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DNA提取有強制性沒有

angd538 2017-11-27 00:32:50 532  瀏覽
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  • 穩(wěn)穩(wěn)雯雯98 2017-11-28 00:00:00
    實驗一、質粒DNA的提取純化與瓊脂糖凝膠電泳 一、實驗目的 掌握質粒DNA提取的基本原理與實驗技能,同時熟悉DNA凝膠成像系統(tǒng)紫外投射儀 利用SDS使細胞膜裂解,同時在堿作用下細菌的線形染色體DNA變性,而質粒DNA(共價閉合環(huán)狀DNA,cccDNA)的二條鏈不會相互分開,當外界條件恢復正常時,線狀染色體DNA片段難以復性,從而與變性的蛋白質和細胞碎片纏繞在一起,而質粒DNA雙鏈又恢復原狀,重新形成天然的超螺旋分子,并以溶解狀態(tài)存在于液相中,通過離心將可以將質粒DNA提取出來。DNA制備膜可選擇性地吸附DNA,從而可快速地純化質粒DNA。 瓊脂糖凝膠電泳分離DNA片段大小范圍較廣,不同濃度瓊脂糖凝膠可分離長度從200bp至近50kb的DNA片段。實驗室中常規(guī)實驗,一般用瓊脂糖水平凝膠電泳裝置進行DNA電泳。DNA在瓊脂糖凝膠電泳中的快慢與DNA分子大小、瓊脂糖濃度、DNA分子構象、電流電壓和離子強度等多種因素有關。 DNA的顯色原理為溴化乙啶(EB)或其它染料可嵌入堆積的堿基對之間,在紫外燈下發(fā)熒光。但需注意EB是一種強誘變劑! 三、實驗材料、儀器與試劑 (一)、實驗材料 含有質粒pBS的DH5(菌株 (二)、實驗儀器 微量移液器, 臺式高速離心機,恒溫振蕩搖床, 高壓蒸汽消毒器(滅菌鍋),冰箱,瓊脂糖凝膠電泳系統(tǒng)、凝膠成像系統(tǒng)紫外投射儀 (三)、實驗試劑與配制 小量質粒DNA提取試劑盒 LB液體培養(yǎng)基: 蛋白胨(tryptone)10g, 酵母提取物(yeast extract)5g, NaCl 10g, 用NaOH調至pH7.2-7.5。高壓下蒸汽滅菌20分鐘。 LB固體培養(yǎng)基:每升液體培養(yǎng)基加12g 瓊脂粉,高壓下蒸汽滅菌20分鐘。 氨芐青霉素(Amp)母液:配成50mg/ml水溶液,-20 ℃下保存?zhèn)溆谩?TE緩沖液:10mol/L TrisCl (pH8.0), 1mmol/L EDTA(pH8.0). 高壓蒸氣滅菌15分鐘, 儲存于4 ℃冰箱。 瓊脂糖 5(TBE緩沖液:Tris. 54g, 硼酸27.5g, 加入20ml 的0.5mol/L EDTA(pH8.0), 定溶至1000ml. 6(上樣緩沖液:0.25% 溴酚蘭, 40%(w/v)蔗糖水溶液。 溴化乙啶(EB)溶液母液:將EB配制成10mg/L,用鋁箔或黑紙包裹容器,儲于溫室即可。 DNA電泳分子量標準(DNA marker)Lambda DNA/EcoRI+HindIII Marker或其它MARker。 四、操作步驟 (一)、質粒DNA的提取純化 diyi次使用時,將試劑盒攜帶的RNaseAl全部加入到S1溶液中,混合均勻,4℃保存。 細菌的培養(yǎng)和收集:將含有質粒pBS的DH5(菌株接種在LB固體培養(yǎng)基(含50(g/ml Amp)中,37℃培養(yǎng)12-24小時。用無菌牙簽挑取單菌落接種到5ml LB液體培養(yǎng)基(含 50(g/ml Amp)中,37℃培養(yǎng)約12小時至對數(shù)生長后期。 取1.5ml在LB培養(yǎng)基中培養(yǎng)過夜的菌液,12000rpm離心1min,棄盡上清; 用0.25ml已加入RNaseAl的S1溶液懸浮細菌沉淀,懸浮需均勻,不應留有小的菌塊; 加0.25ml S2溶液,溫和并充分地上下翻轉混合均勻使菌體充分裂解,直至形成透亮的溶液。此步驟不宜超過5 min; 加入0.5ml 4℃預冷的S3溶液,溫和并充分地上下翻轉混合均勻,直至形成緊實的凝集塊,室溫靜置2min。Z高速度(12000rpm)離心5 min; 吸取步驟5中的離心上清并轉移到DNA制備管(置于2ml離心管中),3600rpm離心l min。如制備管中有液體殘留,適當提高離心速度,再離心1 min,棄濾液; 將制備管置回離心管,加0.5ml Wl溶液,3600rpm離心 30s,棄濾液; 將制備管置回離心管,加0.7ml W2溶液,3600rpm離心30s;以同樣的方法再用0.7ml W 2溶液洗滌一次。棄濾液; 將制備管移入離心管中,12000rpm離心1 min; 將制備管移入新的1.5 ml離心管中,在DNA制備膜正ZY加60μl水或洗脫液,室溫靜置lmin。 12000rpm離心l min洗脫DNA。 (二)、質粒DNA的瓊脂糖凝膠電泳 稀釋緩沖液的制備:用蒸餾水將5(TBE緩沖液配制成0.5(TBE稀釋緩沖液. 1%瓊脂糖凝膠(TBE稀釋緩沖液,放入微波爐或電爐加熱至瓊脂糖全部熔化,取出混勻。 膠板的制備:將二端封閉的電泳槽置于水平支持物上,插上樣品梳子。在冷卻至50-60℃的瓊脂糖膠液中加入EB溶液至終濃度為0.5(g/ml, 即10mg/ml的母液加2.5ul,混勻。小心地倒入電泳槽中至一定高度。待膠液完全凝固后拔出梳子。然后向槽內(nèi)加0.5(TBE稀釋緩沖液至液

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