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應(yīng)用賽默飛Orbitrap對(duì)TMT 標(biāo)記樣本進(jìn)行MS2 定量
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本文由 賽默飛色譜及質(zhì)譜 整理匯編
2018-08-10 10:58 299閱讀次數(shù)
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前言目前,蛋白質(zhì)組學(xué)研究已經(jīng)由傳統(tǒng)的大規(guī)模鑒定逐步轉(zhuǎn)向了靶向蛋白質(zhì)組學(xué),研究?jī)?nèi)容已經(jīng)由蛋白質(zhì)鑒定擴(kuò)展到了蛋白質(zhì)相對(duì)和定量,蛋白質(zhì)相對(duì)定量方法中應(yīng)用Z普遍的為標(biāo)記定量,包括:ICAT,DIART,ICPL,TMT,iTRAQ等等,其中又以TMT以及iTRAQ的應(yīng)用Z為廣泛。傳統(tǒng)的TMT以及iTRAQ標(biāo)記實(shí)驗(yàn)均使用MS2碎片報(bào)告離子來進(jìn)行定量,但是StevenPGygi等人發(fā)現(xiàn)該方法由于母離子篩選過程易受到基質(zhì)干擾,因而定量結(jié)果與真實(shí)值相比偏低,而使用MS3碎片報(bào)告離子來進(jìn)行定量,則可以很好的解決這一問題,使用儀器:GX液相色譜儀ThermoScientificEasy-nLC1000如需詳細(xì)信息請(qǐng)下載,謝謝
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應(yīng)用賽默飛Orbitrap對(duì)TMT 標(biāo)記樣本進(jìn)行MS2 定量
- 前言目前,蛋白質(zhì)組學(xué)研究已經(jīng)由傳統(tǒng)的大規(guī)模鑒定逐步轉(zhuǎn)向了靶向蛋白質(zhì)組學(xué),研究?jī)?nèi)容已經(jīng)由蛋白質(zhì)鑒定擴(kuò)展到了蛋白質(zhì)相對(duì)和定量,蛋白質(zhì)相對(duì)定量方法中應(yīng)用Z普遍的為標(biāo)記定量,包括:ICAT,DIART,ICPL,TMT,iTRAQ等等,其中又以TMT以及iTRAQ的應(yīng)用Z為廣泛。傳統(tǒng)的TMT以及iTRAQ標(biāo)記實(shí)驗(yàn)均使用MS2碎片報(bào)告離子來進(jìn)行定量,但是StevenPGygi等人發(fā)現(xiàn)該方法由于母離子篩選過程易受到基質(zhì)干擾,因而定量結(jié)果與真實(shí)值相比偏低,而使用MS3碎片報(bào)告離子來進(jìn)行定量,則可以很好的解決這一問題,使用儀器:GX液相色譜儀ThermoScientificEasy-nLC1000如需詳細(xì)信息請(qǐng)下載,謝謝[詳細(xì)]
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2018-08-10 10:58
產(chǎn)品樣冊(cè)
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應(yīng)用Orbitrap Fusion對(duì)TMT標(biāo)記樣本進(jìn)行MS2 定量方法以及
- 應(yīng)用Orbitrap Fusion對(duì)TMT標(biāo)記樣本進(jìn)行MS2 定量方法以及[詳細(xì)]
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2015-02-17 00:00
其它
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賽默飛Target MS2 對(duì)大鼠血漿人重組干擾素定量
- 隨著蛋白質(zhì)組學(xué)的不斷發(fā)展,蛋白質(zhì)組學(xué)已廣泛深入到生物學(xué)研究的各個(gè)領(lǐng)域,目前,蛋白質(zhì)組學(xué)研究已經(jīng)由傳統(tǒng)的大規(guī)模鑒定逐步轉(zhuǎn)向了靶向蛋白質(zhì)組學(xué),研究?jī)?nèi)容已經(jīng)由蛋白質(zhì)鑒定擴(kuò)展到了蛋白質(zhì)相對(duì)和定量,對(duì)復(fù)雜樣本中蛋白質(zhì)的相對(duì)與定量有助于發(fā)現(xiàn)疾病的生物標(biāo)志物,對(duì)于研究各類疾病的發(fā)生與發(fā)展有著重要的意義。基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)定量方法主要有SILAC,TMT,iTRAQ以及應(yīng)用三重四級(jí)桿的MRM等,本文主要介紹了賽默飛世爾新一代臺(tái)式高分辨質(zhì)譜儀Q-Exactive在目標(biāo)蛋白質(zhì)定量方面的應(yīng)用。結(jié)果顯示Q-Exactive不僅可以在ng級(jí)上樣量情況下達(dá)到98%以上的蛋白質(zhì)氨基酸序列匹配度,同時(shí)應(yīng)用targetms2方法,可以很好的對(duì)復(fù)雜樣本中目標(biāo)蛋白質(zhì)進(jìn)行定量,其定量下限達(dá)到了amol,動(dòng)態(tài)范圍達(dá)到了6個(gè)數(shù)量級(jí),且線性相關(guān)系數(shù)在0.99以上[詳細(xì)]
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2018-08-10 10:58
產(chǎn)品樣冊(cè)
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賽默飛Orbitrap ID-X? Tribrid 質(zhì)譜儀
- 賽默飛Orbitrap ID-X? Tribrid 質(zhì)譜儀[詳細(xì)]
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2018-09-16 18:37
標(biāo)準(zhǔn)
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賽默飛Q Exactive中TMT定量工作流程的儀器參數(shù)優(yōu)化
- 關(guān)鍵詞QExactivePlus,QExactiveHF,TMT,ProteomeDiscoverer2.1,蛋白質(zhì)鑒定,相對(duì)定量,同量異序標(biāo)簽,多重定量研究目標(biāo)在ThermoScientificTMQExactiveTM儀器平臺(tái)上,采用ThermoScientificTMTMTsixplexTM和TMT10plexTM工作流程,建立Zyou的質(zhì)譜數(shù)據(jù)采集方法將其應(yīng)用于蛋白質(zhì)的相對(duì)定量研究中。文詳細(xì)介紹了該工作流程所涉及的樣品前處理、肽段分離和質(zhì)譜分析等過程,以及采用ThermoScientificTMProteomeDiscovererTM軟件2.1版本對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行處理和分析的具體流程。使用儀器:QExactivePlus[詳細(xì)]
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2018-08-10 10:58
產(chǎn)品樣冊(cè)
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賽默飛Orbitrap Astral 高分辨質(zhì)譜儀
- Orbitrap Astral 高分辨質(zhì)譜儀[詳細(xì)]
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2024-04-09 09:46
應(yīng)用文章
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賽默飛Orbitrap Astral 高分辨質(zhì)譜儀
- 1.· 具有Z新的離子源,以提高靈敏度 · EASY-IC實(shí)時(shí)質(zhì)量校準(zhǔn),以提高質(zhì)量精度 · 通過主動(dòng)離子導(dǎo)向的預(yù)過濾器降低噪音,提高儀器耐用性 · 先進(jìn)的四極桿技術(shù),提高傳輸,使隔離寬度降低到0.4 Th,更快的隔離切換時(shí)間僅為1 ms,并能實(shí)現(xiàn)自動(dòng),切換以提高耐用性。 2.Orbitrap質(zhì)量分析器——在超高分辨率水平上提供高質(zhì)量精度,高動(dòng)態(tài)范圍的測(cè)量結(jié)果。 3.新型的Astral質(zhì)量分析器 Orbitrap Astral 高分辨質(zhì)譜儀并不止于此。我們已經(jīng)開發(fā)了一種全新的非對(duì)稱軌道無損質(zhì)量分析器,簡(jiǎn)稱Astral,與Orbitrap質(zhì)量分析器相輔相成。Astral質(zhì)量分析器是賽默飛15年的研發(fā)成果,每個(gè)組件都經(jīng)過協(xié)同優(yōu)化,以更快的掃描速度和更高的靈敏度提供前所未有的性能水平。[詳細(xì)]
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2024-04-09 09:53
應(yīng)用文章
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賽默飛Orbitrap Astral 高分辨質(zhì)譜儀
- 1.· 具有Z新的離子源,以提高靈敏度 · EASY-IC實(shí)時(shí)質(zhì)量校準(zhǔn),以提高質(zhì)量精度 · 通過主動(dòng)離子導(dǎo)向的預(yù)過濾器降低噪音,提高儀器耐用性 · 先進(jìn)的四極桿技術(shù),提高傳輸,使隔離寬度降低到0.4 Th,更快的隔離切換時(shí)間僅為1 ms,并能實(shí)現(xiàn)自動(dòng),切換以提高耐用性。 2.Orbitrap質(zhì)量分析器——在超高分辨率水平上提供高質(zhì)量精度,高動(dòng)態(tài)范圍的測(cè)量結(jié)果。 3.新型的Astral質(zhì)量分析器 Orbitrap Astral 高分辨質(zhì)譜儀并不止于此。我們已經(jīng)開發(fā)了一種全新的非對(duì)稱軌道無損質(zhì)量分析器,簡(jiǎn)稱Astral,與Orbitrap質(zhì)量分析器相輔相成。Astral質(zhì)量分析器是賽默飛15年的研發(fā)成果,每個(gè)組件都經(jīng)過協(xié)同優(yōu)化,以更快的掃描速度和更高的靈敏度提供前所未有的性能水平。[詳細(xì)]
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2024-04-09 09:57
應(yīng)用文章
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賽默飛 Orbitrap Exploris MX 質(zhì)量檢測(cè)器
- 賽默飛 Orbitrap Exploris MX 質(zhì)量檢測(cè)器[詳細(xì)]
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2025-07-31 15:38
產(chǎn)品樣冊(cè)
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賽默飛Orbitrap Elite? 組合式質(zhì)譜儀產(chǎn)品樣冊(cè)
- 賽默飛Orbitrap Elite? 組合式質(zhì)譜儀產(chǎn)品樣冊(cè)[詳細(xì)]
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2024-09-20 13:35
報(bào)價(jià)單
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賽默飛水質(zhì)分析實(shí)驗(yàn)室樣本
- 賽默飛水質(zhì)分析實(shí)驗(yàn)室樣本[詳細(xì)]
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2020-07-22 11:24
選購(gòu)指南
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賽默飛PepFinder 軟件對(duì)單克隆抗體進(jìn)行肽圖分析
- 在蛋白質(zhì)藥物產(chǎn)品的質(zhì)控要求中,肽圖分析是其中重要的一環(huán)。肽圖分析包括對(duì)蛋白氨基酸序列進(jìn)行確證及相關(guān)修飾的鑒定和定量。根據(jù)蛋白藥物質(zhì)譜分析特點(diǎn)和生物制藥應(yīng)用的特殊需求,ThermoFisher與Amgen聯(lián)合開發(fā)了PepFinderTM軟件。PepFinder不僅具有Z基本的肽段序列確證、覆蓋率分析、修飾位點(diǎn)鑒定與定量、二硫鍵分析、圖譜對(duì)比和肽段CID/HCD/ETD譜圖解析等功能,還具有其獨(dú)特功能,如未知修飾搜索功能和氨基酸突變搜索功能[1-5]。這兩項(xiàng)功能可以幫助分析人員快速發(fā)現(xiàn)可能出現(xiàn)的序列突變,從而大大降低出現(xiàn)質(zhì)量風(fēng)險(xiǎn)的幾率。同時(shí),PepFinder還有更多實(shí)用的功能設(shè)計(jì),如內(nèi)置CHO細(xì)胞系糖型、具有肽段鑒定可信度評(píng)價(jià)功能,還可根據(jù)碎裂方式和能量智能預(yù)測(cè)多肽的理論碎裂譜圖,并用于與實(shí)驗(yàn)圖譜直觀對(duì)比,以輔助分析。這些功能不但減少工作強(qiáng)度,也降低了對(duì)分析員理解質(zhì)譜數(shù)據(jù)深度的要求。對(duì)于氨基酸固定修飾設(shè)置,不同于其它類似軟件(固定修飾只可極ng確至某一類氨基酸),在PepFinder中,可以極ng確到特定的某個(gè)氨基酸位點(diǎn)。此功能對(duì)于蛋白藥的某些特殊分析需求提供了極大的便利。如需要詳細(xì)了解請(qǐng)?jiān)L問商鋪:賽默飛商鋪[詳細(xì)]
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2018-08-10 10:58
產(chǎn)品樣冊(cè)
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賽默飛Exactive? GC Orbitrap? GC-MS系統(tǒng)產(chǎn)品樣冊(cè)
- 賽默飛Exactive? GC Orbitrap? GC-MS系統(tǒng)產(chǎn)品樣冊(cè)[詳細(xì)]
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2016-10-20 09:51
操作手冊(cè)
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賽默飛 Orbitrap Exploris 480 組合型超高分辨質(zhì)譜儀
- 賽默飛 Orbitrap Exploris 480 組合型超高分辨質(zhì)譜儀[詳細(xì)]
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2025-08-01 14:55
產(chǎn)品樣冊(cè)
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應(yīng)用Target MS2 方法對(duì)大鼠血漿中人重組干擾素進(jìn)行
- 應(yīng)用Target MS2 方法對(duì)大鼠血漿中人重組干擾素進(jìn)行[詳細(xì)]
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2015-02-17 00:00
安裝說明
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賽默飛ZG應(yīng)用開發(fā)ZX
- 賽默飛ZG應(yīng)用開發(fā)ZX[詳細(xì)]
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2024-09-20 03:43
課件
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賽默飛Vanquish? Duo UHPLC 系統(tǒng) 樣本
- Thermo Scientific? Vanquish? Duo UHPLC 系統(tǒng),將兩套梯度流路整合在一個(gè)超GX液相系統(tǒng)里,并能實(shí)現(xiàn)三種不同工作流程(雙LC,串聯(lián)液相或LCMS質(zhì)譜前端,以及反梯度)這些工作流程可通過節(jié)約時(shí)間、減少每份樣品的成本、在不額外增加工作臺(tái)面的情況下提高儀器設(shè)備容量并更加GX地利用資源,以提升生產(chǎn)率。[詳細(xì)]
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2018-04-28 12:48
產(chǎn)品樣冊(cè)
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賽默飛飲用水行業(yè)的應(yīng)用解決方案
- 賽默飛飲用水行業(yè)的應(yīng)用解決方案[詳細(xì)]
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2012-06-12 00:00
課件
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賽默飛AppsLab分析應(yīng)用云數(shù)據(jù)庫(kù)
- 賽默飛AppsLab分析應(yīng)用云數(shù)據(jù)庫(kù)[詳細(xì)]
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2016-07-21 00:00
標(biāo)準(zhǔn)
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賽默飛Q Exactive? UHMR 組合型四極桿 Orbitrap? 質(zhì)譜儀
- 賽默飛Q Exactive? UHMR 組合型四極桿 Orbitrap? 質(zhì)譜儀[詳細(xì)]
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2018-09-16 18:06
標(biāo)準(zhǔn)
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