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- 周易大發(fā)財 2017-09-23 00:00:00
- 基本不會 SDS是表面活性劑,但是對DNA結(jié)構(gòu)的影響較小。 可以用SDS法裂解細胞膜,使蛋白質(zhì)變性,進而抽提DNA~ NA會迅速被降解,因為Z終溶解質(zhì)粒的TE緩沖液中有EDTA。如果哪天你手上正好缺了溶液I,可不可以抽提質(zhì)粒呢?實話告訴你,只要用等體積的水,或LB培養(yǎng)基來懸浮菌體就可以了。有一點不能忘的是,菌體一定要懸浮均勻,不能有結(jié)塊。 輪到溶液II了。這是用新鮮的0.4 N的NaOH和2%的SDS等體積混合后使用的。要新從濃NaOH稀釋制備0.4N的NaOH,無非是為了保證NaOH沒有吸收空氣中的CO2而減弱了堿性。很多人不知道其實破細胞的主要是堿,而不是SDS,所以才叫堿法抽提。事實上NaOH是Z佳 的溶解細胞的試劑,不管是大腸桿菌還是哺乳動物細胞,碰到了堿都會幾乎在瞬間就溶解,這是 由于細胞膜發(fā)生了從bilayer(雙層膜)結(jié)構(gòu)向micelle(微囊)結(jié)構(gòu)的相變化所導(dǎo)致。用了不新鮮的0.4 N NaOH,即便是有SDS也無法有效溶解大腸桿菌(不妨可以自己試一下),自然就難GX率抽提得到質(zhì)粒。如果只用SDS當(dāng)然也能抽提得到少量質(zhì)粒,因為SDS也是堿性的,只是弱了點而已。很多人對NaOH的作用誤以為是為了讓基因組DNA變性,以便沉淀,這是由于沒有正確理解一些書上的有關(guān)DNA變性復(fù)性的描述所導(dǎo)致。有人不禁要問,既然是NaOH溶解的細胞,那為什么要加SDS呢?那是為下一步操作做的鋪墊。這一步要記住兩點:diyi,時間不能過長,千萬不要這時候去接電話,因為在這樣的堿性條件下基因組DNA片斷會慢慢斷裂;第二,必須溫柔混合(象對待女孩子一樣),不然基因組DNA也會斷裂?;蚪MDNA的斷裂會帶來麻煩,后面我再詳細說明。 每個人都知道,溶液III加入后就會有大量的沉淀,但大部分人卻不明白這沉淀的本質(zhì)。Z容易產(chǎn)生的誤解是,當(dāng)SDS碰到酸性后發(fā)生的沉淀。如果你這樣懷疑,往1%的SDS溶液中加如2M的醋酸溶液看看就知道不是這么回事了。大量沉淀的出現(xiàn),顯然與SDS的加入有關(guān)系。如果在溶液II中不加SDS會怎樣呢,也會有少量的沉淀,但量上要少得多,顯然是鹽析和酸變性沉淀出來的蛋白質(zhì)。
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