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問答社區(qū)

請(qǐng)問什么是競(jìng)爭(zhēng)定量PCR(competitive quantitative PCR)

七七彩糖 2013-10-11 22:34:37 361  瀏覽
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參與評(píng)論

全部評(píng)論(1條)

  • vg枯產(chǎn)喏 2013-10-12 00:00:00
    去哪里找Z出色的生命科學(xué)學(xué)術(shù)交流論壇?>>> 競(jìng)爭(zhēng)定量PCR(competitive quantitative PCR) 競(jìng)爭(zhēng)定量PCR是先構(gòu)建一個(gè)與靶基因相同的擴(kuò)增效率和引物結(jié)合位點(diǎn)僅探針結(jié)合位點(diǎn)不同的內(nèi)標(biāo),在同一反應(yīng)管內(nèi),靶基因和內(nèi)標(biāo)物和引物(primer)競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合,進(jìn)行同步擴(kuò)增,由于競(jìng)爭(zhēng)作用,當(dāng)一種模板量逐漸增加時(shí),另一種模板的擴(kuò)增產(chǎn)物相對(duì)逐漸減少,但兩種擴(kuò)增產(chǎn)物的比值和兩種初始狀態(tài)時(shí)模板分子數(shù)的比值是一致的。根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)品的準(zhǔn)確含量制作標(biāo)準(zhǔn)曲線,從而進(jìn)行準(zhǔn)確核酸定量。由于內(nèi)標(biāo)品構(gòu)建中特別要求是Ev與靶基因擴(kuò)增效率一致,如果靶基因序列和內(nèi)標(biāo)相同,那么擴(kuò)增過程中兩者的實(shí)際擴(kuò)增效率就接近一致,就可以對(duì)靶基因進(jìn)行定量,即確定樣品中靶基因準(zhǔn)確分子數(shù),否則只能相對(duì)定量,即確定樣本間靶基因分子數(shù)的差異,總體上說,加入內(nèi)標(biāo)物,消除PCR擴(kuò)增過程中于反應(yīng)管和反應(yīng)管間以及標(biāo)本之間存在差異。因此,內(nèi)標(biāo)法是目前PCR定量方法中Z準(zhǔn)確的方法,但構(gòu)建內(nèi)標(biāo)物是建立本方法的關(guān)鍵。 構(gòu)建內(nèi)標(biāo)物的基本原則是內(nèi)標(biāo)物具有靶基因的相同擴(kuò)增條件和相同擴(kuò)增效率。和可區(qū)別于靶基因探針結(jié)合位點(diǎn)與不干擾靶基因的擴(kuò)增。因此,理想的內(nèi)標(biāo)物應(yīng)具備與靶基因序列待分析序列相同的引物結(jié)合位點(diǎn),相似的或相同大小、相似的堿基排列順序。

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    評(píng)論

熱門問答

請(qǐng)問什么是競(jìng)爭(zhēng)定量PCR(competitive quantitative PCR)
 
2013-10-11 22:34:37 361 1
一文知曉PCR,定量PCR,數(shù)字PCR方法選擇

從1985年至今的30多年時(shí)間里,PCR分析經(jīng)歷了三代技術(shù)的發(fā)展。DY代傳統(tǒng)PCR技術(shù),采用瓊脂糖凝膠電泳的方法對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行定性分析。第二代熒光定量PCR技術(shù),通過在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團(tuán),利用熒光信號(hào)的積累實(shí)時(shí)監(jiān)控PCR進(jìn)程,ZH用Cq值對(duì)基因進(jìn)行定量分析。第三代數(shù)字PCR技術(shù),通過將PCR反應(yīng)液進(jìn)行有限稀釋,實(shí)現(xiàn)核酸分子的單分子擴(kuò)增,ZZ采取終點(diǎn)法檢測(cè)陽性微滴的熒光信號(hào),有熒光信號(hào)的微滴判讀為 1;沒有熒光信號(hào)的微滴判讀為 0,因此該技術(shù)被稱為數(shù)字PCR。

PCR技術(shù)在不斷地蛻變卻從未淡出我們的視野,如今已經(jīng)滲透到分子生物學(xué)領(lǐng)域的各種研究層面。尤其在今年大流行疾病中,展現(xiàn)了PCR技術(shù)的強(qiáng)大之處。那在科學(xué)研究中,我們?cè)撊绾芜x擇傳統(tǒng)PCR 、熒光定量 PCR與數(shù)字 PCR呢?

首先我們要清楚,三代PCR技術(shù)所有的基礎(chǔ)源于PCR反應(yīng)的基本原理和PCR反應(yīng)的3個(gè)重要階段,分別是指數(shù)期、線性期和平臺(tái)期。

指數(shù)期

指數(shù)期內(nèi),每個(gè)循環(huán)PCR產(chǎn)物量大約增加1倍(假定 100%反應(yīng)效率),該階段的擴(kuò)增反應(yīng)具有高度特異性和精確度。

線性期(高變異性)

隨著PCR反應(yīng)體系成分的消耗,其中的一個(gè)或者多種成分限制反應(yīng),導(dǎo)致反應(yīng)開始減緩,并且每個(gè)循環(huán)的PCR 產(chǎn)物不再加倍。

平臺(tái)期

反應(yīng)停止,不再產(chǎn)生更多的產(chǎn)物。因?yàn)槊總€(gè)樣品具有不同的反應(yīng)動(dòng)力學(xué),所以每個(gè)反應(yīng)將在不同的時(shí)間點(diǎn)進(jìn)入平臺(tái)期,平臺(tái)期內(nèi)可以看到這些差異。

傳統(tǒng) PCR

傳統(tǒng)PCR通過瓊脂糖凝膠電泳對(duì)PCR終產(chǎn)物進(jìn)行分析(圖2),它的局限性就在于只能做定性分析。在圖3中,3個(gè)反應(yīng)孔含有相同量的 DNA模板,但到達(dá)平臺(tái)期后產(chǎn)生的熒光信號(hào)卻不同,說明擴(kuò)增產(chǎn)物的量存在不同(反應(yīng)動(dòng)力學(xué)變化所致)。這也表明了傳統(tǒng)PCR平臺(tái)期測(cè)量時(shí)結(jié)果存在變異,產(chǎn)出的DNA量不一定能反映最初情況,所以無法進(jìn)行定量。

熒光定量 PCR

同樣在圖3中,發(fā)現(xiàn)在指數(shù)期內(nèi),3個(gè)反應(yīng)孔的擴(kuò)增曲線完全重合,說明指數(shù)期內(nèi)進(jìn)行檢測(cè)將更加精確,可實(shí)現(xiàn)更加準(zhǔn)確的定量。閾值線是擴(kuò)增產(chǎn)物熒光強(qiáng)度超過背景時(shí)的一個(gè)熒光強(qiáng)度值,樣品達(dá)到此熒光強(qiáng)度值所經(jīng)過的循環(huán)數(shù)稱為Cq值。通過比較未知濃度的樣品與一系列標(biāo)準(zhǔn)品的Cq值,可以精確測(cè)定未知反應(yīng)中的模板 DNA數(shù)量。


數(shù)字 PCR

數(shù)字 PCR 是通過將樣本DNA隨機(jī)分布至獨(dú)立的反應(yīng)單元中,每個(gè)反應(yīng)單元中包含或者不包含1個(gè)或多個(gè)拷貝的目標(biāo)分子,所有獨(dú)立的反應(yīng)單元進(jìn)行平行擴(kuò)增后,對(duì)每個(gè)反應(yīng)單元的陰性或者陽性熒光信號(hào)進(jìn)行檢測(cè)并進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,就可以計(jì)算出原始樣本的拷貝數(shù),無需參考標(biāo)準(zhǔn)品或內(nèi)源性對(duì)照品,也不需要標(biāo)準(zhǔn)曲線。

傳統(tǒng)PCR 、熒光定量 PCR與數(shù)字 PCR的選擇


深藍(lán)云生物科技為您提供美國(guó)Azure Cielo 3/6通道熒光定量PCR系統(tǒng)和

        法國(guó)Stilla Naica全自動(dòng)3色/6色微滴芯片數(shù)字PCR系統(tǒng)。


Azure  Cielo?實(shí)時(shí)熒光定量PCR系統(tǒng)

來自于美國(guó)Azure Biosystems公司,為您提供Azure Cielo-3通道和Azure Cielo-6通道,可根據(jù)實(shí)驗(yàn)需求靈活配置。這款產(chǎn)品采用了高能LED作為光源系統(tǒng),可保證光源強(qiáng)度高,光源一致性好;高品質(zhì)的帕爾貼溫度模塊作為溫控系統(tǒng),升降溫速率快,可設(shè)置12列跨度30°C的溫度梯度;ZY的CMOS拍照+光纖信號(hào)傳輸作為檢測(cè)系統(tǒng),CMOS檢測(cè)靈敏度高,光纖傳輸速度快,無光損失和干擾。Azure Cielo?實(shí)時(shí)熒光定量PCR系統(tǒng)可為您的科學(xué)研究提供高JZ度、高靈敏度和高可靠性的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。

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法國(guó)Stilla Technologies Naica數(shù)字PCR平臺(tái)是實(shí)現(xiàn)高靈敏DNA/RNAJD定量的技術(shù)工具,只需一步移液操作,即可自動(dòng)生成單層平鋪的微滴,同一反應(yīng)液進(jìn)行多基因的單分子模板擴(kuò)增,通過三色或六色熒光通道檢測(cè),自動(dòng)QC質(zhì)控,識(shí)別多色熒光中有效的陰陽性微滴,從而達(dá)到目的DNA/RNA的高JZjuedui定量。同時(shí)提供原始數(shù)據(jù)、單微滴追溯等功能,確保數(shù)據(jù)真實(shí)可靠。




參考文獻(xiàn):

1. Sykes PJ, Neoh SH, Brisco MJ, Hughes E, Condon J, Morley AA. Quantitation of targets for PCR by use of limiting dilution. Biotechniques. 1992;13(3):444-449.

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3. Heyries KA, Tropini C, Vaninsberghe M, et al. Megapixel digital PCR. Nat Methods. 2011;8(8):649-651.

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5. Whale AS, Huggett JF, Cowen S, et al. Comparison of microfluidic digital PCR and conventional quantitative PCR for measuring copy number variation. Nucleic Acids Res. 2012;40(11):e82.


2020-08-31 11:14:24 1199 0
什么是PCR?
什么是PCR??
2006-03-06 13:48:01 413 2
什么是PCR 管
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2010-09-02 07:20:51 692 1
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2012-07-19 06:41:40 489 3
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做實(shí)時(shí)定量pcr需要哪些試劑?
我想先從人血液中提取mRNA,然后逆轉(zhuǎn)錄成CDNA,Z后做實(shí)時(shí)定量pcr,這個(gè)過程需要哪些試劑盒或者試劑,請(qǐng)稍微講詳細(xì)一點(diǎn),新人做實(shí)驗(yàn),謝謝!!!
2011-08-18 15:34:39 656 3
abi7500熒光pcr儀用什么pcr管
 
2018-12-04 11:48:05 328 0
PCR管推薦,PCR管什么牌子好,PCR管買哪種好
 
2018-12-05 19:47:04 389 0
請(qǐng)問實(shí)時(shí)熒光定量PCR所用PCR管一定要用八連管嗎,還是普通PCR管就可以?
 
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什么DNA RNA PCR
我真是看不懂,好難理解誰能給說說學(xué)習(xí)這些東西怎么入手啊我學(xué)習(xí)做實(shí)驗(yàn)的需要啊但我本人是中醫(yī)畢業(yè)本身對(duì)這些就沒學(xué)到家... 我真是看不懂,好難理解 誰能給說說學(xué)習(xí)這些東西怎么入手啊 我學(xué)習(xí)做實(shí)驗(yàn)的需要啊 但我本人是中醫(yī)畢業(yè)本身對(duì)這些就沒學(xué)到家 展開
2006-03-09 00:40:05 387 5
我做了婦科定量PCR檢測(cè)報(bào)告.急急急
我做了熒光定量PCR檢測(cè),報(bào)告出來了:沙眼衣原體CT-DNA陰性。解脲支原體UU-DNA陽性(1.46X10^4拷貝/毫升).這結(jié)果是什么意思.是否正常?如果宮頸糜爛達(dá)到幾度?... 我做了熒光定量PCR檢測(cè),報(bào)告出來了:沙眼衣原體CT-DNA 陰性。解脲支原體UU-DNA 陽性(1.46X10^4拷貝/毫升).這結(jié)果是什么意思.是否正常?如果宮頸糜爛達(dá)到幾度? 展開
2011-10-17 12:50:30 608 1
PCR后溶液跑到pcr管蓋上是怎么回事啊
 
2012-05-28 21:17:57 649 4
英國(guó)進(jìn)口PCR耗材,PCR八聯(lián)管

英國(guó)進(jìn)口PCR耗材,PCR八聯(lián)管 實(shí)驗(yàn)室耗材本生生物公司供應(yīng):分光光度計(jì),熒光定量PCR耗材,移液器吸嘴,微量離心管,進(jìn)口凍存管,細(xì)胞培養(yǎng)皿,培養(yǎng)板,培養(yǎng)瓶,吸頭,儀器及手套,色譜耗材,針頭過濾器。

貨號(hào)             品名                       顏色    規(guī)格    
V1082-C    0.1ml PCR八聯(lián)管    透明    120條/盒,10盒/箱    
V1082-M    0.1ml PCR八聯(lián)管    乳白色   120條/盒,10盒/箱    
V2081-C    0.2ml PCR八聯(lián)管    透明    120條/包,10盒/箱  
V2081-M    0.2ml PCR八聯(lián)管    乳白色    120條/盒,10盒/箱    
V2082-C    0.2ml PCR八聯(lián)管    透明    120條/包,10盒/箱    
V2082-M    0.2ml PCR八聯(lián)管    乳白色   120條/盒,10盒/箱

英國(guó)進(jìn)口PCR耗材,PCR八聯(lián)管

0.1ml PCR八聯(lián)管pp材質(zhì),薄壁設(shè)計(jì),適用于使用100ul反應(yīng)體系模塊的熒光定量PCR儀及普通/梯度PCR儀。

產(chǎn)品介紹:  
>以高品質(zhì)生物級(jí)聚丙烯為原料,超潔凈生產(chǎn)環(huán)境生產(chǎn)。
>管壁薄而且壁厚均勻,保證了快速的傳熱效率和樣品的受熱均勻。  
>管蓋專業(yè)級(jí)超亮光學(xué)平面區(qū)域,保證了檢測(cè)光的通過率。
>與PCR儀導(dǎo)熱槽配合設(shè)計(jì),與導(dǎo)熱槽配合性能好,更加利于熱傳導(dǎo)。
>獨(dú)特設(shè)計(jì),與熒光定量PCR光學(xué)平蓋配合適中,有效防止樣品蒸發(fā)。
>高精度模具制造及精密注塑工藝,保證了產(chǎn)品的品質(zhì)及批次間產(chǎn)品均一性和穩(wěn)定性。  
>正面??套帜笜?biāo)識(shí),方便樣品識(shí)別區(qū)分。
適用儀器:
適用于ABI7500fast、stepone/plus;BIO-RADCFX96、MJ;Roche480等100ul反映體系的熒光定量PCR儀及普通PCR儀

英國(guó)進(jìn)口PCR耗材,PCR八聯(lián)管 0.2ml PCR八聯(lián)管

BR>pp材質(zhì),薄壁設(shè)計(jì),適用于使用200ul反應(yīng)體系模塊的熒光定量PCR儀及普通/梯度PCR儀。

產(chǎn)品介紹:
適用于常規(guī)PCR溫度循環(huán)系統(tǒng)和定量PCR系統(tǒng),包括8聯(lián)PCR管和96/384孔PCR板。 純度高達(dá)99.9%的聚丙烯、超薄設(shè)計(jì)、壁厚*均勻的工藝使得熱傳導(dǎo)精確、控溫準(zhǔn)確、減少實(shí)驗(yàn)循環(huán)時(shí)間。通過嚴(yán)格的質(zhì)控和認(rèn)證確保產(chǎn)品無DNase 、無RNase 、無蛋白酶,內(nèi)毒素含量控制在安全標(biāo)準(zhǔn)內(nèi)。獨(dú)有的長(zhǎng)法蘭管蓋設(shè)計(jì),減少樣品蒸發(fā);PCR板裙邊上已標(biāo)記編號(hào),可以方便加樣。

進(jìn)口PCR耗材,PCR八聯(lián)管

  產(chǎn)品標(biāo)題

  堿性蛋白豚水(AP ) Alkaline Peptone Water

  農(nóng)藥殘留快速檢測(cè)儀(干式法)

  微量離心管

  尿沉渣管(螺旋蓋) 12ML

  量筒

  發(fā)泡式帶蓋冰桶/冰盒

  迷你型勻漿機(jī)

  凍存盒Freezer Storage Box

  1.8ml凍存管,自立,內(nèi)旋蓋,帶O型圈,印刷刻度區(qū)

  PCR板硅膠片,適用于384孔PCR板,“+”開口,圓形孔,化學(xué)耐受型

  細(xì)菌培養(yǎng)皿,100x15mm,滅菌,加厚

  24孔帶蓋細(xì)胞培養(yǎng)板,貼壁,平底,透明,單個(gè)滅菌包裝

  12孔帶蓋細(xì)胞培養(yǎng)板,貼壁,平底,透明,單個(gè)滅菌包裝

  6孔帶蓋細(xì)胞培養(yǎng)板,貼壁,平底, 透明,單個(gè)滅菌包裝

  T-175, 650ml細(xì)胞培養(yǎng)瓶,斜口,密封蓋

  15-425 螺紋口頂空瓶

  24-400 EPA/VOA螺紋口樣品瓶及配套瓶蓋和隔墊

  棕色/透明 微量?jī)?chǔ)存瓶

  圓底螺紋樣品管

  Qubit試劑耗材

  50ml離心管錐底,綠色蓋,綠色印刷標(biāo)記區(qū)

  封板膜 100張/10盒/箱

  進(jìn)口Western 孵育盒 Half mini-gel size,75 x 52 x 35mm

  Tip 0.5-10ul, 短吸嘴 ,無色, 盒裝

  5.0ml凍存管

  蠕動(dòng)泵

  100*20mm細(xì)胞培養(yǎng)皿,貼壁培養(yǎng),標(biāo)準(zhǔn)

  100*20mm細(xì)胞培養(yǎng)皿,貼壁培養(yǎng),標(biāo)準(zhǔn),滅菌

  60*15mm細(xì)胞培養(yǎng)皿,懸浮培養(yǎng),滅菌

  10ml離心管,PP(聚柄烯)圓底

  2ml 卡口透明帶書寫處樣品瓶

產(chǎn)品優(yōu)勢(shì):
1、可替代羅氏、伯樂、ABI、安捷倫、耶拿、艾本德、TaKaRa、力康、天隆、博日、達(dá)安、宏石、福生等各熒光定量PCR儀用的單管、八聯(lián)管、96孔板、384孔板。
2、PCR耗材品種全,可替代儀器原廠耗材,性價(jià)比高,質(zhì)量穩(wěn)定,對(duì)用戶可以節(jié)省實(shí)驗(yàn)成本,對(duì)公司每月都有訂單,現(xiàn)貨庫存,順豐快遞配送,下單3個(gè)工作日即可到達(dá)用戶手中。
適應(yīng)客戶:醫(yī)院檢驗(yàn)科PCR實(shí)驗(yàn)室,實(shí)驗(yàn)室;第三方檢測(cè)機(jī)構(gòu),科研院所,大專院校,制藥廠,試劑生產(chǎn)廠家,疾控中心,檢驗(yàn)檢疫。

2021-10-11 14:31:27 402 0

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