiáng)需要用PCR擴(kuò)增來(lái)實(shí)現(xiàn)的技術(shù)難題被該方法克服了,更加靈敏的圖像傳感器在該方法中得到采用。能夠?qū)畏肿觗NTP攜帶的熒光基團(tuán)發(fā)出的信號(hào)檢測(cè)出來(lái),15 ms是單次的掃描時(shí)間。
Solexa基因組分析儀
Solexa 分析儀一般也被叫做Illumina 測(cè)序儀,克隆單分子陣列技術(shù)是其所使用的方法。
1、打斷目的DNA分子,使其變成100-200 bp的片段,在固相基質(zhì)上隨機(jī)連接,經(jīng)過(guò) Bst 聚合酶延伸和甲酸胺變性的橋PCR循環(huán),使得大量的DNA簇生成,大約有1000個(gè)相同序列的DNA 片段在每個(gè)DNA簇中。
2、之后的反應(yīng)類(lèi)似于Sanger法,將用4種不同熒光標(biāo)記并結(jié)合了可逆終止劑的 dNTP加入。有八道獨(dú)立檢測(cè)的位點(diǎn)在固相基質(zhì)上每個(gè)孔中,因此,八個(gè)獨(dú)立文庫(kù)能夠一次性并行,數(shù)百萬(wàn)的模版克隆能夠被容納,能夠檢測(cè)混合在一起的多個(gè)樣品,每個(gè)固相基質(zhì)上能夠讀取的堿基一次有10億個(gè)。
3、DNA簇和單鏈擴(kuò)增產(chǎn)物的通用序列雜交,因?yàn)榻K止劑的作用,DNA聚合酶每次循環(huán)僅有一個(gè) dNTP得到延伸,標(biāo)準(zhǔn)的微陣列光學(xué)檢測(cè)系統(tǒng)對(duì)每次延伸所產(chǎn)生的光信號(hào)進(jìn)行分析測(cè)序,下一次循環(huán)中裂解掉終止劑和熒光標(biāo)記基團(tuán),然后使dNTP繼續(xù)延伸,使邊合成邊測(cè)序技術(shù)得以實(shí)現(xiàn)。
4、因?yàn)楣庑盘?hào)衰減和移相的原因造成只有比較短的序列讀長(zhǎng),能夠進(jìn)行每個(gè) DNA 測(cè)序片段的閱讀長(zhǎng)度只有75 bp的末端雙向測(cè)序反應(yīng)。
Zda的基因組測(cè)序及研究應(yīng)用ZX之一位于深圳的華大基因研究院,華大基因承擔(dān)了人類(lèi)基因組計(jì)劃1%的工作任務(wù),之后又對(duì)國(guó)際HAPmap計(jì)劃進(jìn)行了參與與完成,并且將叫做“炎黃一號(hào)di一個(gè)ZG人也是di一個(gè)亞洲人的基因組測(cè)序完成了。
當(dāng)今世界,如果要評(píng)說(shuō)哪個(gè)地方會(huì)誕生傳奇,那么必定是高科技領(lǐng)域,從前DNA測(cè)序還作為一個(gè)前沿技術(shù)令人高山仰止,如今卻成為一個(gè)生命科學(xué)常規(guī)技術(shù),迅速地得到普及,目前為止,能夠和電腦芯片運(yùn)算能力增強(qiáng)的速度相媲美的也就只有DNA測(cè)序成本下降的速度,DNA測(cè)序的發(fā)展除了在降低成本方面得到了體現(xiàn),還在高通量測(cè)序大幅度提高了工作效率方面得以表現(xiàn),其鋪平了DNA測(cè)序產(chǎn)業(yè)化的道路。
21世紀(jì)di一個(gè)十年里,DNA測(cè)序與生物云計(jì)算、個(gè)性化分子診斷、基因芯片、人類(lèi)基因組計(jì)劃等等吸引無(wú)數(shù)眼球的熱門(mén)詞匯息息相關(guān)。在創(chuàng)意新天地里,生物技術(shù)和信息技術(shù)相互融合,相互作用,相互影響。
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