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- a340244226 2017-09-05 22:27:40
- DNA測序的方法有很多種. 目前Z常見的是雙脫氧終止法了. 在測序用的緩沖液中含有四種dNTP及聚合酶. 測序時分成四個反應(yīng), 每個反應(yīng)除上述成分外分別加入2,3-雙脫氧的A, C, G, T核苷三磷酸(稱為ddATP, ddCTP, ddGTP, ddTTP), 然后進行聚合反應(yīng). 在diyi個反應(yīng)物中, ddATP會隨機地代替dATP參加反應(yīng)一旦ddATP加入了新合成的DNA鏈, 由于其3位的羥基變成了氫, 所以不能繼續(xù)延伸. 所以diyi個反應(yīng)中所產(chǎn)生的DNA鏈都是到A就終止了; 同理第二個反應(yīng)產(chǎn)生的都是以C結(jié)尾的; 第三個反應(yīng)的都以G結(jié)尾, 第四個反應(yīng)的都以T結(jié)尾, 電泳后就可以讀出序列了. 也許這樣說你不一定明白. 舉一個例子, 假如有一個DNA, 互補序列是GATCCGAT, 我們試著做一下: 在diyi個反應(yīng)中由于含有dNTP+ddATP, 所以遇到G, T, C三個堿基時沒什么問題, 但遇到A時, 摻入的可能是dATP或ddATP, 比如已合成到G, 下一個如果參與反應(yīng)的是ddATP則終止, 產(chǎn)生一個僅有2個核苷酸的序列: GA, 否則繼續(xù)延伸, 可以產(chǎn)生序列GATCCG, 又到了下一個A了. 同樣有兩種情況, 如果是ddATP摻入, 則產(chǎn)生的序列是GATCCGA, 延伸終止, 否則可以繼續(xù)延伸, 產(chǎn)生GATCCGAT. 所以在diyi個反應(yīng)系統(tǒng)中產(chǎn)生的都是以A結(jié)尾的片段: GA, GATCCGA, 同理在第二個反應(yīng)中產(chǎn)生的都是以C結(jié)尾的片段: GATC, GATCC, 在第三個反應(yīng)中產(chǎn)生的都是以G結(jié)尾的片段: G, GATCCG 在第四個反應(yīng)中產(chǎn)生的都是以T結(jié)尾的片段: GAT, GATCCGAT, 電泳時按分子量大小排列, A反應(yīng)的片段長度為2, 7; C反應(yīng)的為4, 5; G反應(yīng)的為1, 6; T反應(yīng)的為3, 8, 四個反應(yīng)的產(chǎn)物分別電泳, 結(jié)果為 8 7 6 5 4 3 2 1 A | | C | | G | | T | | 我們可以從右向左讀, 為GATCCGAT, 至此, 測序完成(上面這個圖在百度知道中顯示不正常, 因為百度知道的網(wǎng)頁用的是比例字體, 你如果想看它, 拷貝到記事本中, 用等寬的字體來看).
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