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如何運用克隆文庫法分析土壤真菌微生物多樣性

何炅提及 2017-01-08 02:25:03 438  瀏覽
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  • 拿破侖兩千 2017-01-09 00:00:00
    如何運用克隆文庫法分析土壤真菌微生物多樣性 按照我理解的“土壤中微生物的種類”是指古菌、細菌、真菌等生命體而不包括藻類、原生動物等低等動植物. 土壤中微生物的種類數(shù)量的調(diào)查屬于微生態(tài)區(qū)系分析的范疇. 一般說來,我們所開展的研究工作主要采用以下兩類方法進行研究分析: 1、經(jīng)典的選擇培養(yǎng)法: 即采用選擇培養(yǎng)的方法,對土壤樣品中的細菌、放線菌、酵母菌、絲狀真菌等幾大類微生物進行分類培養(yǎng),還可以采用詳細的選擇培養(yǎng)方式比如無氮培養(yǎng)基培養(yǎng)固氮微生物、利用MPN法測定氮循環(huán)微生物等等,從功能角度再細分一下微生物的種類組成;還可以通過寡營養(yǎng)、富營養(yǎng)、長周期培養(yǎng)等方法做進一步詳細的分析. 此類方法工作量大,分析精度和全面性都有一定的局限性.但同時是任何層面的研究都不可以忽略的方式方法,是獲得微生物菌種資源純培養(yǎng)以進行深入研究的唯yi方法. 2、分子微生態(tài)學(xué)方法 是基于DNA分析和測序基礎(chǔ)上的分子微生態(tài)學(xué)研究方法,常用的有DGGE(變性梯度凝膠電泳)、克隆文庫構(gòu)建、T-RFLP以及宏基因組技術(shù),對樣品中的DNA進行電泳乃至測序分析,從分子水平確定樣品中微生物的種類和數(shù)量. 從全面性和深度以及工作效率方面都教常規(guī)方法有大幅度提升,但目前仍然有不成熟的地方.另外其成本遠高于常規(guī)方法.

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