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生物酶催化原理

害怕害怕還好 2009-04-21 06:41:56 598  瀏覽
  • 如題,化學(xué)催化劑雖然也能起催化作用,但其效率遠(yuǎn)不如生物酶。我想知道一些生物酶的催化機(jī)理。答得好的會(huì)追加點(diǎn)分,謝謝大家的幫忙!... 如題,化學(xué)催化劑雖然也能起催化作用,但其效率遠(yuǎn)不如生物酶。我想知道一些生物酶的催化機(jī)理。 答得好的會(huì)追加點(diǎn)分,謝謝大家的幫忙! 展開(kāi)

參與評(píng)論

全部評(píng)論(6條)

  • 柯拉尼櫥柜 2009-04-23 00:00:00
    不同的酶機(jī)理不同,只能說(shuō)酶催化是一幾級(jí)反應(yīng),而化學(xué)催化是2級(jí)或3級(jí)4級(jí)反應(yīng)所需要的活化能更高一些條件更苛刻而以。

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    評(píng)論

  • hqh何 2009-04-23 00:00:00
    酶的催化原理是降低反應(yīng)所需的活化能,使反應(yīng)在能量較低時(shí)就能發(fā)生,與加熱是兩種不同的方法。

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    評(píng)論

  • awardui 2009-04-22 00:00:00
    建議讀讀 :酶工程》 郭勇主編的。高等教育出版。

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  • xzr48169 2009-04-22 00:00:00
    生物酶的作用機(jī)理 酶蛋白與其它蛋白質(zhì)的不同之處在于酶都具有活性ZX。酶可分為四級(jí)結(jié)構(gòu):一級(jí)結(jié)構(gòu)是氨基酸的排列順序;二級(jí)結(jié)構(gòu)是肽鏈的平面空間構(gòu)象;三級(jí)結(jié)構(gòu)是肽鏈的立體空間構(gòu)象;四級(jí)結(jié)構(gòu)是肽鏈以非共價(jià)鍵相互結(jié)合成為完整的蛋白質(zhì)分子。真正起決定作用的是酶的一級(jí)結(jié)構(gòu),它的改變將改變酶的性質(zhì)(失活或變性)。酶的作用機(jī)理比較被認(rèn)同的是Koshland的“誘導(dǎo)契合”學(xué)說(shuō),其主要內(nèi)容是:當(dāng)?shù)孜锝Y(jié)合到酶的活性部位時(shí),酶的構(gòu)象有一個(gè)改變。催化基團(tuán)的正確定向?qū)τ诖呋饔檬潜匾?。底物誘導(dǎo)酶蛋白構(gòu)象的變化,導(dǎo)致催化基團(tuán)的正確定位與底物結(jié)合到酶的活性部位上去。

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  • hbswjy9998 2009-04-22 00:00:00
    生物酶只能催化一種物質(zhì),所以人體內(nèi)的生物酶有很多種類型.酶與指定的一種物質(zhì)發(fā)生化合反應(yīng),生成的化合物再與其他物質(zhì)發(fā)生復(fù)分解反應(yīng)(大部分是),在生成物中含有原來(lái)的生物酶,并且等量!這個(gè)過(guò)程中,酶起到“鑰匙”的作用。

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    評(píng)論

  • jumbo_劉 2009-04-22 00:00:00
    酶的反應(yīng)機(jī)理如下: 蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)去看,而不能孤立地看形成蛋白質(zhì)后的氨基酸殘基。因?yàn)槊敢话愣际蔷哂腥?jí),或四級(jí)空間結(jié)構(gòu)的,其中有功能的是部分氨基酸殘基形成的結(jié)構(gòu)域,包括底物結(jié)合部位和催化部位。首先底物結(jié)合部位和底物結(jié)合,再由催化部位作用,形成過(guò)渡態(tài)中間體,進(jìn)而使底物發(fā)生化學(xué)變化。 生物學(xué)中的酶是具有高活性的蛋白分子。它的作用機(jī)理 有很多種,如趨近作用,親核作用,親電子作用等。 它具有GX性,專一性,條件性(條件嚴(yán)格,因?yàn)榈鞍踪|(zhì)容易變性) 而化學(xué)里講的催化劑只具有一般的催化作用, 其作用機(jī)理是降低化學(xué)反映的活化能。 ----------------------------------------------------------- 生化中酶的作用機(jī)理: 酶的作用機(jī)理 酶催化反應(yīng)機(jī)理的研究是當(dāng)代生物化學(xué)的一個(gè)重要課題。它探討酶作用GX率的原因以及酶反應(yīng)的重要中間步驟。 酶原的激活(proenzyme activation)著重研究酶在激活——由無(wú)活性的酶原轉(zhuǎn)變成有活性的酶時(shí)構(gòu)象發(fā)生的變化。 一、與酶的GX率有關(guān)的因素 據(jù)現(xiàn)在所知,重要的因素有以下幾個(gè)方面: 1.底物與酶的“靠近”(proximity)及“定向”(orientation) 由于化學(xué)反應(yīng)速度與反應(yīng)物濃度成正比,若在反應(yīng)系統(tǒng)的某一局部區(qū)域,底物濃度,則反應(yīng)速度也隨之。提高酶反應(yīng)速度的Z主要方法是使底物分子進(jìn)入酶的活性ZX區(qū)域,亦即大大提高活性ZX區(qū)域的底物有效濃度。曾測(cè)到過(guò)某底物在溶液中的濃度為0.001mol/L,而在其酶活性ZX的濃度竟達(dá)100mol/L,比溶液中的濃度高十萬(wàn)倍!因此,可以想象在酶的活性ZX區(qū)域反應(yīng)速度必定是極高的。 “靠近“效應(yīng)對(duì)提高反應(yīng)速度的作用可以用一個(gè)的有機(jī)化學(xué)實(shí)驗(yàn)來(lái)說(shuō)明,如表4-12,雙羧酸的單苯基酯,在分子內(nèi)催化的過(guò)程中,自由的羧基作為催化劑起作用,而連有R的酯鍵則作為底物,受—COO-的催化,破裂成環(huán)而形成酸酐,催化基團(tuán)—COO-愈靠近底物酯鍵則反應(yīng)速度愈快,在Z靠近的情況下速度可增加53000倍。 但是僅僅“靠近”還不夠,還需要使反應(yīng)的基團(tuán)在反應(yīng)中彼此相互嚴(yán)格地“定向”,見(jiàn)圖4-19。只有既“靠近”又“定向”,反應(yīng)物分子才被作用,迅速形成過(guò)渡態(tài)。 當(dāng)?shù)孜镂磁c酶結(jié)合時(shí),活性ZX的催化基團(tuán)還未能與底物十分靠近,但由于酶活性ZX的結(jié)構(gòu)有一種可適應(yīng)性,即當(dāng)專一性底物與活性ZX結(jié)合時(shí),酶蛋白會(huì)發(fā)生一定的構(gòu)象變化,使反應(yīng)所需要的酶中的催化基團(tuán)與結(jié)合基團(tuán)正確地排列并定位,以便能與底物楔合,使底物分子可以“靠近”及“定向”于酶,這也就是前面提到的誘導(dǎo)楔合。這樣活性ZX局部的底物濃度才能大大提高。酶構(gòu)象發(fā)生的這種改變是反應(yīng)速度增大的一種很重要的原因。反應(yīng)后,釋放出產(chǎn)物,酶的構(gòu)象再逆轉(zhuǎn),回到它的初始狀態(tài)。對(duì)溶菌酶及羧肽酶進(jìn)行的X-衍射分析的實(shí)驗(yàn)結(jié)果證實(shí)了以上的看法。Jenck等人指出“靠近“及“定向”可能使反應(yīng)速度增長(zhǎng)108倍,這與許多酶催化效率的計(jì)算是很相近的。 2.酶使底物分子中的敏感鍵發(fā)生“變形”(域張力)(distortion或strain),從而促使底物中的敏感鍵更易于破裂。 前面曾經(jīng)提到,當(dāng)酶遇到它的專一性底物時(shí),發(fā)生構(gòu)象變化以利于催化。事實(shí)上,不僅酶構(gòu)象受底物作用而變化,底物分子常常也受酶作用而變化。酶中的某些基團(tuán)或離子可以使底物分子內(nèi)敏感鍵中的某些基團(tuán)的電子云密度或降低,產(chǎn)生“電子張力”,使敏感鍵的一端更加敏感,更易于發(fā)生反應(yīng)。有時(shí)甚至使底物分子發(fā)生變形,見(jiàn)圖4-20A,這樣就使酶-底物復(fù)合物易于形成。而且往往是酶構(gòu)象發(fā)生改變的同時(shí),底物分子也發(fā)生形變,見(jiàn)圖 4-20 B,從而形成一個(gè)互相楔合的酶-底物復(fù)合物。羧肽酶A的X-衍射分析結(jié)果就為這種“電子張力”理論提供了證據(jù)。 3.共價(jià)催化(covalent catalysis) 還有一些酶以另一種方式來(lái)提高催化反應(yīng)的速度,即共價(jià)催化。這種方式是底物與酶形成一個(gè)反應(yīng)活性很高的共價(jià)中間物,這個(gè)中間物很易變成過(guò)渡態(tài),因此反應(yīng)的活化能大大降低,底物可以越過(guò)較低的“能閾”而形成產(chǎn)物。 共價(jià)催化可以提高反應(yīng)速度的原因需要從有機(jī)模式反應(yīng)的某些原理談起,共價(jià)催化的Z一般形式是催化劑的親核基團(tuán)(nucleophilic group)對(duì)底物中親電子的碳原子進(jìn)行攻擊。親核基團(tuán)含有多電子的原子,可以提供電子。它是十分有效的催化劑。親核基團(tuán)作為強(qiáng)有力的催化劑對(duì)提高反應(yīng)速度的作用可由下面親核基團(tuán)催化?;姆磻?yīng)中看出:diyi步,親核基團(tuán)(催化劑Y)攻擊含有?;姆肿?,形成了帶有親核基團(tuán)的?;苌?,這種催化劑的酰基衍生物作為一個(gè)共價(jià)中間物再起作用;第二步,?;鶑挠H核的催化劑上再轉(zhuǎn)移到Z終的酰基受體上, (1)親核基團(tuán)(Y)催化的反應(yīng): (2)非催化的反應(yīng): 這種受體分子可能是某些醇或水。diyi步反應(yīng)有催化劑參加,因此必然比沒(méi)有催化劑時(shí)底物與?;荏w的反應(yīng)更快一些;而且,因?yàn)榇呋瘎┦且鬃兊挠H核基團(tuán),因此如此形成的?;呋瘎┡cZ終的?;荏w的反應(yīng)也必然地要比無(wú)催化劑時(shí)的底物與?;荏w的反應(yīng)更快一些,此兩步催化的總速度要比非催化反應(yīng)大得多。因此形成不穩(wěn)定的共價(jià)中間物可以大大加速反應(yīng)。酶反應(yīng)中可以進(jìn)行共價(jià)催化的、強(qiáng)有力的親核基團(tuán)很多,酶蛋白分子上至少就有三種,即圖4-21中所指出的絲氨酸羥基、半胱氨酸巰基及組氨酸的咪唑基。此外,輔酶中還含有另外一些親核ZX。共價(jià)結(jié)合也可以被親電子基團(tuán)(electrophilic group)催化,Z典型的親電子 等也都屬于此類,它們可以接受電子或供出電子。 下面將通過(guò)共價(jià)催化而提高反應(yīng)速度的酶,按提供親核(或親電子)基團(tuán)的氨基酸種類,分別歸納如表4-13: 絲氨酸類酶與?;纬甚;?酶;或與磷酸基形成磷酸酶,如磷酸葡萄糖變位酶。半胱氨酸類酶活性ZX的半胱氨酸巰基與底物?;纬珊矁r(jià)硫酯鍵的中間物。組氨酸類酶活性ZX的組氨酸咪唑基在反應(yīng)中被磷酸化。賴氨酸類酶的賴氨酸ε-氨基與底物羰基形成西佛堿中間物。 4.酸堿催化(acid-base ctatlysis) 有機(jī)模式反應(yīng)指出,酸堿催化劑是催化有機(jī)反應(yīng)的Z普遍的Z有效的催化劑。 有兩種酸堿催化劑,一是狹義的酸堿催化劑(specific acid-base catalyst),即H+與OH-,由于酶反應(yīng)的Z適pH一般接近于中性,因此H+及OH-的催化在酶反應(yīng)中的重要性是比較有限的。另一種是廣義的酸堿催化劑(general acid-base catalyst),指的是質(zhì)子供體及質(zhì)子受體的催化,它們?cè)诿阜磻?yīng)中的重要性大得多,發(fā)生在細(xì)胞內(nèi)的許多種類型的有機(jī)反應(yīng)都是受廣義的酸堿催化的,例如將水加到羰基上、羧酸酯及磷酸酯的水解,從雙鍵上脫水、各種分子重排以及許多取代反應(yīng)等。 酶蛋白中含有好幾種可以起廣義酸堿催化作用的功能基,如氨基、羧基、硫氫基、酚羥基及咪唑基等。見(jiàn)表4-14。其中組氨酸的咪唑基值得特別注意,因?yàn)樗仁且粋€(gè)很強(qiáng)的親核基團(tuán),又是一個(gè)有效的廣義酸堿功能基。 影響酸堿催化反應(yīng)速度的因素有兩個(gè),diyi個(gè)是酸堿的強(qiáng)度,在這些功能基中,組氨酸咪唑基的解離常數(shù)約為6.0,這意味著由咪唑基上解離下來(lái)的質(zhì)子的濃度與水中的[H+]相近,因此它在接近于生物體液pH的條件下,即在中性條件下,有一半以酸形式存在,另一半以堿形式存在。也就是說(shuō)咪唑基既可以作為質(zhì)子供體,又可以作為質(zhì)子受體在酶反應(yīng)中發(fā)揮催化作用。因此,咪唑基是催化中Z有效Z活潑的一個(gè)催化功能基。第二個(gè)是這種功能基供出質(zhì)子或接受質(zhì)子的速度,在這方面,咪唑基又是特別突出,它供出或接受質(zhì)子的速度十分迅速,其半壽期小于10-10秒。而且,供出或接受質(zhì)子的速度幾乎相等。由于咪唑基有如此的優(yōu)點(diǎn),所以雖然組氨酸在大多數(shù)蛋白質(zhì)中含量很少,卻很重要。推測(cè)它很可能在生物進(jìn)化過(guò)程中,不是作為一般的結(jié)構(gòu)蛋白成分,而是被選擇作為酶分子中的催化結(jié)構(gòu)而存在下來(lái)的。 廣義的酸堿催化與共價(jià)催化可使酶反應(yīng)速度大大提高,但是比起前面兩種方式來(lái),它們提供的速度增長(zhǎng)較小。盡管如此,還必須看到它們?cè)谔岣呙阜磻?yīng)速度中起的重要作用,尤其是廣義酸堿催化還有獨(dú)到之處:它為在近于中性的pH下進(jìn)行催化創(chuàng)造了有利條件。因?yàn)樵谶@種接近中性pH的條件下,H+及OH-的濃度太低,不足以起到催化劑的作用。例如牛胰核糖核酸酶及牛凝乳蛋白酶等都是通過(guò)廣義的酸堿催化而提高酶反應(yīng)速度的。 5.酶活性ZX是低介電區(qū)域 上面討論了提高酶反應(yīng)速度的四個(gè)主要因素。此外,還有一個(gè)事實(shí)必須注意,即某些酶的活性ZX穴內(nèi)相對(duì)地說(shuō)是非極性的,因此,酶的催化基團(tuán)被低介電環(huán)境所包圍,在某些情況下,還可能排除高極性的水分子。這樣,底物分子的敏感鍵和酶的催化基團(tuán)之間就會(huì)有很大的反應(yīng)力,這是有助于加速酶反應(yīng)的。酶活性ZX的這種性質(zhì)也是使某些酶催化總速度增長(zhǎng)的一個(gè)原因。 為什么處于低介電環(huán)境中的基團(tuán)之間的反應(yīng)會(huì)得到加強(qiáng)?可以用水減弱極性基團(tuán)間的相互作用來(lái)解釋。水的極性和形成氫鍵能力使它成為一種具有高度作用力的分子,水的介電常數(shù)非常高(表4-15)。它的高極性使它在離子外形成定向的溶劑層(oriented solvent shell),產(chǎn)生自身的電場(chǎng),結(jié)果就大大減弱了它所包圍的離子間的靜電相互作用或氫鍵作用。 上面介紹了實(shí)現(xiàn)酶反應(yīng)GX率的幾個(gè)因素,但是并不能指出哪一種因素可以影響所有酶的全部催化活性。更可能的情況是:不同的酶,起主要影響的因素可能是不同的,各自都有其特點(diǎn),可以受一種或幾種因素的影響。 ------------------------------------------------------ 催化劑(化學(xué)中)的作用: 酶作用在于降低反應(yīng)活化能(Energy of activation EACT): 酶促反應(yīng)速度比非催化反應(yīng)高108~1020倍,比一般催化反應(yīng)高107~1013。 化學(xué)反應(yīng)速率依賴三個(gè)因素:碰撞頻率、能量因素、概率因素(有效碰撞)。 有效碰撞:能發(fā)生化學(xué)反應(yīng)的分子間碰撞。 活化分子:能發(fā)生有效碰撞的分子。 活化能:在任何化學(xué)反應(yīng)中,反應(yīng)物分子必須超過(guò)一定的能閾,成為活化的狀態(tài),才能發(fā)生變化,形成產(chǎn)物。這種比一般分子高出的能量或提高低能分子達(dá)到活化狀態(tài)的能量,稱為活化能。

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