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基因診斷的方法有哪幾種

愛發(fā)狂的貓11 2017-02-09 12:15:34 566  瀏覽
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  • 小啦啦gg 2017-02-10 00:00:00
    基因診斷(gene diagnosis)是以探測基因的存在,分析基因的類型和缺陷及其表達(dá)功能是否正常,從而達(dá)到診斷疾病的一種方法。它是繼形態(tài)學(xué)、生物化學(xué)和免疫學(xué)診斷之后的第四代診斷技術(shù),它的誕生與發(fā)展得益于分子生物學(xué)理論和技術(shù)的迅速發(fā)展。   常用基因診斷技術(shù):   一、Southern印跡法(Southern blot)   基本原理是:硝酸纖維膜或尼龍濾膜對單鏈DNA的吸附能力很強(qiáng),當(dāng)電泳后凝膠經(jīng)過DNA變性處理,覆以上述濾膜,再于其上方壓上多層干燥的吸水紙,借助它對深鹽溶液的上吸作用,凝膠上的單鏈DNA將轉(zhuǎn)移到濾膜上。轉(zhuǎn)移是原位的,即DNA片段的位置保持不變。轉(zhuǎn)移結(jié)束后,經(jīng)過80℃烘烤的DNA,將原位地固定于膜上。   當(dāng)含有特定基因片段已原位轉(zhuǎn)移到膜上后,即可與同位素標(biāo)記了的探針進(jìn)行雜交,并將雜交的信號顯示出來。雜交通常在塑料袋中進(jìn)行,袋內(nèi)放置上述雜交濾膜,加入含有變性后探針的雜交溶液后,在一定溫度下讓單鏈探針DNA與固定于膜上的單鏈基因DNA分子按堿基到互補(bǔ)原理充分結(jié)合。結(jié)合是特異的,例如只有β珠蛋白基因DNA才能結(jié)合上β珠蛋白的探針。雜交后,洗去膜上的未組合的探針,將Ⅹ線膠片覆于膜上,在暗盒中日光進(jìn)行放射自顯影。結(jié)合了同位素標(biāo)記探針的DNA片段所在部位將顯示黑色的雜交帶,基因的缺失或突變則可能導(dǎo)致帶的缺失或位置改變。   二、聚合酶鏈反應(yīng)   近年來,基因分析和基因工程技術(shù)有了革命性的突破,這主要?dú)w功于聚合酶鏈反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR)的發(fā)展和應(yīng)用。應(yīng)用PCR技術(shù)可以使特定的基因或DNA片段在短短的2-3小時內(nèi)體外擴(kuò)增數(shù)十萬至百萬倍。擴(kuò)增的片段可以直接通過電泳觀察,也可用于進(jìn)一步的分析。這樣,少量的單拷貝基因不需通過同位素提高其敏感性來觀察,而通過擴(kuò)增至百萬倍后直接觀察到,而且原先需要一、二周才能作出的診斷可以縮短至數(shù)小時。   三、擴(kuò)增片段長度多態(tài)性   小衛(wèi)星DNA和微衛(wèi)星DNA的長度多態(tài)性可以通過PCR擴(kuò)增后電泳來檢出,并用于致病基因的連鎖分析,這種診斷方法稱為擴(kuò)增片段長度多態(tài)性(amplified fragment length polymorphism,Amp-FLP)連鎖分析法。PCR擴(kuò)增后,產(chǎn)物即等位片段之間的差別有時只有幾個核苷酸,故需用聚丙烯酰胺凝膠電泳分離鑒定。此法多用于突變性質(zhì)不明的連鎖分析.   四、等位基因的特異寡核苷酸探針診斷法   當(dāng)基因的突變部位和性質(zhì)已完全明了時,可以合成等基因特異的寡核苷酸探針(allele-specific oligonucleotide,ASO)用同位素或非同位素標(biāo)記進(jìn)行診斷。探針通常為長20bp左右的核苷酸。用于探測點(diǎn)突變時一般需要合成兩種探針,與正?;蛐蛄型耆恢?,能與之穩(wěn)定地雜交,但不能與突變基因序列雜交;另一種與突變基因序列一致,能與突變基因序列穩(wěn)定雜交,但不能與正?;蛐蛄蟹€(wěn)定雜交,這樣,就可以把只有一個堿基發(fā)生了突變的基因區(qū)別開來.   PCR可結(jié)合ASO,即PCR-ASO技術(shù),即先將含有突變點(diǎn)的基因有關(guān)片段進(jìn)行體外擴(kuò)增,然后再與ASO探針作點(diǎn)雜交,這樣大大簡化了方法,節(jié)約了時間,而且只要極少量的基因組DNA就可進(jìn)行。   五、單鏈構(gòu)象多態(tài)性診斷法   單鏈構(gòu)象多態(tài)性(signle strand conformation polymorphism,SSCP)是指單鏈DNA由于堿基序列的不同可引起構(gòu)象差異,這種差異將造成相同或相近長度的單鏈DNA電泳遷移率不同,從而可用于DNA中單個堿基的替代、微小的缺失或手稿的檢測。用SSCP法檢查基因突變時,通常在疑有突變的DNA片段附近設(shè)計(jì)一對引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,然后將擴(kuò)增物用甲酰胺等變性,并在聚丙烯酰胺凝膠中電泳,突變所引起的DNA構(gòu)象差異將表現(xiàn)為電泳帶位置的差異,從而可據(jù)之作出診斷。

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